Canal iónico controlado por ligando

Tipo de proteína transmembrana de canal iónico
Región transmembrana del canal iónico controlado por neurotransmisores
Canal iónico controlado por ligando
Identificadores
SímboloMiembro de Neur_chan
PfamPF02932
InterprofesionalIPR006029
PROSITIOPDOC00209
SCOP21cek / ALCANCE / SUPFAM
Base de datos de datos termodinámica1.A.9
Superfamilia OPM14
Proteína OPM2bg9
Estructuras de proteínas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
APPDB RCSB; PDBj
PDBsumaResumen de la estructura
  1. Receptor ligado a canales iónicos
  2. Iones
  3. Ligando (como la acetilcolina )
Cuando los ligandos se unen al receptor, la porción del canal iónico del receptor se abre, permitiendo que los iones pasen a través de la membrana celular .
Canal iónico controlado por ligando que muestra la unión del transmisor (Tr) y el cambio del potencial de membrana (Vm)

Los canales iónicos controlados por ligando ( LIC , LGIC ), también conocidos comúnmente como receptores ionotrópicos , son un grupo de proteínas de canales iónicos transmembrana que se abren para permitir que iones como Na + , K + , Ca2 + y/o Cl− pasen a través de la membrana en respuesta a la unión de un mensajero químico (es decir, un ligando ), como un neurotransmisor . [1] [2] [3]

Cuando una neurona presináptica se excita, libera un neurotransmisor desde vesículas hacia la hendidura sináptica . Luego, el neurotransmisor se une a los receptores ubicados en la neurona postsináptica . Si estos receptores son canales iónicos regulados por ligando, un cambio conformacional resultante abre los canales iónicos, lo que conduce a un flujo de iones a través de la membrana celular. Esto, a su vez, da como resultado una despolarización , para una respuesta del receptor excitadora, o una hiperpolarización , para una respuesta inhibidora.

Estas proteínas receptoras se componen típicamente de al menos dos dominios diferentes: un dominio transmembrana que incluye el poro iónico y un dominio extracelular que incluye la ubicación de unión del ligando (un sitio de unión alostérico ). Esta modularidad ha permitido un enfoque de "dividir y vencer" para encontrar la estructura de las proteínas (cristalizando cada dominio por separado). La función de dichos receptores ubicados en las sinapsis es convertir la señal química del neurotransmisor liberado presinápticamente de manera directa y muy rápida en una señal eléctrica postsináptica . Muchos LIC son modulados adicionalmente por ligandos alostéricos , por bloqueadores de canales , iones o el potencial de membrana . Los LIC se clasifican en tres superfamilias que carecen de relación evolutiva: receptores de bucle cis , receptores de glutamato ionotrópicos y canales regulados por ATP .

Receptores de bucle Cys

Receptor nicotínico de acetilcolina en estado cerrado con límites de membrana previstos mostrados, PDB 2BG9

Los receptores de bucle cis reciben su nombre de un bucle característico formado por un enlace disulfuro entre dos residuos de cisteína en el dominio extracelular N-terminal. Forman parte de una familia más grande de canales iónicos controlados por ligando pentamérico que normalmente carecen de este enlace disulfuro, de ahí el nombre provisional de "receptores de bucle pro". [4] [5] Un sitio de unión en el dominio de unión al ligando N-terminal extracelular les confiere especificidad de receptor para (1) acetilcolina (AcCh), (2) serotonina, (3) glicina, (4) glutamato y (5) ácido γ-aminobutírico (GABA) en vertebrados. Los receptores se subdividen con respecto al tipo de ion que conducen (aniónico o catiónico) y además en familias definidas por el ligando endógeno. Por lo general son pentaméricos y cada subunidad contiene 4 hélices transmembrana que constituyen el dominio transmembrana y un dominio de unión a ligando, N terminal, extracelular, tipo sándwich de lámina beta. [6] Algunos también contienen un dominio intracelular como se muestra en la imagen.

El canal iónico controlado por ligando prototípico es el receptor nicotínico de acetilcolina . Consiste en un pentámero de subunidades proteicas (típicamente ααβγδ), con dos sitios de unión para la acetilcolina (uno en la interfaz de cada subunidad alfa). Cuando la acetilcolina se une, altera la configuración del receptor (tuerce las hélices T2 que mueven los residuos de leucina, que bloquean el poro, fuera de la vía del canal) y hace que la constricción en el poro de aproximadamente 3 angstroms se ensanche a aproximadamente 8 angstroms para que los iones puedan pasar a través. Este poro permite que los iones Na + fluyan a favor de su gradiente electroquímico hacia la célula. Con una cantidad suficiente de canales que se abren a la vez, el flujo entrante de cargas positivas transportadas por los iones Na + despolariza la membrana postsináptica lo suficiente como para iniciar un potencial de acción .

Se ha identificado un homólogo bacteriano de un LIC, que se plantea la hipótesis de que actúa, no obstante, como un quimiorreceptor. [4] Esta variante procariota de nAChR se conoce como receptor GLIC , en honor a la especie en la que se identificó; G loeobacter L igand-gated I on C hannel.

Estructura

Los receptores Cys-loop tienen elementos estructurales que están bien conservados, con un gran dominio extracelular (ECD) que alberga una hélice alfa y 10 cadenas beta. Después del ECD, cuatro segmentos transmembrana (TMS) están conectados por estructuras de bucle intracelulares y extracelulares. [7] Excepto el bucle TMS 3-4, sus longitudes son solo de 7 a 14 residuos. El bucle TMS 3-4 forma la parte más grande del dominio intracelular (ICD) y exhibe la región más variable entre todos estos receptores homólogos. El ICD está definido por el bucle TMS 3-4 junto con el bucle TMS 1-2 que precede al poro del canal iónico. [7] La ​​cristalización ha revelado estructuras para algunos miembros de la familia, pero para permitir la cristalización, el bucle intracelular generalmente se reemplazó por un enlace corto presente en los receptores Cys-loop procariotas, por lo que sus estructuras son desconocidas. Sin embargo, este circuito intracelular parece funcionar en la desensibilización, la modulación de la fisiología del canal por sustancias farmacológicas y las modificaciones postraduccionales . Los motivos importantes para el tráfico están ahí, y el ICD interactúa con las proteínas de andamiaje que permiten la formación de sinapsis inhibidoras . [7]

Receptores catiónicos de bucle cis

TipoClase
Nombre de proteína recomendado por la IUPHAR [8]
GeneNombres anteriores
Serotonina
(5-HT)
5- HT35-HT3A
5-HT3B
5-HT3C
5-HT3D
5-HT3E
HTR3A
HTR3B
HTR3C
HTR3D
HTR3E
5-HT3A 5
-HT3B 5
-HT3C 5
-HT3D 5
- HT3E
Acetilcolina nicotínica
(nAChR)
alfaα1
α2
α3
α4
α5
α6
α7
α9
α10
CHRNA1
CHRNA2
CHRNA3
CHRNA4
CHRNA5
CHRNA6
CHRNA7
CHRNA9
CHRNA10
ACHRA, ACHRD, CHRNA, CMS2A, FCCMS, SCCMS







betaβ1β2β3β4


CRNB1
CRNB2
CRNB3
CRNB4
CMS2A, SCCMS, ACHRB, CHRNB, CMS1D
EFNL3, nAChRB2

gamagammaCRNG (Cronología)Comisión de Derechos Humanos de Canadá
deltadelCRND-enfermedadACHRD, CMS2A, FCCMS, SCCMS
épsilonmiCRNEAchre, CMS1D, CMS1E, CMS2A, FCCMS, SCCMS
Canal iónico activado por zinc
(ZAC)
ZACZACNZAC1, L2m LICZ, LICZ1

Receptores aniónicos de bucle cis

TipoClase
Nombre de proteína recomendado por la IUPHAR [8]
GeneNombres anteriores
GABA -Aalfaα1
α2
α3
α4
α5
α6
GABRA1
GABRA2
GABRA3
GABRA4
GABRA5
GABRA6
EJM, ECA4
betaβ1β2β3

GABRB1
GABRB2
GABRB3


ECA5
gamay1
y2
y3
GABRG1
GABRG2
GABRG3
CAE2, ECA2, GEFSP3
deltadelGABRD
épsilonmiGABRE
piπGABRP
tetaθGABRQ
roρ1
ρ2
ρ3
GABRR1
GABRR2
GABRR3
GABA C [9]
Glicina
(GlyR)
alfaα1α2α3α4


GLRA1
GLRA2
GLRA3
GLRA4
ELLO

betaβGLRB

Receptores ionotrópicos de glutamato

Los receptores ionotrópicos de glutamato se unen al neurotransmisor glutamato . Forman tetrámeros, cada subunidad consta de un dominio amino terminal extracelular (ATD, que participa en el ensamblaje del tetrámero), un dominio de unión al ligando extracelular (LBD, que se une al glutamato) y un dominio transmembrana (TMD, que forma el canal iónico). El dominio transmembrana de cada subunidad contiene tres hélices transmembrana, así como una hélice de media membrana con un bucle reentrante. La estructura de la proteína comienza con el ATD en el extremo N, seguido de la primera mitad del LBD, que se interrumpe por las hélices 1, 2 y 3 del TMD antes de continuar con la mitad final del LBD y luego terminar con la hélice 4 del TMD en el extremo C. Esto significa que hay tres enlaces entre el TMD y los dominios extracelulares. Cada subunidad del tetrámero tiene un sitio de unión para el glutamato formado por las dos secciones del LBD que forman una forma similar a una concha de almeja. Para abrir el canal iónico sólo es necesario que dos de estos sitios en el tetrámero estén ocupados. El poro está formado principalmente por la semihélice 2 de una manera que se asemeja a un canal de potasio invertido .

El receptor AMPA unido a un antagonista del glutamato que muestra el extremo amino, la unión del ligando y el dominio transmembrana, PDB 3KG2
TipoClase
Nombre de proteína recomendado por la IUPHAR [8]
GeneNombres anteriores
AMPAGluAGluA1
GluA2
GluA3
GluA4
GRIA1
GRIA2
GRIA3
GRIA4
GLU A1 , GluR1, GluRA, GluR-A, GluR-K1, HBGR1
GLU A2 , GluR2, GluRB, GluR-B, GluR-K2, HBGR2
GLU A3 , GluR3, GluRC, GluR-C, GluR-K3
GLU A4 , GluR4, GluRD, GluR-D
KainatoGluKGluK1
GluK2
GluK3
GluK4
GluK5
GRIK1
GRIK2
GRIK3
GRIK4
GRIK5
GLU- K5 , GluR5, GluR-5, EAA3
GLU - K6 , GluR6, GluR-6, EAA4
GLU - K7 , GluR7, GluR-7, EAA5
GLU - K1 , KA1, KA-1, EAA1
GLU - K2 , KA2, KA-2, EAA2
Asociación Nacional de Médicos de la Región Administrativa Especial (NMDA)GluNGluN1
NRL1A
NRL1B
GRIN1
GRINL1A
GRINL1B
GLU N1 , NMDA-R1, NR1, GluRξ1


GluN2A
GluN2B
GluN2C
GluN2D
GRIN2A
GRIN2B
GRIN2C
GRIN2D
GLU N2A , NMDA-R2A, NR2A, GluRε1
GLU N2B , NMDA-R2B, NR2B, hNR3, GluRε2
GLU N2C , NMDA-R2C, NR2C, GluRε3
GLU N2D , NMDA-R2D, NR2D, GluRε4
GluN3A
GluN3B
GRIN3A
GRIN3B
GLU N3A , NMDA-R3A, NMDAR-L, chi-1
GLU 3B , NMDA-R3B
'Huérfano'(gluD)GluD1
GluD2
Cuadrícula 1
Cuadrícula 2
GluRδ1
GluRδ2

Receptor AMPA

Tráfico de receptores AMPA

El receptor del ácido α-amino-3-hidroxi-5-metil-4-isoxazolpropiónico (también conocido como receptor AMPA o receptor quisqualato ) es un receptor transmembrana ionotrópico de tipo no NMDA para el glutamato que media la transmisión sináptica rápida en el sistema nervioso central (SNC). Su nombre se deriva de su capacidad para ser activado por el análogo artificial del glutamato AMPA . El receptor fue denominado por primera vez "receptor quisqualato" por Watkins y colegas en honor a un agonista natural quisqualato y solo más tarde se le dio la etiqueta de "receptor AMPA" en honor al agonista selectivo desarrollado por Tage Honore y colegas en la Real Escuela Danesa de Farmacia en Copenhague. [10] Los AMPAR se encuentran en muchas partes del cerebro y son los receptores más comúnmente encontrados en el sistema nervioso . El tetrámero del receptor AMPA GluA2 (GluR2) fue el primer canal iónico del receptor de glutamato en cristalizarse . Los ligandos incluyen:

Receptores NMDA

Representación estilizada de un NMDAR activado

El receptor N-metil-D-aspartato ( receptor NMDA ), un tipo de receptor ionotrópico de glutamato  , es un canal iónico regulado por ligando que se regula por la unión simultánea de glutamato y un coagonista (es decir, D-serina o glicina ). [11] Los estudios muestran que el receptor NMDA está involucrado en la regulación de la plasticidad sináptica y la memoria. [12] [13]

El nombre "receptor NMDA" se deriva del ligando N-metil-D-aspartato (NMDA), que actúa como un agonista selectivo en estos receptores. Cuando el receptor NMDA se activa mediante la unión de dos coagonistas, el canal de cationes se abre, lo que permite que Na + y Ca2 + fluyan hacia la célula, lo que a su vez aumenta el potencial eléctrico de la célula . Por lo tanto, el receptor NMDA es un receptor excitador. En potenciales de reposo , la unión de Mg2 + o Zn2 + en sus sitios de unión extracelulares en el receptor bloquea el flujo de iones a través del canal del receptor NMDA. "Sin embargo, cuando las neuronas se despolarizan, por ejemplo, por la activación intensa de los receptores AMPA postsinápticos colocalizados , el bloqueo dependiente del voltaje por Mg 2+ se alivia parcialmente, lo que permite la entrada de iones a través de los receptores NMDA activados. La entrada de Ca 2+ resultante puede desencadenar una variedad de cascadas de señalización intracelular, que en última instancia pueden cambiar la función neuronal a través de la activación de varias quinasas y fosfatasas". [14] Los ligandos incluyen:

Canales regulados por ATP

Figura 1. Representación esquemática que muestra la topología de membrana de una subunidad típica del receptor P2X. El primer y el segundo dominio transmembrana están denominados TM1 y TM2.

Los canales regulados por ATP se abren en respuesta a la unión del nucleótido ATP . Forman trímeros con dos hélices transmembrana por subunidad y los extremos C y N en el lado intracelular.

TipoClase
Nombre de proteína recomendado por la IUPHAR [8]
GeneNombres anteriores
P2XN / AP2X1P2X2P2X3P2X4P2X5P2X6P2X7





P2RX1
P2RX2
P2RX3
P2RX4
P2RX5
P2RX6
P2RX7
P2X1 P2X2 P2X3 P2X4 P2X5 P2X6 P2X7
​​​




Relevancia clínica

Es probable que los canales iónicos controlados por ligando sean el principal sitio en el que los agentes anestésicos y el etanol tienen sus efectos, aunque todavía se debe establecer evidencia inequívoca de esto. [16] [17] En particular, los receptores GABA y NMDA se ven afectados por agentes anestésicos en concentraciones similares a las utilizadas en la anestesia clínica. [18]

Al comprender el mecanismo y explorar el componente químico/biológico/físico que podría funcionar en esos receptores, cada vez se prueban más aplicaciones clínicas mediante experimentos preliminares o FDA . La memantina está aprobada por la USFDA y la Agencia Europea de Medicamentos para el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer de moderada a grave , [19] y ahora ha recibido una recomendación limitada por el Instituto Nacional para la Excelencia en la Salud y la Atención del Reino Unido para pacientes que no responden a otras opciones de tratamiento. [20] La agomelatina , es un tipo de fármaco que actúa sobre una vía dual melatoninérgica - serotoninérgica , que ha demostrado su eficacia en el tratamiento de la depresión ansiosa durante los ensayos clínicos, [21] [22] el estudio también sugiere la eficacia en el tratamiento de la depresión atípica y melancólica . [23]

Véase también

Referencias

  1. ^ "Familia de genes: canales iónicos regulados por ligando". Comité de nomenclatura genética de HUGO.
  2. ^ "canal controlado por ligando" en el Diccionario médico de Dorland
  3. ^ Purves, Dale, George J. Augustine, David Fitzpatrick, William C. Hall, Anthony-Samuel LaMantia, James O. McNamara y Leonard E. White (2008). Neurociencia. 4.ª ed . Sinauer Associates. págs. 156-157. ISBN 978-0-87893-697-7.{{cite book}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
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  • www.esf.edu
  • www.genenames.org
  • www.guidetopharmacology.org

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