Herpud1

Herpud1
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	1 día de trabajo
Identificadores
Alias	HERPUD1 , HERP, Mif1, SUP, proteína ER inducible por homocisteína con dominio similar a la ubiquitina 1
Identificaciones externas	OMIM : 608070; MGI : 1927406; HomoloGene : 40973; Tarjetas genéticas : HERPUD1; OMA :HERPUD1 - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 16 (humano)
Fin	56.944.864 pb
Ubicación del gen ( ratón )
Cristo.	Cromosoma 8 (ratón)
Fin	95.122.005 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	cuerpo del páncreas; ; conjuntiva palpebral; ; epitelio de la nasofaringe; ; amígdala; ; tráquea; ; tibia; ; pleura parietal; ; recto; ; bulbo olfatorio; ; píloro;
	Top expresado en
	glándula lagrimal; ; glándula parótida; ; riñón derecho; ; vesícula seminal; ; glándula submandibular; ; lóbulo izquierdo del hígado; ; Islote de Langerhans; ; antro pilórico; ; calvaria; ; vesícula biliar;
	Más datos de expresión de referencia
	Más datos de expresión de referencia
Ontología genética
Función molecular	unión del transportador transmembrana; unión de proteínas; función molecular; Actividad del adaptador de sustrato de la ligasa de ubiquitina;
Componente celular	componente integral de la membrana; Núcleo de cuerpos de Lewy; complejo de canales de calcio; membrana del retículo endoplasmático; membrana; retículo endoplasmático;
Proceso biológico	Regulación negativa de la vía de señalización apoptótica intrínseca inducida por estrés del retículo endoplásmico; Regulación negativa de la actividad de la endopeptidasa de tipo cisteína implicada en el proceso apoptótico.; Proceso catabólico de proteínas dependiente de ubiquitina; Regulación negativa de la vía de señalización apoptótica intrínseca.; Regulación de la ubiquitinación de proteínas.; Regulación de la vía de señalización apoptótica intrínseca inducida por estrés del retículo endoplásmico; homeostasis del ion calcio celular; homeostasis de iones de calcio del retículo endoplásmico; Respuesta al estrés del retículo endoplásmico; Respuesta de proteína desplegada mediada por PERK; Regulación positiva del proceso catabólico de proteínas dependiente de ubiquitina asociado al ER; Regulación del proceso catabólico de proteínas dependiente de ubiquitina asociado al ER; respuesta a proteína desplegada; Transporte retrógrado de proteínas, RE al citosol.; Regulación positiva de la unión de proteínas.; Respuesta de la proteína desplegada del retículo endoplásmico; ubiquitinación de proteínas;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	9709
	64209
	ENSG00000051108
	ENSMUSG00000031770
	Q15011
	Q9JJK5
	NM_001010989 ; NM_001010990 ; NM_001272103 ; NM_014685
	Número de serie 022331 Número de ; serie 001357205
	NP_001010989 ; NP_001259032 ; NP_055500 ; NP_001259032.1
	NP_071726NP_001344134;
	Wikidatos
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Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La proteína 1 del dominio similar a la ubiquitina residente en el retículo endoplásmico sensible a la homocisteína es una proteína que en los humanos está codificada por el gen HERPUD1 . ^[5]^[6]^[7]

La acumulación de proteínas desplegadas en el retículo endoplasmático (RE) desencadena la respuesta de estrés del RE. Esta respuesta incluye la inhibición de la traducción para evitar una mayor acumulación de proteínas desplegadas, el aumento de la expresión de proteínas implicadas en el plegamiento de polipéptidos, conocida como respuesta de proteína desplegada (UPR), y la destrucción de proteínas mal plegadas por el sistema de degradación de proteínas asociada al RE (ERAD) . Este gen puede desempeñar un papel tanto en la UPR como en la ERAD. Su expresión es inducida por la UPR y tiene un elemento de respuesta de estrés del RE en su región promotora, mientras que la proteína codificada tiene un dominio similar a la ubiquitina N-terminal que puede interactuar con el sistema ERAD. Se ha demostrado que esta proteína interactúa con las proteínas de presenilina y aumenta el nivel de proteína beta amiloide después de su sobreexpresión. El empalme alternativo de este gen produce múltiples variantes de transcripción, algunas de las cuales codifican diferentes isoformas. No se ha determinado la naturaleza completa de todas las variantes de transcripción. ^[7]

Interacciones

Se ha demostrado que HERPUD1 interactúa con UBQLN1 ^[8] y UBQLN2 . ^[8]

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000051108 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000031770 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ Kokame K, Agarwala KL, Kato H, Miyata T (octubre de 2000). "Herp, una nueva proteína de membrana similar a la ubiquitina inducida por estrés del retículo endoplasmático". The Journal of Biological Chemistry . 275 (42): 32846–53. doi : 10.1074/jbc.M002063200 . PMID 10922362.
^ van Laar T, Schouten T, Hoogervorst E, van Eck M, van der Eb AJ, Terleth C (marzo de 2000). "El nuevo gen Mif1/KIAA0025 inducible por MMS es un objetivo de la vía de respuesta de la proteína desplegada". Cartas FEBS . 469 (1): 123–31. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01253-9 . PMID 10708769. S2CID 6419566.
^ ab "Gen Entrez: Miembro 1 del dominio similar a ubiquitina, inducible por estrés del retículo endoplásmico e inducible por homocisteína HERPUD1".
^ ab Kim TY, Kim E, Yoon SK, Yoon JB (mayo de 2008). "Herp mejora la degradación de proteínas asociadas al ER mediante el reclutamiento de ubiquilinas". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 369 (2): 741–6. doi :10.1016/j.bbrc.2008.02.086. PMID 18307982.

Lectura adicional

van Laar T, van der Eb AJ, Terleth C (junio de 2001). "Mif1: ¿un vínculo perdido entre la vía de respuesta a proteínas desplegadas y la degradación de proteínas asociada al RE?". Current Protein & Peptide Science . 2 (2): 169–90. doi :10.2174/1389203013381189. PMID 12370023.
Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Kawarabayasi Y, Sato S, et al. (1995). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. I. Las secuencias codificantes de 40 genes nuevos (KIAA0001-KIAA0040) deducidas mediante el análisis de clones de ADNc muestreados aleatoriamente de la línea celular mieloide humana inmadura KG-1". DNA Research . 1 (1): 27–35. doi : 10.1093/dnares/1.1.27 . PMID 7584026.
Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
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Lenz B, Bleich S, Beutler S, Schlierf B, Schwager K, Reulbach U, et al. (diciembre de 2006). "La homocisteína regula la expresión de Herp mediante la metilación del ADN que involucra los sitios de unión de AARE y CREB". Experimental Cell Research . 312 (20): 4049–55. doi :10.1016/j.yexcr.2006.09.004. PMID 17020760.

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000051108 – Ensembl , mayo de 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000031770 – Ensembl , mayo de 2017

[3] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[4] "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[pmid10922362-5] Kokame K, Agarwala KL, Kato H, Miyata T (octubre de 2000). "Herp, una nueva proteína de membrana similar a la ubiquitina inducida por estrés del retículo endoplasmático". The Journal of Biological Chemistry . 275 (42): 32846–53. doi : 10.1074/jbc.M002063200 . PMID 10922362.

[pmid10708769-6] van Laar T, Schouten T, Hoogervorst E, van Eck M, van der Eb AJ, Terleth C (marzo de 2000). "El nuevo gen Mif1/KIAA0025 inducible por MMS es un objetivo de la vía de respuesta de la proteína desplegada". Cartas FEBS . 469 (1): 123–31. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01253-9 . PMID 10708769. S2CID 6419566.

[entrez-7] "Gen Entrez: Miembro 1 del dominio similar a ubiquitina, inducible por estrés del retículo endoplásmico e inducible por homocisteína HERPUD1".

[pmid18307982-8] Kim TY, Kim E, Yoon SK, Yoon JB (mayo de 2008). "Herp mejora la degradación de proteínas asociadas al ER mediante el reclutamiento de ubiquilinas". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 369 (2): 741–6. doi :10.1016/j.bbrc.2008.02.086. PMID 18307982.