VPS45

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens
VPS45
Identificadores
AliasVPS45 , H1, H1SCN5, VPS45A, VPS45B, VPS54A, VSP45, VSP45A, homólogo de la proteína vacuolar 45
Identificaciones externasOMIM : 610035; MGI : 891965; HomoloGene : 5250; Tarjetas genéticas : VPS45; OMA :VPS45 - ortólogos
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entre
Conjunto
Protección unificada
RefSeq (ARNm)

NM_001279353
NM_001279354
NM_001279355
NM_007259

NM_013841

RefSeq (proteína)

NP_001266282
NP_001266283
NP_009190

NP_038869

Ubicación (UCSC)Cronos 1: 150.07 – 150.15 MbCrónica 3: 95,91 – 95,97 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
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La proteína 45 asociada a la clasificación de proteínas vacuolares es una proteína que en los humanos está codificada por el gen VPS45 . [5] [6]

Función

La clasificación de proteínas mediada por vesículas desempeña un papel importante en la segregación de moléculas intracelulares en orgánulos distintos . Los estudios genéticos en levaduras han identificado más de 40 genes de clasificación de proteínas vacuolares (VPS) involucrados en el transporte de vesículas a vacuolas. Este gen es miembro de la familia de dominios Sec1 y muestra un alto grado de similitud de secuencia con Vps45 de ratón, rata y levadura. La función exacta de este gen no se conoce, pero su alta expresión en células mononucleares de sangre periférica sugiere un papel en el tráfico de proteínas, incluidos los mediadores inflamatorios . [6]

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000136631 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000015747 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ Pevsner J, Hsu SC, Hyde PS, Scheller RH (febrero de 1997). "Homólogos de mamíferos de genes de clasificación de proteínas vacuolares (vps) de levadura implicados en el tráfico del Golgi al lisosoma". Gene . 183 (1–2): 7–14. doi : 10.1016/S0378-1119(96)00367-8 . PMID  8996080.
  6. ^ ab "Gen Entrez: Homólogo de clasificación de proteína vacuolar VPS45 45 (S. cerevisiae)".

Lectura adicional

  • Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Tellam JT, James DE, Stevens TH, Piper RC (1997). "Identificación de una proteína similar a Sec1p del Golgi de mamíferos, mVps45". J. Biol. Chem . 272 ​​(10): 6187–93. doi : 10.1074/jbc.272.10.6187 . PMID  9045632.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5'". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
  • Rajasekariah P, Eyre HJ, Stanley KK, et al. (1999). "Clonación molecular y caracterización de un ADNc que codifica la proteína vacuolar leucocítica humana (h1Vps45)". Int. J. Biochem. Cell Biol . 31 (6): 683–94. doi :10.1016/S1357-2725(99)00017-5. PMID  10404641.
  • Nielsen E, Christoforidis S, Uttenweiler-Joseph S, et al. (2000). "Rabenosyn-5, un nuevo efector Rab5, se combina con hVPS45 y se recluta en los endosomas a través de un dominio de dedo FYVE". J. Cell Biol . 151 (3): 601–12. doi :10.1083/jcb.151.3.601. PMC 2185588.  PMID 11062261  .
  • de Renzis S, Sönnichsen B, Zerial M (2002). "Los efectores Rab divalentes regulan la organización subcompartimental y la clasificación de los endosomas tempranos". Nat. Cell Biol . 4 (2): 124–33. doi :10.1038/ncb744. PMID  11788822. S2CID  6596498.
  • Dulubova I, Yamaguchi T, Gao Y, et al. (2002). "Cómo Tlg2p/syntaxin 16 'atrapa' a Vps45". EMBO J . 21 (14): 3620–31. doi :10.1093/emboj/cdf381. PMC  126126 . PMID  12110575.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932.
  • Kim BY, Ueda M, Kominami E, et al. (2004). "Identificación de Vps16 de ratón y caracterización bioquímica del complejo Vps de clase C de mamíferos". Biochem. Biophys. Res. Commun . 311 (3): 577–82. doi :10.1016/j.bbrc.2003.10.030. PMID  14623309.
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa". Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID:  14702039.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa del NIH: la Colección de Genes de Mamíferos (MGC)". Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928 . PMID  15489334.
  • Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversificación de la modulación transcripcional: identificación y caracterización a gran escala de promotores alternativos putativos de genes humanos". Genome Res . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC  1356129 . PMID  16344560.


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