MED26
Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

MED26
Identificadores
AliasMED26 , CRSP7, CRSP70, subunidad 26 del complejo mediador
Identificaciones externasOMIM : 605043; MGI : 1917875; HomoloGene : 68417; Tarjetas genéticas : MED26; OMA :MED26 - ortólogos
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entre

9441

70625

Conjunto

ENSG00000105085

ENSMUSG00000045248

Protección unificada

O95402

Q7TN02

RefSeq (ARNm)

Número de modelo_004831

Número nuevo_027485

RefSeq (proteína)

NP_004822

NP_081761

Ubicación (UCSC)Crónicas 19: 16.57 – 16.63 MbCrónica 8: 73.25 – 73.3 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
Wikidatos
Ver/Editar humanoVer/Editar ratón
Med26
Estructura de la solución del dominio i del extremo n de la proteína 3 del factor de elongación de transcripción s-ii del ratón
Identificadores
SímboloDominio N-terminal de Med26
PfamPF08711
InterprofesionalIPR017923
Estructuras de proteínas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
APPDB RCSB; PDBj
PDBsumaResumen de la estructura
Subunidad mediadora 26 Dominio medio
Identificadores
SímboloMed26_M
PfamPF15694
Estructuras de proteínas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
APPDB RCSB; PDBj
PDBsumaResumen de la estructura
Dominio C-terminal de la subunidad 26 del mediador
Identificadores
SímboloMed26_C
PfamPF15693
Estructuras de proteínas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
APPDB RCSB; PDBj
PDBsumaResumen de la estructura

La subunidad 26 del mediador de la transcripción de la ARN polimerasa II es una enzima que en los humanos está codificada por el gen MED26 . [5] [6] Forma parte del complejo Mediador .

La activación de la transcripción génica es un proceso de varios pasos que se desencadena por factores que reconocen sitios potenciadores de la transcripción en el ADN. Estos factores trabajan con coactivadores para dirigir la iniciación de la transcripción por el aparato de la ARN polimerasa II. La proteína codificada por este gen es una subunidad del complejo CRSP (cofactor necesario para la activación de SP1), que, junto con TFIID, es necesario para la activación eficiente por SP1. Esta proteína también es un componente de otros complejos de múltiples subunidades, por ejemplo, las proteínas asociadas al receptor de la hormona tiroidea (TR) que interactúan con TR y facilitan la función de TR en las plantillas de ADN junto con factores de iniciación y cofactores. [6]

Actividad

MED26 es un factor de elongación de la transcripción que aumenta la tasa de transcripción general de la ARN polimerasa II reactivando los complejos de elongación de la transcripción que han detenido la transcripción . Lo hace mediante el reclutamiento de complejos que contienen ELL/EAF y P-TEFb a los promotores a través de una interacción directa con el dominio N-terminal (NTD). El NTD de MED26 también se une a TFIID, y TFIID y los complejos de elongación interactúan con MED26 a través de sitios de unión superpuestos. [7] El NTD de MED26 puede funcionar como un interruptor molecular que contribuye a la transición de Pol II a la elongación productiva.

Los tres dominios estructurales de TFIIS se conservan desde la levadura hasta el ser humano . Los aproximadamente 80 residuos N-terminales forman un dominio de interacción de proteínas que contiene un motivo conservado, que se ha denominado motivo LW debido a los residuos invariantes de leucina y triptófano que contiene. Aunque el dominio N-terminal no es necesario para la actividad transcripcional , se ha identificado una secuencia similar en otros factores de transcripción y proteínas que se localizan predominantemente en el núcleo . [8] [9] [10] A continuación se enumeran ejemplos específicos:

  • MED26 (también conocido como CRSP70 y ARC70), una subunidad del complejo Mediador, que es necesaria para la actividad de la proteína de unión al potenciador Sp1.
  • Elongina A, una subunidad de un factor de elongación de la transcripción anteriormente conocido como SIII. Aumenta la tasa de transcripción al suprimir la pausa transitoria del complejo de elongación .
  • PPP1R10, una subunidad reguladora nuclear de la proteína fosfatasa 1 que anteriormente se conocía como p99, FB19 o PNUTS.
  • PIBP, una pequeña proteína hipotética que podría ser una proteína de unión a fosfoinosítidos .
  • IWS1, que se cree que funciona tanto en la iniciación como en la elongación de la transcripción. [11]
  • TFIIS, que rescata a la ARN polimerasa II de los estados de pausa retrocedidos.

El dominio N-terminal de MED26 es un pliegue proteico conocido como dominio N-terminal TFIIS (o TND). [8] Es un conjunto compacto de cinco hélices. Los residuos centrales hidrofóbicos de las hélices 2, 3 y 4 están bien conservados entre los dominios TFIIS, aunque la hélice 1 está menos conservada. [10]

Interacciones

Se ha demostrado que MED26 interactúa con MED8 , [12] la quinasa dependiente de ciclina 8 , [12] POLR2A , [12] MED12 [12] y MED28 . [12] También actúa sinérgicamente para mediar la interacción entre REST (un factor de transcripción de dedo de zinc de tipo Kruppel que se une a un elemento silenciador RE1 de 21 pb presente en más de 900 genes humanos) y Mediator. [13]

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000105085 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000045248 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
  5. ^ Ryu S, Zhou S, Ladurner AG, Tjian R (febrero de 1999). "El complejo cofactor transcripcional CRSP es necesario para la actividad de la proteína de unión al potenciador Sp1". Nature . 397 (6718): 446–450. Bibcode :1999Natur.397..446R. doi :10.1038/17141. hdl : 11858/00-001M-0000-0019-A36A-8 . PMID  9989412. S2CID  4405569.
  6. ^ ab "Gen Entrez: cofactor CRSP7 necesario para la activación transcripcional de Sp1, subunidad 7, 70 kDa".
  7. ^ Takahashi H, Parmely TJ, Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA, Kong SE, et al. (julio de 2011). "La subunidad mediadora humana MED26 funciona como un sitio de acoplamiento para factores de elongación de la transcripción". Cell . 146 (1): 92–104. doi :10.1016/j.cell.2011.06.005. PMC 3145325 . PMID  21729782. 
  8. ^ ab Cermakova K, Veverka V, Hodges HC (enero de 2023). "El dominio N-terminal de TFIIS (TND): un módulo de ensamblaje de transcripción en la interfaz entre el orden y el desorden". Biochemical Society Transactions . 51 (1): 125–135. doi :10.1042/BST20220342. PMC 9987994 . PMID  36651856. S2CID  255969299. 
  9. ^ Booth V, Koth CM, Edwards AM, Arrowsmith CH (octubre de 2000). "Estructura de un dominio conservado común a los factores de transcripción TFIIS, elongina A y CRSP70". The Journal of Biological Chemistry . 275 (40): 31266–31268. doi : 10.1074/jbc.M002595200 . PMID  10811649.
  10. ^ ab Ling Y, Smith AJ, Morgan GT (2006). "Un motivo de secuencia conservado en diversas proteínas nucleares identifica un dominio de interacción proteica utilizado para la orientación nuclear por TFIIS humano". Investigación de ácidos nucleicos . 34 (8): 2219–2229. doi :10.1093/nar/gkl239. PMC 1450333 . PMID  16648364. 
  11. ^ Cermakova K, Demeulemeester J, Lux V, Nedomova M, Goldman SR, Smith EA, et al. (noviembre de 2021). "Un módulo de interacción de proteínas desordenado y ubicuo organiza la elongación de la transcripción". Science . 374 (6571): 1113–1121. Bibcode :2021Sci...374.1113C. doi :10.1126/science.abe2913. PMC 8943916 . PMID  34822292. 
  12. ^ abcde Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ, Florens L, Zybailov B, Swanson SK, et al. (junio de 2004). "Un conjunto de subunidades de consenso de mediadores de mamíferos identificadas mediante tecnología de identificación de proteínas multidimensional". Molecular Cell . 14 (5): 685–691. doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.006 . PMID  15175163.
  13. ^ Ding N, Tomomori-Sato C, Sato S, Conaway RC, Conaway JW, Boyer TG (enero de 2009). "MED19 y MED26 son objetivos funcionales sinérgicos del factor de transcripción silenciador RE1 en el silenciamiento epigenético de la expresión génica neuronal". The Journal of Biological Chemistry . 284 (5): 2648–2656. doi : 10.1074/jbc.M806514200 . PMC 2631966 . PMID  19049968. 
Este artículo incorpora texto de dominio público de Pfam e InterPro : IPR017923

Lectura adicional

  • Näär AM, Beaurang PA, Zhou S, Abraham S, Solomon W, Tjian R (abril de 1999). "El coactivador compuesto ARC media la activación transcripcional dirigida por la cromatina". Nature . 398 (6730): 828–832. Bibcode :1999Natur.398..828N. doi :10.1038/19789. PMID  10235267. S2CID  23646963.
  • Booth V, Koth CM, Edwards AM, Arrowsmith CH (octubre de 2000). "Estructura de un dominio conservado común a los factores de transcripción TFIIS, elongina A y CRSP70". The Journal of Biological Chemistry . 275 (40): 31266–31268. doi : 10.1074/jbc.M002595200 . PMID  10811649.
  • Näär AM, Taatjes DJ, Zhai W, Nogales E, Tjian R (junio de 2002). "La CRSP humana interactúa con la ARN polimerasa II CTD y adopta una conformación específica unida a CTD". Genes & Development . 16 (11): 1339–1344. doi :10.1101/gad.987602. PMC  186316 . PMID  12050112.
  • Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA, Parmely TJ, Sorokina I, Brower CS, et al. (diciembre de 2003). "Un homólogo mamífero del coactivador transcripcional intersexual de Drosophila melanogaster es una subunidad del complejo mediador mamífero". The Journal of Biological Chemistry . 278 (50): 49671–49674. doi : 10.1074/jbc.C300444200 . PMID  14576168.
  • Tomomori-Sato C, Sato S, Parmely TJ, Banks CA, Sorokina I, Florens L, et al. (febrero de 2004). "Una subunidad mediadora de mamíferos que comparte propiedades con la subunidad mediadora Cse2 de Saccharomyces cerevisiae". The Journal of Biological Chemistry . 279 (7): 5846–5851. doi : 10.1074/jbc.M312523200 . PMID  14638676.
  • Mo X, Kowenz-Leutz E, Xu H, Leutz A (enero de 2004). "Ras induce intercambio de complejos mediadores en C/EBP beta". Molecular Cell . 13 (2): 241–250. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00521-5 . PMID  14759369.
  • Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ, Florens L, Zybailov B, Swanson SK, et al. (junio de 2004). "Un conjunto de subunidades de consenso de mediadores de mamíferos identificadas mediante tecnología de identificación de proteínas multidimensional". Molecular Cell . 14 (5): 685–691. doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.006 . PMID  15175163.
  • Zhang X, Krutchinsky A, Fukuda A, Chen W, Yamamura S, Chait BT, Roeder RG (julio de 2005). "MED1/TRAP220 existe predominantemente en una subpoblación TRAP/Mediator enriquecida en ARN polimerasa II y es necesaria para la transcripción mediada por ER". Molecular Cell . 19 (1): 89–100. doi : 10.1016/j.molcel.2005.05.015 . PMID  15989967.
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (noviembre de 2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización". Cell . 127 (3): 635–648. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573.
Obtenido de "https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=MED26&oldid=1194707500"