Síndrome respiratorio agudo severo por coronavirus [1]
El coronavirus 1 del síndrome respiratorio agudo severo ( SARS-CoV-1 ), anteriormente conocido como coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo ( SARS-CoV ), [2] es una cepa de coronavirus que causa el síndrome respiratorio agudo severo ( SARS ), la enfermedad respiratoria responsable del brote de SARS de 2002-2004 . [3] Es un virus de ARN monocatenario , de sentido positivo y envuelto que infecta las células epiteliales dentro de los pulmones. [4] El virus ingresa a la célula huésped al unirse a la enzima convertidora de angiotensina 2. [ 5] Infecta a humanos , murciélagos y civetas de palma . [6] [7] El brote de SARS-CoV-1 se controló en gran medida mediante simples medidas de salud pública. La realización de pruebas a las personas con síntomas (fiebre y problemas respiratorios), el aislamiento y la cuarentena de los casos sospechosos y la restricción de los viajes tuvieron un efecto. El SARS-CoV-1 era más transmisible cuando los pacientes estaban enfermos, por lo que su propagación podía suprimirse eficazmente aislando a los pacientes con síntomas. [8]
El síndrome respiratorio agudo severo (SARS) es la enfermedad causada por el SARS-CoV-1. Provoca una enfermedad a menudo grave y se caracteriza inicialmente por síntomas sistémicos de dolor muscular , dolor de cabeza y fiebre , seguidos en 2 a 14 días por la aparición de síntomas respiratorios, [13] principalmente tos, disnea y neumonía . Otro hallazgo común en pacientes con SARS es una disminución en el número de linfocitos circulantes en la sangre. [14]
En el brote de SARS de 2003, aproximadamente el 9% de los pacientes con infección confirmada por SARS-CoV-1 murieron. [15] La tasa de mortalidad fue mucho más alta para los mayores de 60 años, con tasas de mortalidad cercanas al 50% para este subconjunto de pacientes. [15]
Origen e historia evolutiva
En marzo de 2003, la OMS estableció una red mundial de laboratorios líderes para colaborar en la identificación del agente causal del SARS. Al principio, los laboratorios de la red limitaron la búsqueda a miembros de las familias de paramixovirus y coronavirus. Los primeros hallazgos compartidos por los laboratorios apuntaban a coronavirus con cada vez mayor consistencia. El 21 de marzo, científicos de la Universidad de Hong Kong anunciaron el aislamiento de un nuevo virus del que se sospechaba firmemente que era el agente causal del SARS. [16]
La evidencia epidemiológica sugirió un origen zoonótico del virus: más del 33% de los primeros casos de SARS detectados en Guangdong correspondieron a manipuladores de animales o alimentos. [17] Los estudios de seroprevalencia reforzaron este vínculo zoonótico (una alta proporción de manipuladores de animales asintomáticos en los mercados de la provincia de Guangdong tenían anticuerpos contra el SARS-CoV). [17]
El 12 de abril de 2003, los científicos que trabajaban en el Centro de Ciencias Genómicas Michael Smith en Vancouver terminaron de mapear la secuencia genética de un coronavirus que se creía vinculado al SARS. El equipo estaba dirigido por Marco Marra y Caroline Astell y trabajó en colaboración con el Centro para el Control de Enfermedades de Columbia Británica y el Laboratorio Nacional de Microbiología en Winnipeg , Manitoba , utilizando muestras de pacientes infectados en Toronto . [18] [19] El mapa, aclamado por la OMS como un importante paso adelante en la lucha contra el SARS, [ cita requerida ] se comparte con científicos de todo el mundo a través del sitio web del GSC (ver más abajo). Donald Low del Hospital Mount Sinai en Toronto describió el descubrimiento como realizado con "velocidad sin precedentes". [20] La secuencia del coronavirus del SARS ha sido confirmada desde entonces por otros grupos independientes.
La investigación epidemiológica molecular demostró que el virus aislado en 2002-2003 en el sur de China y el virus aislado en la misma zona a finales de 2003 y principios de 2004 son diferentes, lo que indica eventos separados de cruce de especies. [21] La filogenia de las cepas del brote muestra que las provincias del suroeste, incluidas Yunnan, Guizhou y Guangxi, se comparan mejor con el SARS-CoV-1 humano que las de las otras provincias, pero la evolución de los virus es un producto de la interacción y la particularidad del huésped. [22]
A finales de mayo de 2003, estudios de muestras de animales salvajes vendidos como alimento en el mercado local de Guangdong , China, encontraron que una cepa del coronavirus del SARS podía aislarse de civetas palmeras enmascaradas ( Paguma sp.), pero los animales no siempre mostraban signos clínicos. La conclusión preliminar fue que el virus del SARS cruzó la barrera de especies de la civeta palmera a los humanos, y más de 10.000 civetas palmeras enmascaradas fueron asesinadas en la provincia de Guangdong. El virus también se encontró más tarde en perros mapaches ( Nyctereuteus sp.), [23] tejones hurones ( Melogale spp.) y gatos domésticos. En 2004, científicos del Centro Chino para el Control y la Prevención de Enfermedades de la Universidad de Hong Kong y el Centro de Guangzhou para el Control y la Prevención de Enfermedades establecieron un vínculo genético entre el coronavirus del SARS que aparece en civetas y humanos, confirmando las afirmaciones de que el virus podría haberse transmitido de la especie animal a los humanos. [24] Las civetas palmeras infectadas en el mercado fueron rastreadas hasta granjas donde no se encontraron animales infectados. Se desconoce si el virus fue introducido originalmente en el mercado por civetas, humanos u otro animal. [23]
En 2005, dos estudios identificaron varios coronavirus similares al SARS en murciélagos chinos . [25] [26] Aunque el virus del SARS del murciélago no se replicó en un cultivo celular, en 2008, investigadores estadounidenses [27] alteraron la estructura genética del virus del SARS del murciélago con el dominio de unión al receptor humano tanto en el virus del murciélago como en los ratones, lo que demostró cómo podría producirse la zoonosis en la evolución. [28]
El análisis filogenético de estos virus indicó una alta probabilidad de que el coronavirus del SARS se originara en murciélagos y se propagara a los humanos directamente o a través de animales mantenidos en mercados chinos. Los murciélagos no mostraron ningún signo visible de enfermedad, pero son los probables reservorios naturales de coronavirus similares al SARS.
Filogenético
Es probable que los murciélagos sean el reservorio natural, es decir, el huésped que alberga el patógeno pero que no muestra efectos nocivos y sirve como fuente de infección. No se encontró ningún progenitor directo del SARS-CoV en las poblaciones de murciélagos, pero se encontró WIV16 en una cueva en el municipio étnico Xiyang Yi , Yunnan, China entre 2013 y 2016, y tiene una cepa de virus genéticamente similar en un 96%. [29] La hipótesis de que el SARS-CoV-1 surgió a través de recombinaciones de SARSr-CoV de murciélago en la cueva de Yunnan de WIV16 o en otras cuevas de murciélagos aún por identificar se considera muy probable. [30]
Un árbol filogenético basado en secuencias del genoma completo del SARS-CoV-1 y coronavirus relacionados es:
El SARS-CoV-1 sigue la estrategia de replicación típica de la subfamilia de los coronavirus . El principal receptor humano del virus es la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2) y la hemaglutinina (HE), [40] identificada por primera vez en 2003. [41] [42]
El SARS-CoV-1 humano parece haber tenido una historia compleja de recombinación entre coronavirus ancestrales que se hospedaron en varios grupos animales diferentes. [43] [44] Para que se produzca la recombinación, deben estar presentes al menos dos genomas del SARS-CoV-1 en la misma célula hospedadora. La recombinación puede ocurrir durante la replicación del genoma cuando la ARN polimerasa cambia de una plantilla a otra (recombinación por elección de copia). [44]
El SARS-CoV-1 es uno de los siete coronavirus conocidos que infectan a los humanos. Los otros seis son: [45]
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Wikimedia Commons tiene medios relacionados con el SARS-CoV .
Wikispecies tiene información relacionada con el coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo .
Comunicado de prensa de la OMS que identifica y nombra el virus del SARS
El mapa genético del virus del SARS Archivado el 18 de agosto de 2006 en Wayback Machine.
Especial de ciencia sobre el virus del SARS (contenido gratuito: no requiere registro)
Recursos sobre el SARS de la Universidad McGill en Wayback Machine (archivados el 1 de marzo de 2005)
Página de inicio del SARS de los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) de EE. UU.