Factor IX

F9
Estructuras disponibles AP Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación del PDB 1CFH, 1CFI, 1EDM, 1IXA, 1MGX, 1NL0, 1RFN, 2WPH, 2WPI, 2WPJ, 2WPK, 2WPL, 2WPM, 3KCG, 3LC3, 3LC5, 4YZU, 4Z0K, 4ZAE, 4WM0, 4WMA, 4WMI, 4WMK, 4WN2, 4WNH, 5EGM, 5JBC, 5JB9, 5JBB, 5JB8, 5JBA
Identificadores
Alias	F9 , F9 p22, FIX, HEMB, P19, PTC, THPH8, factor de coagulación IX, factor de coagulación sanguínea IX, factor de Christmas
Identificaciones externas	OMIM : 300746; MGI : 88384; HomoloGene : 106; Tarjetas genéticas : F9; OMA :F9 - ortólogos
Ubicación genética ( humana ) Cristo. Cromosoma X (humano) [1] Banda Xq27.1 Comenzar 139.530.739 pb [1] Fin 139.563.459 pb [1]
Ubicación del gen ( ratón ) Cristo. Cromosoma X (ratón) [2] Banda Tamaño A6|X33,5 cm Comenzar 59.044.824 pb [2] Fin 59.076.119 pb [2]
Patrón de expresión del ARN Bgee Humano Ratón (ortólogo) Top expresado en lóbulo derecho del hígado ovocito secundario gónada célula ductal pancreática piel del muslo riñón sangre sistema musculoesquelético humano sistema muscular músculo Top expresado en lóbulo izquierdo del hígado ganglio espinal lumbar vesícula biliar organismo sexualmente inmaduro diafragma torácico cabeza medial del músculo gastrocnemio giro dentado núcleo de la estría terminal corteza piriforme yeyuno Más datos de expresión de referencia BioGPS Más datos de expresión de referencia
Ontología genética Función molecular actividad endopeptidasa unión de iones metálicos actividad de peptidasa actividad de la peptidasa de tipo serina actividad hidrolasa unión de iones de calcio actividad de endopeptidasa de tipo serina unión de proteínas Componente celular luz del retículo endoplasmático membrana plasmática Luz del aparato de Golgi exosoma extracelular región extracelular espacio extracelular Matriz extracelular que contiene colágeno Proceso biológico hemostasia coagulación sanguínea, vía intrínseca activación del zimógeno Transporte mediado por vesículas del retículo endoplasmático al aparato de Golgi procesamiento de péptidos señal coagulación sanguínea, vía extrínseca carboxilación del ácido peptidil-glutámico proteólisis coagulación sanguínea Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos Especies Humano Ratón Entre 2158 14071 Conjunto ENSG00000101981 ENSMUSG00000031138 Protección unificada P00740 P16294 RefSeq (ARNm) NM_000133 NM_001313913 NM_007979 NM_001305797 RefSeq (proteína) NP_000124NP_001300842 ​ NP_001292726NP_032005 ​ Ubicación (UCSC) Cromosoma X: 139,53 – 139,56 Mb Cromosoma X: 59,04 – 59,08 Mb Búsqueda en PubMed [3] [4]
Wikidatos
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El factor IX ( EC 3.4.21.22), también conocido como factor Christmas , es una de las serina proteasas implicadas en la coagulación ; pertenece a la familia de las peptidasas S1. La deficiencia de esta proteína causa hemofilia B.

Se descubrió en 1952 después de que a un niño llamado Stephen Christmas se le detectara una deficiencia de este factor exacto, lo que le provocaba hemofilia . ^[5] El factor de coagulación IX está en la Lista de medicamentos esenciales de la Organización Mundial de la Salud . ^[6]

El factor IX se produce como un zimógeno , un precursor inactivo. Se procesa para eliminar el péptido señal , se glicosila y luego se escinde por el factor XIa (de la vía de contacto) o el factor VIIa (de la vía del factor tisular) para producir una forma de dos cadenas, donde las cadenas están unidas por un puente disulfuro . ^{[7] [8]} Cuando se activa en el factor IXa , en presencia de Ca ²⁺ , fosfolípidos de membrana y un cofactor del factor VIII, hidroliza un enlace arginina - isoleucina en el factor X para formar el factor Xa.

El factor IX es inhibido por la antitrombina . ^[7]

La expresión del factor IX aumenta con la edad en humanos y ratones. En modelos de ratón, las mutaciones dentro de la región promotora del factor IX tienen un fenotipo dependiente de la edad. ^[9]

Los factores VII , IX y X desempeñan papeles clave en la coagulación sanguínea y también comparten una arquitectura de dominio común. ^[10] La proteína del factor IX se compone de cuatro dominios proteicos : el dominio Gla , dos copias en tándem del dominio EGF y un dominio de peptidasa similar a tripsina C-terminal que lleva a cabo la escisión catalítica.

Se ha demostrado que el dominio EGF N-terminal es al menos en parte responsable de la unión del factor tisular . ^[10] Wilkinson et al . concluyen que los residuos 88 a 109 del segundo dominio EGF median la unión a las plaquetas y el ensamblaje del complejo activador del factor X. ^[11]

Se han resuelto las estructuras de los cuatro dominios. Se determinó la estructura de los dos dominios EGF y del dominio similar a la tripsina para la proteína de cerdo. ^[12] La estructura del dominio Gla, que es responsable de la unión de fosfolípidos dependiente de Ca(II), también se determinó mediante RMN . ^[13]

Se han resuelto varias estructuras de mutantes "superactivos", ^[14] que revelan la naturaleza de la activación del factor IX por otras proteínas en la cascada de coagulación.

Debido a que el gen del factor IX se encuentra en el cromosoma X (Xq27.1-q27.2), las mutaciones de pérdida de función del mismo son recesivas ligadas al cromosoma X : los hombres experimentan el fenotipo de la enfermedad con mucha más frecuencia que las mujeres. Se han descubierto al menos 534 mutaciones causantes de enfermedad en este gen. ^[15] El gen F9 fue clonado por primera vez en 1982 por Kotoku Kurachi y Earl Davie . ^[16]

Polly , una oveja Poll Dorset transgénica clonada que porta el gen del factor IX, fue producida por el Dr. Ian Wilmut en el Instituto Roslin en 1997. ^[17]

La deficiencia del factor IX causa la enfermedad de Christmas ( hemofilia B ). ^[5] Se han descrito más de 3000 variantes del factor IX, que afectan al 73% de los 461 residuos; ^[22] algunas no causan síntomas, pero muchas provocan un trastorno hemorrágico importante. La mutación original de la enfermedad de Christmas se identificó mediante la secuenciación del ADN de Christmas, que reveló una mutación que cambió una cisteína a una serina. ^{[23] El factor IX} recombinante se utiliza para tratar la enfermedad de Christmas. Las formulaciones incluyen:

• nonacog alfa (nombre comercial Benefix) ^[24]
• nonacog gamma (nombre comercial Rixubis) ^[18]
• albutrepenonacog alfa (nombre comercial Idelvion) ^​​[25]
• eftrenonacog alfa (nombre comercial Alprolix) ^[26]
• nonacog beta pegol (nombre comercial Refixia) ^[27]
• Factor de coagulación IX [recombinante] (Benefix) ^[28]
• Factor de coagulación IX [recombinante] (Idelvion) ^​​[29]
• Factor de coagulación IX (recombinante), proteína de fusión Fc (Alprolix) ^[30]
• Factor de coagulación IX [recombinante] (Ixinity) ^{[31] [32]}
• Factor de coagulación IX [recombinante] (Rebinyn) ^[33]
• Factor de coagulación IX [recombinante] (Rixubis) ^[34]
• Factor de coagulación IX (humano) (Alfanina SD) ^[35]

Algunas mutaciones raras del factor IX dan lugar a una actividad de coagulación elevada y pueden provocar enfermedades de la coagulación, como la trombosis venosa profunda . Esta mutación con ganancia de función hace que la proteína sea hiperfuncional y se asocia con la trombofilia familiar de aparición temprana. ^[36]

La deficiencia del factor IX se trata mediante la inyección de factor IX purificado producido mediante clonación en diversos vectores animales o de células animales. El ácido tranexámico puede ser útil en pacientes sometidos a cirugía que han heredado la deficiencia del factor IX para reducir el riesgo perioperatorio de sangrado. ^[37]

La EAHAD compila y mantiene una lista de todas las mutaciones del factor IX. ^[38]

El factor IX de coagulación está en la Lista de Medicamentos Esenciales de la Organización Mundial de la Salud . ^[6]

• Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : P00740 (Factor de coagulación IX) en el PDBe-KB .
• Entrada en GeneReviews/NCBI/NIH/UW sobre la hemofilia B
• Base de datos en línea MEROPS para peptidasas y sus inhibidores: S01.214 Archivado el 5 de mayo de 2005 en Wayback Machine.