El brazo en T tiene dos componentes: el vástago en T y el bucle en T.
El tallo T consta de una serie de nucleótidos pareados, normalmente 5 pares, pero a veces tan solo 1 o hasta 6. [1] [2]
El bucle T también se conoce como brazo TΨC debido a la presencia de residuos de ribotimidina (T/m5U), pseudouridina y citidina . Se pliega en un elemento estructural único que consiste en bases apiladas en un giro en U, ahora denominado "motivo de bucle T". [3]
En las arqueas, la m5U se reemplaza por N1-metilpseudouridina (m1Ψ). Se cree que la modificación m5U/m1Ψ en la posición 54 aumenta la estabilidad estructural. [4]
Los organismos con bucle T que carece de ARNt muestran un nivel mucho menor de aminoacilación y unión de EF-Tu que los organismos que tienen el ARNt nativo. [ cita requerida ]
El motivo de bucle T se ha identificado como un elemento estructural omnipresente en varios ARN no codificantes. [3] Al menos otra instancia del bucle T, encontrada en el ARNr, también lleva la modificación m5U. [5]
Referencias
^ Lang, B. Franz; Lavrov, Dennis; Beck, Natacha; Steinberg, Sergey V. (2012). "Estructura, identidad y evolución del código genético del ARNt mitocondrial". En Bullerwell, Charles E. (ed.). Genética de orgánulos . Berlín: Springer. págs. 431–474. doi :10.1007/978-3-642-22380-8_17. ISBN .9783642223792.
^ Dirheimer, G.; Keith, G.; Dumas, P.; Westhof, E. (1995). "Estructuras primarias, secundarias y terciarias de ARNt". En Söll, Dieter; RajBhandary, Uttam (eds.). ARNt: estructura, biosíntesis y función . Washington, DC: Prensa ASM. págs. 93-126. doi :10.1128/9781555818333.ch8. ISBN9781555810733.
^ ab Chan, CW; Chetnani, B; Mondragón, A (septiembre de 2013). "Estructura y función del motivo estructural T-loop en ARN no codificantes". Wiley Interdisciplinary Reviews. ARN . 4 (5): 507–22. doi :10.1002/wrna.1175. PMC 3748142 . PMID 23754657.
^ Wurm JP, Griese M, Bahr U, Held M, Heckel A, Karas M, et al. (marzo de 2012). "Identificación de la enzima responsable de la metilación N1 de pseudouridina 54 en ARNt de arqueas". ARN . 18 (3): 412–420. doi :10.1261/rna.028498.111. PMC 3285930 . PMID 22274954. Por el contrario, en la mayoría de las arqueas esta posición está ocupada por otro nucleótido hipermodificado: la pseudouridina isostérica metilada en N1.
^ Powell, CA; Minczuk, M (abril de 2020). "TRMT2B es responsable de la metilación m(5)U del ARNt y del ARNr en las mitocondrias humanas". RNA Biology . 17 (4): 451–462. doi :10.1080/15476286.2020.1712544. PMC 7237155 . PMID 31948311.