Segunda Guerra Mundial
| Segunda Guerra Mundial | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Identificadores | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alias | Dominio WWC2 , BOMB, WW y C2 que contiene 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identificaciones externas | MGI : 1261872; HomoloGene : 32618; GeneCards : WWC2; OMA : WWC2 - ortólogos | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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El dominio WW y C2 que contiene 2 (WWC2) es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen WWC2 (4q35.1). Aunque la función de WWC2 sigue siendo desconocida, se ha predicho que WWC2 puede desempeñar un papel en el cáncer.
Gene
Lugar
El gen humano WWC2 se encuentra en el cromosoma 4 , en la banda 4q35.1. El gen se encuentra en la cadena positiva del cromosoma y tiene una longitud de 8.822 pares de bases. El gen contiene 23 exones. El locus WWC2 es bastante complejo y parece producir varias proteínas sin superposición de secuencias [5].
Alias
Un alias común del gen es BH3-Only Member B (BOMB) [6]
Homología
Parálogos
Existen dos parálogos de WWC2 en los seres humanos: WWC1 y WWC3. WWC1 se encuentra en el cromosoma 5 y es un probable regulador de la vía de señalización de Hippo que desempeña un papel en la supresión tumoral al restringir la proliferación y promover la apoptosis. [7] WWC3 se encuentra en el cromosoma X y no se sabe mucho sobre su función.
| Secuencia | Género/especie | Número de Adhesión | Longitud de secuencia | Identidad de secuencia |
|---|---|---|---|---|
| Segunda Guerra Mundial | Homo sapiens | NP_079225 | 1192 años | 100% |
| KIBRA (WWC1) | Homo sapiens | AA015881 | 1113 años | 49,7% |
| Campeonato Mundial 3 | Homo sapiens | NP_056506 | 1092 años | 41,2% |
Ortólogos
WWC2 está muy conservado en Mammalia , Aves , Reptilia y Amphibia , así como en el raro celacanto , que está más estrechamente relacionado con los peces pulmonados, reptiles y mamíferos que los peces con aletas radiadas. WWC2 está conservado en algunos Actinopterygii , Gastropoda y Bivalvia . Sin embargo, WWC2 no está bien conservado en Insecta .
| Género/especie | Nombre común | Fecha de divergencia | Número de Adhesión | Identidad de secuencia |
|---|---|---|---|---|
| Homo sapiens | Humano | N / A | NP_079225 | 100% |
| Pan trogloditas | Chimpancé | 6,1 millones de años | XP_003310624 | 99% |
| Heterocéfalo glaber | Rata topo desnuda | 91 millones de años | EHB18748 | 88% |
| Músculo musculoso | Ratón | 91 millones de años | NP_598552 | 86% |
| Orca del orcino | Orca | 97,4 millones de años | XP_004281794 | 90% |
| Bos mutus | Yak | 97,4 millones de años | XP_005903227 | 84% |
| Caimán mississippiensis | Caimán | 324,5 millones de años | XP_006269678 | 79,2% |
| Pelodiscus sinensis | Tortuga china de caparazón blando | 324,5 millones de años | XP_006130219 | 79% |
| Anas platyrhynchos | Pato real | 324,5 millones de años | EOA93642 | 78% |
| Falco peregrinus | Halcón peregrino | 324,5 millones de años | XP_005230882 | 77% |
| Ficedula albicollis | Papamoscas de collar | 324,5 millones de años | XP_005045160 | 76% |
| Xenopus (Silurana) tropicalis | Rana de garras occidental | 361,2 millones de años | Número de serie 001004872 | 71% |
| Ofiofago hannah | Cobra real | 362,2 millones de años | ETE71408 | 71% |
| Latimeria chalumnae | Celacanto | 430 millones de años | XP_005989542 | 72% |
| Takifugu rubripes | Pez globo | 454,6 millones de años | XP_003973883 | 55% |
| Danio rerio | Pez cebra | 454,6 millones de años | XP_689275 | 53% |
| Xiphophorus maculatus | Platyfish del sur | 454,6 millones de años | XP_005800442 | 51% |
| Aplysia californica | Liebre marina de California (babosa) | 782,7 millones de años | XP_005096216 | 51% |
| Crassostrea gigas | Ostra del Pacífico | Hace 910 millones de años | EKC42771 | 39% |
| Anopheles darlingi | Mosquito | Hace 910 millones de años | ETN67979 | 34% |
| Drosophila melanogaster | Mosca de la fruta | Hace 910 millones de años | AAF55090.2 | 28,9% |
Proteína
Secuencia primaria
El gen codifica una proteína también llamada WWC2, que tiene una longitud de 1192 aminoácidos. El peso molecular de la proteína es de 133,9 kilodaltons. [8] La proteína es rica en serina y no tiene grupos de carga, segmentos hidrofóbicos ni dominios transmembrana. El punto isoeléctrico es 5,23800 [9].
Dominios y motivos
WWC2 es un miembro de la familia de proteínas WWC [10] que consta de un dominio WW y un dominio C2 . WWC2 contiene dos dominios WW y un dominio C2. WWC2 también contiene dos dominios de función desconocida, DUF342 y DUF444. Una cremallera de leucina se encuentra en la posición 854.
Modificaciones postraduccionales
Se predice que la proteína WWC2 está altamente fosforilada . [11] Hay 89 sitios predichos de fosforilación de serina , 17 sitios predichos de fosforilación de treonina y 11 sitios predichos de fosforilación de tirosina . Estos números fueron relativamente consistentes en las proteínas ortólogas.
También se predice que las proteínas quinasas activadas por mitógeno p38 y la glucógeno sintasa quinasa 3 se unen en la posición T3, y la caseína quinasa 2 se une en las posiciones S13 y T50. [12]
Expresión
Expresión
La expresión de WWC2 es baja y es específica de los tejidos del útero, la tiroides, los pulmones y el hígado. Se ha descubierto que la expresión de WWC2 es elevada en las etapas de desarrollo fetal y de blastocisto .
Variantes de transcripción
Existen muchas variantes de transcripción para WWC2. A continuación se enumeran aquellas que modifican un residuo de aminoácido altamente conservado o rodean un residuo de aminoácido altamente conservado:
| Partido Nacional Socialista | Alelo | Residuos de proteína | Posición de aminoácidos |
|---|---|---|---|
| rs200024780 | De la A a la G | De Tyr (T) a Cys (C) | 470 |
| rs191286964 | C a T | Arg (R) a Cys (C) | 1082 |
| rs139606516 | G a T | Arg (der.) a Leu (izq.) | 1082 |
| rs149738870 | De la A a la G | Asn (N) a Ser (S) | 1084 |
Proteínas interactuantes
Factores de transcripción
Los factores de transcripción con las puntuaciones de matriz más altas que se unen a secuencias dentro del promotor (ID GXP_1499160) se muestran a continuación:
- STAT (transductor de señales y activador de la transcripción)
- Caja TATA muscular
- NOLF (factor olfativo específico de la neurona)
- XCPE (elemento promotor central 1 del gen X)
- CTCF (factor de unión a CCCTC)
- HDBP ( región reguladora del gen de la enfermedad de Huntington )
- OCT1 (proteína de unión al octamero)
- E2FF ( E2F - activador myc regulador del ciclo celular)
- ZF57 (proteína de dedo de zinc del dominio KRAB 57)
- ZF07 (factor de transcripción de dedo de zinc C2H2 7)
- EGRF (proteína inducida por factor de crecimiento nervioso/EGR)
- CDEF (elemento dependiente del ciclo celular - sitio de unión CDF-1)
- AP2F (proteína activadora 2)
Proteínas
Las proteínas que pueden interactuar incluyen: YWHAZ , YWHAQ , RUVBL1 y REPS1 .
Importancia clínica y bioinformación actual
Aunque la función exacta de WWC2 sigue siendo desconocida, se han investigado varias mutaciones y variantes de WWC2 en enfermedades. Una nueva mutación sin sentido en WWC2 se analizó en el síndrome de piernas inquietas , pero no se identificó como un gen candidato. [13] Un estudio examinó el papel de Drosophila KIBRA (WWC1) en la cascada de señalización Expanded-Hippo-Warts, que está involucrada en la supresión tumoral . El estudio afirmó que la aberración del número de copias, la translocación y las mutaciones puntuales de WWC2, así como otros genes, deberían investigarse más a fondo en los cánceres humanos. [14] El alias de WWC2, BOMB, se investigó en una subvención que sugería que BOMB, junto con otros dos genes ( APOL6 y APOL1 ) promovían la muerte celular en células HCT116 p53 -nulas .
Referencias
- ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000151718 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000031563 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
- ^ AceView. NCBI. Homo sapiens WWC2. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/Research/Acembly/av.cgi?db=human&term=WWC2&submit=Go
- ^ Fichas genéticas. WWC2. Homo sapiens. https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=WWC2&search=wwc2
- ^ Tarjetas genéticas. KIBRA. Homo Sapiens. https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=WWC1
- ^ Banco de trabajo SDSC. Programa SAPS. WWC2. Homo sapiens
- ^ Banco de trabajo SDSC. Programa PI. WWC2. Homo sapiens
- ^ Wennmann DO, Schmitz J, Wehr MC, Krahn MP, Koschmal N, Gromnitza S, Schulze U, Weide T, Chekuri A, Skryabin BV, Gerke V, Pavenstädt H, Duning K, Kremerskothen J (2014). "Los hechos evolutivos y moleculares vinculan la familia de proteínas WWC con la señalización del hipopótamo". Biología Molecular y Evolución . 31 (7): 1710–23. doi : 10.1093/molbev/msu115 . PMID 24682284.
- ^ Programa ExPASy. NetPhos 2.0. http://www.cbs.dtu.dk/cgi-bin/webface2.fcgi?jobid=5341A6B500000A4BB89D0F8C&wait=20
- ^ Programa ExPASy. NetPhosK 1.0. http://www.cbs.dtu.dk/cgi-bin/webface2.fcgi?jobid=5341A89700000A4B44994EF8&wait=20
- ^ Weissbach A, Siegesmund K, Brüggemann N, Schmidt A, Kasten M, Pichler I, Muhle H, Lohmann E, Lohnau T, Schwinger E, Hagenah J, Stephani U, Pramstaller PP, Klein C, Lohmann K (noviembre de 2012). "Secuenciación del exoma en una familia con síndrome de piernas inquietas". Trastornos del movimiento . 27 (13): 1686–9. doi :10.1002/mds.25191. PMID 23192925. S2CID 11969320.
- ^ Katoh M (diciembre de 2012). "Función y genómica del cáncer de los genes de la familia FAT (revisión)". Revista Internacional de Oncología . 41 (6): 1913–8. doi :10.3892/ijo.2012.1669. PMC 3583642 . PMID 23076869.
