EGR1

EGR1
Estructuras disponibles
AP	Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación del PDB
	4R2A, 4R2C, 4R2D, 4X9J
Identificadores
Alias	EGR1 , AT225, G0S30, KROX-24, NGFI-A, TIS8, ZIF-268, ZNF225, respuesta de crecimiento temprano 1
Identificaciones externas	OMIM : 128990; MGI : 95295; HomoloGene : 56394; Tarjetas genéticas : EGR1; OMA :EGR1 - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 5 (humano)
Fin	138.469.303 pb
Ubicación del gen ( ratón )
Cristo.	Cromosoma 18 (ratón)
Fin	34.998.037 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	mucosa gástrica; ; trompa uterina izquierda; ; vesícula biliar; ; vena safena; ; vena cava; ; piel del muslo; ; pezón; ; fibra periodontal; ; vesícula seminal; ; médula renal;
	Top expresado en
	granulocito; ; corteza prefrontal; ; estriado dorsal; ; circunvolución cingulada; ; corteza motora primaria; ; corteza visual; ; célula cúmulo; ; núcleo accumbens; ; corteza visual primaria; ; giro frontal superior;
	Más datos de expresión de referencia
	; ;
	Más datos de expresión de referencia
Ontología genética
Función molecular	Unión del ADN; unión de ADN específica de secuencia; Unión específica de ADN a la secuencia de la región reguladora de la transcripción de la ARN polimerasa II; Actividad del factor de transcripción que se une al ADN; Actividad activadora de la transcripción de unión al ADN, específica de la ARN polimerasa II; Unión a la región reguladora cis de la transcripción; unión de iones metálicos; Actividad del factor de transcripción, unión específica de secuencia de la región proximal del promotor central de la ARN polimerasa II; unión de proteínas; unión de la acetiltransferasa de histonas; unión de ácidos nucleicos; unión al ADN hemimetilado; unión de ADN metilado de doble cadena; unión de iones de zinc; unión de cromatina específica del promotor; Actividad del factor de transcripción de unión al ADN, específico de la ARN polimerasa II;
Componente celular	nucleoplasm; núcleo; citoplasma;
Proceso biológico	Regulación del proceso apoptótico; Respuesta celular a la sustancia orgánica; regulación de la transcripción, plantilla de ADN; proliferación de células mesangiales glomerulares; Regulación negativa de la transcripción por la ARN polimerasa II; respuesta a la glucosa; transcripción por la ARN polimerasa II; Vía de señalización de BMP; transcripción, con plantilla de ADN; Regulación positiva de la transcripción, con plantilla de ADN.; respuesta a la insulina; vía de señalización mediada por interleucina-1; Respuesta celular al ácido micofenólico; Diferenciación de células T; vía de señalización del interferón tipo I; Regulación positiva de la proliferación de células mesangiales metanéfricas glomerulares.; Respuesta celular a la radiación gamma; Regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II en respuesta a la hipoxia; diferenciación de células del músculo esquelético; respuesta celular a la heparina; Regulación de la sumoilación de proteínas; Regulación negativa de la vía de señalización Wnt canónica; Regulación positiva de la transcripción por la ARN polimerasa II.; Respuesta celular a la interleucina-8; respuesta a la hipoxia; respuesta a la isquemia; ciclo estral; Regulación positiva del proceso biosintético de hormonas.; Regulación del proceso biosintético de la progesterona.; Regulación de la transcripción por la ARN polimerasa II; regulación positiva de la expresión genética; Regulación circadiana de la expresión genética.; ritmo locomotor; proceso rítmico; homeostasis de la temperatura circadiana; Regulación positiva de la muerte neuronal.; Regulación positiva de la actividad de la proteína quinasa tau;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	1958
	13653
	ENSG00000120738
	ENSMUSG00000038418
	P18146
	P08046
	NM_001964
	NM_007913
	NP_001955
	NP_031939
	Wikidatos
Ver/Editar humano	Ver/Editar ratón

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

EGR-1 (proteína de respuesta al crecimiento temprano 1), también conocida como ZNF268 (proteína de dedo de zinc 268) o NGFI-A (proteína A inducida por factor de crecimiento nervioso), es una proteína que en los humanos está codificada por el gen EGR1 .

EGR-1 es un factor de transcripción de mamíferos . También se lo conoce como Krox-24, TIS8 y ZENK . Se descubrió originalmente en ratones .

Función

La proteína codificada por este gen pertenece a la familia EGR de proteínas de dedo de zinc de tipo Cys ₂ His ₂ . Es una proteína nuclear y funciona como regulador transcripcional. Los productos de los genes diana que activa son necesarios para la diferenciación y la mitogénesis . Los estudios sugieren que se trata de un gen supresor de tumores . ^[5]

Tiene un patrón de expresión distintivo en el cerebro y se ha demostrado que su inducción está asociada con la actividad neuronal. Varios estudios sugieren que tiene un papel en la plasticidad neuronal . ^[6]

EGR-1 es un factor de transcripción importante en la formación de la memoria . Tiene un papel esencial en la reprogramación epigenética de las neuronas cerebrales . EGR-1 recluta la proteína TET1 que inicia una vía de desmetilación del ADN . ^[7] La eliminación de las marcas de metilación del ADN permite la activación de genes posteriores. EGR-1, junto con TET1, se emplea en la programación de la distribución de los sitios de metilación en el ADN cerebral durante el desarrollo cerebral, en el aprendizaje y en la plasticidad neuronal a largo plazo . También se ha descubierto que EGR-1 regula la expresión de VAMP2 (una proteína importante para la exocitosis sináptica ). ^[8]

Además de su función en el sistema nervioso, hay evidencia significativa de que EGR-1 junto con su parálogo EGR-2 se induce en enfermedades fibróticas, tiene funciones clave en la fibrinogénesis y es necesario para la fibrosis inducida experimentalmente en ratones. ^[9]

También puede estar involucrado en la función ovárica ^[10]

Estructura

El dominio de unión al ADN de EGR-1 consta de tres dominios de dedos de zinc del tipo Cys ₂ His _2. La estructura de aminoácidos del dominio de dedos de zinc de EGR-1 se muestra en esta tabla, utilizando el código de aminoácidos de una sola letra. Los dedos 1 a 3 se indican con f1 - f3. Los números hacen referencia a los residuos (aminoácidos) de la hélice alfa (no hay cero). Los residuos marcados con 'x' no son parte de los dedos de zinc, sino que sirven para conectarlos entre sí.


																				-1	1	2	3	4	5	6	7	8	9			incógnita	incógnita	incógnita	incógnita	incógnita
f1	METRO	A	mi	mi	R	PAG	Y	A	do	PAG	V	mi	S	do	D	R	R	F	S	R	S	D	mi	yo	yo	R	yo	I	R	I	yo	yo	GRAMO	Q	K	PAG
f2							F	Q	do	R	I	-	-	do	METRO	R	norte	F	S	R	S	D	yo	yo	yo	yo	yo	I	R	yo	yo	yo	GRAMO	mi	K	PAG
f3							F	A	do	D	I	-	-	do	GRAMO	R	K	F	A	R	S	D	mi	R	K	R	yo	yo	K	I	yo	yo	R	Q	K	D

Clave de aminoácidos: Alanina (Ala, A), Arginina (Arg, R), Asparagina (Asn, N), Ácido aspártico (Asp, D), Cisteína (Cys, C), Ácido glutámico (Glu, E), Glutamina (Gln, Q), Glicina (Gly, G), Histidina (His, H), Isoleucina (Ile, I), Leucina (Leu, L), Lisina (Lys, K), Metionina (Met, M), Fenilalanina (Phe, F), Prolina (Pro, P), Serina (Ser, S), Treonina (Thr, T), Triptófano (Trp, W), Tirosina (Tyr, Y), Valina (Val, V)

La estructura cristalina del ADN unido por el dominio de dedo de zinc de EGR-1 se resolvió en 1991, lo que ayudó en gran medida a las primeras investigaciones en los dominios de unión al ADN con dedo de zinc. ^[11]

La proteína humana EGR-1 contiene (en su forma no procesada) 543 aminoácidos con un peso molecular de 57,5 kDa , y el gen está ubicado en el cromosoma 5 .

Especificidad de unión al ADN

EGR-1 se une a la secuencia de ADN 5'-GCG TGG GCG-3' (y otras similares como 5'-GCG GGG GCG-3'). ^[12]^[13] La posición f1 6 une la 5' G (la primera base desde la izquierda); la posición f1 3 a la segunda base (C); la posición f1 -1 se une a la tercera posición (G); la posición f2 6 a la cuarta base (T); y así sucesivamente.

Interacciones

Se ha demostrado que EGR-1 interactúa con:

CEBPB , ^[14]
Proteína de unión a CREB , ^[15]
EP300 , ^[15]
NAB1 , ^[16]
P53 , ^[17] y
PSMA3 ^[18]

Véase también

Dedo de zinc

Referencias

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Lectura adicional

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Enlaces externos

Zif+268+protein,+human en los Encabezados de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
FactorBook Egr-1
Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : P18146 (Human Early growth response protein 1) en PDBe-KB .
Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : P08046 (Mouse Early growth response protein 1) en PDBe-KB .

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