El tris(batofenantrolina disulfonato)rutenio(II) tetrasódico (Na 4 Ru(bps) 3 ) es una sal sódica de un compuesto de coordinación . En esta forma, es la sal de un ácido sulfónico . Este compuesto es una extensión de la serie de compuestos de coordinación de la fenantrolina . El tris(batofenantrolina disulfonato) de rutenio(II), que hace referencia al fragmento aniónico, se utiliza como colorante proteico en bioquímica para diferenciar y detectar diferentes proteínas en entornos de laboratorio.
En los últimos años, la electroforesis 2-D ha sido ampliamente aceptada como un procedimiento estándar para separar mezclas complejas de proteínas en estudios de proteoma ( Proteómica ). La visualización de proteínas por tris(batofentrolina disulfonato) de rutenio (II) se ha convertido en un método firmemente establecido y ampliamente utilizado en el análisis proteómico [1] [2] [3 ] [4] [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11] [12] [ 13] [14] [15] [16] y un paso crucial en el perfil de expresión genética .
Originalmente, el complejo de metal de transición de rutenio , rutenio (II) tris (4,7-difenil-1,10-fenantrolina disulfonato) también denominado rutenio (II) tris ( batofentrolina disulfonato ) ( RuBPS ) fue sintetizado por Bannwarth [17] como una molécula precursora para un tinte que se utilizó como una etiqueta no radiactiva para oligonucleótidos . [18] En 5 años, complejos de metales de transición similares habían sido reconocidos como reactivos de detección de proteínas viables, [19] y poco después se demostró que el análogo de europio de RuBPS era un reactivo de detección de proteínas fluorescentes eficaz. [20] El primer uso informado de RuBPS para la detección de proteínas parece ser el lanzamiento comercial de la solución de tinción de proteínas patentada Sypro Ruby en 1999. [21] [22] Si bien Sypro Ruby es patentado y no se afirma que tenga RuBPS como componente principal, se afirma que tiene rutenio, y Rabilloud et al. sintetizaron RuPBS y lo compararon con Sypro Ruby, encontrando que eran reactivos muy similares, aunque no idénticos, para la detección fluorescente de proteínas en geles de poliacrilamida . [21] [23] En particular, Rabilloud et al. hicieron sus comparaciones con la primera formulación de Sypro Ruby, la segunda (y presuntamente actual) formulación de Sypro Ruby tiene los mismos números de producto (pero números de lote distintos) y un mayor rendimiento con diversas soluciones de fijación. [24] [25]
El hecho de que el RuBPS no sólo sea fácil de sintetizar sino también de manipular, indujo a nuevos desarrollos en este campo.
Desarrollos en curso
Lamanda et al. mejoraron el protocolo de tinción de RuBPS decolorando selectivamente la matriz de poliacrilamida mientras el contenido proteico permanecía teñido . Esta nueva técnica implicó una variedad de ventajas como señales fuertes, relación señal-fondo mejorada, mejor linealidad y resolución de línea base avanzada. [25] Más recientemente, se demostró que los complejos heterolépticos de rutenio(II) muy similares a RuBPS tenían algunas propiedades mejoradas, específicamente un rango de pH más amplio en el que podían usarse. [26]
Referencias
^ Miller, I.; Crawford, J.; Gianazza, E. (octubre de 2006). "Tintes de proteínas para aplicaciones proteómicas: ¿cuáles, cuándo, por qué?". Proteómica . 6 (20): 5385–5408. doi : 10.1002/pmic.200600323 . PMID 16991193. S2CID 27311378.
^ Bryborn, Malin; Adner, Mikael; Cardell, Lars-Olaf (2005). "Psoriasina, una de varias proteínas nuevas identificadas en el líquido de lavado nasal de individuos alérgicos y no alérgicos mediante electroforesis en gel bidimensional y espectrometría de masas". Investigación respiratoria . 6 (1): 118. doi : 10.1186/1465-9921-6-118 . PMC 1282590 . PMID 16236163.
^ Clerk, Angela; Cullingford, Timothy E.; Kemp, Timothy J.; Kennedy, Robert A.; Sugden, Peter H. (2005). "Regulación de la expresión de genes y proteínas en la hipertrofia y apoptosis de los miocitos cardíacos". Avances en la regulación enzimática . 45 (1): 94–111. doi :10.1016/j.advenzreg.2005.02.007. PMID 16084574.
^ Schaller, A.; Troller, R.; Molina, D.; Gallati, S.; Aebi, C.; Stutzmann Meier, P. (enero de 2006). "Tipificación rápida de subpoblaciones de Moraxella catarrhalis basada en proteínas de membrana externa utilizando espectrometría de masas". Proteómica . 6 (1): 172–180. doi :10.1002/pmic.200500086. PMID 16317771. S2CID 1626277.
^ Stasyk, T.; Morandell, S.; Bakry, R.; Feuerstein, I.; Huck, CW; Stecher, G.; Bonn, GK; Huber, LA (julio de 2005). "Detección cuantitativa de fosfoproteínas mediante la combinación de electroforesis en gel de diferencia bidimensional y tinción fluorescente fosfoespecífica". Electroforesis . 26 (14): 2850–2854. doi :10.1002/elps.200500026. PMID 15966015. S2CID 21102274.
^ Berger, K.; Wissmann, D.; Ihling, C.; Kalkhof, S.; Beck-Sickinger, A.; Sinz, A.; Paschke, R.; Führer, D. (noviembre de 2004). "Análisis cuantitativo del proteoma en la enfermedad nodular tiroidea benigna utilizando la tinción fluorescente de rutenio II tris(batofenantrolina disulfonato)". Endocrinología molecular y celular . 227 (1–2): 21–30. doi :10.1016/j.mce.2004.08.001. PMID 15501581. S2CID 1622208.
^ Görg, A.; Weiss, W.; Dunn, MJ (diciembre de 2004). "Tecnología actual de electroforesis bidimensional para proteómica". Proteómica . 4 (12): 3665–3685. doi :10.1002/pmic.200401031. PMID 15543535. S2CID 28594824.
^ Smejkal, GB; Robinson, MH; Lazarev, A. (agosto de 2004). "Comparación de tinciones fluorescentes: fotoestabilidad relativa y tinción diferencial de proteínas en geles bidimensionales". Electroforesis . 25 (15): 2511–2519. doi :10.1002/elps.200406005. PMID 15300770. S2CID 1163843.
^ Junca, H.; Plumeier, I.; Hecht, HJR; Pieper, DH (diciembre de 2004). "Diferencia en el comportamiento cinético de las variantes de la catecol 2,3-dioxigenasa de un entorno contaminado". Microbiología . 150 (12): 4181–4187. doi : 10.1099/mic.0.27451-0 . PMID 15583170.
^ Tang, HY; Speicher, DW (junio de 2005). "Prefraccionamiento de proteomas complejos mediante isoelectroenfoque en solución a microescala". Expert Review of Proteomics . 2 (3): 295–306. doi :10.1586/14789450.2.3.295. PMID 16000077. S2CID 38064911.
^ Piette, André; Derouaux, Adeline; Gerkens, Pascal; Noens, Elke EE; Mazzucchelli, Gabriel; Vion, Sébastien; Koerten, Henk K.; Titgemeyer, Fritz; De Pauw, Edwin; Leprince, Pierre; van Wezel, Gilles P.; Galleni, Moreno; Rigali, Sébastien (2005). "De esporas inactivas a germinadas de Streptomyces coelicolor A3 (2): nuevas perspectivas desde el mutante nulo crp ". Revista de investigación del proteoma . 4 (5): 1699-1708. doi :10.1021/pr050155b. hdl : 1887/3239397 . PMID 16212423.
^ Quaglino, Daniela; Boraldi, Federica; Bini, Luca; Volpi, Nicola (abril de 2004). "El perfil proteico de los fibroblastos: el papel de la proteómica". Proteómica actual . 1 (2): 167. doi : 10.2174/1570164043379424.
^ Hjernø, K.; Alm, R.; Canbäck, BR; Matthiesen, R.; Trajkovski, K.; Björk, L.; Roepstorff, P.; Emanuelsson, C. (2006). "Regulación a la baja del alérgeno homólogo de la fresa Bet v 1 en concierto con la vía de biosíntesis de flavonoides en el mutante de fresa incoloro". Proteómica . 6 (5): 1574–1587. doi : 10.1002/pmic.200500469 . PMID 16447153. S2CID 29423198.
^ Gerber, Isak B.; Laukens, Kris; Witters, Erwin; Dubery, Ian A. (2006). "Fosfoproteínas sensibles a lipopolisacáridos en células de Nicotiana tabacum ". Fisiología y bioquímica de plantas . 44 (5–6): 369–379. doi :10.1016/j.plaphy.2006.06.015. PMID 16889970.
^ Chevallet, M.; Diemer, HLN; Luche, S.; Van Dorsselaer, A.; Rabilloud, T.; Leize-Wagner, E. (2006). "La tinción con plata amoniacal proporciona una compatibilidad mejorada con la espectrometría de masas". Proteómica . 6 (8): 2350–2354. arXiv : q-bio/0611083 . Bibcode :2006q.bio....11083C. doi :10.1002/pmic.200500567. PMC 2797540 . PMID 16548061.
^ Lamanda, Andreas; Cheaib, Zeinab; Turgut, Melek Dilek; Lussi, Adrian (2007). Imhof, Axel (ed.). "Amortiguación de proteínas en sistemas modelo y en saliva humana completa". PLoS ONE . 2 (2): e263. Bibcode :2007PLoSO...2..263L. doi : 10.1371/journal.pone.0000263 . PMC 1803027 . PMID 17327922.
^ "Copia archivada". Archivado desde el original el 15 de mayo de 2007. Consultado el 26 de abril de 2007 .{{cite web}}: CS1 maint: copia archivada como título ( enlace )
^ Bannwarth, W.; Schmidt, D.; Stallard, RL; Hornung, C.; Knorr, R.; Müller, F. (diciembre de 1988). "Complejos de batofenantrolina-rutenio(II) como marcadores no radiactivos para oligonucleótidos que pueden medirse mediante técnicas de fluorescencia resuelta en el tiempo". Helvetica Chimica Acta . 71 (8): 2085. doi :10.1002/hlca.19880710826.
^ Patton, WF; Lam, L.; Su, Q.; Lui, M.; Erdjumentbromage, H.; Tempst, P. (1994). "Quelatos metálicos como colorantes reversibles para la detección de proteínas electrotransferidas: aplicación a la microsecuenciación de proteínas y la inmunotransferencia". Analytical Biochemistry . 220 (2). Elsevier BV: 324–335. doi : 10.1006/abio.1994.1345 . ISSN 0003-2697. PMID 7526738. S2CID 24405621.
^ Lim, Mark J.; Patton, Wayne F.; Lopez, Mary F.; Spofford, Kimberley H.; Shojaee, Negin; Shepro, David (1997). "Un complejo de europio luminiscente para la detección sensible de proteínas y ácidos nucleicos inmovilizados en soportes de membrana". Analytical Biochemistry . 245 (2). Elsevier BV: 184–195. doi : 10.1006/abio.1996.9961 . ISSN 0003-2697. PMID 9056210.
^ ab Berggren, Kiera; Steinberg, Thomas H.; Lauber, Wendy M.; Carroll, James A.; Lopez, Mary F.; Chernokalskaya, Elena; Zieske, Lynn; Diwu, Zhenjun; Haugland, Richard P.; Patton, Wayne F. (1999). "Un complejo de rutenio luminiscente para la detección ultrasensible de proteínas inmovilizadas en soportes de membrana". Analytical Biochemistry . 276 (2). Elsevier BV: 129–143. doi :10.1006/abio.1999.4364. ISSN 0003-2697. PMID 10603235.
^ Steinberg, Thomas H.; Chernokalskaya, Elena; Berggren, Kiera; Lopez, Mary F.; Diwu, Zhenjun; Haugland, Richard P.; Patton, Wayne F. (1 de febrero de 2000). "Detección de proteínas por fluorescencia ultrasensible en geles de enfoque isoeléctrico utilizando una tinción de quelato de metal de rutenio". Electroforesis . 21 (3). Wiley: 486–496. doi :10.1002/(sici)1522-2683(20000201)21:3<486::aid-elps486>3.0.co;2-q. ISSN 0173-0835. PMID 10726748. S2CID 36787237.
^ "Proteoma - Texto completo DOI 10.1007/S102160000002". doi :10.1007/S102160000002. S2CID 98713308. Archivado desde el original el 29 de mayo de 2011. Consultado el 26 de abril de 2007 .{{cite journal}}: Requiere citar revista |journal=( ayuda )
^ Berggren, Kiera N.; Schulenberg, Birte; Lopez, Mary F.; Steinberg, Thomas H.; Bogdanova, Alla; Smejkal, Gary; Wang, Annie; Patton, Wayne F. (2002). "Una formulación mejorada de la tinción de gel de proteína SYPRO Ruby: Comparación con la formulación original y con una formulación de tris (disulfonato de batofenantrolina) de rutenio II". Proteómica . 2 (5). Wiley: 486–498. doi :10.1002/1615-9861(200205)2:5<486::aid-prot486>3.0.co;2-x. ISSN 1615-9853. PMID 11987123. S2CID 23902055.
^ ab Lamanda, A.; Zahn, A.; Röder, D.; Langen, H. (marzo de 2004). "Protocolo mejorado de tinción y decoloración con tris (disulfonato de batofenantrolina) de rutenio II para una mejor relación señal-fondo y una resolución de línea base mejorada". Proteómica . 4 (3): 599–608. doi :10.1002/pmic.200300587. PMID 14997483. S2CID 26442102.
^ Babak, Maria V.; Le Faouder, Pauline; Trivelli, Xavier; Venkatesan, Gopalakrishnan; Bezzubov, Stanislav I.; Kajjout, Mohammed; Gushchin, Artem L.; Hanif, Muhammad; Poizat, Olivier; Vezin, Hervé; Rolando, Christian (17 de marzo de 2020). "Complejos heterolépticos de rutenio (II) con batofenantrolina y sal disódica de disulfonato de batofenantrolina como colorantes fluorescentes para tinción de proteínas en gel". Química inorgánica . 59 (7). Sociedad Química Estadounidense (ACS): 4527–4535. doi :10.1021/acs.inorgchem.9b03679. ISSN 0020-1669. Número de modelo: PMID 32181663. Número de modelo: S2CID 212739460.
Enlaces externos
Se puede encontrar más información sobre la tinción de tris(batofenantrolina disulfonato) de rutenio (II) en [1]