Archivo de información cristalográfica
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| Extensión de nombre de archivo | .cif |
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| Tipo de medio de Internet | químico/x-cif |
| Desarrollado por | Unión Internacional de Cristalografía (IUCr) |
| Tipo de formato | formato de archivo químico |
| Extendido desde | Archivo y recuperación de textos autodefinidos |
| Extendido a | CIF mm |
| Sitio web | www.iucr.org/resources/cif |
El Archivo de Información Cristalográfica ( CIF ) es un formato de archivo de texto estándar para representar información cristalográfica , promulgado por la Unión Internacional de Cristalografía (IUCr). CIF fue desarrollado por el Grupo de Trabajo de la IUCr sobre Información Cristalográfica en un esfuerzo patrocinado por la Comisión de Datos Cristalográficos de la IUCr y la Comisión de Revistas de la IUCr. El formato de archivo fue publicado inicialmente por Hall, Allen y Brown [1] y desde entonces ha sido revisado, las versiones más recientes son 1.1 y 2.0. [2] Las especificaciones completas para el formato están disponibles en el sitio web de la IUCr. Muchos programas de computadora para visualización molecular son compatibles con este formato, incluido Jmol .
CIF mm
Un formato estrechamente relacionado es el mmCIF , CIF macromolecular, [3] que se concibe como sucesor del formato Protein Data Bank (PDB) . Actualmente es el formato predeterminado que utiliza el Protein Data Bank . [4] [5]
También estrechamente relacionado está Crystallographic Information Framework , un sistema más amplio de protocolos de intercambio basado en diccionarios de datos y reglas relacionales expresables en diferentes manifestaciones legibles por máquina, incluyendo, pero no limitado a, Crystallographic Information File y XML .
Referencias
- ^ Hall SR, Allen FH, Brown ID (1991). "El Archivo de Información Cristalográfica (CIF): un nuevo archivo estándar para cristalografía". Acta Crystallographica Sección A . 47 (6): 655–685. Código Bibliográfico :1991AcCrA..47..655H. doi : 10.1107/S010876739101067X .
- ^ Brown ID, McMahon B (2002). "CIF: el lenguaje informático de la cristalografía". Acta Crystallographica Sección B: Ciencia estructural . 58 (Pt 3 Pt 1): 317–24. doi :10.1107/s0108768102003464. PMID 12037350.
- ^ Bourne, PE; Berman, HM; McMahon, B; Watenpaugh, KD; Westbrook, JD; Fitzgerald, PM (1997). "Archivo de información cristalográfica macromolecular". Cristalografía macromolecular, parte B. Métodos en enzimología. Vol. 277. págs. 571–90. doi :10.1016/s0076-6879(97)77032-0. ISBN 978-0-12-182178-4. Número de identificación personal 18488325.
- ^ Adams, policía; Afonine, PV; Baskaran, K; Berman, HM; Berrisford, J; Bricogne, G; Brown, director general; Burley, SK; Chen, M; Feng, Z; Flensburgo, C; Gutmanas, A; Hoch, JC; Ikegawa, Y; Kengaku, Y; Krissinel, E; Kurisu, G; Liang, Y; Liebschner, D; Mak, L; Markley, JL; Moriarty, noroeste; Murshudov, GN; Noble, M; Peisach, E; Persikova, yo; Poon, BK; Sobolev, OV; Ulrich, EL; Velankar, S; Vonrhein, C; Westbrook, J; Wojdyr, M; Yokochi, M; Young, JY (1 de abril de 2019). "Anuncio de la presentación obligatoria de archivos en formato PDBx/mmCIF para deposiciones cristalográficas al Protein Data Bank (PDB)". Acta Crystallographica Sección D . 75 (Pt 4): 451–454. doi :10.1107/S2059798319004522. PMC 6465986 . PMID 30988261.
- ^ - Bichler, Martin (1997), "Grundlegende WWW-Techniken" , Aufbau unternehmensweiter WWW-Informationssysteme , Wiesbaden: Vieweg+Teubner Verlag, págs. 8–32, doi :10.1007/978-3-322-86597-7_2, ISBN 978-3-322-86598-4, consultado el 17 de septiembre de 2021
Enlaces externos
- Unión Internacional de Cristalografía
