Reparación por escisión de base

Proceso de reparación del ADN
Pasos básicos de la reparación por escisión de la base

La reparación por escisión de bases ( BER ) es un mecanismo celular, estudiado en los campos de la bioquímica y la genética , que repara el ADN dañado a lo largo del ciclo celular. Es responsable principalmente de eliminar pequeñas lesiones de bases que no distorsionan la hélice del genoma. La vía de reparación por escisión de nucleótidos relacionada repara lesiones voluminosas que distorsionan la hélice. La BER es importante para eliminar bases dañadas que de otro modo podrían causar mutaciones por apareamiento incorrecto o provocar roturas en el ADN durante la replicación. La BER es iniciada por las glicosilasas de ADN , que reconocen y eliminan bases dañadas o inapropiadas específicas, formando sitios AP . Estos luego son escindidos por una endonucleasa AP . La rotura de cadena sencilla resultante puede luego ser procesada por BER de parche corto (donde se reemplaza un solo nucleótido) o de parche largo (donde se sintetizan de 2 a 10 nucleótidos nuevos). [1]

Lesiones procesadas por BER

La 8-oxoguanina forma un par de bases Hoogsteen con adenina

Las bases individuales del ADN pueden resultar dañadas químicamente por diversos mecanismos, siendo los más comunes la desaminación, la oxidación y la alquilación. Estas modificaciones pueden afectar la capacidad de la base para formar puentes de hidrógeno, lo que da lugar a un emparejamiento incorrecto de las bases y, como consecuencia, a mutaciones en el ADN. Por ejemplo, la incorporación de adenina en lugar de 8-oxoguanina (derecha) durante la replicación del ADN hace que un par de bases G:C mute a T:A. Otros ejemplos de lesiones de bases reparadas mediante BER son:

Además de las lesiones de base, los pasos posteriores del BER también se utilizan para reparar roturas de cadena sencilla.

La elección entre reparación con parche largo y reparación con parche corto

Actualmente se está investigando la elección entre la reparación con parche corto y con parche largo. Se cree que varios factores influyen en esta decisión, incluido el tipo de lesión, la etapa del ciclo celular y si la célula está diferenciada terminalmente o en división activa. [3] Algunas lesiones, como los sitios de AP oxidados o reducidos, son resistentes a la actividad de la pol β liasa y, por lo tanto, deben procesarse mediante BER con parche largo.

La preferencia de la vía también puede diferir entre organismos. Mientras que las células humanas utilizan tanto la vía BER de parche corto como la de parche largo, durante mucho tiempo se creyó que la levadura Saccharomyces cerevisiae carecía de una vía de parche corto porque no tiene homólogos de varias proteínas de parche corto de mamíferos, incluidas la pol β, la ADN ligasa III, XRCC1 y el dominio quinasa de PNKP . El reciente descubrimiento de que la polimerasa poli-A Trf4 posee actividad de liasa dRP 5' ha desafiado esta opinión. [4]

Proteínas implicadas en la reparación por escisión de bases

Glicosilasas de ADN

La ADN glicosilasa de uracilo saca un residuo de uracilo del dúplex, que se muestra en amarillo.

Las glicosilasas de ADN son responsables del reconocimiento inicial de la lesión. Hacen girar la base dañada fuera de la doble hélice, como se muestra en la imagen, y escinden el enlace N-glucosídico de la base dañada, dejando un sitio AP . Hay dos categorías de glicosilasas: monofuncionales y bifuncionales. Las glicosilasas monofuncionales solo tienen actividad glicosilasa, mientras que las glicosilasas bifuncionales también poseen actividad AP liasa . Por lo tanto, las glicosilasas bifuncionales pueden convertir una lesión de base en una rotura de cadena simple sin la necesidad de una endonucleasa AP . La β-eliminación de un sitio AP por una glicosilasa-liasa produce un aldehído 3' α,β-insaturado adyacente a un fosfato 5', que difiere del producto de escisión de la endonucleasa AP. [5] Algunas glicosilasas-liasas pueden realizar además una δ-eliminación, que convierte el aldehído 3' en un fosfato 3'. Se ha desarrollado una amplia variedad de glicosilasas para reconocer diferentes bases dañadas. Entre los ejemplos de glicosilasas de ADN se incluyen Ogg1 , que reconoce la 8-oxoguanina, MPG , que reconoce la 3-metiladenina, y UNG , que elimina el uracilo del ADN.

Endonucleasas AP

Las endonucleasas AP escinden un sitio AP para producir un hidroxilo 3' adyacente a un fosfato de desoxirribosa 5' (dRP). Las endonucleasas AP se dividen en dos familias según su homología con las endonucleasas AP bacterianas ancestrales, la endonucleasa IV y la exonucleasa III . [6] Muchos eucariotas tienen miembros de ambas familias, incluida la levadura Saccharomyces cerevisiae , en la que Apn1 es el homólogo de EndoIV y Apn2 está relacionado con ExoIII. En humanos, se han identificado dos endonucleasas AP, APE1 y APE2. [7] Es un miembro de la familia ExoIII.


Enzimas de procesamiento final

Para que se produzca la ligadura, una rotura de cadena de ADN debe tener un hidroxilo en su extremo 3' y un fosfato en su extremo 5' . En los seres humanos, la polinucleótido quinasa-fosfatasa ( PNKP ) promueve la formación de estos extremos durante la BER. Esta proteína tiene un dominio quinasa, que fosforila los extremos hidroxilo 5', y un dominio fosfatasa, que elimina los fosfatos de los extremos 3'. Juntas, estas actividades preparan las roturas de cadena sencilla con extremos dañados para la ligadura. Las endonucleasas AP también participan en el procesamiento del extremo 3'. Además de abrir los sitios AP, poseen actividad fosfodiesterasa 3' y pueden eliminar una variedad de lesiones 3', incluidos fosfatos, fosfoglicolatos y aldehídos. El procesamiento 3' debe ocurrir antes de que pueda iniciarse la síntesis de ADN porque las ADN polimerasas requieren un hidroxilo 3' para extenderse.

Polimerasas de ADN

La pol β es la principal polimerasa humana que cataliza la BER de parche corto, con pol λ capaz de compensar en su ausencia. [8] Estas polimerasas son miembros de la familia Pol X y típicamente insertan solo un único nucleótido. Además de la actividad polimerasa, estas enzimas tienen un dominio liasa que elimina el dRP 5' dejado atrás por la escisión de la endonucleasa AP. Durante la BER de parche largo, se cree que la síntesis de ADN está mediada por pol δ y pol ε junto con el factor de procesividad PCNA , las mismas polimerasas que llevan a cabo la replicación del ADN . Estas polimerasas realizan una síntesis de desplazamiento, lo que significa que el extremo 5' del ADN corriente abajo se "desplaza" para formar un colgajo (ver el diagrama anterior). La pol β también puede realizar una síntesis de desplazamiento de parche largo y, por lo tanto, puede participar en cualquiera de las vías de la BER. [9] La síntesis de parche largo típicamente inserta de 2 a 10 nucleótidos nuevos.

Endonucleasa del colgajo

FEN1 elimina el colgajo 5' generado durante la BER de parche largo. Esta endonucleasa muestra una marcada preferencia por un colgajo 5' largo adyacente a un colgajo 3' de 1 nt. [10] El homólogo de levadura de FEN1 es RAD27 . Además de su función en la BER de parche largo, FEN1 corta colgajos con una estructura similar durante el procesamiento del fragmento de Okazaki , un paso importante en la replicación del ADN de cadena rezagada .

Ligasa de ADN

La ADN ligasa III junto con su cofactor XRCC1 cataliza el paso de sellado de la mella en la BER de parche corto en humanos. [11] [12] La ADN ligasa I liga la rotura en la BER de parche largo. [13]

Los defectos en una variedad de vías de reparación del ADN conducen a la predisposición al cáncer, y la BER parece seguir este patrón. Se ha demostrado que las mutaciones por deleción en los genes BER dan como resultado una mayor tasa de mutación en una variedad de organismos, lo que implica que la pérdida de BER podría contribuir al desarrollo del cáncer. De hecho, se han encontrado mutaciones somáticas en Pol β en el 30% de los cánceres humanos, y algunas de estas mutaciones conducen a la transformación cuando se expresan en células de ratón. [14] También se sabe que las mutaciones en la ADN glicosilasa MYH aumentan la susceptibilidad al cáncer de colon . [15]

Deficiencias epigenéticas en los cánceres

Las alteraciones epigenéticas (epimutaciones) en genes de reparación por escisión de bases recién han comenzado a evaluarse en unos pocos tipos de cáncer, en comparación con los numerosos estudios previos de epimutaciones en genes que actúan en otras vías de reparación del ADN (como MLH1 en la reparación de desajustes y MGMT en la reversión directa). [ cita requerida ] A continuación se resumen algunos ejemplos de epimutaciones en genes de reparación por escisión de bases que ocurren en los cánceres.

MBD4

Hidrólisis de citosina a uracilo

La MBD4 (proteína 4 del dominio de unión a metil-CpG) es una glicosilasa empleada en un paso inicial de la reparación por escisión de bases. La proteína MBD4 se une preferentemente a los sitios CpG completamente metilados y a las bases de ADN alteradas en esos sitios. Estas bases alteradas surgen de la hidrólisis frecuente de citosina a uracilo (ver imagen) y la hidrólisis de 5-metilcitosina a timina, produciendo pares de bases G:U y G:T. [16] Si los uracilos o timinas inadecuados en estos pares de bases no se eliminan antes de la replicación del ADN, causarán mutaciones de transición . La MBD4 cataliza específicamente la eliminación de T y U emparejadas con guanina (G) dentro de los sitios CpG. [17] Esta es una función de reparación importante ya que aproximadamente 1/3 de todas las mutaciones intragénicas de un solo par de bases en cánceres humanos ocurren en dinucleótidos CpG y son el resultado de las transiciones de G:C a A:T. [17] [18] Estas transiciones comprenden las mutaciones más frecuentes en el cáncer humano. Por ejemplo, casi el 50% de las mutaciones somáticas del gen supresor de tumores p53 en el cáncer colorrectal son transiciones de G:C a A:T dentro de sitios CpG. [17] Por lo tanto, una disminución en la expresión de MBD4 podría causar un aumento en las mutaciones carcinógenas .

La expresión de MBD4 se reduce en casi todas las neoplasias colorrectales debido a la metilación de la región promotora de MBD4. [19] Además, MBD4 es deficiente debido a la mutación en aproximadamente el 4% de los cánceres colorrectales. [20]

La mayoría de los campos histológicamente normales que rodean crecimientos neoplásicos (adenomas y cánceres de colon) en el colon también muestran una expresión reducida del ARNm de MBD4 (un defecto de campo ) en comparación con el tejido histológicamente normal de individuos que nunca tuvieron una neoplasia colónica. [19] Este hallazgo sugiere que el silenciamiento epigenético de MBD4 es un paso temprano en la carcinogénesis colorrectal .

En una población china evaluada, el polimorfismo MBD4 Glu346Lys se asoció con una reducción de alrededor del 50% en el riesgo de cáncer de cuello uterino, lo que sugiere que las alteraciones en MBD4 pueden ser importantes en el cáncer. [21]

NEIL1

NEIL1 reconoce (se dirige a) y elimina ciertas bases dañadas oxidativamente y luego corta el sitio abásico a través de la eliminación β,δ, dejando los extremos de fosfato 3' y 5'. NEIL1 reconoce pirimidinas oxidadas , formamidopirimidinas, residuos de timina oxidados en el grupo metilo y ambos estereoisómeros de timina glicol . [22] Los mejores sustratos para NEIL1 humano parecen ser las lesiones de hidantoína , guanidinohidantoína y espiroiminodihidantoína que son otros productos de oxidación de 8-oxoG . NEIL1 también es capaz de eliminar lesiones del ADN monocatenario, así como de estructuras de ADN en forma de burbuja y bifurcada. Una deficiencia en NEIL1 causa un aumento de la mutagénesis en el sitio de un par 8-oxo-Gua:C, y la mayoría de las mutaciones son transversiones de G:C a T:A. [23]

Un estudio de 2004 descubrió que el 46% de los cánceres gástricos primarios presentaban una expresión reducida del ARNm de NEIL1 , aunque no se conocía el mecanismo de reducción. [24] Este estudio también descubrió que el 4% de los cánceres gástricos presentaban mutaciones en NEIL1. Los autores sugirieron que la baja actividad de NEIL1 derivada de la expresión reducida y/o mutación en NEIL1 a menudo estaba involucrada en la carcinogénesis gástrica.

Se realizó un análisis de 145 genes de reparación de ADN para detectar la metilación aberrante del promotor en tejidos de carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello (HNSCC) de 20 pacientes y en muestras de mucosa de cabeza y cuello de 5 pacientes no oncológicos. [25] Este análisis mostró que NEIL1, con una hipermetilación sustancialmente aumentada, tenía la frecuencia de metilación más significativamente diferente. Además, la hipermetilación correspondía a una disminución en la expresión del ARNm de NEIL1. Un trabajo posterior con 135 tumores y 38 tejidos normales también mostró que el 71% de las muestras de tejido de HNSCC tenían una metilación elevada del promotor de NEIL1. [25]

Cuando se evaluaron 8 genes de reparación del ADN en tumores de cáncer de pulmón de células no pequeñas (CPCNP), el 42 % estaba hipermetilado en la región promotora NEIL1. [26] Esta fue la anomalía de reparación del ADN más frecuente encontrada entre los 8 genes de reparación del ADN evaluados. NEIL1 también fue uno de los seis genes de reparación del ADN que se encontraron hipermetilados en sus regiones promotoras en el cáncer colorrectal . [27]

Desmetilación de 5-metilcitosina (5mC) en ADN. Como se revisó en 2018, [28] 5mC es oxidado por la familia de dioxigenasas de translocación diez-once (TET) ( TET1 , TET2 , TET3 ) para generar 5-hidroximetilcitosina (5hmC). En pasos sucesivos, las enzimas TET hidroxilan aún más 5hmC para generar 5-formilcitosina (5fC) y 5-carboxilcitosina (5caC). La glicosilasa de ADN-timina (TDG) reconoce las bases intermedias 5fC y 5caC y escinde el enlace glucosídico dando como resultado un sitio apirimidínico ( sitio AP ). En una vía de desaminación oxidativa alternativa, 5hmC puede desaminarse oxidativamente por las desaminasas del complejo de edición de ARNm de la apolipoproteína B/citidina desaminasa inducida por actividad (AID/APOBEC) para formar 5-hidroximetiluracilo (5hmU) o 5mC puede convertirse en timina (Thy). 5hmU puede escindirse por TDG, la uracilo-ADN glicosilasa 1 monofuncional selectiva de cadena simple ( SMUG1 ), la ADN glicosilasa 1 similar a Nei ( NEIL1 ) o la proteína de unión a metil-CpG 4 ( MBD4 ). Los sitios AP y los desajustes T:G luego se reparan por enzimas de reparación por escisión de bases (BER) para producir citosina (Cyt).

La metilación y desmetilación activa del ADN es necesaria para el proceso cognitivo de formación y mantenimiento de la memoria . [29] En ratas, el condicionamiento del miedo contextual puede desencadenar la memoria de por vida para el evento con un solo ensayo, y los cambios de metilación parecen estar correlacionados con el desencadenamiento de recuerdos particularmente duraderos. [29] Con el condicionamiento del miedo contextual , después de 24 horas, el ADN aislado de la región del hipocampo del cerebro de la rata tenía 2097 genes metilados de manera diferencial, y una proporción estaba desmetilada. [29] Como revisaron Bayraktar y Kreutz, [28] la desmetilación del ADN depende de la reparación por escisión de bases (ver figura).

El ejercicio físico tiene efectos beneficiosos bien establecidos sobre el aprendizaje y la memoria (ver Efectos neurobiológicos del ejercicio físico ). El BDNF es un regulador particularmente importante del aprendizaje y la memoria. [30] Como revisaron Fernandes et al., [31] en ratas, el ejercicio mejora la expresión del gen Bdnf en el hipocampo , que tiene un papel esencial en la formación de la memoria. La expresión mejorada de Bdnf ocurre a través de la desmetilación de su promotor de isla CpG en el exón IV [31] y la desmetilación depende de la reparación por escisión de bases (ver figura). [28]

Disminución del BER con la edad

La actividad de la ADN glicosilasa que elimina las bases metiladas en los leucocitos humanos disminuye con la edad. [32] La reducción en la escisión de bases metiladas del ADN sugiere una disminución dependiente de la edad en la ADN glicosilasa de 3-metiladenina , una enzima BER responsable de eliminar las bases alquiladas. [32]

Las ratas jóvenes (de 4 a 5 meses de edad), pero no las ratas viejas (de 24 a 28 meses de edad), tienen la capacidad de inducir la ADN polimerasa beta y la endonucleasa AP en respuesta al daño oxidativo. [33]

Véase también

Referencias

  1. ^ Liu Y, Prasad R, Beard WA, Kedar PS, Hou EW, Shock DD, Wilson SH (2007). "Coordinación de pasos en la reparación por escisión de una base de un solo nucleótido mediada por la endonucleasa 1 apurínica/apirimidínica y la ADN polimerasa β". Journal of Biological Chemistry . 282 (18): 13532–13541. doi : 10.1074/jbc.M611295200 . PMC  2366199 . PMID  17355977.
  2. ^ Jayanta Chaudhuri y Frederick W. Alt (2004). "Recombinación por cambio de clase: interacción entre transcripción, desaminación del ADN y reparación del ADN". Nature Reviews Immunology . 4 (7): 541–552. doi :10.1038/nri1395. PMID  15229473. S2CID  34376550.
  3. ^ Fortini P, Dogliotti E (abril de 2007). "Daños en las bases y reparación de roturas de cadena sencilla: mecanismos y significado funcional de las subvías de reparación de parches cortos y largos". Reparación del ADN . 6 (4): 398–409. doi :10.1016/j.dnarep.2006.10.008. PMID  17129767.
  4. ^ Gellon L, Carson DR, Carson JP, Demple B (febrero de 2008). "Actividad intrínseca de la 5'-desoxirribosa-5-fosfato liasa en la proteína Trf4 de Saccharomyces cerevisiae con un posible papel en la reparación del ADN por escisión de bases". Reparación del ADN . 7 (2): 187–98. doi :10.1016/j.dnarep.2007.09.009. PMC 2258243 . PMID  17983848. 
  5. ^ Fromme JC, Banerjee A, Verdine GL (febrero de 2004). "Reconocimiento y catálisis de la glicosilasa de ADN". Curr. Opin. Struct. Biol . 14 (1): 43–9. doi :10.1016/j.sbi.2004.01.003. PMID  15102448.
  6. ^ Aravind L, Walker DR, Koonin EV (1999). "Dominios conservados en proteínas reparadoras de ADN y evolución de sistemas de reparación". Nucleic Acids Research . 27 (5): 1223–1242. doi :10.1093/nar/27.5.1223. PMC 148307 . PMID  9973609. 
  7. ^ Demple B, Herman T, Chen DS (1991). "Clonación y expresión de APE, el ADNc que codifica la principal endonucleasa apurínica humana: definición de una familia de enzimas de reparación del ADN". PNAS USA . 88 (24): 11450–11454. Bibcode :1991PNAS...8811450D. doi : 10.1073/pnas.88.24.11450 . PMC 53153 . PMID  1722334. 
  8. ^ Braithwaite EK, Prasad R, Shock DD, Hou EW, Beard WA, Wilson SH (mayo de 2005). "La ADN polimerasa lambda media una actividad de reparación por escisión de base de respaldo en extractos de fibroblastos embrionarios de ratón". J. Biol. Chem . 280 (18): 18469–75. doi : 10.1074/jbc.M411864200 . PMID  15749700.
  9. ^ Beard WA, Prasad R, Wilson SH (2006). "Actividades y mecanismos de la ADN polimerasa". Reparación del ADN, parte A. Métodos en enzimología. Vol. 408. págs. 91–107. doi :10.1016/S0076-6879(06)08007-4. ISBN 9780121828134. Número de identificación personal  16793365.
  10. ^ Kao HI, Henricksen LA, Liu Y, Bambara RA (abril de 2002). "La especificidad de escisión de la endonucleasa 1 del colgajo de Saccharomyces cerevisiae sugiere una estructura de doble colgajo como sustrato celular". J. Biol. Chem . 277 (17): 14379–89. doi : 10.1074/jbc.M110662200 . PMID  11825897.
  11. ^ Cappelli, Enrico (1997). "Participación de los productos génicos de XRCC1 y de la ADN ligasa III en la reparación por escisión de bases del ADN". Journal of Biological Chemistry . 272 ​​(38): 23970–23975. doi : 10.1074/jbc.272.38.23970 . PMID  9295348.
  12. ^ Caldecott, Keith (1995). "Caracterización del complejo XRCC1-ADN ligasa III in vitro y su ausencia en células de hámster mutantes". Nucleic Acids Research . 23 (23): 4836–4843. doi :10.1093/nar/23.23.4836. PMC 307472 . PMID  8532526 . Consultado el 10 de marzo de 2019 . 
  13. ^ Pascucci, Barbara (1999). "Reparación por escisión de bases de parche largo con proteínas humanas purificadas ADN LIGASA I COMO MEDIADOR DEL TAMAÑO DEL PARCHE PARA LAS ADN POLIMERASAS δ Y ε". The Journal of Biological Chemistry . 274 (47): 33696–33702. doi : 10.1074/jbc.274.47.33696 . PMID  10559260.
  14. ^ Starcevic D, Dalal S, Sweasy JB (agosto de 2004). "¿Existe un vínculo entre la ADN polimerasa beta y el cáncer?". Cell Cycle . 3 (8): 998–1001. doi : 10.4161/cc.3.8.1062 . PMID  15280658.
  15. ^ Farrington, SM; Tenesa, A; Barnetson, R; Wiltshire, A; Prendergast, J; Porteous, M; Campbell, H; Dunlop, MG (2005). "Susceptibilidad de la línea germinal al cáncer colorrectal debido a defectos en los genes de reparación por escisión de bases". The American Journal of Human Genetics . 77 (1): 112–9. doi :10.1086/431213. PMC 1226182 . PMID  15931596. 
  16. ^ Bellacosa A, Drohat AC (agosto de 2015). "El papel de la reparación por escisión de bases en el mantenimiento de la integridad genética y epigenética de los sitios CpG". Reparación del ADN . 32 : 33–42. doi :10.1016/j.dnarep.2015.04.011. PMC 4903958 . PMID  26021671. 
  17. ^ abc Sjolund AB, Senejani AG, Sweasy JB (2013). "MBD4 y TDG: glicosilasas de ADN multifacéticas con funciones biológicas en constante expansión". Mutation Research . 743–744: 12–25. Bibcode :2013MRFMM.743...12S. doi :10.1016/j.mrfmmm.2012.11.001. PMC 3661743 . PMID  23195996. 
  18. ^ Cooper DN, Youssoufian H (febrero de 1988). "El dinucleótido CpG y la enfermedad genética humana". Genética humana . 78 (2): 151–5. doi :10.1007/bf00278187. PMID  3338800. S2CID  41948691.
  19. ^ ab Howard JH, Frolov A, Tzeng CW, Stewart A, Midzak A, Majmundar A, Godwin A, Heslin M, Bellacosa A, Arnoletti JP (enero de 2009). "Regulación descendente epigenética del gen de reparación del ADN MED1/MBD4 en el cáncer colorrectal y de ovario". Cancer Biology & Therapy . 8 (1): 94–100. doi :10.4161/cbt.8.1.7469. PMC 2683899 . PMID  19127118. 
  20. ^ Tricarico R, Cortellino S, Riccio A, Jagmohan-Changur S, Van der Klift H, Wijnen J, Turner D, Ventura A, Rovella V, Percesepe A, Lucci-Cordisco E, Radice P, Bertario L, Pedroni M, Ponz de Leon M, Mancuso P, Devarajan K, Cai KQ, Klein-Szanto AJ, Neri G, Møller P, Viel A, Genuardi M, Fodde R, Bellacosa A (octubre de 2015). "Participación de la inactivación de MBD4 en la tumorigénesis deficiente en reparación de desajustes". Oncoobjetivo . 6 (40): 42892–904. doi :10.18632/oncotarget.5740. PMC 4767479 . PMID  26503472. 
  21. ^ Xiong XD, Luo XP, Liu X, Jing X, Zeng LQ, Lei M, Hong XS, Chen Y (2012). "El polimorfismo MBD4 Glu346Lys está asociado con el riesgo de cáncer de cuello uterino en una población china". Int. J. Gynecol. Cáncer . 22 (9): 1552–6. doi :10.1097/IGC.0b013e31826e22e4. PMID  23027038. S2CID  788490.
  22. ^ Nemec AA, Wallace SS, Sweasy JB (octubre de 2010). "Proteínas de reparación por escisión de bases variantes: contribuyentes a la inestabilidad genómica". Seminarios en biología del cáncer . 20 (5): 320–8. doi :10.1016/j.semcancer.2010.10.010. PMC 3254599 . PMID  20955798. 
  23. ^ Suzuki T, Harashima H, Kamiya H (2010). "Efectos de las proteínas de reparación por escisión de bases en la mutagénesis por 8-oxo-7,8-dihidroguanina (8-hidroxiguanina) emparejada con citosina y adenina". Reparación de ADN (Amst.) . 9 (5): 542–50. doi :10.1016/j.dnarep.2010.02.004. hdl : 2115/43021 . PMID  20197241. S2CID  207147128.
  24. ^ Shinmura K, Tao H, Goto M, Igarashi H, Taniguchi T, Maekawa M, Takezaki T, Sugimura H (2004). "Mutaciones inactivantes del gen de reparación por escisión de base humana NEIL1 en cáncer gástrico". Carcinogénesis . 25 (12): 2311–7. doi : 10.1093/carcin/bgh267 . PMID  15319300.
  25. ^ ab Chaisaingmongkol J, Popanda O, Warta R, Dyckhoff G, Herpel E, Geiselhart L, Claus R, Lasitschka F, Campos B, Oakes CC, Bermejo JL, Herold-Mende C, Plass C, Schmezer P (2012). "El análisis epigenético de genes de reparación del ADN humano identifica la metilación aberrante del promotor de NEIL1 en el carcinoma de células escamosas de cabeza y cuello". Oncogén . 31 (49): 5108–16. doi : 10.1038/onc.2011.660 . PMID  22286769.
  26. ^ Do H, Wong NC, Murone C, John T, Solomon B, Mitchell PL, Dobrovic A (2014). "Una reevaluación crítica de la metilación del promotor del gen de reparación del ADN en el carcinoma de pulmón de células no pequeñas". Scientific Reports . 4 : 4186. Bibcode :2014NatSR...4E4186D. doi :10.1038/srep04186. PMC 3935198 . PMID  24569633. 
  27. ^ Farkas SA, Vymetalkova V, Vodickova L, Vodicka P, Nilsson TK (abril de 2014). "Cambios en la metilación del ADN en genes frecuentemente mutados en el cáncer colorrectal esporádico y en los genes de la vía de reparación del ADN y de señalización Wnt/β-catenina". Epigenomics . 6 (2): 179–91. doi :10.2217/epi.14.7. PMID  24811787.
  28. ^ abc Bayraktar G, Kreutz MR (2018). "El papel de la desmetilación del ADN dependiente de la actividad en el cerebro adulto y en los trastornos neurológicos". Front Mol Neurosci . 11 : 169. doi : 10.3389/fnmol.2018.00169 . PMC 5975432 . PMID  29875631. 
  29. ^ abc Duke CG, Kennedy AJ, Gavin CF, Day JJ, Sweatt JD (julio de 2017). "Reorganización epigenómica dependiente de la experiencia en el hipocampo". Learn. Mem . 24 (7): 278–288. doi :10.1101/lm.045112.117. PMC 5473107. PMID  28620075 . 
  30. ^ Karpova NN (enero de 2014). "El papel de la epigenética del BDNF en la plasticidad neuronal dependiente de la actividad". Neurofarmacología . 76 Pt C: 709–18. doi : 10.1016/j.neuropharm.2013.04.002 . PMID  23587647.
  31. ^ ab Fernandes J, Arida RM, Gomez-Pinilla F (septiembre de 2017). "El ejercicio físico como modulador epigenético de la plasticidad cerebral y la cognición". Neurosci Biobehav Rev. 80 : 443–456. doi :10.1016/j.neubiorev.2017.06.012. PMC 5705447. PMID  28666827 . 
  32. ^ ab Atamna H, Cheung I, Ames BN (2000). "Un método para detectar sitios abásicos en células vivas: cambios dependientes de la edad en la reparación por escisión de bases". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 97 (2): 686–91. Bibcode :2000PNAS...97..686A. doi : 10.1073/pnas.97.2.686 . PMC 15391 . PMID  10639140. 
  33. ^ Cabelof DC, Raffoul JJ, Ge Y, Van Remmen H, Matherly LH, Heydari AR (2006). "Pérdida relacionada con la edad de la respuesta de reparación del ADN tras la exposición al estrés oxidativo". J. Gerontol. A Biol. Sci. Med. Sci . 61 (5): 427–34. doi : 10.1093/gerona/61.5.427 . PMID  16720738.
Obtenido de "https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Reparación_por_excisión_de_la_base&oldid=1230310571"