Jmol

Visor Java de código abierto para estructuras químicas en 3D
Jmol
Desarrollador(es)Equipo de desarrollo de Jmol
Lanzamiento inicial2001 ; hace 23 años ( 2001 )
Versión estable
16.1.59  / 26 de febrero de 2024 ; hace 8 meses ( 26 de febrero de 2024 )
Repositoriosourceforge.net/projects/jmol
Escrito enJava
Sistema operativoMultiplataforma
PlataformaSistemas con Java y navegadores web sin Java
Disponible en16 idiomas
Lista de idiomas
Catalán, checo, chino, danés, holandés, inglés, francés, alemán, húngaro, indonesio, italiano, coreano, portugués, español, turco, ucraniano [1]
TipoModelado molecular
LicenciaLicencia LGPL 2.0
Sitio webwww.jmol.org

Jmol es un software informático para modelar estructuras químicas moleculares en tres dimensiones . [2] Jmol devuelve una representación tridimensional de una molécula que puede utilizarse como herramienta de enseñanza, [3] o para investigación, por ejemplo, en química y bioquímica .

Software

Jmol está escrito en el lenguaje de programación Java , por lo que puede ejecutarse en los sistemas operativos Windows , macOS , Linux y Unix , si Java está instalado. Es un software gratuito y de código abierto publicado bajo la Licencia Pública General Reducida de GNU (LGPL) versión 2.0. Existe una aplicación independiente y un kit de desarrollo de software (SDK) que se puede integrar en otras aplicaciones Java, como Bioclipse y Taverna .

Una característica popular es un subprograma que se puede integrar en páginas web para mostrar moléculas de diversas maneras. Por ejemplo, las moléculas se pueden mostrar como modelos de bolas y palos , modelos que llenan el espacio , diagramas de cinta , etc. [4] Jmol admite una amplia gama de formatos de archivos químicos , incluidos Protein Data Bank (pdb), Crystallographic Information File (cif), MDL Molfile (mol) y Chemical Markup Language (CML). También hay una versión solo para JavaScript ( HTML5 ), JSmol , que se puede usar en computadoras sin Java. [5]

El subprograma Jmol, entre otras funciones, ofrece una alternativa al complemento Chime , [3] que ya no se encuentra en desarrollo activo. Si bien Jmol tiene muchas funciones de las que carece Chime, no pretende reproducir todas las funciones de Chime, en particular, el modo Sculpt . Chime requiere la instalación del complemento e Internet Explorer 6.0 o Firefox 2.0 en Microsoft Windows , o Netscape Communicator 4.8 en Mac OS 9. Jmol requiere la instalación de Java y funciona en una amplia variedad de plataformas. Por ejemplo, Jmol es completamente funcional en Mozilla Firefox , Internet Explorer , Opera , Google Chrome y Safari .

Capturas de pantalla

Véase también

Referencias

  1. ^ Traducciones de Jmol
  2. ^ Chen, Jim X. (2008), Springer (ed.), Guía de herramientas de software de gráficos, pág. 471, ISBN 978-1-84800-900-4
  3. ^ ab Herráez, A (2006), "Biomoléculas en la computadora: Jmol al rescate", Biochemistry and Molecular Biology Education , 34 (4): 255–61, doi : 10.1002/bmb.2006.494034042644 , PMID  21638687, S2CID  36319720
  4. ^ Herráez, A (2007), Lulu (ed.), Cómo usar Jmol para estudiar y presentar estructuras moleculares, Volumen 1, p. 21, ISBN 978-1-84799-259-8
  5. ^ "JSmol". Archivado desde el original el 1 de enero de 2018. Consultado el 2 de noviembre de 2015 .
  • Sitio web oficial
    • Wiki con listados de sitios web, wikis y moodles
  • Willighagen, Egon; Howard, Miguel (junio de 2007). "Gráficos moleculares rápidos y programables en navegadores web sin Java3D". Nature Precedings . doi : 10.1038/npre.2007.50.1 .
  • Extensión Jmol para MediaWiki
  • Biomodelo
  • Vista de moluscos
Obtenido de "https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Jmol&oldid=1249846249"