Superfilo FCB

Filo de bacterias

Superfilo FCB
Especies de bacteroides
Clasificación científica Editar esta clasificación
Dominio:Bacteria
Clado :Grupo FCB
Filos
Sinónimos

Esfingobacterias Cavalier-Smith, 1987 [1]

El grupo FCB es un superfilo de bacterias que lleva el nombre de los filos principales Fibrobacterota , Chlorobiota y Bacteroidota . Se considera que los miembros forman un clado debido a una serie de indeles de firma conservados . [2]

Cavalier-Smith denomina a la agrupación equivalente, un filo , con el nombre de Sphingobacteria . Contiene las clases Chlorobiota , Fibrobacterota , Bacteroidota y Flavobacteria . Sin embargo, esta megaclasificación no es seguida por la comunidad científica en general. [3] [4] [5]

Grupo FCB [2] [6] [7]LTP basado en ARNr 16S _12_2021 [8] [9] [10]GTDB 07-RS207 de la base de datos de taxonomía del genoma [11] [12] [13]
FCB

"Latescibacteria (incluida "Handelsmanbacteria")

"bacterias de Edwards"

" Zixibacterias "

"bacterias de Eisen"

"Krumholzibacteriota" (incluidas las " Delphibacteria ")

" Fermentibacteria " (incluidas "Aegiribacteria")

Gemmatimonadota (incl. "Glassbacteria")

"Hidrotermota" (incluidas "Stahlbacteria", "Pyropristinus")

"Cloacimonetes"

Fibrobacterota (incluida la "Raymondbacteria")

"bacterias delong"

Una situación análoga se observa con el grupo PVC/Planctobacteria .

El grupo Bacteroidota–Chlorobiota en marrón es visible en este árbol de la vida de 2016 utilizando secuencias de proteínas ribosómicas [14]

Notas

Véase también

Referencias

  1. ^ Cavalier-Smith, T. (1987). El origen de las células: una simbiosis entre genes, catalizadores y membranas. Simposios sobre biología cuantitativa de Cold Spring Harbor 52, 805-24, [1], [2].
  2. ^ ab Gupta, RS (2004). "Filogenia y secuencias distintivas características de Fibrobacteres, Chlorobi y Bacteroidetes". Critical Reviews in Microbiology . 30 (2): 123–143. doi :10.1080/10408410490435133. PMID  15239383. S2CID  24565648.
  3. ^ Cavalier-Smith T (2006). "Enraizando el árbol de la vida mediante análisis de transición". Biol. Direct . 1 : 19. doi : 10.1186/1745-6150-1-19 . PMC 1586193 . PMID  16834776. 
  4. ^ Krieg, NR; Ludwig, W.; Whitman, WB; Hedlund, BP; Paster, BJ; Staley, JT; Ward, N.; Brown, D.; Parte, A. (24 de noviembre de 2010) [1984(Williams & Wilkins)]. George M. Garrity (ed.). Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae y Planctomycetes. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 4 (2.ª ed.). Nueva York: Springer. pág. 908. ISBN. 978-0-387-95042-6. Biblioteca Británica n.º GBA561951.
  5. ^ Clasificación en LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 de noviembre de 2020). "La lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) se traslada al DSMZ". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 70 (11): 5607–5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
  6. ^ Emiley A Eloe-Fadrosh et al. 2017, Global metagenomic survey revealed a new bacteria candidate phylum in geothermal springs (Un estudio metagenómico global revela un nuevo filo de bacterias candidatas en manantiales geotermales). Nature Communications 7 · enero de 2016 DOI: 10.1038/ncomms1047
  7. ^ Kirkegaard, Rasmus Hansen; Düholm, Morten Simonsen; McIlroy, Simon Jon; Nierychlo, Marta; Karst, Søren Michael; Albertsen, Mads; Nielsen, Per Halkjær (octubre de 2016). "Conocimientos genómicos sobre miembros del filo candidato Hyd24-12 común en digestores anaeróbicos mesófilos". La Revista ISME . 10 (10): 2352–2364. doi : 10.1038/ismej.2016.43 . ISSN  1751-7370. PMC 5030696 . PMID  27058503. 
  8. ^ "El LTP" . Consultado el 23 de febrero de 2021 .
  9. ^ "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 23 de febrero de 2021 .
  10. ^ "Notas de la versión LTP_12_2021" (PDF) . Consultado el 23 de febrero de 2021 .
  11. ^ "GTDB release 07-RS207". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 20 de junio de 2022 .
  12. ^ "ar53_r207.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 20 de junio de 2022 .
  13. ^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 20 de junio de 2022 .
  14. ^ Hug, Laura A.; Baker, Brett J.; Anantharaman, Karthik; Brown, Christopher T.; Probst, Alexander J.; Castelle, Cindy J.; Butterfield, Cristina N.; Hernsdorf, Alex W.; Amano, Yuki; Ise, Kotaro; Suzuki, Yohey; Dudek, Natasha; Relman, David A.; Finstad, Kari M.; Amundson, Ronald; Thomas, Brian C.; Banfield, Jillian F. (11 de abril de 2016). "Una nueva visión del árbol de la vida". Nature Microbiology . 1 (5): 16048. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.48 . PMID  27572647.


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