UBQLN1

UBQLN1
Estructuras disponibles
AP	Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación del PDB
	2JY5, 2JY6, 2KLC
Identificadores
Alias	UBQLN1 , DA41, DSK2, PLIC-1, UBQN, XDRP1, ubiquilina 1
Identificaciones externas	OMIM : 605046; MGI : 1860276; HomoloGene : 137258; Tarjetas genéticas : UBQLN1; OMA :UBQLN1 - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 9 (humano)
Fin	83.707.958 pb
Ubicación del gen ( ratón )
Cristo.	Cromosoma 13 (ratón)
Fin	58.363.467 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	mucosa del íleon; ; Tejido muscular cardíaco de la aurícula derecha; ; piel del brazo; ; músculo tibial anterior; ; miocardio del ventrículo izquierdo; ; célula endotelial; ; Puente de Varolio; ; célula epitelial pancreática; ; eminencia ganglionar; ; célula estromal del endometrio;
	Top expresado en
	ovocito secundario; ; vesícula seminal; ; glándula parótida; ; núcleo dorsal medial; ; núcleos pontinos; ; área tegmental ventral; ; núcleo tegmental dorsal; ; núcleos cerebelosos profundos; ; veta primitiva; ; núcleo geniculado medial;
	Más datos de expresión de referencia
	n / A
Ontología genética
Función molecular	unión a proteínas dependiente de la modificación de la poliubiquitina; unión de quinasa; unión de proteínas; unión de proteínas idénticas;
Componente celular	citoplasma; membrana; membrana plasmática; nucleoplasm; agresivo; autofagosoma; retículo endoplasmático; región perinuclear del citoplasma; complejo proteasoma; vesícula citoplasmática; núcleo; citosol; complejo que contiene proteínas;
Proceso biológico	agrefagia; Regulación negativa de la actividad del canal de calcio operado por el depósito; Regulación de la ubiquitinación de proteínas.; regulación de la vía de señalización apoptótica intrínseca inducida por estrés oxidativo; Respuesta al estrés del retículo endoplásmico; Regulación positiva del proceso catabólico de proteínas dependiente de ubiquitina asociado al ER; autofagia; vía ERAD dependiente de ubiquitina; Regulación positiva de la ubiquitinación de proteínas.; Regulación negativa de la vía de señalización del receptor tipo Toll 3; respuesta celular a la hipoxia; maduración del autofagosoma; ensamblaje del autofagosoma; macroautofagia; Proceso catabólico de proteínas dependiente de ubiquitina; regulación de la macroautofagia;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	29979
	56085
	ENSG00000135018
	ENSMUSG00000005312
	Q9UMX0
	Q8R317
	Número de serie 013438 Número de ; serie 053067
	Número de serie 026842 Número de ; serie 152234
	NP_038466 ; NP_444295 ; NP_444295.1
	NP_081118NP_689420;
	Wikidatos
Ver/Editar humano	Ver/Editar ratón

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La ubiquilina-1 es una proteína que en los humanos está codificada por el gen UBQLN1 . ^[5]^[6]^[7]

Las ubiquilinas contienen dos dominios , un dominio similar a la ubiquitina en la terminal N y un dominio asociado a la ubiquitina en la terminal C. Se asocian físicamente con los proteasomas y las ligasas de ubiquitina y, por lo tanto, se cree que vinculan funcionalmente la maquinaria de ubiquitinación al proteasoma para efectuar la degradación de proteínas in vivo .

Funciones

La ubiquilina-1 está asociada con la degradación de proteínas y la agregación de proteínas mal plegadas , y puede estar involucrada en enfermedades neurodegenerativas . ^[8]^[9] Se ha informado que la ubiquilina-1 actúa como una chaperona molecular para la proteína precursora amiloide (APP), una proteína asociada con la enfermedad de Alzheimer . ^[10]

La ubiquilina-1 se identificó por primera vez a través de sus interacciones con presenilinas . ^[11] Se han encontrado dos variantes de transcripción que codifican diferentes isoformas para este gen. ^[7]

Proteínas relacionadas

La UBQLN1 humana comparte un alto grado de similitud con ubiquilinas relacionadas, incluidas UBQLN2 y UBQLN4 . ^[12]

Interacciones

Se ha demostrado que UBQLN1 interactúa con

HERPUD1 , ^[13]
MTOR , ^[14]
P4HB , ^[15]
PSEN1 ^[16]
PSEN2 , ^[16] y
UBE3A . ^[17]
TMCO6 , ^[18]

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000135018 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000005312 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ Ozaki T, Hishiki T, Toyama Y, Yuasa S, Nakagawara A, Sakiyama S (agosto de 1997). "Identificación de una nueva proteína celular que puede interactuar específicamente con DAN". ADN y biología celular . 16 (8): 985–91. doi :10.1089/dna.1997.16.985. PMID 9303440.
^ Hanaoka E, Ozaki T, Ohira M, Nakamura Y, Suzuki M, Takahashi E, et al. (julio de 2000). "Clonación molecular y análisis de expresión del gen humano DA41 y su mapeo al cromosoma 9q21.2-q21.3". Journal of Human Genetics . 45 (3): 188–91. doi : 10.1007/s100380050209 . PMID 10807547.
^ ab "Entrez Gene: UBQLN1 ubiquilina 1".
^ Haapasalo A, Viswanathan J, Bertram L, Soininen H, Tanzi RE, Hiltunen M (febrero de 2010). "Función emergente de la ubiquilina-1 asociada a la enfermedad de Alzheimer en la agregación de proteínas". Biochemical Society Transactions . 38 (Pt 1): 150–5. doi :10.1042/BST0380150. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-7C06-4 . PMID 20074050.
^ Zhang C, Saunders AJ (junio de 2009). "Un papel emergente para la ubiquilina 1 en la regulación del sistema de control de calidad de las proteínas y en la patogénesis de enfermedades". Discovery Medicine . 8 (40): 18–22. PMC 3158983 . PMID 19772837.
^ Stieren ES, El Ayadi A, Xiao Y, Siller E, Landsverk ML, Oberhauser AF, et al. (octubre de 2011). "La ubiquilina-1 es una chaperona molecular de la proteína precursora de amiloide". La Revista de Química Biológica . 286 (41): 35689–98. doi : 10.1074/jbc.M111.243147 . PMC 3195644 . PMID 21852239.
- "Se ha descubierto que los cerebros con Alzheimer tienen niveles más bajos de una proteína clave". ScienceDaily (nota de prensa). 1 de septiembre de 2011.
^ Mah AL, Perry G, Smith MA, Monteiro MJ (noviembre de 2000). "Identificación de la ubiquilina, un nuevo interactor de la presenilina que aumenta la acumulación de la proteína presenilina". The Journal of Cell Biology . 151 (4): 847–62. doi : 10.1083/jcb.151.4.847 . PMC 2169435 . PMID 11076969.
^ Marín I (marzo de 2014). "La familia de genes de la ubiquilina: patrones evolutivos y perspectivas funcionales". BMC Evolutionary Biology . 14 (1): 63. Bibcode :2014BMCEE..14...63M. doi : 10.1186/1471-2148-14-63 . PMC 4230246 . PMID 24674348.
^ Kim TY, Kim E, Yoon SK, Yoon JB (mayo de 2008). "Herp mejora la degradación de proteínas asociadas al ER mediante el reclutamiento de ubiquilinas". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 369 (2): 741–6. doi :10.1016/j.bbrc.2008.02.086. PMID 18307982.
^ Wu S, Mikhailov A, Kallo-Hosein H, Hara K, Yonezawa K, Avruch J (enero de 2002). "Caracterización de la ubiquilina 1, una proteína que interactúa con mTOR". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Investigación de células moleculares . 1542 (1–3): 41–56. doi : 10.1016/S0167-4889(01)00164-1 . PMID 11853878.
^ Ko HS, Uehara T, Nomura Y (septiembre de 2002). "El papel de la ubiquilina asociada con la proteína-disulfuro isomerasa en el retículo endoplasmático en la muerte celular apoptótica inducida por estrés". The Journal of Biological Chemistry . 277 (38): 35386–92. doi : 10.1074/jbc.M203412200 . PMID 12095988.
^ ab Mah AL, Perry G, Smith MA, Monteiro MJ (noviembre de 2000). "Identificación de la ubiquilina, un nuevo interactor de la presenilina que aumenta la acumulación de la proteína presenilina". The Journal of Cell Biology . 151 (4): 847–62. doi :10.1083/jcb.151.4.847. PMC 2169435 . PMID 11076969.
^ Kleijnen MF, Shih AH, Zhou P, Kumar S, Soccio RE, Kedersha NL, et al. (agosto de 2000). "Las proteínas hPLIC pueden proporcionar un vínculo entre la maquinaria de ubiquitinación y el proteasoma". Molecular Cell . 6 (2): 409–19. doi : 10.1016/S1097-2765(00)00040-X . PMID 10983987.
^ Rolland T, Taşan M, Charloteaux B, Pevzner SJ, Zhong Q, Sahni N, et al. (noviembre de 2014). "Un mapa a escala del proteoma de la red del interactoma humano". Cell . 159 (5): 1212–1226. doi :10.1016/j.cell.2014.10.050. PMC 4266588 . PMID 25416956.

Lectura adicional

Ozaki T, Kondo K, Nakamura Y, Ichimiya S, Nakagawara A, Sakiyama S (agosto de 1997). "Interacción de DA41, una proteína de unión a DAN, con la proteína similar al factor de crecimiento epidérmico, S(1-5)". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 237 (2): 245–50. doi :10.1006/bbrc.1997.7122. PMID 9268694.
Ozaki T, Hanaoka E, Naka M, Nakagawara A, Sakiyama S (junio de 1999). "Clonación y caracterización del ADNc de BAT3 de rata". ADN y biología celular . 18 (6): 503–12. doi :10.1089/104454999315222. PMID 10390159.
Wu AL, Wang J, Zheleznyak A, Brown EJ (octubre de 1999). "Las proteínas relacionadas con la ubiquitina regulan la interacción de los filamentos intermedios de vimentina con la membrana plasmática". Molecular Cell . 4 (4): 619–25. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80212-9 . PMID 10549293.
Kleijnen MF, Shih AH, Zhou P, Kumar S, Soccio RE, Kedersha NL, et al. (agosto de 2000). "Las proteínas hPLIC pueden proporcionar un vínculo entre la maquinaria de ubiquitinación y el proteasoma". Molecular Cell . 6 (2): 409–19. doi : 10.1016/S1097-2765(00)00040-X . PMID 10983987.
Mah AL, Perry G, Smith MA, Monteiro MJ (noviembre de 2000). "Identificación de la ubiquilina, un nuevo interactor de la presenilina que aumenta la acumulación de la proteína presenilina". The Journal of Cell Biology . 151 (4): 847–62. doi :10.1083/jcb.151.4.847. PMC 2169435 . PMID 11076969.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, et al. (marzo de 2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanas: secuenciación y análisis de 500 nuevos ADNc humanos que codifican proteínas completas". Genome Research . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072 . PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (septiembre de 2000). "Localización subcelular sistemática de nuevas proteínas identificadas mediante secuenciación de ADNc a gran escala". EMBO Reports . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732 . PMID 11256614.
Bedford FK, Kittler JT, Muller E, Thomas P, Uren JM, Merlo D, et al. (septiembre de 2001). "El número de superficie celular y la estabilidad de las subunidades del receptor GABA(A) están regulados por la proteína similar a la ubiquitina Plic-1". Nature Neuroscience . 4 (9): 908–16. doi :10.1038/nn0901-908. PMID 11528422. S2CID 13078743.
Wu S, Mikhailov A, Kallo-Hosein H, Hara K, Yonezawa K, Avruch J (enero de 2002). "Caracterización de la ubiquilina 1, una proteína que interactúa con mTOR". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Investigación de células moleculares . 1542 (1–3): 41–56. doi : 10.1016/S0167-4889(01)00164-1 . PMID 11853878.
Ko HS, Uehara T, Nomura Y (septiembre de 2002). "Función de la ubiquilina asociada con la proteína-disulfuro isomerasa en el retículo endoplasmático en la muerte celular apoptótica inducida por estrés". The Journal of Biological Chemistry . 277 (38): 35386–92. doi : 10.1074/jbc.M203412200 . PMID 12095988.
Gao L, Tu H, Shi ST, Lee KJ, Asanaka M, Hwang SB, Lai MM (abril de 2003). "La interacción con una proteína similar a la ubiquitina mejora la ubiquitinación y la degradación de la ARN polimerasa dependiente del ARN del virus de la hepatitis C". Journal of Virology . 77 (7): 4149–59. doi :10.1128/JVI.77.7.4149-4159.2003. PMC 150629 . PMID 12634373.
Massey LK, Mah AL, Ford DL, Miller J, Liang J, Doong H, Monteiro MJ (febrero de 2004). "La sobreexpresión de ubiquilina disminuye la ubiquitinación y la degradación de las proteínas presenilinas". Journal of Alzheimer's Disease . 6 (1): 79–92. doi :10.3233/jad-2004-6109. PMID 15004330.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, et al. (julio de 2004). "Mapeo proteómico funcional de una vía de señalización humana". Genome Research . 14 (7): 1324–32. doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148 . PMID 15231748.
Persson P, Stockhausen MT, Påhlman S, Axelson H (noviembre de 2004). "La ubiquilina-1 es una nueva proteína complejante de HASH-1 que regula los niveles de factores de transcripción neuronales bHLH en células de neuroblastoma humano". Revista Internacional de Oncología . 25 (5): 1213–21. doi :10.3892/ijo.25.5.1213. PMID 15492808.
Bertram L, Hiltunen M, Parkinson M, Ingelsson M, Lange C, Ramasamy K, et al. (marzo de 2005). "Asociación familiar entre la enfermedad de Alzheimer y variantes en UBQLN1". The New England Journal of Medicine . 352 (9): 884–94. doi : 10.1056/NEJMoa042765 . PMID 15745979.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000135018 – Ensembl , mayo de 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000005312 – Ensembl , mayo de 2017

[3] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[4] "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[pmid9303440-5] Ozaki T, Hishiki T, Toyama Y, Yuasa S, Nakagawara A, Sakiyama S (agosto de 1997). "Identificación de una nueva proteína celular que puede interactuar específicamente con DAN". ADN y biología celular . 16 (8): 985–91. doi :10.1089/dna.1997.16.985. PMID 9303440.

[pmid10807547-6] Hanaoka E, Ozaki T, Ohira M, Nakamura Y, Suzuki M, Takahashi E, et al. (julio de 2000). "Clonación molecular y análisis de expresión del gen humano DA41 y su mapeo al cromosoma 9q21.2-q21.3". Journal of Human Genetics . 45 (3): 188–91. doi : 10.1007/s100380050209 . PMID 10807547.

[entrez-7] "Entrez Gene: UBQLN1 ubiquilina 1".

[haapasalo_2010-8] Haapasalo A, Viswanathan J, Bertram L, Soininen H, Tanzi RE, Hiltunen M (febrero de 2010). "Función emergente de la ubiquilina-1 asociada a la enfermedad de Alzheimer en la agregación de proteínas". Biochemical Society Transactions . 38 (Pt 1): 150–5. doi :10.1042/BST0380150. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-7C06-4 . PMID 20074050.

[zhang_2009-9] Zhang C, Saunders AJ (junio de 2009). "Un papel emergente para la ubiquilina 1 en la regulación del sistema de control de calidad de las proteínas y en la patogénesis de enfermedades". Discovery Medicine . 8 (40): 18–22. PMC 3158983 . PMID 19772837.

[pmid21852239-10] Stieren ES, El Ayadi A, Xiao Y, Siller E, Landsverk ML, Oberhauser AF, et al. (octubre de 2011). "La ubiquilina-1 es una chaperona molecular de la proteína precursora de amiloide". La Revista de Química Biológica . 286 (41): 35689–98. doi : 10.1074/jbc.M111.243147 . PMC 3195644 . PMID 21852239.
"Se ha descubierto que los cerebros con Alzheimer tienen niveles más bajos de una proteína clave". ScienceDaily (nota de prensa). 1 de septiembre de 2011.

[11] "Se ha descubierto que los cerebros con Alzheimer tienen niveles más bajos de una proteína clave". ScienceDaily (nota de prensa). 1 de septiembre de 2011.

[mah_2000-11] Mah AL, Perry G, Smith MA, Monteiro MJ (noviembre de 2000). "Identificación de la ubiquilina, un nuevo interactor de la presenilina que aumenta la acumulación de la proteína presenilina". The Journal of Cell Biology . 151 (4): 847–62. doi : 10.1083/jcb.151.4.847 . PMC 2169435 . PMID 11076969.

[pmid24674348-12] Marín I (marzo de 2014). "La familia de genes de la ubiquilina: patrones evolutivos y perspectivas funcionales". BMC Evolutionary Biology . 14 (1): 63. Bibcode :2014BMCEE..14...63M. doi : 10.1186/1471-2148-14-63 . PMC 4230246 . PMID 24674348.

[pmid18307982-13] Kim TY, Kim E, Yoon SK, Yoon JB (mayo de 2008). "Herp mejora la degradación de proteínas asociadas al ER mediante el reclutamiento de ubiquilinas". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 369 (2): 741–6. doi :10.1016/j.bbrc.2008.02.086. PMID 18307982.

[pmid11853878-14] Wu S, Mikhailov A, Kallo-Hosein H, Hara K, Yonezawa K, Avruch J (enero de 2002). "Caracterización de la ubiquilina 1, una proteína que interactúa con mTOR". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Investigación de células moleculares . 1542 (1–3): 41–56. doi : 10.1016/S0167-4889(01)00164-1 . PMID 11853878.

[pmid12095988-15] Ko HS, Uehara T, Nomura Y (septiembre de 2002). "El papel de la ubiquilina asociada con la proteína-disulfuro isomerasa en el retículo endoplasmático en la muerte celular apoptótica inducida por estrés". The Journal of Biological Chemistry . 277 (38): 35386–92. doi : 10.1074/jbc.M203412200 . PMID 12095988.

[pmid11076969-16] Mah AL, Perry G, Smith MA, Monteiro MJ (noviembre de 2000). "Identificación de la ubiquilina, un nuevo interactor de la presenilina que aumenta la acumulación de la proteína presenilina". The Journal of Cell Biology . 151 (4): 847–62. doi :10.1083/jcb.151.4.847. PMC 2169435 . PMID 11076969.

[pmid10983987-17] Kleijnen MF, Shih AH, Zhou P, Kumar S, Soccio RE, Kedersha NL, et al. (agosto de 2000). "Las proteínas hPLIC pueden proporcionar un vínculo entre la maquinaria de ubiquitinación y el proteasoma". Molecular Cell . 6 (2): 409–19. doi : 10.1016/S1097-2765(00)00040-X . PMID 10983987.

[18] Rolland T, Taşan M, Charloteaux B, Pevzner SJ, Zhong Q, Sahni N, et al. (noviembre de 2014). "Un mapa a escala del proteoma de la red del interactoma humano". Cell . 159 (5): 1212–1226. doi :10.1016/j.cell.2014.10.050. PMC 4266588 . PMID 25416956.