El coronavirus relacionado con el SARS es miembro del género Betacoronavirus (grupo 2) y monotípico del subgénero Sarbecovirus (subgrupo B). [13] Los sarbecovirus, a diferencia de los embecovirus o alfacoronavirus , tienen solo una proteinasa similar a la papaína (PLpro) en lugar de dos en el marco de lectura abierto ORF1ab . [14] Se determinó que el SARSr-CoV era una escisión temprana de los betacoronavirus en función de un conjunto de dominios conservados que comparte con el grupo. [15] [16]
Los murciélagos son la principal especie hospedadora reservorio de los coronavirus relacionados con el SARS, como el SARS-CoV-1 y el SARS-CoV-2. El virus ha coevolucionado en el murciélago hospedador reservorio durante un largo período de tiempo. [17] Solo recientemente se ha observado que las cepas de coronavirus relacionadas con el SARS han evolucionado hasta ser capaces de hacer el salto entre especies de los murciélagos a los humanos, como en el caso de las cepas SARS-CoV-1 y SARS-CoV-2 . [18] [8] Ambas cepas descienden de un único ancestro, pero hicieron el salto entre especies a los humanos por separado. El SARS-CoV-2 no es un descendiente directo del SARS-CoV-1. [3]
La tapa metilada de 5' y la cola poliadenilada de 3' permiten que el genoma de ARN de sentido positivo sea traducido directamente por el ribosoma de la célula huésped al ingresar el virus . [21] El SARSr-CoV es similar a otros coronavirus en que la expresión de su genoma comienza con la traducción por los ribosomas de la célula huésped de sus dos grandes marcos de lectura abiertos (ORF) superpuestos iniciales, 1a y 1b, los cuales producen poliproteínas . [19]
Inhibe la síntesis de proteínas celulares; induce la respuesta inflamatoria por el promotor NF-kappaB e IL-8 ; regula positivamente quimiocinas como IL-8 y RANTES; regula positivamente JNK, p38 MAP quinasa; induce apoptosis y detención del ciclo celular
Se conocen las funciones de varias de las proteínas virales. [26] Los ORF 1a y 1b codifican la poliproteína replicasa/transcriptasa, y los ORF 2, 4, 5 y 9a codifican, respectivamente, las cuatro proteínas estructurales principales: espícula (S), envoltura (E), membrana (M) y nucleocápside (N). [27] Los ORF posteriores también codifican ocho proteínas únicas (orf3a a orf9b), conocidas como proteínas accesorias , muchas de las cuales no tienen homólogos conocidos. Las diferentes funciones de las proteínas accesorias no se comprenden bien. [26]
Los coronavirus del SARS han sido modificados genéticamente en varios laboratorios. [28]
Filogenética
El análisis filogenético mostró que la rama evolutiva compuesta por los coronavirus de murciélago BtKY72 y BM48-31 fue el grupo base del árbol evolutivo de los CoV relacionados con el SARS, que se separó de otros CoV relacionados con el SARS antes que el SARS-CoV-1 y el SARS-CoV-2. [29] [3]
SARS-CoV
CoV de murciélago BtKY72
Murciélago CoV BM48-31
Coronavirus relacionado con el SARS-CoV-1
Coronavirus relacionado con el SARS-CoV-2
Relacionado con el SARS-CoV-1
Un árbol filogenético basado en secuencias del genoma completo del SARS-CoV-1 y coronavirus relacionados es:
Dentro de la envoltura, se encuentra la nucleocápside , que se forma a partir de múltiples copias de la proteína nucleocápside (N), que están unidas al genoma de ARN monocatenario de sentido positivo (~30 kb ) en una conformación continua de tipo cuentas en una cuerda . [55] [56] La envoltura de bicapa lipídica, las proteínas de membrana y la nucleocápside protegen al virus cuando está fuera del huésped. [57]
Ciclo vital
El coronavirus relacionado con el SARS sigue la estrategia de replicación típica de todos los coronavirus. [20] [58]
Adjunto y entrada
La unión del coronavirus relacionado con el SARS a la célula huésped está mediada por la proteína de la espícula y su receptor. [59] El dominio de unión al receptor (RBD) de la proteína de la espícula reconoce y se une al receptor de la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2). [8] Después de la unión, el virus puede entrar en la célula huésped por dos vías diferentes. La vía que sigue el virus depende de la proteasa del huésped disponible para escindir y activar la proteína de la espícula unida al receptor. [60]
Se ha demostrado que la unión de los sarbecovirus a ACE2 es una característica conservada evolutivamente , presente en muchas especies del taxón. [61]
Como alternativa, el virus puede entrar en la célula huésped directamente mediante la escisión proteolítica de la proteína de pico unida al receptor por las serina proteasas TMPRSS2 o TMPRSS11D del huésped en la superficie celular. [62] [63] En el coronavirus del SARS, la activación de la parte C-terminal de la proteína de pico desencadena la fusión de la envoltura viral con la membrana de la célula huésped al inducir cambios conformacionales que no se comprenden completamente. [64]
Traducción del genoma
Función de las proteínas no estructurales del coronavirus (nsps) [65]
Después de la fusión, la nucleocápside pasa al citoplasma , donde se libera el genoma viral. [59] El genoma actúa como un ARN mensajero , y el ribosoma de la célula traduce dos tercios del genoma, que corresponde al marco de lectura abierto ORF1a y ORF1b , en dos grandes poliproteínas superpuestas, pp1a y pp1ab.
La poliproteína pp1ab de mayor tamaño es el resultado de un desplazamiento del marco ribosómico -1 causado por una secuencia resbaladiza (UUUAAAC) y un pseudonudo de ARN corriente abajo al final del marco de lectura abierto ORF1a. [67] El desplazamiento del marco ribosómico permite la traducción continua de ORF1a seguido de ORF1b. [68]
Las poliproteínas contienen sus propias proteasas , PLpro y 3CLpro , que las escinden en diferentes sitios específicos. La escisión de la poliproteína pp1ab produce 16 proteínas no estructurales (nsp1 a nsp16). Las proteínas del producto incluyen varias proteínas de replicación como la ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp), la ARN helicasa y la exorribonucleasa (ExoN). [68]
Las dos proteasas del SARS-CoV-2 (PLpro y 3CLpro) también interfieren en la respuesta del sistema inmunitario a la infección viral al escindir tres proteínas del sistema inmunitario. PLpro escinde IRF3 y 3CLpro escinde tanto NLRP12 como TAB1 . "La escisión directa de IRF3 por NSP3 podría explicar la respuesta atenuada del IFN de tipo I observada durante las infecciones por SARS-CoV-2, mientras que la escisión mediada por NSP5 de NLRP12 y TAB1 apunta a un mecanismo molecular para la producción mejorada de IL-6 y la respuesta inflamatoria observada en pacientes con COVID-19". [69]
Replicación y transcripción
Varias proteínas de replicación no estructurales se unen para formar un complejo multiproteico de replicasa-transcriptasa (RTC). [68] La principal proteína de replicasa-transcriptasa es la ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp). Está directamente involucrada en la replicación y transcripción del ARN a partir de una cadena de ARN. Las otras proteínas no estructurales del complejo ayudan en el proceso de replicación y transcripción. [65]
La proteína nsp14 es una exorribonucleasa 3'-5' que proporciona una fidelidad extra al proceso de replicación. La exorribonucleasa proporciona una función de corrección de errores al complejo de la que carece la ARN polimerasa dependiente de ARN. De manera similar, las proteínas nsp7 y nsp8 forman una abrazadera deslizante hexadecamérica como parte del complejo que aumenta en gran medida la procesividad de la ARN polimerasa dependiente de ARN. [65] Los coronavirus requieren una mayor fidelidad y procesividad durante la síntesis de ARN debido al tamaño relativamente grande del genoma en comparación con otros virus de ARN. [70]
Una de las principales funciones del complejo replicasa-transcriptasa es transcribir el genoma viral. RdRp media directamente la síntesis de moléculas de ARN subgenómico de sentido negativo a partir del ARN genómico de sentido positivo. A esto le sigue la transcripción de estas moléculas de ARN subgenómico de sentido negativo a sus ARNm de sentido positivo correspondientes . [71]
La otra función importante del complejo replicasa-transcriptasa es replicar el genoma viral. RdRp media directamente la síntesis de ARN genómico de sentido negativo a partir del ARN genómico de sentido positivo. A esto le sigue la replicación del ARN genómico de sentido positivo a partir del ARN genómico de sentido negativo. [71]
El ARN genómico de sentido positivo replicado se convierte en el genoma de los virus de la progenie . Los diversos ARNm más pequeños son transcripciones del último tercio del genoma del virus que sigue los marcos de lectura ORF1a y ORF1b. Estos ARNm se traducen en las cuatro proteínas estructurales (S, E, M y N) que se convertirán en parte de las partículas del virus de la progenie y también en otras ocho proteínas accesorias (orf3 a orf9b) que ayudan al virus. [72]
Recombinación
Cuando dos genomas del SARS-CoV están presentes en una célula huésped, pueden interactuar entre sí para formar genomas recombinantes que pueden transmitirse a los virus de la progenie. Es probable que la recombinación ocurra durante la replicación del genoma cuando la ARN polimerasa cambia de una plantilla a otra (recombinación por elección de copia). [73] El SARS-CoV humano parece haber tenido una historia compleja de recombinación entre coronavirus ancestrales que se hospedaron en varios grupos animales diferentes. [73] [74]
Montaje y liberación
La traducción del ARN se produce dentro del retículo endoplasmático . Las proteínas estructurales virales S, E y M se desplazan a lo largo de la vía secretora hasta el compartimento intermedio del Golgi . Allí, las proteínas M dirigen la mayoría de las interacciones proteína-proteína necesarias para el ensamblaje de los virus tras su unión a la nucleocápside. [75] Los virus descendientes se liberan de la célula huésped por exocitosis a través de vesículas secretoras. [75]
^ Los términos SARSr-CoV y SARS-CoV a veces se usan indistintamente, especialmente antes del descubrimiento del SARS-CoV-2. Esto puede causar confusión cuando algunas publicaciones se refieren al SARS-CoV-1 como SARS-CoV .
Referencias
^ "Historia de la taxonomía del ICTV: coronavirus relacionado con el síndrome respiratorio agudo severo". Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Consultado el 27 de enero de 2019 .
^ "Detalles del taxón | ICTV". Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Consultado el 30 de mayo de 2024 .
^ abcd Grupo de estudio Coronaviridae del Comité Internacional de Taxonomía de Virus (marzo de 2020). «La especie coronavirus relacionado con el síndrome respiratorio agudo severo: clasificación del 2019-nCoV y denominación del SARS-CoV-2». Nature Microbiology . 5 (4): 536–544. doi : 10.1038/s41564-020-0695-z . PMC 7095448 . PMID 32123347.
^ Kohen, Jon; Kupferschmidth, Kai (28 de febrero de 2020). "Las estrategias cambian a medida que se avecina una pandemia de coronavirus". Science . 367 (6481): 962–963. Bibcode :2020Sci...367..962C. doi :10.1126/science.367.6481.962. PMID 32108093. S2CID 211556915.
^ Lau SK, Li KS, Huang Y, Shek CT, Tse H, Wang M, et al. (marzo de 2010). "La ecoepidemiología y la comparación completa del genoma de diferentes cepas del coronavirus de murciélago Rhinolophus relacionado con el síndrome respiratorio agudo severo en China revelan que los murciélagos son un reservorio de infecciones agudas y autolimitantes que permiten eventos de recombinación". Journal of Virology . 84 (6): 2808–19. doi : 10.1128/JVI.02219-09 . PMC 2826035 . PMID 20071579.
^ Branswell H (9 de noviembre de 2015). «Estudio revela que un virus similar al SARS en murciélagos tiene potencial para infectar a humanos». Stat News . Consultado el 20 de febrero de 2020 .
^ Wong AC, Li X, Lau SK, Woo PC (febrero de 2019). "Epidemiología global de los coronavirus de murciélago". Viruses . 11 (2): 174. doi : 10.3390/v11020174 . PMC 6409556 . PMID 30791586. En particular, se descubrió que los murciélagos de herradura eran el reservorio de CoV similares al SARS, mientras que las civetas de las palmeras se consideran el huésped intermedio de los SARS-CoV [43,44,45].
^ abc Ge XY, Li JL, Yang XL, Chmura AA, Zhu G, Epstein JH, et al. (noviembre de 2013). "Aislamiento y caracterización de un coronavirus similar al SARS de murciélago que utiliza el receptor ACE2". Nature . 503 (7477): 535–8. Bibcode :2013Natur.503..535G. doi :10.1038/nature12711. PMC 5389864 . PMID 24172901.
^ "Taxonomía de virus: publicación de 2018". Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Octubre de 2018. Consultado el 13 de enero de 2019 .
^ Woo PC, Huang Y, Lau SK, Yuen KY (agosto de 2010). "Análisis genómico y bioinformático de coronavirus". Viruses . 2 (8): 1804–20. doi : 10.3390/v2081803 . PMC 3185738 . PMID 21994708. Figura 2. Análisis filogenético de las ARN polimerasas dependientes de ARN (Pol) de coronavirus con secuencias genómicas completas disponibles. El árbol se construyó mediante el método de unión vecinal y se enraizó utilizando la poliproteína del virus Breda.
^ Kieny MP. "Después del ébola, surge un plan para impulsar la I+D". Red de blogs de Scientific American . Archivado desde el original el 20 de diciembre de 2016. Consultado el 13 de diciembre de 2016 .
^ "LISTA DE PATÓGENOS". Organización Mundial de la Salud . Archivado desde el original el 20 de diciembre de 2016. Consultado el 13 de diciembre de 2016 .
^ Wong AC, Li X, Lau SK, Woo PC (febrero de 2019). "Epidemiología global de los coronavirus de murciélago". Viruses . 11 (2): 174. doi : 10.3390/v11020174 . PMC 6409556 . PMID 30791586. Véase la Figura 1.
^ Woo PC, Huang Y, Lau SK, Yuen KY (agosto de 2010). "Análisis genómico y bioinformático del coronavirus". Viruses . 2 (8): 1804–20. doi : 10.3390/v2081803 . PMC 3185738 . PMID 21994708. Véase la Figura 1.
^ Woo PC, Huang Y, Lau SK, Yuen KY (agosto de 2010). "Análisis genómico y bioinformático del coronavirus". Viruses . 2 (8): 1804–20. doi : 10.3390/v2081803 . PMC 3185738 . PMID 21994708. Además, mediante un análisis filogenético posterior que utilizó tanto la secuencia completa del genoma como enfoques proteómicos, se concluyó que el SARSr-CoV es probablemente una escisión temprana del linaje Betacoronavirus [1]; Véase la Figura 2.
^ "Coronaviridae - Figuras - Virus ARN de sentido positivo - Virus ARN de sentido positivo (2011)". Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Archivado desde el original el 3 de abril de 2020. Consultado el 6 de marzo de 2020. Véase la Figura 2.
^ Gouilh MA, Puechmaille SJ, Gonzalez JP, Teeling E, Kittayapong P, Manuguerra JC (octubre de 2011). "Huellas de los ancestros del SARS-Coronavirus en colonias de murciélagos del sudeste asiático y la teoría del refugio". Infección, genética y evolución . 11 (7): 1690–702. doi : 10.1016/j.meegid.2011.06.021 . PMC 7106191 . PMID 21763784. Los ancestros de los betacoronavirus-b, es decir, los ancestros del SARSr-CoV, podrían haber sido hospedados históricamente por el ancestro común de Rhinolophidae e Hipposideridae y podrían haber evolucionado posteriormente de forma independiente en los linajes que condujeron a los betacoronavirus Rhinolophidae e Hipposideridae.
^ Cui J, Han N, Streicker D, Li G, Tang X, Shi Z, et al. (octubre de 2007). "Relaciones evolutivas entre los coronavirus de murciélago y sus huéspedes". Enfermedades infecciosas emergentes . 13 (10): 1526–32. doi :10.3201/eid1310.070448. PMC 2851503 . PMID 18258002.
^ abc Snijder EJ, Bredenbeek PJ, Dobbe JC, Thiel V, Ziebuhr J, Poon LL, et al. (agosto de 2003). "Características únicas y conservadas del genoma y el proteoma del coronavirus del SARS, una escisión temprana del linaje del grupo 2 de coronavirus". Journal of Molecular Biology . 331 (5): 991–1004. doi : 10.1016/S0022-2836(03)00865-9 . PMC 7159028 . PMID 12927536. El genoma del SARS-CoV tiene una longitud de ~29,7 kb y contiene 14 marcos de lectura abiertos (ORF) flanqueados por regiones no traducidas 5′ y 3′ de 265 y 342 nucleótidos, respectivamente (Figura 1).
^ ab Fehr AR, Perlman S (2015). "Coronavirus: una descripción general de su replicación y patogénesis". En Maier HJ, Bickerton E, Britton P (eds.). Coronavirus . Métodos en biología molecular. Vol. 1282. Springer. págs. 1–23. doi :10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN978-1-4939-2438-7. PMC 4369385 . PMID 25720466.
^ Fehr AR, Perlman S (2015). "Coronavirus: una descripción general de su replicación y patogénesis". En Maier HJ, Bickerton E, Britton P (eds.). Coronavirus . Métodos en biología molecular. Vol. 1282. Springer. págs. 1–23. doi :10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN .978-1-4939-2438-7. PMC 4369385 . PMID 25720466.
^ McBride R, Fielding BC (noviembre de 2012). "El papel de las proteínas accesorias del coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo (SARS) en la patogénesis del virus". Viruses . 4 (11): 2902–23. doi : 10.3390/v4112902 . PMC 3509677 . PMID 23202509. Véase la Tabla 1.
^ Tang X, Li G, Vasilakis N, Zhang Y, Shi Z, Zhong Y, Wang LF, Zhang S (marzo de 2009). "Evolución gradual diferencial de las proteínas funcionales del coronavirus del SARS en diferentes especies hospedadoras". BMC Evolutionary Biology . 9 (1): 52. Bibcode :2009BMCEE...9...52T. doi : 10.1186/1471-2148-9-52 . PMC 2676248 . PMID 19261195.
^ Narayanan, Krishna; Huang, Cheng; Makino, Shinji (abril de 2008). "Proteínas accesorias del coronavirus del SARS". Virus Research . 133 (1): 113–121. doi :10.1016/j.virusres.2007.10.009. ISSN 0168-1702. PMC 2720074 . PMID 18045721. Véase la Tabla 1.
^ Redondo, Natalia; Zaldívar-López, Sara; Garrido, Juan J.; Montoya, Maria (7 de julio de 2021). "Proteínas accesorias del SARS-CoV-2 en la patogénesis viral: aspectos conocidos y desconocidos". Frontiers in Immunology . 12 : 708264. doi : 10.3389/fimmu.2021.708264 . PMC 8293742 . PMID 34305949.
^ ab McBride R, Fielding BC (noviembre de 2012). "El papel de las proteínas accesorias del coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo (SARS) en la patogénesis del virus". Viruses . 4 (11): 2902–23. doi : 10.3390/v4112902 . PMC 3509677 . PMID 23202509.
^ Snijder EJ, Bredenbeek PJ, Dobbe JC, Thiel V, Ziebuhr J, Poon LL, et al. (agosto de 2003). "Características únicas y conservadas del genoma y el proteoma del coronavirus del SARS, una escisión temprana del linaje del grupo 2 de coronavirus". Journal of Molecular Biology . 331 (5): 991–1004. doi : 10.1016/S0022-2836(03)00865-9 . PMC 7159028 . PMID 12927536. Véase la Figura 1.
^ Kaina, Bernd (2021). "Sobre el origen del SARS-CoV-2: ¿Los experimentos con cultivos celulares condujeron a una mayor virulencia del virus progenitor para los humanos?". In Vivo . 35 (3): 1313–1326. doi : 10.21873/invivo.12384 . PMC 8193286 . PMID 33910809.
^ Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H; et al. (2020). "Caracterización genómica y epidemiología del nuevo coronavirus de 2019: implicaciones para los orígenes del virus y la unión al receptor". Lancet . 395 (10224): 565–574. doi :10.1016/S0140-6736(20)30251-8. PMC 7159086 . PMID 32007145.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
^ Kim, Yongkwan; Son, Kidong; Kim, Young-Sik; Lee, Sook-Young; Jheong, Weonhwa; Oem, Jae-Ku (2019). "Análisis completo del genoma de un coronavirus de murciélago similar al SARS identificado en la República de Corea". Virus Genes . 55 (4): 545–549. doi :10.1007/s11262-019-01668-w. PMC 7089380 . PMID 31076983.
^ Xu, L; Zhang, F; Yang, W; Jiang, T; Lu, G; He, B; Li, X; Hu, T; Chen, G; Feng, Y; Zhang, Y; Fan, Q; Feng, J; Zhang, H; Tu, C (febrero de 2016). "Detección y caracterización de diversos alfa- y betacoronavirus de murciélagos en China". Virologica Sinica . 31 (1): 69–77. doi :10.1007/s12250-016-3727-3. PMC 7090707 . PMID 26847648.
^ ab Li, W. (2005). "Los murciélagos son reservorios naturales de coronavirus similares al SARS". Science . 310 (5748): 676–679. Bibcode :2005Sci...310..676L. doi :10.1126/science.1118391. ISSN 0036-8075. PMID 16195424. S2CID 2971923.
^ ab Xing‐Yi Ge; Ben Hu; Zheng‐Li Shi (2015). "CORONAVIRUS EN MURCIÉLAGOS". En Lin-Fa Wang; Christopher Cowled (eds.). Murciélagos y virus: una nueva frontera de enfermedades infecciosas emergentes (Primera edición). John Wiley & Sons. págs. 127–155. doi : 10.1002/9781118818824.ch5 .
^ He, Biao; Zhang, Yuzhen; Xu, Lin; Yang, Weihong; Yang, Fanli; Feng, Yun; et al. (2014). "Identificación de diversos alfacoronavirus y caracterización genómica de un nuevo coronavirus similar al síndrome respiratorio agudo severo de murciélagos en China". J Virol . 88 (12): 7070–82. doi :10.1128/JVI.00631-14. PMC 4054348 . PMID 24719429.
^ ab Lau, Susanna KP; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes KH; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth SM; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. (2015). "La proteína ORF8 del coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo (SARS) se adquiere del coronavirus relacionado con el SARS de los murciélagos de herradura mayor mediante recombinación". Revista de Virología . 89 (20): 10532–10547. doi :10.1128/JVI.01048-15. ISSN 0022-538X. PMC 4580176 . PMID 26269185.
^ ab Xing-Yi Ge; Jia-Lu Li; Xing-Lou Yang; et al. (2013). "Aislamiento y caracterización de un coronavirus similar al SARS de murciélago que utiliza el receptor ACE2". Nature . 503 (7477): 535–8. Bibcode :2013Natur.503..535G. doi :10.1038/nature12711. PMC 5389864 . PMID 24172901.
^ Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; et al. (2016). "Aislamiento y caracterización de un nuevo coronavirus de murciélago estrechamente relacionado con el progenitor directo del coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo". Journal of Virology . 90 (6): 3253–6. doi :10.1128/JVI.02582-15. PMC 4810638 . PMID 26719272.
^ Ben, Hu; Hua, Guo; Peng, Zhou; Zheng-Li, Shi (2020). "Características del SARS-CoV-2 y la COVID-19". Nature Reviews Microbiology . 19 (3): 141–154. doi :10.1038/s41579-020-00459-7. PMC 7537588 . PMID 33024307.
^ ab Zhou H, Ji J, Chen X, Bi Y, Li J, Wang Q, et al. (agosto de 2021). "La identificación de nuevos coronavirus de murciélago arroja luz sobre los orígenes evolutivos del SARS-CoV-2 y virus relacionados". Cell . 184 (17): 4380–4391.e14. doi :10.1016/j.cell.2021.06.008. PMC 8188299 . PMID 34147139.
^ ab Wacharapluesadee S, Tan CW, Maneeorn P, Duengkae P, Zhu F, Joyjinda Y, et al. (febrero de 2021). "Evidencia de coronavirus relacionados con el SARS-CoV-2 que circulan en murciélagos y pangolines en el sudeste asiático". Comunicaciones de la naturaleza . 12 (1): 972. Código bibliográfico : 2021NatCo..12..972W. doi : 10.1038/s41467-021-21240-1 . PMC 7873279 . PMID 33563978.
^ Murakami S, Kitamura T, Suzuki J, Sato R, Aoi T, Fujii M, et al. (diciembre de 2020). "Detección y caracterización de sarbecovirus de murciélago filogenéticamente relacionado con SARS-CoV-2, Japón". Enfermedades infecciosas emergentes . 26 (12): 3025–3029. doi :10.3201/eid2612.203386. PMC 7706965 . PMID 33219796.
^ ab Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, et al. (junio de 2020). "Un nuevo coronavirus de murciélago estrechamente relacionado con el SARS-CoV-2 contiene inserciones naturales en el sitio de escisión S1/S2 de la proteína Spike". Current Biology . 30 (11): 2196–2203.e3. doi :10.1016/j.cub.2020.05.023. PMC 7211627 . PMID 32416074.
^ Lam TT, Jia N, Zhang YW, Shum MH, Jiang JF, Zhu HC y otros. (julio de 2020). "Identificación de coronavirus relacionados con el SARS-CoV-2 en pangolines malayos". Naturaleza . 583 (7815): 282–285. Código Bib :2020Natur.583..282L. doi :10.1038/s41586-020-2169-0. PMID 32218527. S2CID 214683303.
^ Xiao K, Zhai J, Feng Y, Zhou N, Zhang X, Zou JJ y otros. (julio de 2020). "Aislamiento de coronavirus relacionado con el SARS-CoV-2 de pangolines malayos". Naturaleza . 583 (7815): 286–289. Código Bib :2020Natur.583..286X. doi :10.1038/s41586-020-2313-x. PMID 32380510. S2CID 256822274.
^ ab Delaune D, Hul V, Karlsson EA, Hassanin A, Ou TP, Baidaliuk A, et al. (noviembre de 2021). "Un nuevo coronavirus relacionado con el SARS-CoV-2 en murciélagos de Camboya". Comunicaciones de la naturaleza . 12 (1): 6563. Código bibliográfico : 2021NatCo..12.6563D. doi :10.1038/s41467-021-26809-4. PMC 8578604 . PMID 34753934.
^ Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, et al. (junio de 2020). "Un nuevo coronavirus de murciélago estrechamente relacionado con el SARS-CoV-2 contiene inserciones naturales en el sitio de escisión S1/S2 de la proteína Spike". Current Biology . 30 (11): 2196–2203.e3. doi :10.1016/j.cub.2020.05.023. PMC 7211627 . PMID 32416074.
^ Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. (marzo de 2020). "Un brote de neumonía asociado con un nuevo coronavirus de probable origen en murciélagos". Nature . 579 (7798): 270–273. Bibcode :2020Natur.579..270Z. doi :10.1038/s41586-020-2012-7. PMC 7095418 . PMID 32015507.
^ Temmam S, Vongphayloth K, Baquero E, Munier S, Bonomi M, Regnault B, et al. (abril de 2022). "Coronavirus de murciélago relacionados con el SARS-CoV-2 e infecciosos para las células humanas". Naturaleza . 604 (7905): 330–336. Código Bib :2022Natur.604..330T. doi :10.1038/s41586-022-04532-4. PMID 35172323. S2CID 246902858.
^ Sonnevend, Julia (diciembre de 2020). Alexander, Jeffrey C.; Jacobs, Ronald N.; Smith, Philip (eds.). "Un virus como icono: la pandemia de 2020 en imágenes" (PDF) . American Journal of Cultural Sociology . 8 (3: La crisis de la COVID y la sociología cultural: juntos y solos ). Basingstoke : Palgrave Macmillan : 451–461. doi : 10.1057/s41290-020-00118-7 . eISSN: 2049-7121. ISSN: 2049-7113. PMC: 7537773. PMID: 33042541 .
^ Goldsmith CS, Tatti KM, Ksiazek TG, Rollin PE, Comer JA, Lee WW, et al. (febrero de 2004). "Caracterización ultraestructural del coronavirus del SARS". Enfermedades infecciosas emergentes . 10 (2): 320–6. doi :10.3201/eid1002.030913. PMC 3322934 . PMID 15030705. Los viriones adquirieron una envoltura al gemar en las cisternas y formaron partículas principalmente esféricas, a veces pleomórficas, que promediaron 78 nm de diámetro (Figura 1A).
^ Neuman BW, Adair BD, Yoshioka C, Quispe JD, Orca G, Kuhn P, et al. (agosto de 2006). "Arquitectura supramolecular del coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo revelada por criomicroscopía electrónica". Journal of Virology . 80 (16): 7918–28. doi :10.1128/JVI.00645-06. PMC 1563832 . PMID 16873249. Los diámetros de las partículas oscilaron entre 50 y 150 nm, excluyendo las espigas, con diámetros de partícula medios de 82 a 94 nm; Véase también la Figura 1 para la doble capa.
^ Lai MM, Cavanagh D (1997). "La biología molecular de los coronavirus". Avances en la investigación de virus . 48 : 1–100. doi : 10.1016/S0065-3527(08)60286-9 . ISBN9780120398485. PMC 7130985 . PMID 9233431.
^ Masters PS (1 de enero de 2006). La biología molecular de los coronavirus . Avances en la investigación de virus. Vol. 66. Academic Press. págs. 193-292. doi :10.1016/S0065-3527(06)66005-3. ISBN9780120398690. PMC 7112330 . PMID 16877062. Sin embargo, la interacción entre la proteína S y el receptor sigue siendo el determinante principal, si no el único, del rango de especies hospedadoras del coronavirus y del tropismo tisular.
^ Cui J, Li F, Shi ZL (marzo de 2019). "Origen y evolución de los coronavirus patógenos". Nature Reviews. Microbiology . 17 (3): 181–192. doi :10.1038/s41579-018-0118-9. PMC 7097006 . PMID 30531947. Diferentes cepas de SARS-CoV aisladas de varios hospedadores varían en sus afinidades de unión para la ECA2 humana y, en consecuencia, en su infectividad de las células humanas76,78 (Fig. 6b)
^ Fehr AR, Perlman S (2015). "Coronavirus: una descripción general de su replicación y patogénesis". En Maier HJ, Bickerton E, Britton P (eds.). Coronavirus . Métodos en biología molecular. Vol. 1282. Springer. págs. 1–23. doi :10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN .978-1-4939-2438-7. PMC 4369385 . PMID 25720466. Ver sección: Estructura del virión.
^ Chang CK, Hou MH, Chang CF, Hsiao CD, Huang TH (marzo de 2014). "La proteína de la nucleocápside del coronavirus del SARS: formas y funciones". Antiviral Research . 103 : 39–50. doi : 10.1016/j.antiviral.2013.12.009 . PMC 7113676 . PMID 24418573. Véase la Figura 4c.
^ Neuman BW, Kiss G, Kunding AH, Bhella D, Baksh MF, Connelly S, et al. (abril de 2011). "Un análisis estructural de la proteína M en el ensamblaje y la morfología del coronavirus". Journal of Structural Biology . 174 (1): 11–22. doi :10.1016/j.jsb.2010.11.021. PMC 4486061 . PMID 21130884. Véase la Figura 10.
^ Lal SK, ed. (2010). Biología molecular del coronavirus SARS . doi :10.1007/978-3-642-03683-5. ISBN978-3-642-03682-8.
^ ab Fehr AR, Perlman S (2015). "Coronavirus: una descripción general de su replicación y patogénesis". En Maier HJ, Bickerton E, Britton P (eds.). Coronavirus . Métodos en biología molecular. Vol. 1282. Springer. págs. 1–23. doi :10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN978-1-4939-2438-7. PMC 4369385 . PMID 25720466. Ver sección: Ciclo de vida del coronavirus: adhesión y entrada
^ ab Simmons G, Zmora P, Gierer S, Heurich A, Pöhlmann S (diciembre de 2013). "Activación proteolítica de la proteína de pico del coronavirus SARS: enzimas de corte en la vanguardia de la investigación antiviral". Investigación antiviral . 100 (3): 605–14. doi :10.1016/j.antiviral.2013.09.028. PMC 3889862 . PMID 24121034. Véase la Figura 2.
^ Starr, Tyler N.; Zepeda, Samantha K.; Walls, Alexandra C.; Greaney, Allison J.; Alkhovsky, Sergey; Veesler, David; Bloom, Jesse D. (1 de marzo de 2022). "La unión de ACE2 es un rasgo ancestral y evolutivo de los sarbecovirus". Nature . 603 (7903): 913–918. Bibcode :2022Natur.603..913S. doi :10.1038/s41586-022-04464-z. ISSN 1476-4687. PMC 8967715 . PMID 35114688.
^ Heurich A, Hofmann-Winkler H, Gierer S, Liepold T, Jahn O, Pöhlmann S (enero de 2014). "TMPRSS2 y ADAM17 escinden ACE2 de forma diferencial y solo la proteólisis por TMPRSS2 aumenta la entrada impulsada por la proteína de pico del coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo". Journal of Virology . 88 (2): 1293–307. doi :10.1128/JVI.02202-13. PMC 3911672 . PMID 24227843. El SARS-CoV puede secuestrar dos sistemas proteolíticos celulares para asegurar el procesamiento adecuado de su proteína S. La escisión del SARS-S puede ser facilitada por la catepsina L, una proteasa de la célula huésped endo/lisosomal dependiente del pH, tras la captación de viriones en los endosomas de la célula diana (25). Como alternativa, las serina proteasas transmembrana tipo II (TTSP) TMPRSS2 y HAT pueden activar el SARS-S, presumiblemente mediante la escisión del SARS-S en la superficie celular o cerca de ella, y la activación del SARS-S por TMPRSS2 permite la entrada celular independiente de la catepsina L (26,–28).
^ Zumla A, Chan JF, Azhar EI, Hui DS, Yuen KY (mayo de 2016). "Coronavirus: descubrimiento de fármacos y opciones terapéuticas". Nature Reviews. Drug Discovery . 15 (5): 327–47. doi :10.1038/nrd.2015.37. PMC 7097181 . PMID 26868298. S se activa y se escinde en las subunidades S1 y S2 por otras proteasas del huésped, como la proteasa transmembrana serina 2 (TMPRSS2) y TMPRSS11D, lo que permite la entrada del virus no endosómico a la superficie celular en la membrana plasmática.
^ Li Z, Tomlinson AC, Wong AH, Zhou D, Desforges M, Talbot PJ, et al. (octubre de 2019). "La estructura de la proteína S del coronavirus humano HCoV-229E y la unión al receptor". eLife . 8 . doi : 10.7554/eLife.51230 . PMC 6970540 . PMID 31650956.
^ abc Fehr AR, Perlman S (2015). "Coronavirus: una descripción general de su replicación y patogénesis". En Maier HJ, Bickerton E, Britton P (eds.). Coronavirus . Métodos en biología molecular. Vol. 1282. Springer. págs. 1–23. doi :10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN978-1-4939-2438-7. PMC 4369385 . PMID 25720466. Véase la Tabla 2.
^ Rao, S; Hoskins, I; Tonn, T; Garcia, PD; Ozadam, H; Sarinay Cenik, E; Cenik, C (septiembre de 2021). "Los genes con tractos de oligopirimidina en la terminal 5' escapan preferentemente a la supresión global de la traducción por la proteína Nsp1 del SARS-CoV-2". ARN . 27 (9): 1025–1045. doi :10.1261/rna.078661.120. PMC 8370740 . PMID 34127534.
^ Masters PS (1 de enero de 2006). "La biología molecular de los coronavirus". Avances en la investigación de virus . 66 . Academic Press: 193–292. doi : 10.1016/S0065-3527(06)66005-3 . ISBN9780120398690. PMC 7112330 . PMID 16877062. Véase la Figura 8.
^ abc Fehr AR, Perlman S (2015). "Coronavirus: una descripción general de su replicación y patogénesis". En Maier HJ, Bickerton E, Britton P (eds.). Coronavirus . Métodos en biología molecular. Vol. 1282. Springer. págs. 1–23. doi :10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN978-1-4939-2438-7. PMC 4369385 . PMID 25720466. Ver sección: Expresión de la proteína replicasa
^ Mehdi Moustaqil (5 de junio de 2020). "Las proteasas del SARS-CoV-2 escinden IRF3 y moduladores críticos de las vías inflamatorias (NLRP12 y TAB1): implicaciones para la presentación de enfermedades en distintas especies y la búsqueda de huéspedes reservorios". bioRxiv : 2020.06.05.135699. doi : 10.1101/2020.06.05.135699 . S2CID 219604020.
^ Sexton NR, Smith EC, Blanc H, Vignuzzi M, Peersen OB, Denison MR (agosto de 2016). "Identificación basada en homología de una mutación en la ARN polimerasa dependiente del ARN del coronavirus que confiere resistencia a múltiples mutágenos". Journal of Virology . 90 (16): 7415–28. doi :10.1128/JVI.00080-16. PMC 4984655 . PMID 27279608. Finalmente, estos resultados, combinados con los de trabajos anteriores (33, 44), sugieren que los CoV codifican al menos tres proteínas implicadas en la fidelidad (nsp12-RdRp, nsp14-ExoN y nsp10), lo que respalda el ensamblaje de un complejo de fidelidad de replicasa multiproteica, como se describió anteriormente (38).
^ ab Fehr AR, Perlman S (2015). "Coronavirus: una descripción general de su replicación y patogénesis". En Maier HJ, Bickerton E, Britton P (eds.). Coronavirus . Métodos en biología molecular. Vol. 1282. Springer. págs. 1–23. doi :10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN978-1-4939-2438-7. PMC 4369385 . PMID 25720466. Ver sección: Ciclo de vida de Corona: replicación y transcripción
^ Fehr AR, Perlman S (2015). "Coronavirus: una descripción general de su replicación y patogénesis". En Maier HJ, Bickerton E, Britton P (eds.). Coronavirus . Métodos en biología molecular. Vol. 1282. Springer. págs. 1–23. doi :10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN .978-1-4939-2438-7. PMC 4369385 . PMID 25720466. Véase la Figura 1.
^ ab Zhang XW, Yap YL, Danchin A. Prueba de la hipótesis de un origen recombinante del coronavirus asociado al SARS. Arch Virol. 2005 enero;150(1):1-20. Publicación electrónica 11 de octubre de 2004. PMID 15480857
^ Stanhope MJ, Brown JR, Amrine-Madsen H. Evidencia del análisis evolutivo de secuencias de nucleótidos para una historia recombinante del SARS-CoV. Infect Genet Evol. 2004 Mar;4(1):15-9. PMID 15019585
^ ab Fehr AR, Perlman S (2015). "Coronavirus: una descripción general de su replicación y patogénesis". En Maier HJ, Bickerton E, Britton P (eds.). Coronavirus . Métodos en biología molecular. Vol. 1282. Springer. págs. 1–23. doi :10.1007/978-1-4939-2438-7_1. ISBN978-1-4939-2438-7. PMC 4369385 . PMID 25720466. Consulte la sección: Ciclo de vida del coronavirus: ensamblaje y lanzamiento
Lectura adicional
Peiris JS, Lai ST, Poon LL, Guan Y, Yam LY, Lim W, et al. (abril de 2003). "El coronavirus como posible causa del síndrome respiratorio agudo severo". Lancet . 361 (9366): 1319–25. doi : 10.1016/s0140-6736(03)13077-2 . PMC 7112372 . PMID 12711465.
Rota PA, Oberste MS, Monroe SS, Nix WA, Campagnoli R, Icenogle JP, et al. (mayo de 2003). "Caracterización de un nuevo coronavirus asociado con el síndrome respiratorio agudo severo". Science . 300 (5624): 1394–9. Bibcode :2003Sci...300.1394R. doi : 10.1126/science.1085952 . PMID 12730500.
Marra MA, Jones SJ, Astell CR, Holt RA, Brooks-Wilson A, Butterfield YS, et al. (mayo de 2003). "La secuencia del genoma del coronavirus asociado al SARS". Science . 300 (5624): 1399–404. Bibcode :2003Sci...300.1399M. doi : 10.1126/science.1085953 . PMID 12730501.
Snijder EJ, Bredenbeek PJ, Dobbe JC, Thiel V, Ziebuhr J, Poon LL, et al. (agosto de 2003). "Características únicas y conservadas del genoma y el proteoma del coronavirus del SARS, una escisión temprana del linaje del grupo 2 de coronavirus". Journal of Molecular Biology . 331 (5): 991–1004. CiteSeerX 10.1.1.319.7007 . doi :10.1016/S0022-2836(03)00865-9. PMC 7159028 . PMID 12927536. S2CID 14974326.
Yount B, Roberts RS, Lindesmith L, Baric RS (agosto de 2006). "Reconfiguración del circuito de transcripción del coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV): ingeniería de un genoma resistente a la recombinación". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 103 (33): 12546–51. Bibcode :2006PNAS..10312546Y. doi : 10.1073/pnas.0605438103 . PMC 1531645 . PMID 16891412.
Enjuanes L, Sola I, Zúñiga S, Almazán F (2008). "Replicación del coronavirus e interacción con el huésped". En Mettenleiter TC, Sobrino F (eds.). Virus animales: biología molecular . Caister Academic Press. ISBN978-1-904455-22-6.
Enlaces externos
Medios relacionados con el coronavirus relacionado con el síndrome respiratorio agudo severo en Wikimedia Commons
Datos relacionados con el coronavirus relacionado con el SARS en Wikispecies
Comunicado de prensa de la OMS en el que se identifica y nombra el virus del SRAS (archivado el 23 de abril de 2003)
El mapa genético del virus del SARS Archivado el 18 de agosto de 2006 en Wayback Machine.
Especial de ciencia sobre el virus del SARS (contenido gratuito: no requiere registro)
Recursos sobre el SARS de la Universidad McGill en Wayback Machine (archivados el 1 de marzo de 2005)
Página de inicio sobre el SARS de los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) de los EE. UU. (archivada el 12 de abril de 2016)