Timidina

Compuesto químico
Timidina
Fórmula esquelética de la timidina
Modelo de bolas y palos de la molécula de timidina
Nombres
Nombre IUPAC
Timidina
Nombre sistemático de la IUPAC
1-[(2 R ,4 S ,5 R )-4-Hidroxi-5-(hidroximetil)oxolan-2-il]-5-metilpirimidina-2,4(1 H ,3 H )-diona
Otros nombres
Desoxitimidina, Td, dT, 1-[(2 R ,4 S ,5 R )-4-Hidroxi-5-(hidroximetil)tetrahidrofur-2-il]-5-metil-1,3-dihidropirimidina-2,4-diona
Identificadores
  • 50-89-5 controlarY
Modelo 3D ( JSmol )
  • Imagen interactiva
Química biológica
  • ChEMBL52609 ☒norte
Araña química
  • 5585 ☒norte
Banco de medicamentos
  • DB04485 ☒norte
Tarjeta informativa de la ECHA100.000.065
  • 4718
MallaDesoxitimidina
Identificador de centro de PubChem
  • 1134
UNIVERSIDAD
  • VC2W18DGKR ☒norte
  • DTXSID5023661
  • InChI=1S/C10H14N2O5/c1-5-3-12(10(16)11-9(5)15)8-2-6(14)7(4-13)17-8/h3,6-8, 13-14H,2,4H2,1H3,(H,11,15,16)/t6-,7+,8+/m0/s1 ☒norte
    Clave: IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N ☒norte
  • InChI=1/C10H14N2O5/c1-5-3-12(10(16)11-9(5)15)8-2-6(14)7(4-13)17-8/h3,6-8, 13-14H,2,4H2,1H3,(H,11,15,16)/t6-,7+,8+/m0/s1
    Clave: IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQBQ
  • Cc1cn(c(=O)[nH]c1=O)[C@H]2C[C@@H]([C@H](O2)CO)O
Propiedades
C10H14N2O5
Masa molar242,231  g·mol −1
Punto de fusión185 °C
Salvo que se indique lo contrario, los datos se proporcionan para los materiales en su estado estándar (a 25 °C [77 °F], 100 kPa).
☒norte verificar  ( ¿qué es   ?)controlarY☒norte
Compuesto químico

La timidina ( símbolo dT o dThd ), también conocida como desoxitimidina , desoxirribosiltimina o timina desoxirribosido , es un desoxinucleósido de pirimidina . La desoxitimidina es el nucleósido de ADN T, que se aparea con la desoxiadenosina (A) en el ADN bicatenario. En biología celular, se utiliza para sincronizar las células en la fase G1/S temprana. El prefijo desoxi- a menudo se omite ya que no hay precursores de nucleótidos de timina involucrados en la síntesis de ARN.

Antes del auge en el uso de timidina causado por la necesidad de timidina en la producción del fármaco antirretroviral azidotimidina (AZT), gran parte de la producción mundial de timidina provenía de esperma de arenque . [1] La timidina se encuentra casi exclusivamente en el ADN, pero también se encuentra en el bucle T del ARNt .

Estructura y propiedades

En su composición, la desoxitimidina es un nucleósido compuesto por desoxirribosa (un azúcar pentosa ) unida a la base pirimidínica timina .

La desoxitimidina se puede fosforilar con uno, dos o tres grupos de ácido fosfórico, creando dTMP ( monofosfato de desoxitimidina ) , dTDP o dTTP ( para los di- y tri -fosfatos, respectivamente) .

Existe en forma sólida como pequeños cristales blancos o polvo cristalino blanco . Tiene un peso molecular de242,229 Da y un punto de fusión de 185  °C . La estabilidad de la desoxitimidina a temperatura y presión estándar (STP) es muy alta.

La desoxitimidina no es tóxica y forma parte de uno de los cuatro nucleósidos del ADN. Es un compuesto natural que existe en todos los organismos vivos y en los virus de ADN. En lugar de timidina, el ARN contiene uridina ( uracilo unido a ribosa ). El uracilo es químicamente muy similar a la timina, que también se conoce como 5-metiluracilo. Dado que los nucleótidos de timina son precursores del ADN (pero no del ARN), a menudo se omite el prefijo "desoxi", es decir, a la desoxitimidina a menudo se la llama simplemente timidina.

La timidina está catalogada como teratógeno químico . [2]

Análogos modificados

La yododesoxiuridina es un radiosensibilizador y aumenta la cantidad de daño al ADN recibido por la radiación ionizante.

Azidotimidina (AZT): se utiliza en el tratamiento de la infección por VIH . La AZT inhibe el proceso de transcripción inversa , un paso fundamental en el ciclo de vida del virus .

La timidina radiomarcada (TdR), como la timidina tritiada ( 3 H-TdR), se utiliza habitualmente en ensayos de proliferación celular. La timidina se incorpora a las células en división y el nivel de esta incorporación, medido utilizando un contador de centelleo líquido , es proporcional a la cantidad de proliferación celular. Por ejemplo, la proliferación de linfocitos se puede medir de esta manera en trastornos linfoproliferativos .

La bromodesoxiuridina (BrdU) es otro análogo de timidina que se utiliza a menudo para la detección de células proliferantes en tejidos vivos.

La 5-etinil-2´-desoxiuridina (EdU) es un análogo de la timidina que se incorpora al ADN de las células en división y se utiliza para analizar la síntesis de ADN en cultivos celulares o tejidos vivos. Se puede visualizar mediante la unión covalente de una azida fluorescente mediante química de clic , que es menos dura que las condiciones utilizadas para exponer el epítopo de los anticuerpos BrdU.

La edoxudina es un fármaco antiviral .

La telbivudina (β- L -2′-desoxitimidina, LdT) es el enantiómero L "no natural " no modificado de la timidina que se utilizó en el tratamiento de la hepatitis B crónica . [3]

El desequilibrio de timidina induce mutación y recombinación

Durante el crecimiento del bacteriófago T4 , un exceso de disponibilidad de timidina aumenta la mutación . [4] [5] Una deficiencia de timidina durante el crecimiento también aumenta la mutación. [4] Se cultivó un auxótrofo de timidilato de la levadura diploide Saccharomyces cerevisiae en condiciones en las que los niveles de timidilato variaban desde el exceso hasta el agotamiento. [6] Se observó que los niveles altos de timidilato eran mutagénicos y recombinogénicos, mientras que la inanición de timidilato era recombinogénica pero solo ligeramente mutagénica.

Referencias

  1. ^ Makoto Ishii; Hideyuki Shirae; Kenzo Yokozeko, Producción enzimática de 5-metiluridina a partir de nucleósidos de purina y timina por Erwinia carotovora AJ-2992 , Química agrícola y biológica
  2. ^ La siguiente lista de sustancias químicas conocidas o que se cree que son teratógenas se extrajo principalmente de Dangerous Properties of Industrial Materials, 7.ª edición, de N. Irving Sax y Richard J. Lewis.
  3. ^ Gosselin, Gilles; Pierra, Claire; Benzaria-Prad, Samira; Dukhan, David; Cretton-Scott, Erika; Standring, David; Sommadossi, Jean-Pierre (2008). "LdT (telbivudina) como un análogo de nucleósido potente y específico (Tyzeka™, Sebivo™) para el tratamiento de la hepatitis B crónica". Colección Symposium Series : 244–248. doi :10.1135/css200810244. ISBN 978-80-86241-29-6.
  4. ^ ab Bernstein C, Bernstein H, Mufti S, Strom B. Estimulación de la mutación en el fago T 4 por lesiones en el gen 32 y por desequilibrio de timidina. Mutat Res. 1972 Oct;16(2):113-9. doi: 10.1016/0027-5107(72)90171-6. PMID: 4561494
  5. ^ DeVries JK, Wallace SS. Reversión de mutantes del bacteriófago T4rII mediante altos niveles de desoxirribonucleósidos de pirimidina. Mol Gen Genet. 1982;186(1):101-5. doi: 10.1007/BF00422919. PMID: 7050620
  6. ^ Eckardt F, Kunz BA, Haynes RH. Variación de las frecuencias de mutación y recombinación en un rango de concentraciones de timidilato en un auxótrofo de timidilato diploide. Curr Genet. 1983 Sep;7(5):399-402. doi: 10.1007/BF00445881. PMID: 24173422
  • http://money.cnn.com/magazines/fortune/fortune_archive/1990/11/05/74308/index.htm
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