16BO133
| 16BO133 | |
|---|---|
Clasificación de virus  | |
| (sin clasificar): | Virus |
| Reino : | Riboviridae |
| Reino: | Virus de la ortiga |
| Filo: | Pisuviricota |
| Clase: | Pisoniviricetes |
| Orden: | Nidovirus |
| Familia: | Coronavirus |
| Género: | Betacoronavirus |
| Subgénero: | Sarbecovirus |
| Especies: | |
| Cepa: | 16BO133 |
16BO133 es un coronavirus similar al SARS (SL-COV) que se encontró en el murciélago de herradura mayor en Corea del Sur . Se publicó en 2019 y su genoma fue secuenciado por completo. La cepa coreana secuenciada del SARSr-CoV pertenece al coronavirus 1 del síndrome respiratorio agudo severo y su similitud de secuencia genómica es del 82,8%.
Descubrimiento
El virus 16BO133 fue descubierto en la cavidad oral del murciélago de herradura mayor en 2016. El genoma de esta cepa de virus es de 29075 nt. Entre los SARSr-CoV, 16BO133 es el más cercano al virus JTMC15, que fue publicado en 2016 y descubierto en Jilin , China, con una similitud de secuencia de ácido nucleico del genoma del 98,3%. En comparación con otros SARSr-CoV, estos dos virus tienen la cepa ORF8 debido a una mutación de cambio de marco al final de ORF7b. [1] [2] La similitud de la secuencia de ácido nucleico del genoma del virus 16BO133 y el SARS-CoV es del 82,8%. [3]
Aunque en el pasado se han encontrado otras cepas del SARSr-CoV en Corea (virus B15-21, etc.), ninguna de ellas ha sido secuenciada. [4] El virus 16BO133 es la primera cepa coreana del SARSr-CoV que ha sido completamente secuenciada. [1]
Filogenético
Un árbol filogenético basado en secuencias del genoma completo del SARS-CoV-1 y coronavirus relacionados es:
| Coronavirus relacionado con el SARS-CoV-1 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SARS-CoV-2 , 79% frente a SARS-CoV-1 [13] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Véase también
Referencias
- ^ ab Kim Y, Son K, Kim YS, Lee SY, Jheong W, Oem JK (2019). "Análisis completo del genoma de un coronavirus de murciélago similar al SARS identificado en la República de Corea". Virus Genes . 55 (4): 545–549. doi :10.1007/s11262-019-01668-w. PMC 7089380 . PMID 31076983.
- ^ Xu L, Zhang F, Yang W, Jiang T, Lu G, He B, et al. (2016). "Detección y caracterización de diversos alfa- y betacoronavirus de murciélagos en China". Virol Sin . 31 (1): 69–77. doi :10.1007/s12250-016-3727-3. PMC 7090707 . PMID 26847648.
- ^ Na EJ, Lee SY, Kim HJ, Oem JK (2021). "Análisis genéticos comparativos de coronavirus de murciélago coreanos con SARS-CoV y el recién surgido SARS-CoV-2". J Vet Sci . 22 (1): e12. doi :10.4142/jvs.2021.22.e12. PMC 7850784 . PMID 33522164.
- ^ Kim HK, Yoon SW, Kim DJ, Koo BS, Noh JY, Kim JH, et al. (2016). "Detección de coronavirus de murciélago similares al síndrome respiratorio agudo severo, similares al síndrome respiratorio de Oriente Medio y rotavirus del grupo H en heces de murciélagos coreanos". Transbound Emerg Dis . 63 (4): 365–72. doi :10.1111/tbed.12515. PMC 7169817 . PMID 27213718.
- ^ Kim, Yongkwan; Son, Kidong; Kim, Young-Sik; Lee, Sook-Young; Jheong, Weonhwa; Oem, Jae-Ku (2019). "Análisis completo del genoma de un coronavirus de murciélago similar al SARS identificado en la República de Corea". Virus Genes . 55 (4): 545–549. doi :10.1007/s11262-019-01668-w. PMC 7089380 . PMID 31076983.
- ^ Xu, L; Zhang, F; Yang, W; Jiang, T; Lu, G; He, B; Li, X; Hu, T; Chen, G; Feng, Y; Zhang, Y; Fan, Q; Feng, J; Zhang, H; Tu, C (febrero de 2016). "Detección y caracterización de diversos alfa- y betacoronavirus de murciélagos en China". Virologica Sinica . 31 (1): 69–77. doi :10.1007/s12250-016-3727-3. PMC 7090707 . PMID 26847648.
- ^ ab Li, W. (2005). "Los murciélagos son reservorios naturales de coronavirus similares al SARS". Science . 310 (5748): 676–679. Bibcode :2005Sci...310..676L. doi :10.1126/science.1118391. ISSN 0036-8075. PMID 16195424. S2CID 2971923.
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- ^ He, Biao; Zhang, Yuzhen; Xu, Lin; Yang, Weihong; Yang, Fanli; Feng, Yun; et al. (2014). "Identificación de diversos alfacoronavirus y caracterización genómica de un nuevo coronavirus similar al síndrome respiratorio agudo severo de murciélagos en China". J Virol . 88 (12): 7070–82. doi :10.1128/JVI.00631-14. PMC 4054348 . PMID 24719429.
- ^ ab Lau, Susanna KP; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes KH; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth SM; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. (2015). "La proteína ORF8 del coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo (SARS) se adquiere del coronavirus relacionado con el SARS de los murciélagos de herradura mayor mediante recombinación". Revista de Virología . 89 (20): 10532–10547. doi :10.1128/JVI.01048-15. ISSN 0022-538X. PMC 4580176 . PMID 26269185.
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- ^ Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; et al. (2016). "Aislamiento y caracterización de un nuevo coronavirus de murciélago estrechamente relacionado con el progenitor directo del coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo". Journal of Virology . 90 (6): 3253–6. doi :10.1128/JVI.02582-15. PMC 4810638 . PMID 26719272.
- ^ Ben, Hu; Hua, Guo; Peng, Zhou; Zheng-Li, Shi (2020). "Características del SARS-CoV-2 y la COVID-19". Nature Reviews Microbiology . 19 (3): 141–154. doi :10.1038/s41579-020-00459-7. PMC 7537588 . PMID 33024307.
