Bacillota

Filo de bacterias

Bacillota
Bacillus subtilis , tinción de Gram
Clasificación científica Editar esta clasificación
Dominio:Bacteria
Clado :Terrabacteria
Filo:Bacillota
Gibbons y Murray 2021 [1]
Clases
Sinónimos
  • "Bacillaeota" Oren et al. 2015
  • "Bacillota" Whitman y otros 2018
  • "Desulfotomaculota" Watanabe et al. 2019
  • "Endobacterias" (Cavalier-Smith 1998) Cavalier-Smith 2020
  • "Endobacterias" Cavalier-Smith 1998
  • "Endospora" Margulis y Schwartz 1998
  • "Firmacutes" Gibbons y Murray 1978 (Listas aprobadas 1980)
  • Corrección de la expresión "Firmicutes" de Gibbons y Murray, 1978 (listas aprobadas, 1980)
  • "Posibacterias" Cavalier-Smith 2002

Bacillota (sinónimo Firmicutes ) es un filo de bacterias , la mayoría de las cuales tienen una estructura de pared celular grampositiva . [2] El cambio de nombre de filos como Firmicutes en 2021 sigue siendo controvertido entre los microbiólogos, muchos de los cuales continúan usando los nombres anteriores de larga data en la literatura. [3]

El nombre "Firmicutes" se deriva de las palabras latinas para "piel dura", en referencia a la pared celular gruesa típica de las bacterias de este filo. Los científicos alguna vez clasificaron a los Firmicutes para incluir todas las bacterias grampositivas, pero recientemente los han definido como parte de un grupo central de formas relacionadas llamadas el grupo de bajo G+C , en contraste con los Actinomycetota . Tienen células redondas, llamadas cocos (singular coccus), o formas similares a bastoncillos (bacilo). Algunos Firmicutes, como Megasphaera , Pectinatus , Selenomonas y Zymophilus , tienen una membrana pseudoexterna porosa que hace que se tiñan como gramnegativos .

Muchos bacilos (Firmicutes) producen endosporas , que son resistentes a la desecación y pueden sobrevivir en condiciones extremas. Se encuentran en diversos entornos y el grupo incluye algunos patógenos notables. Los de una familia, las heliobacterias , producen energía a través de la fotosíntesis anoxigénica . Los bacilos juegan un papel importante en el deterioro de la cerveza, el vino y la sidra.

Clases

El grupo se divide típicamente en Clostridia , que son anaeróbicos , y Bacilli , que son aerobios obligados o facultativos . [ cita requerida ]

En los árboles filogenéticos , los dos primeros grupos aparecen como parafiléticos o polifiléticos , al igual que sus géneros principales, Clostridium y Bacillus . [4] Sin embargo, generalmente se cree que Bacillota en su conjunto es monofilético o parafilético con la exclusión de Mollicutes . [5]

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) [6] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [7]

Algunos [8] creen que los Firmicutes son la fuente de las arqueas , según los modelos que sostienen que las arqueas se ramificaron relativamente tarde a partir de las bacterias, en lugar de formar un linaje temprano de origen independiente (dominio de vida) a partir del último ancestro común universal de la vida celular (LUCA). [ cita requerida ]

LTP basado en ARNr 16S _01_2022 [9] [10] [11]GTDB 08-RS214 de la base de datos de taxonomía del genoma [12] [13] [14]

Arqueas

Bacteria

"Acuificida"

"Sinergistas"

Atribacterota

Firmicutes 3 ♦

Dictoglomota

"Caldicellulosiruptorales"

"Thermosediminibacteria" [incl. "Ammonificales", DSM-22653]

"Termoanaerobacterias" [incluidas Thermanaeromonas y Desulfovirgula ]

" Grupo FCB "

Firmicutes 2 ♦

"Sulfobacilos"

"Termobacterias"

"Carboxidotermos"

"Termacetogeniales"

Moorellales {"Moorellia"}

"Caldereros habitacionales"

"Koleobacterias"

Zhaonelláceas

"Desulfitibacterias"

"Sintrofomonadia"

Gelria

"Simbiosis" ♦

Actinomicetos

" Firmicutes " 1 ♦

Termolitobacterias

"Carboxidocelales"

"Termincolía"

"Desulfofunduláceas"

UBA4882

" Selenomonadia "

Limnocordia

"Desulfotomaculota"

"Desulfotomaculia"

"Desulfitobacterias"

"Peptococcia"

"Detiobacterias"

" Natranaerobia "

" Proteobacterias " sl

♦ Firmicutes parafiléticos

Bacillota E

"Termobacterias"

" Cerca de la acetocimmeria" {UBA3575}

"Simbiosis"

"Sulfobacilos"

Bacillota G

Limnocordia

"Hidrogenisporia" (UBA4882)

"Halanaerobiaeota"

" Halanaerobia "

Bacillota ss

" Bacilos "

Bacillota D

"Proteinivoracia"

"Detiobacterias"

" Natranaerobia "

"Selenobacterias"

" Selenomonadia "

"Desulfotomaculota"

"Sintrofomonadia"

"Peptococcia"

"Dehalobacteriia"

"Desulfitobacterias"

"Termacetogeniales" {DSM-12270}

"Moorellia"

"Carboxidocelales" {GCA-003054495}

"Termincolía"

"Carboxidotermales" {Z-2901}

"Desulfotomaculia"

Bacillota A

"Termosediminibacterias"

"Termoanaerobacterias"

" Clostridium " ss

Géneros

En 2016 se consideraba que más de 274 géneros [actualizar]estaban dentro del filo Bacillota, [ cita requerida ] los géneros notables de Bacillota incluyen:

Bacilos, orden Bacillales

Bacilos, orden Lactobacillales

Clostridios

Erisipelotriquia

Importancia clínica

Bacillota constituye ~30% del microbioma intestinal de ratones y humanos . [15] [ verificación fallida ] Se ha demostrado que el filo Bacillota como parte de la microbiota intestinal está involucrado en la reabsorción de energía y potencialmente relacionado con el desarrollo de diabetes y obesidad . [16] [17] [18] [19] Dentro del intestino de adultos humanos sanos, la bacteria más abundante: Faecalibacterium prausnitzii (F. prausnitzii) , que constituye el 5% del microbioma intestinal total, es un miembro del filo Bacillota. Esta especie está directamente asociada con la reducción de la inflamación de bajo grado en la obesidad. [20] F. prausnitzii se ha encontrado en niveles más altos dentro de los intestinos de niños obesos que en niños no obesos.

En varios estudios se ha encontrado una mayor abundancia de Bacillota en individuos obesos que en controles delgados. Se ha encontrado un nivel más alto de Lactobacillus (del filo Bacillota) en pacientes obesos y en un estudio, pacientes obesos sometidos a dietas de pérdida de peso mostraron una cantidad reducida de Bacillota en sus intestinos. [21]

También se ha demostrado que los cambios en la dieta de los ratones promueven cambios en la abundancia de Bacillota. Se observó una mayor abundancia relativa de Bacillota en ratones alimentados con una dieta occidental (rica en grasas y azúcar) que en ratones alimentados con una dieta estándar baja en grasas y rica en polisacáridos. La mayor cantidad de Bacillota también se relacionó con una mayor adiposidad y peso corporal en los ratones. [22] Específicamente, dentro de los ratones obesos, la clase Mollicutes (dentro del filo Bacillota) fue la más común. Cuando la microbiota de ratones obesos con esta mayor abundancia de Bacillota se trasplantó a los intestinos de ratones libres de gérmenes, los ratones libres de gérmenes ganaron una cantidad significativa de grasa en comparación con los trasplantados con la microbiota de ratones delgados con menor abundancia de Bacillota. [23]

Se ha descubierto que la presencia de Christensenella (Bacillota, de la clase Clostridia), aislada de heces humanas , se correlaciona con un índice de masa corporal más bajo . [24]

Véase también

Referencias

  1. ^ Oren A, Garrity GM (2021). "Publicación válida de los nombres de cuarenta y dos filos de procariotas". Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID  34694987. S2CID  239887308.
  2. ^ "Firmicutes" en el Diccionario médico de Dorland
  3. ^ Robitzki, Dan (4 de enero de 2022). "Los filos procariotas recientemente renombrados causan revuelo". Revista The Scientist . Archivado desde el original el 20 de mayo de 2022. Consultado el 23 de mayo de 2022 .
  4. ^ Wolf M, Müller T, Dandekar T, Pollack JD (mayo de 2004). "Filogenia de Firmicutes con especial referencia a Mycoplasma (Mollicutes) como se infiere de los datos de la secuencia de aminoácidos de la fosfoglicerato quinasa". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. (Estudio comparativo). 54 (Pt 3): 871–5. CiteSeerX 10.1.1.126.3863 . doi :10.1099/ijs.0.02868-0. PMID  15143038. Archivado desde el original el 9 de diciembre de 2012. 
  5. ^ Ciccarelli, FD (2006). "Hacia la reconstrucción automática de un árbol de la vida altamente resuelto". Science . 311 (5765): 1283–1287. Bibcode :2006Sci...311.1283C. CiteSeerX 10.1.1.381.9514 . doi :10.1126/science.1123061. PMID  16513982. S2CID  1615592. Archivado desde el original el 24 de julio de 2010 . Consultado el 2 de diciembre de 2020 . 
  6. ^ JP Euzéby. "Firmicutes". Lista de nombres procariotas con clasificación en la nomenclatura (LPSN). Archivado desde el original el 27 de enero de 2013. Consultado el 20 de marzo de 2013 .
  7. ^ Sayers; et al. "Firmicutes". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). Archivado desde el original el 28 de julio de 2018. Consultado el 24 de abril de 2019 .
  8. ^ Ruben E Valas, Philip E Bourne (2011). "El origen de un superreino derivado: cómo una bacteria grampositiva cruzó el desierto para convertirse en una arquea". Biology Direct . 6 . Biology Direct 2011; 6:16: 16. doi : 10.1186/1745-6150-6-16 . PMC 3056875 . PMID  21356104. 
  9. ^ "El LTP". Archivado desde el original el 14 de junio de 2021 . Consultado el 20 de junio de 2022 .
  10. ^ "Árbol LTP_all en formato newick". Archivado desde el original el 4 de septiembre de 2022 . Consultado el 20 de junio de 2022 .
  11. ^ "Notas de la versión LTP_01_2022" (PDF) . Archivado (PDF) del original el 26 de agosto de 2023 . Consultado el 20 de junio de 2022 .
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  14. ^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Archivado desde el original el 1 de noviembre de 2021. Consultado el 10 de mayo de 2023 .
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  22. ^ Turnbaugh, Peter J. (17 de abril de 2008). "La obesidad inducida por la dieta está relacionada con alteraciones marcadas pero reversibles en el microbioma intestinal distal del ratón". Cell Host & Microbe . 3 (4): 213–223. doi :10.1016/j.chom.2008.02.015. PMC 3687783 . PMID  18407065. 
  23. ^ Million, M. (abril de 2013). "Microbiota bacteriana intestinal y obesidad". Microbiología celular e infección . 19 (4): 305–313. doi : 10.1111/1469-0691.12172 . PMID:  23452229.
  24. ^ Goodrich, Julia K.; Waters, Jillian L.; Poole, Angela C.; Sutter, Jessica L.; Koren, Omry; Blekhman, Ran; Beaumont, Michelle; Van Treuren, William; Knight, Rob; Bell, Jordana T.; Spector, Timothy D.; Clark, Andrew G.; Ley, Ruth E. (2014). "La genética humana moldea el microbioma intestinal". Cell . 159 (4): 789–799. doi :10.1016/j.cell.2014.09.053. ISSN  0092-8674. PMC 4255478 . PMID  25417156. Icono de acceso abierto
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