PRPF31

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens
PRPF31
Estructuras disponibles
APBúsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Identificadores
AliasPRPF31 , factor de procesamiento pre-ARNm 31, NY-BR-99, PRP31, RP11, SNRNP61
Identificaciones externasOMIM : 606419; MGI : 1916238; HomoloGene : 5980; Tarjetas genéticas : PRPF31; OMA :PRPF31 - ortólogos
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entre
Conjunto
Protección unificada
RefSeq (ARNm)

Número nuevo_015629

Número de serie 001159714 Número de
serie 027328

RefSeq (proteína)

NP_056444
NP_056444.3

NP_001153186NP_081604

Ubicación (UCSC)Crónicas 19:54.12 – 54.13 MbCrónica 7: 3.63 – 3.65 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
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El factor de procesamiento de pre-ARNm 31 homólogo PRP31 (S. cerevisiae) , también conocido como PRPF31 , es una proteína que en los humanos está codificada por el gen PRPF31 . [5]

Función

PRPF31 es el gen que codifica el factor de empalme hPRP31. Es esencial para la formación del espliceosoma . hPRP31 está asociado con el U4 / U6 di-snRNP e interactúa con otro factor de empalme, h PRP6 , para formar el U4/U6- U5 tri-snRNP. Se ha demostrado que cuando hPRP31 es inactivado por RNAi , los U4/U6 di-snRNP se acumulan en los cuerpos de Cajal y el U4/U6-U5 tri-snRNP no se puede formar. [6]

El PRPF31 se incorpora a los intrones tras la unión de los ARN U4 y U6 y la proteína 15.5K NHP2L1 . La adición del PRPF31 es crucial para la transición del complejo espliceosómico al estado activado. [7]

Importancia clínica

Una mutación en PRPF31 es una de las cuatro mutaciones conocidas en los factores de empalme que se sabe que causan retinitis pigmentosa . La primera mutación en PRPF31 fue descubierta por Vithana et al. en 2001. [5] La retinitis pigmentosa (RP) es un grupo clínica y genéticamente heterogéneo de distrofias retinianas que se caracteriza por una degeneración progresiva de los fotorreceptores , que finalmente resulta en un deterioro visual grave. [8]

Herencia

Las mutaciones en PRPF31 se heredan de manera autosómica dominante , lo que representa el 2,5% de los casos de retinitis pigmentosa autosómica dominante (adRP) en una población mixta del Reino Unido. [9] Sin embargo, el patrón de herencia de las mutaciones de PRPF31 es atípico de la herencia dominante, mostrando el fenómeno de penetrancia parcial, por el cual las mutaciones dominantes parecen "saltearse" generaciones. Se cree que esto se debe a la presencia de dos alelos de tipo salvaje , un alelo de alta expresividad y un alelo de baja expresividad. Si un paciente tiene un alelo mutante y un alelo de alta expresividad, no muestra fenotipo de enfermedad. Si un paciente tiene un alelo mutante y un alelo de baja expresividad, el nivel residual de proteína cae por debajo del umbral para la función normal, y por lo tanto muestra fenotipo de enfermedad. Por lo tanto, el patrón de herencia de PRPF31 puede considerarse como una variación de la haploinsuficiencia . Esta variante de haploinsuficiencia sólo se observa en otras dos enfermedades humanas: la protoporfiria eritropoyética , causada por mutaciones en el gen FECH , y la eliptocitosis hereditaria , causada por mutaciones en el gen de la espectrina . [10] [11]

Referencias

  1. ^ abc ENSG00000105618 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000275885, ENSG00000105618 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000008373 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ ab Vithana EN, Abu-Safieh L, Allen MJ, Carey A, Papaioannou M, Chakarova C, Al-Maghtheh M, Ebenezer ND, Willis C, Moore AT, Bird AC, Hunt DM, Bhattacharya SS (agosto de 2001). "Un homólogo humano del gen de empalme de pre-ARNm de levadura, PRP31, subyace a la retinitis pigmentosa autosómica dominante en el cromosoma 19q13.4 (RP11)". Mol. Cell . 8 (2): 375–81. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00305-7 . PMID  11545739.
  6. ^ Schaffert N, Hossbach M, Heintzmann R, Achsel T, Lührmann R (agosto de 2004). "La inhibición de hPrp31 mediante RNAi conduce a una acumulación de di-snRNP U4/U6 en los cuerpos de Cajal". EMBO J . 23 (15): 3000–9. doi :10.1038/sj.emboj.7600296. PMC 514917 . PMID  15257298. 
  7. ^ Liu S, Li P, Dybkov O, Nottrott S, Hartmuth K, Lührmann R, Carlomagno T, Wahl MC (abril de 2007). "Unión del dominio humano Prp31 Nop a una plataforma de proteína-ARN compuesta en U4 snRNP". Science . 316 (5821): 115–20. Bibcode :2007Sci...316..115L. doi :10.1126/science.1137924. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-E16C-F . PMID  17412961. S2CID  22091845.
  8. ^ "Gen Entrez: PRPF31 PRP31 factor de procesamiento de pre-ARNm 31 homólogo (S. cerevisiae)".
  9. ^ Waseem NH, Vaclavik V, Webster A, Jenkins SA, Bird AC, Bhattacharya SS (marzo de 2007). "Mutaciones en el gen que codifica el factor de empalme pre-ARNm, PRPF31, en pacientes con retinitis pigmentosa autosómica dominante". Oftalmología y ciencia visual de investigación . 48 (3): 1330–4. doi :10.1167/iovs.06-0963. PMID  17325180.
  10. ^ Randon J, Boulanger L, Marechal J, Garbarz M, Vallier A, Ribeiro L, Tamagnini G, Dhermy D, Delaunay J (noviembre de 1994). "Una variante del alelo alfa de baja expresión de espectrina LELY que porta una mutación de eliptocitosis hereditaria en el codón 28". H. J. Haematol . 88 (3): 534–40. doi :10.1111/j.1365-2141.1994.tb05070.x. PMID  7819065. S2CID  39527747.
  11. ^ Gouya L, Puy H, Lamoril J, Da Silva V, Grandchamp B, Nordmann Y, Deybach JC (junio de 1998). "Herencia en la protoporfiria eritropoyética: una variante alélica común de la ferroquelatasa de tipo salvaje con baja expresión explica la manifestación clínica". Am J Hum Genet . 93 (6): 2150–10. PMID  10068685.

Lectura adicional

  • Tarizzo ML (1975). "La Organización Mundial de la Salud y la prevención de la ceguera". Transacciones. Sección de Oftalmología. Academia Estadounidense de Oftalmología y Otorrinolaringología . 79 (3 Pt 2): OP453–6. PMID  1154573.
  • al-Maghtheh M, Inglehearn CF, Keen TJ, et al. (1994). "Identificación de un sexto locus para la retinitis pigmentosa autosómica dominante en el cromosoma 19". Hum. Mol. Genet . 3 (2): 351–4. doi :10.1093/hmg/3.2.351. PMID  8004108.
  • Al-Maghtheh M, Vithana E, Tarttelin E, et al. (1996). "Evidencia de un locus importante de retinitis pigmentosa en 19q13.4 (RP11) y asociación con un fenotipo de expresividad bimodal único". Am. J. Hum. Genet . 59 (4): 864–71. PMC  1914817. PMID  8808602 .
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "Clonación de ADN mediante recombinación específica de sitio in vitro". Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948 . PMID  11076863.
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanas: secuenciación y análisis de 500 nuevos ADNc humanos que codifican proteínas completas". Genome Res . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC  311072 . PMID  11230166.
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, et al. (2001). "Localización subcelular sistemática de nuevas proteínas identificadas mediante secuenciación de ADNc a gran escala". EMBO Rep . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC  1083732 . PMID  11256614.
  • Vithana EN, Abu-Safieh L, Allen MJ, et al. (2001). "Un homólogo humano del gen de empalme de pre-ARNm de levadura, PRP31, subyace a la retinitis pigmentosa autosómica dominante en el cromosoma 19q13.4 (RP11)". Mol. Cell . 8 (2): 375–81. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00305-7 . PMID  11545739.
  • Makarova OV, Makarov EM, Liu S, et al. (2002). "La proteína 61K, codificada por un gen (PRPF31) vinculado a la retinitis pigmentosa autosómica dominante, es necesaria para la formación de tri-snRNP U4/U6·U5 y el empalme del pre-ARNm". EMBO J . 21 (5): 1148–57. doi :10.1093/emboj/21.5.1148. PMC  125353 . PMID  11867543.
  • Deery EC, Vithana EN, Newbold RJ, et al. (2003). "Mecanismo de la enfermedad de la retinitis pigmentosa (RP11) causada por mutaciones en el gen del factor de empalme PRPF31". Hum. Mol. Genet . 11 (25): 3209–19. doi : 10.1093/hmg/11.25.3209 . PMID  12444105.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932.
  • Martínez-Gimeno M, Gamundi MJ, Hernan I, et al. (2003). "Mutaciones en los genes PRPF3, PRPF8 y PRPF31 de factores de empalme del pre-ARNm en familias españolas con retinosis pigmentaria autosómica dominante". Invest. Ophthalmol. Vis. Sci . 44 (5): 2171–7. doi :10.1167/iovs.02-0871. PMID  12714658.
  • Scanlan MJ, Gout I, Gordon CM, et al. (2003). "Inmunidad humoral al cáncer de mama humano: definición de antígeno y análisis cuantitativo de la expresión de ARNm". Cancer Immun . 1 : 4. PMID  12747765.
  • Wang L, Ribaudo M, Zhao K, et al. (2003). "Una nueva deleción en el gen de empalme de pre-ARNm PRPF31 causa retinitis pigmentosa autosómica dominante en una gran familia china". Am. J. Med. Genet. A . 121 (3): 235–9. doi :10.1002/ajmg.a.20224. PMC  1579744 . PMID  12923864.
  • Reuter TY, Medhurst AL, Waisfisz Q, et al. (2003). "Los análisis de dos híbridos en levaduras implican la participación de las proteínas de la anemia de Fanconi en la regulación de la transcripción, la señalización celular, el metabolismo oxidativo y el transporte celular". Exp. Cell Res . 289 (2): 211–21. doi :10.1016/S0014-4827(03)00261-1. PMID  14499622.
  • Vithana EN, Abu-Safieh L, Pelosini L, et al. (2003). "Expresión del ARNm de PRPF31 en pacientes con retinitis pigmentosa autosómica dominante: ¿una pista molecular para la penetrancia incompleta?". Invest. Ophthalmol. Vis. Sci . 44 (10): 4204–9. doi :10.1167/iovs.03-0253. PMID  14507862.
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa". Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID:  14702039.
  • Grimwood J, Gordon LA, Olsen A, et al. (2004). "La secuencia de ADN y la biología del cromosoma humano 19". Nature . 428 (6982): 529–35. Bibcode :2004Natur.428..529G. doi : 10.1038/nature02399 . PMID  15057824.
  • Xia K, Zheng D, Pan Q, et al. (2004). "Una nueva mutación del sitio de empalme PRPF31 en una familia china con retinitis pigmentosa autosómica dominante". Mol. Vis . 10 : 361–5. PMID  15162096.
  • Schaffert N, Hossbach M, Heintzmann R, et al. (2005). "La inhibición de hPrp31 mediante RNAi conduce a una acumulación de di-snRNP U4/U6 en los cuerpos de Cajal". EMBO J . 23 (15): 3000–9. doi :10.1038/sj.emboj.7600296. PMC  514917 . PMID  15257298.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa del NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)". Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928 . PMID  15489334.
  • Entrada de GeneReviews/NCBI/NIH/UW sobre descripción general de la retinitis pigmentosa


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