Idaeovirus
Género de virus

Idaeovirus
Clasificación de virus Editar esta clasificación
(sin clasificar):Virus
Reino :Riboviridae
Reino:Virus de la ortiga
Filo:Kitrinoviricota
Clase:Alsuviricetes
Orden:Virus martelídicos
Familia:Mayovirus
Género:Idaeovirus

Idaeovirus es un género de virus ssRNA de sentido positivo que contiene dos especies: Raspberry bushy dwarf virus (RBDV) y Privet idaeovirus . [1] [2] RBDV tiene dos clados dependientes del huésped: uno para frambuesas ; el otro para vides . [3] Las infecciones son una carga agrícola significativa, resultando en una disminución del rendimiento y la calidad de los cultivos. [4] RBDV tiene una relación sinérgica con Raspberry leaf mottle virus , con coinfección que amplifica en gran medida la concentración de viriones en plantas infectadas. [5] El virus se transmite a través de la polinización con granos de polen infectados con RBDV que primero infectan el estigma antes de causar una infección sistémica. [6]

Virología

El RBDV no está envuelto con una capa proteica isométrica de unos 33 nanómetros de diámetro. [7] Dentro de la capa proteica se encuentra el genoma viral, que es bipartito, con las hebras de ARN denominadas ARN-1 y ARN-2. El ARN-1 tiene 5.449 nucleótidos de longitud y contiene un marco de lectura abierto (ORF) que codifica una proteína combinada que tiene dominios de metiltransferasa , helicasa y una ARN polimerasa dependiente de ARN . [1] [8] [9] El ARN-2 tiene 2.231 nucleótidos de longitud y contiene dos ORF, uno en el extremo 5' y el otro en el extremo 3'. [9] [10] El primer ORF codifica una proteína de movimiento de célula a célula, mientras que el segundo ORF se expresa como una hebra de ARN subgenómica . [7] [10] Esta cadena, ARN-3, tiene 946 nucleótidos de longitud y codifica la proteína de la cubierta. [11] Se ha demostrado que no se produce infección si el ARN-3 no está presente o está suficientemente dañado. [7]

GéneroEstructuraSimetríaCápsideDisposición genómicaSegmentación genómica
IdaeovirusIcosaédrica, isométricaSin envoltorioLinealBipartito

Ciclo vital

La replicación viral es citoplasmática. La entrada en la célula huésped se logra mediante la penetración en la célula huésped. La replicación sigue el modelo de replicación del virus ARN de cadena positiva. La transcripción del virus ARN de cadena positiva es el método de transcripción. El virus sale de la célula huésped mediante un movimiento viral guiado por túbulos. Las plantas sirven como huésped natural. Las vías de transmisión están asociadas al polen. [12]

GéneroDetalles del anfitriónTropismo tisularDetalles de la entradaDetalles del lanzamientoSitio de replicaciónLugar de montajeTransmisión
IdaeovirusPlantasNingunoCitoplasmaCitoplasmaAsociado al polen

Diagnóstico

Se han desarrollado reacciones en cadena de polimerasa con transcripción inversa de un solo paso para detectar RBDV. [5] [13] Los virus se enriquecen con anticuerpos en los micropocillos de PCR, seguido de la lisis de las partículas virales y luego la transcripción inversa del ARN viral. [13] Al incluir la transcriptasa inversa y la ADN polimerasa en todo el proceso, el procedimiento se puede realizar en un solo paso. [13] Estas pruebas son lo suficientemente sensibles para identificar la cepa específica del virus. [5]

Tratamiento

El RBDV puede erradicarse de las plantas infectadas mediante un procedimiento que primero aplica termoterapia y luego crioterapia a los brotes infectados . [14] [15] La aplicación de calor a las plantas infectadas hace que las vacuolas en las células infectadas se agranden, y estas células mueren más tarde durante la crioterapia. [15] La adición de ácido etilendiaminotetraacético Fe o ácido etilendiaminodi(o)hidroxifenilacético Fe después de la crioterapia estimula el recrecimiento y evita que se desarrolle clorosis en los brotes de las plantas. [14] Con este método, aproximadamente el 80% de los brotes sobreviven a la terapia de calor inicial, y el 33% sobrevive a la crioterapia y vuelve a crecer con éxito. [14]

Referencias

  1. ^ ab Ziegler, A; Natsuaki, T; Mayo, MA; Jolly, CA; Murant, AF (1992). "La secuencia de nucleótidos del ARN-1 del virus del enanismo arbustivo de la frambuesa". The Journal of General Virology . 73 (12): 3213–8. doi : 10.1099/0022-1317-73-12-3213 . PMID  1469359.
  2. ^ "Taxonomía de virus: publicación de 2020". Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Consultado el 5 de julio de 2021 .
  3. ^ Valasevich, N; Kukharchyk, N; Kvarnheden, A (2011). "Caracterización molecular de los aislados del virus del enanismo arbustivo de la frambuesa de Suecia y Bielorrusia". Archivos de Virología . 156 (3): 369–74. doi :10.1007/s00705-010-0912-9. PMID  21253783. S2CID  43135450.
  4. ^ Malowicki, SM; Martin, R; Qian, MC (2008). "Comparación de azúcar, ácidos y composición volátil en frambuesas transgénicas resistentes al virus del enanismo arbustivo y el tipo silvestre 'meeker' (rubus idaeus L.)". Journal of Agricultural and Food Chemistry . 56 (15): 6648–55. doi :10.1021/jf800253e. PMID  18598047.
  5. ^ abc Quito-Avila, DF; Martin, RR (2012). "RT-PCR en tiempo real para la detección del virus del enanismo arbustivo de la frambuesa, virus del moteado de la hoja de la frambuesa y caracterización de interacciones sinérgicas en infecciones mixtas". Journal of Virological Methods . 179 (1): 38–44. doi :10.1016/j.jviromet.2011.09.016. PMID  21968094.
  6. ^ Isogai, M; Yoshida, T; Nakanowatari, C; Yoshikawa, N (2014). "La penetración de los tubos polínicos con el virus del enanismo arbustivo de la frambuesa acumulado en los estigmas está implicada en la infección inicial del tejido materno y la transmisión horizontal". Virología . 452–453: 247–53. doi : 10.1016/j.virol.2014.02.001 . PMID  24606702.
  7. ^ abc MacFarlane, SA; McGavin, WJ (2009). "Activación del genoma por la proteína de la cubierta del virus del enanismo arbustivo de la frambuesa". Journal of General Virology . 90 (Pt 3): 747–53. doi : 10.1099/vir.0.007195-0 . PMID  19218221.
  8. ^ Ziegler, A; Mayo, MA; Murant, AF (1993). "Propuesta de clasificación del idaeovirus enano arbustivo de frambuesa con genoma bipartito, con virus con genoma tripartito en la familia Bromoviridae". Archivos de Virología . 131 (3–4): 483–8. doi : 10.1007/bf01378649 . PMID  8347087. S2CID  31922799.
  9. ^ ab Quito-Avila, DF; Ibarra, MA; Alvarez, R; Peralta, EL; Martin, RR (2014). "Un virus del enanismo arbustivo de la frambuesa aislado del Rubus glaucus ecuatoriano contiene un ARN adicional que es un reordenamiento del ARN-2". Archivos de Virología . 159 (9): 2519–21. doi :10.1007/s00705-014-2069-4. PMID  24719196. S2CID  18080015.
  10. ^ ab Natsuaki, T; Mayo, MA; Jolly, CA; Murant, AF (1991). "Secuencia de nucleótidos del ARN-2 del virus del enanismo arbustivo de la frambuesa: un componente bicistrónico de un genoma bipartito". The Journal of General Virology . 72 (9): 2183–9. doi : 10.1099/0022-1317-72-9-2183 . PMID  1895055.
  11. ^ Mayo, MA; Jolly, CA; Murant, AF; Raschke, JH (1991). "Secuencia de nucleótidos del ARN-3 del virus del enanismo arbustivo de la frambuesa". The Journal of General Virology . 72 (2): 469–72. doi : 10.1099/0022-1317-72-2-469 . PMID  1993886.
  12. ^ "Zona viral". ExPASy . Consultado el 15 de junio de 2015 .
  13. ^ abc Kokko, HI; Kivineva, M; Kärenlampi, SO (1996). "RT-PCR de inmunocaptura de un solo paso en la detección del virus del enanismo arbustivo de la frambuesa". BioTechniques . 20 (5): 842–6. doi : 10.2144/96205st03 . PMID  8723929.
  14. ^ abc Wang, Q; Valkonen, JP (2009). "Recuperación mejorada de las puntas de los brotes tratados con crioterapia después de la termoterapia de brotes madre de frambuesa (Rubus idaeus L.) cultivados in vitro". Cryo Letters . 30 (3): 170–82. PMID  19750241.
  15. ^ ab Wang, Q; Cuellar, WJ; Rajamäki, ML; Hirata, Y; Valkonen, JP (2008). "Termoterapia y crioterapia combinadas para la erradicación eficiente de virus: Relación de la distribución del virus, cambios subcelulares, supervivencia celular y degradación del ARN viral en las puntas de los brotes". Patología molecular de plantas . 9 (2): 237–50. doi :10.1111/j.1364-3703.2007.00456.x. PMC 6640318 . PMID  18705855. 
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