5-Metiluridina

Uno de los cinco nucleósidos principales de los ácidos nucleicos.
5-Metiluridina
Fórmula esquelética de la 5-metiluridina
Modelo de relleno espacial de la molécula de 5-metiluridina
Nombres
Nombre IUPAC
5-Metiluridina
Nombre sistemático de la IUPAC
1-[(2 R ,3 R ,4 S ,5 R )-3,4-Dihidroxi-5-(hidroximetil)oxolan-2-il]-5-metilpirimidina-2,4(1 H ,3 H )-diona
Otros nombres
Ribotimidina, Ribosiltimina; Ribósido de timina, m5U
Identificadores
  • 1463-10-1 controlarY
Modelo 3D ( JSmol )
  • Imagen interactiva
Araña química
  • 393058 ☒norte
Tarjeta informativa de la ECHA100.014.522
Identificador de centro de PubChem
  • 445408
UNIVERSIDAD
  • ZS1409014A controlarY
  • DTXSID20163348
  • InChI=1S/C10H14N2O6/c1-4-2-12(10(17)11-8(4)16)9-7(15)6(14)5(3-13)18-9/h2,5-7,9,13-15H,3H2,1H3,(H,11,16,17)/t5-,6-,7-,9-/m1/s1 ☒norte
    Clave: DWRXFEITVBNRMK-JXOAFFINSA-N ☒norte
  • InChI=1/C10H14N2O6/c1-4-2-12(10(17)11-8(4)16)9-7(15)6(14)5(3-1 3)18-9/h2,5-7,9,13-15H,3H2,1H3,(H,11,16,17)/t5-,6-,7-,9-/m1/s1
    Clave: DWRXFEITVBNRMK-JXOAFFINBW
  • CC1=CN(C(=O)NC1=O)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O
Propiedades
C10H14N2O6
Masa molar258,23 g/mol
Densidad1,6 g/cm3 [ 1]
Punto de fusión184 [2]  °C (363 °F; 457 K)
Salvo que se indique lo contrario, los datos se proporcionan para los materiales en su estado estándar (a 25 °C [77 °F], 100 kPa).
☒norte verificar  ( ¿qué es   ?)controlarY☒norte
Compuesto químico

El compuesto químico 5-metiluridina ( símbolo m 5 U o m5U ), también llamado ribotimidina (rT) [nota al pie 1] , es un nucleósido de pirimidina . Es el ribonucleósido homólogo del desoxirribonucleósido timidina , que carece de un grupo hidroxilo en la posición 2'. La 5-metiluridina contiene una base de timina unida a un azúcar ribosa pentosa . [4] Es un sólido blanco .

La m5U es una de las modificaciones más comunes que se realizan en el ARN celular. Se presenta casi universalmente en la posición 54 (parte del brazo T ) del ARNt eucariota y bacteriano , y sirve para estabilizar la molécula. El mismo motivo de "bucle T" se presenta en muchas otras formas de ARN no codificante, como el ARNtm y el ARNr . La pérdida de la modificación del ARNt no suele producir un fenotipo diferente, menos adecuado. [5]

Véase también

Notas al pie

  1. ^ El término ribotimidina se utiliza especialmente para describir su aparición inusual en el ARN. [3]

Referencias

  1. ^ "5-Metiluridina". ChemSpider . Consultado el 6 de diciembre de 2018 .
  2. ^ William M. Haynes (2016). Manual de química y física del CRC (97.ª edición). Boca Raton: CRC Press. pág. 3-400. ISBN 978-1-4987-5429-3.
  3. ^ Principios de bioquímica de Lehninger (6.ª ed.). WH Freeman and Company . 2013. pág. 282. ISBN. 9781429234146.
  4. ^ Shobbir Hussain (2019). "Métodos basados ​​en reticulación catalítica para la elaboración de perfiles enzimáticos específicos de modificaciones de ribonucleótidos de ARN". Métodos . 156 : 60–65. doi :10.1016/j.ymeth.2018.10.003. PMID  30308313. S2CID  52961265.
  5. ^ Powell, CA; Minczuk, M (abril de 2020). "TRMT2B es responsable de la metilación de m(5)U del ARNt y del ARNr en las mitocondrias humanas". RNA Biology . 17 (4): 451–462. doi : 10.1080/15476286.2020.1712544 . PMC 7237155 . PMID  31948311. 
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