LGP2

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens
DHX58
Estructuras disponibles
APBúsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Identificadores
AliasDHX58 , D11LGP2, D11lgp2e, LGP2, RLR-3, helicasa de caja DEXH 58
Identificaciones externasOMIM : 608588; MGI : 1931560; HomoloGene : 69371; Tarjetas genéticas : DHX58; OMA :DHX58 - ortólogos
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entre
Conjunto
Protección unificada
RefSeq (ARNm)

NM_024119

Número nuevo_030150

RefSeq (proteína)

NP_077024

NP_084426

Ubicación (UCSC)Crónicas 17:42.1 – 42.11 MbCrónica 11: 100.59 – 100.6 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
Wikidatos
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La probable helicasa de ARN dependiente de ATP DHX58, también conocida como receptor 3 similar a RIG-I (RLR-3) o receptor similar a RIG-I LGP2 (RLR), es una enzima helicasa de ARN bicatenario del receptor similar a RIG-I que en los seres humanos está codificada por el gen DHX58 . [5] [6] La proteína codificada por el gen DHX58 se conoce como LGP2 (Laboratorio de Genética y Fisiología 2). [5] [7] [8]

Estructura y función

La LGP2 se identificó y caracterizó por primera vez en el contexto del tejido mamario en 2001, [5] pero se ha descubierto que su función es más relevante en el campo de la inmunidad antiviral innata . Se ha descubierto que la LGP2 es esencial para producir respuestas antivirales efectivas contra muchos virus que son reconocidos por RIG-I y MDA5 . [9]

Dado que LGP2 carece de dominios CARD , su efecto sobre la señalización antiviral descendente probablemente se deba a la interacción con el ligando viral dsRNA o los otros RLR (RIG-I y MDA5). [10]

Se ha demostrado que LGP2 interactúa directamente [10] con RIG-I a través de su dominio represor C-terminal (RD). Los sitios de contacto primarios en esta interacción probablemente se encuentran entre el RD de LGP2 y el CARD o dominio helicasa de RIG-I como se observa con la autoasociación de RIG-I, [10] pero esto no ha sido confirmado. Se ha descubierto que la actividad helicasa de LGP2 es esencial para su regulación positiva de la señalización de RIG-I. [9] La sobreexpresión de LGP2 puede inhibir la señalización antiviral mediada por RIG-I tanto en presencia como en ausencia de ligandos virales. [10] [11] [12] Esta inhibición de la señalización de RIG-I no depende de la capacidad de LGP2 para unirse a ligandos virales y, por lo tanto, no se debe a la competencia de ligandos. [7] [13] Aunque LGP2 se une al dsRNA con mayor afinidad, [12] es prescindible para el reconocimiento mediado por RIG-I de ligandos sintéticos de dsRNA. [9] Se ha demostrado que RIG-I, cuando se sobreexpresa [7] y en estudios de supresión de LGP2 , [14] induce una respuesta antiviral en ausencia de ligando viral.

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000108771 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000017830 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
  5. ^ abc Cui Y, Li M, Walton KD, Sun K, Hanover JA, Furth PA, Hennighausen L (diciembre de 2001). "El locus Stat3/5 codifica nuevas proteínas del retículo endoplasmático y similares a la helicasa que se expresan preferentemente en tejido mamario normal y neoplásico". Genómica . 78 (3): 129–34. doi :10.1006/geno.2001.6661. hdl : 2027.42/175385 . PMID  11735219.
  6. ^ "Gen Entrez: LGP2 probablemente ortólogo del D11lgp2 de ratón".
  7. ^ abc Childs K, Randall R, Goodbourn S (abril de 2012). "Las proteínas del paramixovirus V interactúan con la helicasa de ARN LGP2 para inhibir la inducción de interferón dependiente de RIG-I". J. Virol . 86 (7): 3411–21. doi :10.1128/JVI.06405-11. PMC 3302505 . PMID  22301134. 
  8. ^ Matsumiya T, Stafforini DM (2010). "Función y regulación del gen I inducible por ácido retinoico". Crit. Rev. Immunol . 30 (6): 489–513. doi :10.1615/critrevimmunol.v30.i6.10. PMC 3099591. PMID 21175414  . 
  9. ^ abc Satoh T, Kato H, Kumagai Y, Yoneyama M, Sato S, Matsushita K, Tsujimura T, Fujita T, Akira S, Takeuchi O (enero de 2010). "LGP2 es un regulador positivo de las respuestas antivirales mediadas por RIG-I y MDA5". Proc. Nacional. Acad. Ciencia. EE.UU . 107 (4): 1512–7. Código Bib : 2010PNAS..107.1512S. doi : 10.1073/pnas.0912986107 . PMC 2824407 . PMID  20080593. 
  10. ^ abcd Saito T, Hirai R, Loo YM, Owen D, Johnson CL, Sinha SC, Akira S, Fujita T, Gale M (enero de 2007). "Regulación de las defensas antivirales innatas a través de un dominio represor compartido en RIG-I y LGP2". Proc. Natl. Sci. USA . 104 (2): 582–7. Bibcode :2007PNAS..104..582S. doi : 10.1073/pnas.0606699104 . PMC 1766428 . PMID  17190814. 
  11. ^ Rothenfusser S, Goutagny N, DiPerna G, Gong M, Monks BG, Schoenemeyer A, Yamamoto M, Akira S, Fitzgerald KA (octubre de 2005). "La helicasa de ARN Lgp2 inhibe la detección independiente de TLR de la replicación viral por el gen I inducible por ácido retinoico". J. Immunol . 175 (8): 5260–8. doi : 10.4049/jimmunol.175.8.5260 . PMID  16210631.
  12. ^ ab Yoneyama M, Kikuchi M, Matsumoto K, Imaizumi T, Miyagishi M, Taira K, Foy E, Loo YM, Gale M, Akira S, Yonehara S, Kato A, Fujita T (septiembre de 2005). "Funciones compartidas y únicas de las helicasas DExD/H-box RIG-I, MDA5 y LGP2 en la inmunidad innata antiviral". J. Immunol . 175 (5): 2851–8. doi : 10.4049/jimmunol.175.5.2851 . PMID:  16116171.
  13. ^ Wang Y, Ludwig J, Schuberth C, Goldeck M, Schlee M, Li H, Juranek S, Sheng G, Micura R, Tuschl T, Hartmann G, Patel DJ (julio de 2010). "Información estructural y funcional sobre el reconocimiento de patrones de ARN 5'-ppp por el receptor inmunitario innato RIG-I". Nat. Struct. Mol. Biol . 17 (7): 781–7. doi :10.1038/nsmb.1863. PMC 3744876. PMID  20581823 . 
  14. ^ Burel SA, Machemer T, Ragone FL, Kato H, Cauntay P, Greenlee S, Salim A, Gaarde WA, Hung G, Peralta R, Freier SM, Henry SP (julio de 2012). "Un oligonucleótido quimérico único de O-metoxietilo ribosa-ADN induce una inducción dependiente del gen 5 asociado a la diferenciación del melanoma atípico de la respuesta al interferón tipo I". J. Pharmacol. Exp. Ther . 342 (1): 150–62. doi :10.1124/jpet.112.193789. PMID  22505629. S2CID  1899247.

Lectura adicional

  • Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). "Normalización y sustracción: dos enfoques para facilitar el descubrimiento de genes". Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5'". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932.
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa". Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID:  14702039.
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Hacia un mapa a escala del proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Nature . 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Komuro A, Horvath CM (2007). "Inhibición independiente del ARN y del virus de la señalización antiviral por la helicasa de ARN LGP2". J. Virol . 80 (24): 12332–42. doi :10.1128/JVI.01325-06. PMC  1676302 . PMID  17020950.


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