La microbiota humana está formada por microorganismos (bacterias, virus, hongos y arqueas) que se encuentran en un entorno específico. Se pueden encontrar en el estómago, los intestinos, la piel, los genitales y otras partes del cuerpo. [1] Las distintas partes del cuerpo tienen diversos microorganismos. Algunos microbios son específicos de ciertas partes del cuerpo y otros están asociados a muchos microbiomas. Este artículo enumera algunas de las especies reconocidas como pertenecientes al microbioma humano y se centra en la microbiota oral, vaginal, de los folículos ováricos, del útero y del tracto reproductivo masculino.
Se estima que el cuerpo humano de referencia de 70 kg contiene alrededor de 39 billones de bacterias con una masa de aproximadamente 0,2 kg. [2] [3] [4] [5] Estas pueden separarse en aproximadamente 10.000 especies microbianas, de las cuales aproximadamente 180 se han estudiado más a fondo y se pueden clasificar en tres categorías: [6]
Los cocos suelen tener forma redonda o esférica. Pueden formar grupos y no son móviles. [7] Algunos ejemplos son Staphylococcus aureus , Streptococcus pyogenes y Neisseria gonorrhea .
Los bacilos suelen tener forma de varilla o cilindro. Entre los ejemplos se incluyen Listeria , Salmonella typhimurium , Yersinia enterocolitica y Escherichia coli .
Las espiroquetas suelen tener forma de espiral o sacacorchos y se desplazan mediante filamentos axiales. Algunos ejemplos son Treponema pallidum y Leptospira borgpetersenii . [8]
Nombre binomial | Ubicación | ¿Patológico? | ¿% del microbioma total? |
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Acinetobacter calcoaceticus | Distribuida por todo el cuerpo | ||
Burkholderia cepacia | Distribuida por todo el cuerpo | ||
Especies de Peptostreptococcus | Distribuida por todo el cuerpo | ||
Pseudomonas pseudoalcaligenes | Distribuida por todo el cuerpo | ||
Especies de eubacterias | Cavidades naturales | ||
Fusobacterium necrophorum | Cavidades naturales | ||
Especies de microbacterias | Cavidades naturales | ||
Especies de Acinetobacter | Piel | ||
Especies de bacilo | Piel | ||
Candida albicans | Piel | ||
Candida parapsilosis | Piel | ||
Corynebacterium parvum | Piel | ||
Especies de Corynebacterium | Piel | ||
Cutibacterium acnes | Piel | ||
Demodex foliculorum | Piel | ||
Enterobacter cloacae | Piel | ||
Epidermophyton floccosum | Piel | ||
Malassezia ovale | Piel | ||
Micrococo lúteo | Piel | ||
Especies de micrococos | Piel | ||
Especies de micobacterias | Piel | ||
Especies de Neisseria | Piel | ||
Especies de Peptostreptococcus | Piel | ||
Especies de Propionibacterium | Piel | ||
Pseudomonas aeruginosa | Piel | Principalmente | |
Especies de sarcina | Piel | ||
Estafilococo áureo | Piel | ||
Estafilococo epidermidis | Piel | A veces, la mayoría de las veces no | |
Estafilococo haemolítico | Piel | ||
Estreptococo viridans | Piel | ||
Especies de Trichophyton | Piel | ||
Estafilococo áureo | Folículos pilosos | ||
Especies de Corynebacterium | Oído externo | ||
Estafilococo áureo | Oído externo | ||
Estafilococo epidermidis | Oído externo | ||
Clamidia trachomatis | Membranas mucosas | ||
Haemophilus influenzae | Membranas mucosas | ||
Estafilococo áureo | Membranas mucosas | ||
Estafilococo epidermidis | Membranas mucosas | ||
Chlamydophila pneumoniae | Ojo | ||
Haemophilus aegyptius | Ojo | ||
Haemophilus influenzae | Ojo | ||
Especies de Moraxella | Ojo | ||
Especies de Neisseria | Ojo | ||
Estafilococo áureo | Ojo | ||
Estafilococo epidermidis | Ojo | ||
Estreptococo viridans | Ojo | ||
Especies de Achromobacter | Intestino grueso, intestino delgado (íleon) | ||
Acidinococcus fermentans (ácido fólico) | Intestino grueso | ||
Acinetobacter calcoaceticus | Intestino grueso | ||
Especies de Actinomyces | Boca, intestino delgado y grueso | ||
Actinomyces viscosus | Boca | ||
Actinomyces naeslundii | Boca | ||
Especies de Aeromonas | Intestino grueso, intestino delgado (íleon) | ||
Aggregatibacter actinomycetemcomitans | Boca | ||
Especies de anaerobiospirillum | Heces | ||
Alcaligenes faecalis | Intestino grueso, intestino delgado (íleon) | ||
Arachnia propionica | Boca | ||
Especies de bacilo | Intestino grueso | ||
Especies de bacteroides | Boca, tracto gastrointestinal | ||
Bacteroides gingivalis | Boca | ||
Bacteroides fragilis | Distribución general | ||
Bacteroides intermedio | Boca | ||
Bacteroides melaninogenicus | Boca, heces | ||
Bacteroides pneumosintes | Faringe | ||
Bacterionema matruchotii (Corynebacterium matruchotii, nueva combinación 1983 IJSB 33:438) | Encía | ||
Especies de bifidobacterias | Intestino grueso, heces | ||
Buchnera aphidicola | Boca | ||
Butyriviberio fibrosolvens | Intestino grueso | ||
Especies de Campylobacter | Intestino grueso | ||
Campylobacter coli | Distribución general | ||
Campylobacter sputorum | Boca | ||
Campylobacter upsaliensis | Boca | ||
Candida albicans | Boca | ||
Especies de Capnocytophaga | Boca | ||
Especies de clostridium | Intestino grueso, intestino delgado (íleon) | ||
Citrobacter freundii | Esputo | ||
Clostridioides difficile | Intestino grueso | ||
Clostridium sordellii | Estómago, intestino delgado, intestino grueso, recto, canal anal | ||
Especies de Corynebacterium | Boca | ||
Cutibacterium acnes | Distribución general | ||
Eikenella corrodens | Distribución general, boca | ||
Enterobacter cloacae | Distribución general | ||
Especies de enterococo | Boca, tracto gastrointestinal | ||
Enterococcus faecalis | Distribución general | ||
Enterococcus faecium | Distribución general | ||
Escherichia coli | Distribución general | ||
Especies de eubacterias | Boca, tracto gastrointestinal | ||
Especies de Faecalibacterium | Intestino grueso, intestino delgado (íleon) | ||
Especies de flavobacterias | Intestino grueso, intestino delgado (íleon) | ||
Especies de fusobacterias | Boca, tracto gastrointestinal | ||
Fusobacterium nucleatum | Boca | ||
especies de Gordonia | Esputo | ||
Haemophilus parainfluenzae | Boca | ||
Haemophilus paraphrophilus | Boca | ||
Especies de lactobacilos | Boca, saliva, tracto gastrointestinal (probiótico conocido) | ||
Leptotrichia bucal | Boca | ||
Metanobrevibacter smithii | Intestinos | ||
Morganella morganii | Heces | ||
Especies de micobacterias | Intestino grueso, intestino delgado (íleon) | ||
Especies de micoplasma | Intestino grueso, intestino delgado (íleon) | ||
Especies de micrococos | Boca | ||
Especies de micoplasma | Boca | ||
Micobacteria chelonae | Esputo | ||
Especies de Neisseria | Boca | ||
Neisseria sicca | Saliva, esputo | ||
Especies de Peptococcus | Boca, intestino grueso | ||
Especies de Peptostreptococcus | Boca, tracto gastrointestinal | ||
Plesiomonas shigelloides | Distribución general | ||
Porphyromonas gingivalis | Boca | ||
Especies de Propionibacterium | Intestino grueso | ||
Providencia spp | Heces | ||
Pseudomonas aeruginosa | Intestino grueso, intestino delgado (íleon) | ||
especie de roseburia | Intestino grueso | ||
Rothia dentocariosa | Boca | ||
Especies de Ruminococcus | Ciego, intestino grueso | ||
Ruminococcus bromii | Intestino grueso | ||
Especies de sarcina | Intestino grueso | ||
Estafilococo áureo | Boca, intestino grueso, intestino delgado (íleon) | ||
Estafilococo epidermidis | Boca | ||
Estreptococo anginosus | Distribución general | ||
Estreptococo mutans | Dientes: placa dental | ||
Estreptococo oralis | Dientes: placa dental | ||
Neumonía por estreptococo | Nasofaringe | ||
Estreptococo sobrino | Dientes: placa dental | ||
Estreptococo viridans | Boca, intestino grueso, intestino delgado (íleon) | ||
Torulopsis glabrata | Boca | ||
Treponema denticola | Boca | ||
Treponema refringens | Boca | ||
Especies de Veillonella | Boca, intestino grueso | ||
Especies de Vibrio | Intestino grueso, intestino delgado (íleon) | ||
Vibrio esputo | Boca | ||
Wolinella succinogenes | Boca | ||
Yersinia enterocolitica | Intestino grueso | ||
Especies de Acinetobacter | Nasofaringe | ||
Complejo de Burkholderia cepacia | Pulmón | ||
Campylobacter sputorum | Nasofaringe | ||
Candida albicans | Faringe | ||
Especies de cardiobacterias | Nariz | ||
Chlamydophila pneumoniae | Pulmón | ||
Citrobacter freundii | Garganta | ||
Eikenella corrodens | Distribución general | ||
Especies de Haemophilus | Nasofaringe | ||
Haemophilus parainfluenzae | Faringe | ||
Haemophilus paraphrophilus | Faringe | ||
Especies de Kingella | Tracto respiratorio superior | ||
Kingella kingae | Tracto respiratorio superior | ||
Especies de Moraxella | Nasofaringe | ||
Moraxella catarrhalis | Nasofaringe | ||
Micoplasma oral | Orofaringe | ||
Pneumonia por micoplasma | Epitelio respiratorio | ||
Especies de Neisseria | Nasofaringe | ||
Neisseria cinerea | Nasofaringe | ||
Neisseria elongata | Faringe | ||
Neisseria gonorrhoeae | Faringe [ cita requerida ] | ||
Neisseria lactamica | Nasofaringe | ||
Neisseria meningitidis | Nasofaringe | ||
Neisseria mucosa | Nasofaringe | ||
Neisseria sicca | Nasofaringe | ||
Especies de Peptococcus | Tracto respiratorio superior | ||
Especies de Peptostreptococcus | Faringe | ||
Pseudomonas aeruginosa | Pulmón | ||
Selenomonas sputigena | Nasofaringe | ||
Estafilococo áureo | Nariz | ||
Especies de estreptobacilo | Garganta, nasofaringe | ||
Estreptococo constellatus | Orofaringe | ||
Estreptococo intermedio | Orofaringe | ||
Estreptococo mitis | Distribución general | ||
Estreptococo pyogenes | Tracto respiratorio superior | ||
Estreptococo viridans | Faringe | ||
Especies de Acinetobacter | Uretra anterior | ||
Especies de bacteroides | Genitales externos | ||
Candida albicans | Uretra anterior, genitales externos | ||
Especies de Corynebacterium | Uretra anterior, genitales externos | ||
Enterobacteriaceae | Uretra anterior, genitales externos | ||
Estreptococo viridans | Uretra anterior, genitales externos | ||
Eikenella corrodens | Distribución general | ||
Estreptococo anginosus | Distribución general | ||
Estafilococo áureo | Perineo |
Columna | Descripción |
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Nombre binomial | Nombre de la especie, idealmente incluyendo la forma de la bacteria. |
Ubicación | Dónde se puede encontrar en el cuerpo |
¿Patológico? | ¿Puede dañar a los humanos o es útil? La escala va de No, Generalmente no, A veces, Útil |
¿% del microbioma total? | ¿Qué porcentaje de todo el microbioma humano representan las bacterias en número de organismos? |
La microbiota vaginal se va configurando durante la pubertad, el embarazo y la menopausia. La microbiota vaginal, que incluye algunas especies de Lactobacillus, protege la vagina de patógenos nocivos. [10] Convierten la glucosa en ácido láctico y este entorno ácido mata a los patógenos nocivos. La microbiota vaginal durante el embarazo varía notablemente durante todo el tiempo de gestación. Las especies y la diversidad de microorganismos pueden estar relacionadas con los distintos niveles de hormonas durante el embarazo. La flora vaginal puede transmitirse a los bebés durante el parto. La disbiosis vaginal puede provocar infecciones vaginales como la vaginosis bacteriana, que hace que la mujer sea relativamente susceptible a las enfermedades de transmisión sexual. Una buena higiene personal y los probióticos promueven una microbiota vaginal saludable. [11]
Se ha identificado el microbioma uterino sano y se han secuenciado más de 278 géneros. Las especies de bacterias como Fusobacterium se encuentran típicamente en el útero. [12] Aunque el Lactobacillus puede ser beneficioso en la vagina, “el aumento de los niveles en el útero a través de una ruptura de la barrera cervical” puede ser perjudicial para el útero. [13]
El microbioma del folículo ovárico se ha estudiado utilizando técnicas de cultivo estándar. Se lo ha asociado con los resultados de las tecnologías de reproducción asistida y los resultados del parto. Los resultados positivos están relacionados con la presencia de Lactobacillus spp., mientras que la presencia de Propionibacterium y Actinomyces se relacionó con resultados negativos. El microbioma puede variar de un ovario a otro. Se están realizando estudios para identificar mejor las bacterias presentes. [13]
Se ha evaluado el microbioma presente en el líquido seminal . Utilizando técnicas de cultivo tradicionales, el microbioma difiere entre los hombres que tienen prostatitis aguda y aquellos que tienen prostatitis crónica . La identificación del microbioma del líquido seminal se ha convertido en una de las herramientas de diagnóstico utilizadas en el tratamiento de la infertilidad en hombres que no muestran síntomas de infección o enfermedad. Los taxones Pseudomonas , Lactobacillus y Prevotella muestran un efecto negativo en la calidad del esperma. La presencia de Lactobacillus spp en muestras de semen se asocia con un recuento de espermatozoides normal muy alto. [13]
La microbiota oral está formada por todos los microorganismos que existen en la boca. Es la segunda más grande del cuerpo humano y está formada por diversas bacterias, virus, hongos y protozoos. [14] Estos organismos desempeñan un papel importante en la salud oral y general. Anthony Van Leeuwenhoek fue el primero en observar estos organismos utilizando un microscopio que él mismo creó. [14] La temperatura y el pH de la saliva hacen que sea propicia para que las bacterias sobrevivan en la cavidad oral. Las bacterias de la cavidad oral incluyen Streptococcus mutans , Porphyromonas gingivalis y Staphylococcus . [15] S. mutans es el principal componente de la microbiota oral. [15]
Un microbioma bucal sano disminuye las infecciones bucales y promueve un microbioma intestinal sano. Sin embargo, cuando se altera, puede provocar inflamaciones de las encías y mal aliento. [16] La placa dental se forma cuando los microorganismos bucales forman biopelículas en las superficies de los dientes. Las prácticas recomendadas para mantener un microbioma bucal sano incluyen practicar una buena higiene bucal (cepillarse los dientes dos veces y usar hilo dental, reemplazar el cepillo de dientes con frecuencia), llevar una dieta saludable (alimentos con poco o nada de azúcares agregados y alimentos ultraprocesados), beber mucha agua y tomar probióticos.