Fosforilación oxidativa
Vía metabólica

La fosforilación oxidativa está formada por dos componentes estrechamente relacionados: la cadena de transporte de electrones y la quimiosmosis. La cadena de transporte de electrones en la célula es el sitio de la fosforilación oxidativa. El NADH y el succinato generados en el ciclo del ácido cítrico se oxidan, liberando la energía del O 2 para alimentar la ATP sintasa .

La fosforilación oxidativa (UK / ɒ k ˈ s ɪ d . ə . t ɪ v / , US / ˈ ɑː k . s ɪ ˌ d eɪ . t ɪ v / [1] ) o fosforilación ligada al transporte de electrones u oxidación terminal es la vía metabólica en la que las células utilizan enzimas para oxidar nutrientes , liberando así energía química para producir trifosfato de adenosina (ATP). En eucariotas , esto tiene lugar dentro de las mitocondrias . Casi todos los organismos aeróbicos llevan a cabo la fosforilación oxidativa. Esta vía es tan omnipresente porque libera más energía que los procesos de fermentación alternativos como la glucólisis anaeróbica .

La energía almacenada en los enlaces químicos de la glucosa es liberada por la célula en el ciclo del ácido cítrico , produciendo dióxido de carbono y los energéticos donadores de electrones NADH y FADH . La fosforilación oxidativa utiliza estas moléculas y O 2 para producir ATP , que se utiliza en toda la célula siempre que se necesita energía. Durante la fosforilación oxidativa, los electrones se transfieren desde los donadores de electrones a una serie de aceptores de electrones en una serie de reacciones redox que terminan en oxígeno, cuya reacción libera la mitad de la energía total. [2]

En los eucariotas , estas reacciones redox son catalizadas por una serie de complejos proteicos dentro de la membrana interna de las mitocondrias de la célula, mientras que, en los procariotas , estas proteínas se encuentran en la membrana externa de la célula. Estos conjuntos de proteínas enlazadas se denominan cadena de transporte de electrones . En los eucariotas, intervienen cinco complejos proteicos principales, mientras que en los procariotas están presentes muchas enzimas diferentes, que utilizan una variedad de donantes y aceptores de electrones.

La energía transferida por los electrones que fluyen a través de esta cadena de transporte de electrones se utiliza para transportar protones a través de la membrana mitocondrial interna , en un proceso llamado transporte de electrones . Esto genera energía potencial en forma de gradiente de pH y el potencial eléctrico resultante a través de esta membrana. Esta reserva de energía se aprovecha cuando los protones fluyen de regreso a través de la membrana y hacia abajo por el gradiente de energía potencial, a través de una enzima grande llamada ATP sintasa en un proceso llamado quimiosmosis . La ATP sintasa usa la energía para transformar el difosfato de adenosina (ADP) en trifosfato de adenosina, en una reacción de fosforilación . La reacción es impulsada por el flujo de protones, que fuerza la rotación de una parte de la enzima. La ATP sintasa es un motor mecánico rotatorio.

Aunque la fosforilación oxidativa es una parte vital del metabolismo, produce especies reactivas de oxígeno como el superóxido y el peróxido de hidrógeno , que conducen a la propagación de radicales libres , dañando las células y contribuyendo a la enfermedad y, posiblemente, al envejecimiento y la senescencia . Las enzimas que llevan a cabo esta vía metabólica también son el objetivo de muchos medicamentos y venenos que inhiben sus actividades.

Quimiosmosis

La fosforilación oxidativa funciona mediante el uso de reacciones químicas que liberan energía para impulsar reacciones que requieren energía. Se dice que los dos conjuntos de reacciones están acoplados . Esto significa que uno no puede ocurrir sin el otro. La cadena de reacciones redox que impulsa el flujo de electrones a través de la cadena de transporte de electrones, desde los donantes de electrones como NADH hasta los aceptores de electrones como el oxígeno y el hidrógeno (protones), es un proceso exergónico : libera energía, mientras que la síntesis de ATP es un proceso endergónico , que requiere un aporte de energía. Tanto la cadena de transporte de electrones como la ATP sintasa están incrustadas en una membrana, y la energía se transfiere de la cadena de transporte de electrones a la ATP sintasa mediante movimientos de protones a través de esta membrana, en un proceso llamado quimiosmosis . [3] Una corriente de protones es impulsada desde el lado N negativo de la membrana al lado P positivo a través de las enzimas de bombeo de protones de la cadena de transporte de electrones. El movimiento de protones crea un gradiente electroquímico a través de la membrana, llamado fuerza protón-motriz . Tiene dos componentes: una diferencia en la concentración de protones (un gradiente de H + , Δ pH ) y una diferencia en el potencial eléctrico , con el lado N con carga negativa. [4]

La ATP sintasa libera esta energía almacenada completando el circuito y permitiendo que los protones fluyan por el gradiente electroquímico, de regreso al lado N de la membrana. [5] El gradiente electroquímico impulsa la rotación de parte de la estructura de la enzima y acopla este movimiento a la síntesis de ATP.

Los dos componentes de la fuerza protón-motriz son termodinámicamente equivalentes: en las mitocondrias, la mayor parte de la energía es proporcionada por el potencial; en las bacterias alcalófilas , la energía eléctrica incluso tiene que compensar una diferencia inversa de pH. A la inversa, los cloroplastos funcionan principalmente en ΔpH. Sin embargo, también requieren un pequeño potencial de membrana para la cinética de la síntesis de ATP. En el caso de la fusobacteria Propionigenium modestum, impulsa la contrarrotación de las subunidades a y c del motor F O de la ATP sintasa. [4]

La cantidad de energía liberada por la fosforilación oxidativa es alta, comparada con la cantidad producida por la fermentación anaeróbica . La glucólisis produce solo 2 moléculas de ATP, pero entre 30 y 36 ATP se producen por la fosforilación oxidativa de las 10 moléculas de NADH y 2 de succinato que se forman al convertir una molécula de glucosa en dióxido de carbono y agua [6] , mientras que cada ciclo de beta oxidación de un ácido graso produce alrededor de 14 ATP. Estos rendimientos de ATP son valores máximos teóricos; en la práctica, algunos protones se filtran a través de la membrana, lo que reduce el rendimiento de ATP. [7]

Moléculas de transferencia de electrones y protones

Reducción de la coenzima Q de su forma ubiquinona (Q) a la forma ubiquinol reducida (QH 2 ).

La cadena de transporte de electrones transporta tanto protones como electrones, pasando electrones de donantes a aceptores y transportando protones a través de una membrana. Estos procesos utilizan moléculas de transferencia tanto solubles como unidas a proteínas. En las mitocondrias, los electrones se transfieren dentro del espacio intermembrana por la proteína de transferencia de electrones soluble en agua citocromo c . [8] Esta transporta solo electrones, y estos se transfieren por la reducción y oxidación de un átomo de hierro que la proteína mantiene dentro de un grupo hemo en su estructura. El citocromo c también se encuentra en algunas bacterias, donde se encuentra dentro del espacio periplásmico . [9]

Dentro de la membrana mitocondrial interna, la coenzima Q10 (Q), transportadora de electrones soluble en lípidos, transporta electrones y protones mediante un ciclo redox . [10] Esta pequeña molécula de benzoquinona es muy hidrófoba , por lo que se difunde libremente dentro de la membrana. Cuando Q acepta dos electrones y dos protones, se reduce a la forma ubiquinol (QH 2 ); cuando QH 2 libera dos electrones y dos protones, se oxida de nuevo a la forma ubiquinona (Q). Como resultado, si dos enzimas se organizan de modo que Q se reduzca en un lado de la membrana y QH 2 se oxide en el otro, la ubiquinona acoplará estas reacciones y transportará protones a través de la membrana. [11] Algunas cadenas de transporte de electrones bacterianas utilizan diferentes quinonas, como la menaquinona , además de la ubiquinona. [12]

Dentro de las proteínas, los electrones se transfieren entre cofactores de flavina , [5] [13] cúmulos de hierro-azufre y citocromos. Hay varios tipos de cúmulos de hierro-azufre. El tipo más simple que se encuentra en la cadena de transferencia de electrones consiste en dos átomos de hierro unidos por dos átomos de azufre inorgánico ; estos se denominan cúmulos [2Fe–2S]. El segundo tipo, llamado [4Fe–4S], contiene un cubo de cuatro átomos de hierro y cuatro átomos de azufre. Cada átomo de hierro en estos cúmulos está coordinado por un aminoácido adicional , generalmente por el átomo de azufre de la cisteína . Los cofactores de iones metálicos experimentan reacciones redox sin unirse ni liberar protones, por lo que en la cadena de transporte de electrones sirven únicamente para transportar electrones a través de las proteínas. Los electrones se mueven distancias bastante largas a través de las proteínas saltando a lo largo de las cadenas de estos cofactores. [14] Esto ocurre por efecto túnel cuántico , que es rápido en distancias de menos de 1,4 × 10 −9 m. [15]

Cadenas de transporte de electrones eucariotas

Muchos procesos bioquímicos catabólicos , como la glucólisis , el ciclo del ácido cítrico y la beta oxidación , producen la coenzima reducida NADH . Esta coenzima contiene electrones que tienen un alto potencial de transferencia ; en otras palabras, liberarán una gran cantidad de energía al oxidarse. Sin embargo, la célula no libera esta energía de una sola vez, ya que sería una reacción incontrolable. En cambio, los electrones se eliminan del NADH y pasan al oxígeno a través de una serie de enzimas que liberan cada una una pequeña cantidad de energía. Este conjunto de enzimas, que consta de los complejos I a IV, se llama cadena de transporte de electrones y se encuentra en la membrana interna de la mitocondria . El succinato también se oxida mediante la cadena de transporte de electrones, pero alimenta la vía en un punto diferente.

En los eucariotas , las enzimas de este sistema de transporte de electrones utilizan la energía liberada del O2 por el NADH para bombear protones a través de la membrana interna de la mitocondria. Esto hace que los protones se acumulen en el espacio intermembrana y genera un gradiente electroquímico a través de la membrana. La energía almacenada en este potencial es luego utilizada por la ATP sintasa para producir ATP. La fosforilación oxidativa en la mitocondria eucariota es el ejemplo mejor entendido de este proceso. La mitocondria está presente en casi todos los eucariotas, con la excepción de los protozoos anaeróbicos como Trichomonas vaginalis que, en cambio, reducen los protones a hidrógeno en una mitocondria remanente llamada hidrogenosoma . [16]

Enzimas respiratorias y sustratos típicos en eucariotas.
Enzima respiratoriaPar redoxPotencial de punto medio 

(Voltios)

NADH deshidrogenasaNAD + / NADH-0,32 [17]
Succinato deshidrogenasaFMN o FAD / FMNH 2 o FADH 2-0,20 [17]
Complejo citocromo bc 1Coenzima Q10 buey / Coenzima Q10 roja+0,06 [17]
Complejo citocromo bc 1Citocromo b ox / Citocromo b rojo+0,12 [17]
Complejo IVCitocromo c ox / Citocromo c rojo+0,22 [17]
Complejo IVCitocromo a buey / Citocromo a rojo+0,29 [17]
Complejo IVO2 / HO−​+0,82 [17]
Condiciones: pH = 7 [17]

NADH-coenzima Q oxidorreductasa (complejo I)

Complejo I o NADH-Q oxidorreductasa . Las abreviaturas se comentan en el texto. En todos los diagramas de complejos respiratorios de este artículo, la matriz se encuentra en la parte inferior, con el espacio intermembrana por encima. [ se necesita referencia de imagen ]

La NADH-coenzima Q oxidorreductasa , también conocida como NADH deshidrogenasa o complejo I , es la primera proteína en la cadena de transporte de electrones. [18] El complejo I es una enzima gigante con el complejo I de mamíferos que tiene 46 subunidades y una masa molecular de aproximadamente 1.000 kilodaltons (kDa). [19] La estructura se conoce en detalle solo de una bacteria; [20] [21] en la mayoría de los organismos el complejo se asemeja a una bota con una gran "bola" que sobresale de la membrana hacia la mitocondria. [22] [23] Los genes que codifican las proteínas individuales están contenidos tanto en el núcleo celular como en el genoma mitocondrial , como es el caso de muchas enzimas presentes en la mitocondria.

La reacción que cataliza esta enzima es la oxidación de dos electrones del NADH por la coenzima Q10 o ubiquinona (representada como Q en la ecuación siguiente), una quinona liposoluble que se encuentra en la membrana mitocondrial:

NADH + Q + 5 yo matriz + ⟶ NAD + + Buena suerte 2 + 4 yo intermembrana + {\displaystyle {\ce {NADH + Q + 5H+_{matriz}-> NAD+ + QH2 + 4H+_{intermembrana}}}} ( 1 )

El inicio de la reacción, y de hecho de toda la cadena electrónica, es la unión de una molécula de NADH al complejo I y la donación de dos electrones. Los electrones entran al complejo I a través de un grupo prostético unido al complejo, el mononucleótido de flavina (FMN). La adición de electrones al FMN lo convierte en su forma reducida, FMNH 2 . Los electrones luego se transfieren a través de una serie de grupos de hierro-azufre: el segundo tipo de grupo prostético presente en el complejo. [20] Hay grupos de hierro-azufre tanto [2Fe–2S] como [4Fe–4S] en el complejo I.

A medida que los electrones pasan a través de este complejo, se bombean cuatro protones desde la matriz hacia el espacio intermembrana. No está claro exactamente cómo ocurre esto, pero parece implicar cambios conformacionales en el complejo I que hacen que la proteína se una a los protones en el lado N de la membrana y los libere en el lado P de la membrana. [24] Finalmente, los electrones se transfieren desde la cadena de grupos de hierro-azufre a una molécula de ubiquinona en la membrana. [18] La reducción de la ubiquinona también contribuye a la generación de un gradiente de protones, ya que se toman dos protones de la matriz a medida que se reduce a ubiquinol (QH 2 ).

Succinato-Q oxidorreductasa (complejo II)

Complejo II: Succinato-Q oxidorreductasa .

La succinato-Q oxidorreductasa , también conocida como complejo II o succinato deshidrogenasa , es un segundo punto de entrada a la cadena de transporte de electrones. [25] Es inusual porque es la única enzima que forma parte tanto del ciclo del ácido cítrico como de la cadena de transporte de electrones. El complejo II consta de cuatro subunidades proteicas y contiene un cofactor de dinucleótido de flavina y adenina (FAD) unido, grupos de hierro-azufre y un grupo hemo que no participa en la transferencia de electrones a la coenzima Q, pero se cree que es importante para disminuir la producción de especies reactivas de oxígeno. [26] [27] Oxida el succinato a fumarato y reduce la ubiquinona. Como esta reacción libera menos energía que la oxidación de NADH, el complejo II no transporta protones a través de la membrana y no contribuye al gradiente de protones.

Succinato + Q ⟶ Fumarato + Buena suerte 2 {\displaystyle {\ce {{Succinato}+ Q -> {Fumarato}+ QH2}}} ( 2 )

En algunos eucariotas, como el gusano parásito Ascaris suum , una enzima similar al complejo II, la fumarato reductasa (menaquinol: fumarato oxidorreductasa o QFR), opera a la inversa para oxidar el ubiquinol y reducir el fumarato. Esto permite que el gusano sobreviva en el ambiente anaeróbico del intestino grueso , llevando a cabo la fosforilación oxidativa anaeróbica con el fumarato como aceptor de electrones. [28] Otra función no convencional del complejo II se observa en el parásito de la malaria Plasmodium falciparum . Aquí, la acción inversa del complejo II como oxidasa es importante para regenerar el ubiquinol, que el parásito utiliza en una forma inusual de biosíntesis de pirimidina . [29]

Oxidorreductasa de flavoproteína-Q de transferencia de electrones

La flavoproteína-ubiquinona oxidorreductasa de transferencia de electrones (ETF-Q oxidorreductasa), también conocida como flavoproteína deshidrogenasa de transferencia de electrones , es un tercer punto de entrada a la cadena de transporte de electrones. Es una enzima que acepta electrones de la flavoproteína de transferencia de electrones en la matriz mitocondrial y utiliza estos electrones para reducir la ubiquinona. [30] Esta enzima contiene una flavina y un grupo [4Fe–4S], pero, a diferencia de los otros complejos respiratorios, se adhiere a la superficie de la membrana y no atraviesa la bicapa lipídica. [31]

ETF rojo + Q ⟶ ETF buey + Buena suerte 2 {\displaystyle {\ce {ETF_{red}{}+ Q -> ETF_{ox}{}+ QH2}}} ( 3 )

En los mamíferos, esta vía metabólica es importante en la beta oxidación de los ácidos grasos y el catabolismo de los aminoácidos y la colina , ya que acepta electrones de múltiples acetil-CoA deshidrogenasas. [32] [33] En las plantas, la oxidorreductasa ETF-Q también es importante en las respuestas metabólicas que permiten la supervivencia en períodos prolongados de oscuridad. [34]

Q-citocromo c oxidorreductasa (complejo III)

Los dos pasos de transferencia de electrones en el complejo III: Q-citocromo c oxidorreductasa . Después de cada paso, Q (en la parte superior de la figura) abandona la enzima.

La Q-citocromo c oxidorreductasa también se conoce como citocromo c reductasa , complejo citocromo bc 1 o simplemente complejo III . [35] [36] En los mamíferos, esta enzima es un dímero , y cada complejo de subunidades contiene 11 subunidades proteicas, un grupo hierro-azufre [2Fe-2S] y tres citocromos : un citocromo c 1 y dos citocromos b . [37] Un citocromo es un tipo de proteína de transferencia de electrones que contiene al menos un grupo hemo . Los átomos de hierro dentro de los grupos hemo del complejo III alternan entre un estado ferroso reducido (+2) y férrico oxidado (+3) a medida que los electrones se transfieren a través de la proteína.

La reacción catalizada por el complejo III es la oxidación de una molécula de ubiquinol y la reducción de dos moléculas de citocromo c , una proteína hemo asociada de forma vaga a la mitocondria. A diferencia de la coenzima Q, que lleva dos electrones, el citocromo c lleva sólo un electrón.

Buena suerte 2 + 2 Cita do buey + 2 yo matriz + ⟶ Q + 2 Cita do rojo + 4 yo intermembrana + {\displaystyle {\ce {QH2{}+ 2 Cyt\, c_{ox}{}+ 2H+_{matriz}-> Q{}+ 2 Cyt\, c_{rojo}{}+ 4H+_{intermembrana}}}} ( 4 )

Como sólo uno de los electrones puede ser transferido desde el donante QH 2 a un aceptor de citocromo c a la vez, el mecanismo de reacción del complejo III es más elaborado que los de los otros complejos respiratorios, y ocurre en dos pasos llamados ciclo Q. [38] En el primer paso, la enzima se une a tres sustratos, primero, QH 2 , que luego se oxida, pasando un electrón al segundo sustrato, el citocromo c. Los dos protones liberados de QH 2 pasan al espacio intermembrana. El tercer sustrato es Q, que acepta el segundo electrón del QH 2 y se reduce a Q .− , que es el radical libre ubisemiquinona . Los primeros dos sustratos se liberan, pero este intermediario ubisemiquinona permanece unido. En el segundo paso, una segunda molécula de QH 2 se une y nuevamente pasa su primer electrón a un aceptor de citocromo c. El segundo electrón pasa a la ubisemiquinona unida, reduciéndola a QH 2 al ganar dos protones de la matriz mitocondrial. Luego, este QH 2 se libera de la enzima. [39]

A medida que la coenzima Q se reduce a ubiquinol en el lado interno de la membrana y se oxida a ubiquinona en el otro, se produce una transferencia neta de protones a través de la membrana, lo que aumenta el gradiente de protones. [5] El mecanismo de dos pasos, bastante complejo, por el que esto ocurre es importante, ya que aumenta la eficiencia de la transferencia de protones. Si, en lugar del ciclo Q, se utilizara una molécula de QH 2 para reducir directamente dos moléculas de citocromo c, la eficiencia se reduciría a la mitad, y solo se transferiría un protón por cada citocromo c reducido. [5]

Citocromo c oxidasa (complejo IV)

Complejo IV: citocromo c oxidasa .

La citocromo c oxidasa , también conocida como complejo IV , es el complejo proteico final en la cadena de transporte de electrones. [40] La enzima de los mamíferos tiene una estructura extremadamente complicada y contiene 13 subunidades, dos grupos hemo, así como múltiples cofactores de iones metálicos: en total, tres átomos de cobre , uno de magnesio y uno de zinc . [41]

Esta enzima media la reacción final en la cadena de transporte de electrones y transfiere electrones al oxígeno y al hidrógeno (protones), mientras bombea protones a través de la membrana. [42] El oxígeno, el último aceptor de electrones , se reduce a agua en este paso. Tanto el bombeo directo de protones como el consumo de protones de la matriz en la reducción del oxígeno contribuyen al gradiente de protones. La reacción catalizada es la oxidación del citocromo c y la reducción del oxígeno:

4 Cita do rojo + Oh 2 + 8 yo matriz + ⟶ 4 Cita do buey + 2 yo 2 Oh + 4 yo intermembrana + {\displaystyle {\ce {4Cyt\,c_{red}{}+O2{}+8H+_{matriz}->4Cyt\,c_{ox}{}+2H2O{}+4H+_{intermembrana}}}} ( 5 )

Reductasas y oxidasas alternativas

Muchos organismos eucariotas tienen cadenas de transporte de electrones que difieren de las enzimas de mamíferos descritas anteriormente, que han sido muy estudiadas. Por ejemplo, las plantas tienen oxidasas de NADH alternativas, que oxidan el NADH en el citosol en lugar de en la matriz mitocondrial, y pasan estos electrones al depósito de ubiquinona. [43] Estas enzimas no transportan protones y, por lo tanto, reducen la ubiquinona sin alterar el gradiente electroquímico a través de la membrana interna. [44]

Otro ejemplo de una cadena de transporte de electrones divergente es la oxidasa alternativa , que se encuentra en las plantas , así como en algunos hongos , protistas y posiblemente algunos animales. [45] [46] Esta enzima transfiere electrones directamente del ubiquinol al oxígeno. [47]

Las vías de transporte de electrones producidas por estas oxidasas alternativas de NADH y ubiquinona tienen rendimientos de ATP más bajos que la vía completa. Las ventajas producidas por una vía acortada no están del todo claras. Sin embargo, la oxidasa alternativa se produce en respuesta a estreses como el frío, las especies reactivas de oxígeno y la infección por patógenos, así como otros factores que inhiben la cadena de transporte de electrones completa. [48] [49] Por lo tanto, las vías alternativas podrían mejorar la resistencia de un organismo a las lesiones, al reducir el estrés oxidativo . [50]

Organización de complejos

El modelo original de cómo se organizan los complejos de la cadena respiratoria era que se difundían libre e independientemente en la membrana mitocondrial. [51] Sin embargo, datos recientes sugieren que los complejos podrían formar estructuras de orden superior llamadas supercomplejos o " respirasomas ". [52] En este modelo, los diversos complejos existen como conjuntos organizados de enzimas interactuantes. [53] Estas asociaciones podrían permitir la canalización de sustratos entre los diversos complejos enzimáticos, aumentando la velocidad y la eficiencia de la transferencia de electrones. [54] Dentro de estos supercomplejos mamíferos, algunos componentes estarían presentes en mayores cantidades que otros, con algunos datos que sugieren una relación entre los complejos I/II/III/IV y la ATP sintasa de aproximadamente 1:1:3:7:4. [55] Sin embargo, el debate sobre esta hipótesis del supercomplejo no está completamente resuelto, ya que algunos datos no parecen encajar con este modelo. [19] [56]

Cadenas de transporte de electrones procariotas

En contraste con la similitud general en la estructura y función de las cadenas de transporte de electrones en eucariotas, las bacterias y las arqueas poseen una gran variedad de enzimas de transferencia de electrones. Estas utilizan un conjunto igualmente amplio de sustancias químicas como sustratos. [57] Al igual que en eucariotas, el transporte de electrones en procariotas utiliza la energía liberada por la oxidación de un sustrato para bombear iones a través de una membrana y generar un gradiente electroquímico. En las bacterias, la fosforilación oxidativa en Escherichia coli se conoce con mayor detalle, mientras que los sistemas de las arqueas son actualmente poco conocidos. [58]

La principal diferencia entre la fosforilación oxidativa eucariota y procariota es que las bacterias y las arqueas utilizan muchas sustancias diferentes para donar o aceptar electrones. Esto permite que los procariotas crezcan en una amplia variedad de condiciones ambientales. [59] En E. coli , por ejemplo, la fosforilación oxidativa puede ser impulsada por una gran cantidad de pares de agentes reductores y agentes oxidantes, que se enumeran a continuación. El potencial de punto medio de una sustancia química mide cuánta energía se libera cuando se oxida o se reduce, y los agentes reductores tienen potenciales negativos y los agentes oxidantes, potenciales positivos.

Enzimas respiratorias y sustratos en E. coli . [60]
Enzima respiratoriaPar redoxPotencial de punto medio 

(Voltios)

Formato deshidrogenasaBicarbonato / Formato-0,43
HidrogenasaProtón / Hidrógeno-0,42
NADH deshidrogenasaNAD + / NADH-0,32
Glicerol-3-fosfato deshidrogenasaDHAP / Gly-3-P-0,19
Piruvato oxidasaAcetato + dióxido de carbono / piruvato?
Lactato deshidrogenasaPiruvato / Lactato-0,19
D- aminoácido deshidrogenasa2-oxoácido + amoniaco / D -aminoácido?
Glucosa deshidrogenasaGluconato / glucosa-0,14
Succinato deshidrogenasaFumarato / Succinato+0,03
Ubiquinol oxidasaOxígeno / Agua+0,82
Nitrato reductasaNitrato / Nitrito+0,42
Nitrito reductasaNitrito / Amoniaco+0,36
Dimetilsulfóxido reductasaDMSO / DMS+0,16
Reductasa de N -óxido de trimetilaminaTMAO / TMA+0,13
Fumarato reductasaFumarato / Succinato+0,03

Como se muestra arriba, E. coli puede crecer con agentes reductores como formiato, hidrógeno o lactato como donantes de electrones, y nitrato, DMSO u oxígeno como aceptores. [59] Cuanto mayor sea la diferencia en el potencial de punto medio entre un agente oxidante y reductor, más energía se libera cuando reaccionan. De estos compuestos, el par succinato/fumarato es inusual, ya que su potencial de punto medio es cercano a cero. Por lo tanto, el succinato se puede oxidar a fumarato si está disponible un agente oxidante fuerte como el oxígeno, o el fumarato se puede reducir a succinato usando un agente reductor fuerte como el formiato. Estas reacciones alternativas son catalizadas por la succinato deshidrogenasa y la fumarato reductasa , respectivamente. [61]

Algunos procariotas utilizan pares redox que tienen solo una pequeña diferencia en el potencial de punto medio. Por ejemplo, las bacterias nitrificantes como Nitrobacter oxidan el nitrito a nitrato, donando los electrones al oxígeno. La pequeña cantidad de energía liberada en esta reacción es suficiente para bombear protones y generar ATP, pero no suficiente para producir NADH o NADPH directamente para su uso en el anabolismo . [62] Este problema se resuelve utilizando una nitrito oxidorreductasa para producir suficiente fuerza protomomotriz para ejecutar parte de la cadena de transporte de electrones en sentido inverso, lo que hace que el complejo I genere NADH. [63] [64]

Los procariotas controlan el uso de estos donantes y aceptores de electrones al variar las enzimas que se producen, en respuesta a las condiciones ambientales. [65] Esta flexibilidad es posible porque diferentes oxidasas y reductasas utilizan el mismo grupo de ubiquinona. Esto permite que muchas combinaciones de enzimas funcionen juntas, unidas por el intermediario común ubiquinol. [60] Por lo tanto, estas cadenas respiratorias tienen un diseño modular , con conjuntos de sistemas enzimáticos fácilmente intercambiables.

Además de esta diversidad metabólica, los procariotas también poseen una gama de isoenzimas  , diferentes enzimas que catalizan la misma reacción. Por ejemplo, en E. coli , hay dos tipos diferentes de ubiquinol oxidasa que utilizan el oxígeno como aceptor de electrones. En condiciones altamente aeróbicas, la célula utiliza una oxidasa con baja afinidad por el oxígeno que puede transportar dos protones por electrón. Sin embargo, si los niveles de oxígeno caen, cambian a una oxidasa que transfiere solo un protón por electrón, pero tiene una alta afinidad por el oxígeno. [66]

ATP sintasa (complejo V)

La ATP sintasa, también llamada complejo V , es la enzima final en la vía de la fosforilación oxidativa. Esta enzima se encuentra en todas las formas de vida y funciona de la misma manera tanto en procariotas como en eucariotas. [67] La ​​enzima utiliza la energía almacenada en un gradiente de protones a través de una membrana para impulsar la síntesis de ATP a partir de ADP y fosfato (P i ). Las estimaciones de la cantidad de protones necesarios para sintetizar un ATP han oscilado entre tres y cuatro, [68] [69] y algunos sugieren que las células pueden variar esta proporción para adaptarse a diferentes condiciones. [70]

PDA + PAG i + 4 yo intermembrana + ↽ − − ⇀ ATP + yo 2 Oh + 4 yo matriz + {\displaystyle {\ce {ADP + P_i + 4H+_{intermembrana}<=> ATP + H2O + 4H+_{matriz}}}} ( 6 )

Esta reacción de fosforilación es un equilibrio que se puede alterar modificando la fuerza protón-motriz. En ausencia de una fuerza protón-motriz, la reacción de la ATP sintasa se desarrollará de derecha a izquierda, hidrolizando el ATP y bombeando protones fuera de la matriz a través de la membrana. Sin embargo, cuando la fuerza protón-motriz es alta, la reacción se ve obligada a desarrollarse en la dirección opuesta; procede de izquierda a derecha, permitiendo que los protones fluyan a favor de su gradiente de concentración y convirtiendo el ADP en ATP. [67] De hecho, en las H+-ATPasas de tipo vacuolar estrechamente relacionadas , la reacción de hidrólisis se utiliza para acidificar los compartimentos celulares, bombeando protones e hidrolizando el ATP. [71]

La ATP sintasa es un complejo proteico masivo con forma de hongo. El complejo enzimático de los mamíferos contiene 16 subunidades y tiene una masa de aproximadamente 600 kilodaltons . [72] La porción incrustada dentro de la membrana se llama F O y contiene un anillo de subunidades c y el canal de protones. El tallo y la cabeza esférica se llama F 1 y es el sitio de la síntesis de ATP. El complejo esférica al final de la porción F 1 contiene seis proteínas de dos tipos diferentes (tres subunidades α y tres subunidades β), mientras que el "tallo" consta de una proteína: la subunidad γ, con la punta del tallo extendiéndose hacia la bola de subunidades α y β. [73] Tanto las subunidades α como las β unen nucleótidos, pero solo las subunidades β catalizan la reacción de síntesis de ATP. A lo largo del costado de la porción F 1 y de regreso a la membrana se encuentra una subunidad larga con forma de varilla que ancla las subunidades α y β a la base de la enzima.

A medida que los protones cruzan la membrana a través del canal en la base de la ATP sintasa, el motor impulsado por protones F O gira. [74] La rotación puede ser causada por cambios en la ionización de los aminoácidos en el anillo de subunidades c que causan interacciones electrostáticas que impulsan el anillo de subunidades c más allá del canal de protones. [75] Este anillo giratorio a su vez impulsa la rotación del eje central (el tallo de la subunidad γ) dentro de las subunidades α y β. Las subunidades α y β no pueden girar por sí mismas mediante el brazo lateral, que actúa como un estator . Este movimiento de la punta de la subunidad γ dentro de la bola de subunidades α y β proporciona la energía para que los sitios activos en las subunidades β experimenten un ciclo de movimientos que produce y luego libera ATP. [76]

Mecanismo de la ATP sintasa . El ATP se muestra en rojo, el ADP y el fosfato en rosa y la subunidad γ giratoria en negro.

Esta reacción de síntesis de ATP se denomina mecanismo de cambio de enlace e implica que el sitio activo de una subunidad β pase por tres estados. [77] En el estado "abierto", el ADP y el fosfato entran en el sitio activo (que se muestra en marrón en el diagrama). A continuación, la proteína se cierra alrededor de las moléculas y las une de forma laxa: el estado "suelto" (que se muestra en rojo). A continuación, la enzima cambia de forma de nuevo y fuerza a estas moléculas a unirse, con el sitio activo en el estado "apretado" resultante (que se muestra en rosa) uniendo la molécula de ATP recién producida con una afinidad muy alta . Finalmente, el sitio activo vuelve al estado abierto, liberando ATP y uniendo más ADP y fosfato, listo para el siguiente ciclo.

En algunas bacterias y arqueas, la síntesis de ATP está impulsada por el movimiento de iones de sodio a través de la membrana celular, en lugar del movimiento de protones. [78] [79] Las arqueas como Methanococcus también contienen la A 1 A o sintasa, una forma de la enzima que contiene proteínas adicionales con poca similitud en secuencia con otras subunidades de ATP sintasa bacterianas y eucariotas. Es posible que, en algunas especies, la forma A 1 A o de la enzima sea una ATP sintasa especializada impulsada por sodio, [80] pero esto podría no ser cierto en todos los casos. [79]

Fosforilación oxidativa – energética

El transporte de electrones desde el par redox NAD + /NADH al par redox final 1/2 O2 / H2O se puede resumir como

1/2 O 2 + NADH + H + → H 2 O + NAD +

La diferencia de potencial entre estos dos pares redox es de 1,14 voltios, lo que equivale a -52 kcal/mol o -2600 kJ por 6 moles de O 2 .

Cuando un NADH se oxida a través de la cadena de transferencia de electrones, se producen tres ATP, lo que equivale a 7,3 kcal/mol x 3 = 21,9 kcal/mol.

La conservación de la energía se puede calcular mediante la siguiente fórmula

Eficiencia = (21,9 x 100%) / 52 = 42%

Así que podemos concluir que cuando el NADH se oxida, alrededor del 42% de la energía se conserva en forma de tres ATP y la energía restante (58%) se pierde en forma de calor (a menos que se haya subestimado la energía química del ATP en condiciones fisiológicas).

Especies reactivas de oxígeno

El oxígeno molecular es un buen aceptor terminal de electrones porque es un agente oxidante fuerte. La reducción del oxígeno implica intermediarios potencialmente dañinos. [81] Aunque la transferencia de cuatro electrones y cuatro protones reduce el oxígeno a agua, que es inofensiva, la transferencia de uno o dos electrones produce aniones superóxido o peróxido , que son peligrosamente reactivos.

Oh 2 → mi − Oh 2 ∙ _ Superóxido → mi − Oh 2 2 − Peróxido {\displaystyle {\ce {O2->[{\ce {e^{-}}}]{\underset {Superoxide}{O2^{\underline {\bullet }}}}->[{\ce {e^{-}}}]{\underset {Peroxide}{O2^{2-}}}}}} ( 7 )

Estas especies reactivas de oxígeno y sus productos de reacción, como el radical hidroxilo , son muy perjudiciales para las células, ya que oxidan las proteínas y provocan mutaciones en el ADN . Este daño celular puede contribuir a la aparición de enfermedades y se propone como una de las causas del envejecimiento . [82] [83]

El complejo citocromo c oxidasa es muy eficiente en la reducción del oxígeno a agua y libera muy pocos intermediarios parcialmente reducidos; sin embargo, la cadena de transporte de electrones produce pequeñas cantidades de anión superóxido y peróxido. [84] Particularmente importante es la reducción de la coenzima Q en el complejo III, ya que se forma un radical libre ubisemiquinona altamente reactivo como intermediario en el ciclo Q. Esta especie inestable puede provocar una "fuga" de electrones cuando los electrones se transfieren directamente al oxígeno, formando superóxido. [85] Como la producción de especies reactivas de oxígeno por estos complejos de bombeo de protones es mayor a potenciales de membrana altos, se ha propuesto que las mitocondrias regulan su actividad para mantener el potencial de membrana dentro de un rango estrecho que equilibra la producción de ATP frente a la generación de oxidantes. [86] Por ejemplo, los oxidantes pueden activar proteínas desacopladoras que reducen el potencial de membrana. [87]

Para contrarrestar estas especies reactivas de oxígeno, las células contienen numerosos sistemas antioxidantes , incluidas vitaminas antioxidantes como la vitamina C y la vitamina E , y enzimas antioxidantes como la superóxido dismutasa , la catalasa y las peroxidasas , [81] que desintoxican las especies reactivas, limitando el daño a la célula.

Fosforilación oxidativa en condiciones hipóxicas/anóxicas

Como el oxígeno es fundamental para la fosforilación oxidativa, una escasez en el nivel de O2 puede alterar las tasas de producción de ATP. En condiciones anóxicas, la ATP-sintasa cometerá una "traición celular" y funcionará en sentido inverso, forzando a los protones de la matriz a regresar al espacio de la membrana interna, consumiendo ATP en el proceso. [88] La fuerza motriz de protones y la producción de ATP se pueden mantener mediante la acidosis intracelular. [89] Los protones citosólicos que se han acumulado con la hidrólisis de ATP y la acidosis láctica pueden difundirse libremente a través de la membrana externa mitocondrial y acidificar el espacio intermembrana, contribuyendo así directamente a la fuerza motriz de protones y la producción de ATP.

Inhibidores

Existen varios fármacos y toxinas bien conocidos que inhiben la fosforilación oxidativa. Aunque cualquiera de estas toxinas inhibe sólo una enzima en la cadena de transporte de electrones, la inhibición de cualquier paso de este proceso detendrá el resto del proceso. Por ejemplo, si la oligomicina inhibe la ATP sintasa, los protones no pueden volver a pasar a la mitocondria. [90] Como resultado, las bombas de protones no pueden funcionar, ya que el gradiente se vuelve demasiado fuerte para que lo superen. El NADH ya no se oxida y el ciclo del ácido cítrico deja de funcionar porque la concentración de NAD + cae por debajo de la concentración que estas enzimas pueden utilizar.

Muchos inhibidores específicos de la cadena de transporte de electrones han contribuido al conocimiento actual de la respiración mitocondrial. La síntesis de ATP también depende de la cadena de transporte de electrones, por lo que todos los inhibidores específicos de la cadena también inhiben la formación de ATP. El veneno para peces rotenona , el fármaco barbitúrico amital y el antibiótico piericidina A inhiben el NADH y la coenzima Q. [91]

El monóxido de carbono, el cianuro, el sulfuro de hidrógeno y la azida inhiben eficazmente la citocromo oxidasa. El monóxido de carbono reacciona con la forma reducida del citocromo, mientras que el cianuro y la azida reaccionan con la forma oxidada. Un antibiótico, la antimicina A , y el anti-Lewisita británico , un antídoto utilizado contra las armas químicas, son los dos inhibidores importantes del sitio entre el citocromo B y C1. [91]

CompuestosUsarSitio de acciónEfecto sobre la fosforilación oxidativa
Cianuro
Monóxido de carbono
Azida
Sulfuro de hidrógeno		VenenosComplejo IVInhibe la cadena de transporte de electrones uniéndose más fuertemente que el oxígeno al centro Fe – Cu en la citocromo c oxidasa, previniendo la reducción del oxígeno. [92]
OligomicinaAntibióticoComplejo VInhibe la ATP sintasa al bloquear el flujo de protones a través de la subunidad F o . [90]
CCCP
2,4-Dinitrofenol		Venenos para adelgazar [N 1]Membrana internaIonóforos que alteran el gradiente de protones al transportarlos a través de una membrana. Este ionóforo desacopla el bombeo de protones de la síntesis de ATP porque transporta protones a través de la membrana mitocondrial interna. [93]
RotenonaPesticidaComplejo IPreviene la transferencia de electrones del complejo I a la ubiquinona al bloquear el sitio de unión de la ubiquinona. [94]
Malonato y oxaloacetatoVenenosComplejo IIInhibidores competitivos de la succinato deshidrogenasa (complejo II). [95]
Antimicina APiscicidaComplejo IIISe une al sitio Qi de la citocromo c reductasa , inhibiendo así la oxidación del ubiquinol .

No todos los inhibidores de la fosforilación oxidativa son toxinas. En el tejido adiposo pardo , los canales de protones regulados, llamados proteínas desacopladoras, pueden desacoplar la respiración de la síntesis de ATP. [96] Esta respiración rápida produce calor y es particularmente importante como forma de mantener la temperatura corporal de los animales que hibernan , aunque estas proteínas también pueden tener una función más general en las respuestas de las células al estrés. [97]

Historia

El campo de la fosforilación oxidativa comenzó con el informe en 1906 de Arthur Harden sobre un papel vital del fosfato en la fermentación celular , pero inicialmente solo se sabía que los fosfatos de azúcar estaban involucrados. [98] Sin embargo, a principios de la década de 1940, el vínculo entre la oxidación de azúcares y la generación de ATP fue firmemente establecido por Herman Kalckar , [99] confirmando el papel central del ATP en la transferencia de energía que había sido propuesto por Fritz Albert Lipmann en 1941. [100] Más tarde, en 1949, Morris Friedkin y Albert L. Lehninger demostraron que la coenzima NADH vinculaba vías metabólicas como el ciclo del ácido cítrico y la síntesis de ATP. [101] El término fosforilación oxidativa fue acuñado por Volodymyr Belitser  [uk] en 1939. [102] [103]

Durante otros veinte años, el mecanismo por el cual se genera el ATP siguió siendo un misterio, con científicos buscando un esquivo "intermediario de alta energía" que vinculara las reacciones de oxidación y fosforilación. [104] Este rompecabezas fue resuelto por Peter D. Mitchell con la publicación de la teoría quimiosmótica en 1961. [105] Al principio, esta propuesta fue muy controvertida, pero poco a poco fue aceptada y Mitchell recibió el premio Nobel en 1978. [106] [107] La ​​investigación posterior se concentró en purificar y caracterizar las enzimas involucradas, con importantes contribuciones de David E. Green sobre los complejos de la cadena de transporte de electrones, así como de Efraim Racker sobre la ATP sintasa. [108] Un paso crítico hacia la solución del mecanismo de la ATP sintasa fue proporcionado por Paul D. Boyer , con su desarrollo en 1973 del mecanismo de "cambio de enlace", seguido por su propuesta radical de catálisis rotacional en 1982. [77] [109] Trabajos más recientes han incluido estudios estructurales sobre las enzimas involucradas en la fosforilación oxidativa por John E. Walker , con Walker y Boyer recibiendo un Premio Nobel en 1997. [110]

Véase también

Notas

  1. ^ El DNP se utilizó ampliamente como medicamento contra la obesidad en la década de 1930, pero finalmente se dejó de utilizar debido a sus peligrosos efectos secundarios. Sin embargo, el uso ilícito del fármaco con este fin continúa en la actualidad. Consulte 2,4-Dinitrofenol#Ayuda para la dieta para obtener más información.

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  108. ^ Pullman ME, Penefsky HS, Datta A, Racker E (noviembre de 1960). "Resolución parcial de las enzimas que catalizan la fosforilación oxidativa. I. Purificación y propiedades de la adenosina trifosfatasa soluble estimulada por dinitrofenol". The Journal of Biological Chemistry . 235 (11): 3322–3329. doi : 10.1016/S0021-9258(20)81361-1 . PMID  13738472. Archivado desde el original el 29 de septiembre de 2007.
  109. ^ Boyer PD, Cross RL, Momsen W (octubre de 1973). "Un nuevo concepto para el acoplamiento de energía en la fosforilación oxidativa basado en una explicación molecular de las reacciones de intercambio de oxígeno". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 70 (10): 2837–2839. Bibcode :1973PNAS...70.2837B. doi : 10.1073/pnas.70.10.2837 . PMC 427120 . PMID  4517936. 
  110. ^ "El Premio Nobel de Química 1997". Fundación Nobel. Archivado desde el original el 25 de marzo de 2017. Consultado el 21 de julio de 2007 .

Lectura adicional

Introductorio

  • Nelson DL, Cox MM (2004). Principios de bioquímica de Lehninger (4.ª ed.). WH Freeman. ISBN 0-7167-4339-6.
  • Schneider ED, Sagan D (2006). Into the Cool: flujo de energía, termodinámica y vida (1.ª ed.). University of Chicago Press. ISBN 0-226-73937-6.
  • Lane N (2006). Poder, sexo, suicidio: mitocondrias y el sentido de la vida (1.ª ed.). Oxford University Press, EE. UU. ISBN 0-19-920564-7.

Avanzado

  • Nicholls DG, Ferguson SJ (2002). Bioenergética 3 (1.ª ed.). Academic Press. ISBN 0-12-518121-3.
  • Haynie D (2001). Termodinámica biológica (1.ª ed.). Cambridge University Press. ISBN 0-521-79549-4.
  • Rajan SS (2003). Introducción a la bioenergética (1.ª ed.). Anmol. ISBN 81-261-1364-2.
  • Wikstrom M, ed. (2005). Aspectos biofísicos y estructurales de la bioenergética (1.ª ed.). Royal Society of Chemistry. ISBN 0-85404-346-2.

Recursos generales

Recursos estructurales

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