VPS26A

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens
VPS26A
Estructuras disponibles
APBúsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Identificadores
AliasVPS26A , HB58, Hbeta58, PEP8A, VPS26, componente A del complejo retrómero VPS26, VPS26, componente A del complejo retrómero
Identificaciones externasOMIM : 605506; MGI : 1353654; HomoloGene : 68420; Tarjetas genéticas : VPS26A; OMA :VPS26A - ortólogos
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entre
Conjunto
Protección unificada
RefSeq (ARNm)

NM_001035260
NM_004896
NM_001318944
NM_001318945
NM_001318946

NM_001113355
NM_133672
NM_001358543

RefSeq (proteína)

NP_001030337
NP_001305873
NP_001305874
NP_001305875
NP_004887

NP_001106826
NP_598433
NP_001345472

Ubicación (UCSC)Crónicas 10:69.12 – 69.17 MbCrónica 10: 62.29 – 62.32 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
Wikidatos
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La proteína 26A asociada a la clasificación de proteínas vacuolares es una proteína que en los humanos está codificada por el gen VPS26A . [5] [6] [7]

Este gen pertenece a un grupo de genes de clasificación de proteínas vacuolares (VPS). La proteína codificada es un componente de un gran complejo multimérico, denominado complejo retrómero , que participa en el transporte retrógrado de proteínas desde los endosomas hasta la red trans-Golgi . La estrecha similitud estructural entre las proteínas de levadura y humanas que forman este complejo sugiere una similitud en la función. Los estudios de expresión en células de levadura y mamíferos indican que esta proteína interactúa directamente con VPS35 , que sirve como núcleo del complejo retrómero. El empalme alternativo da como resultado múltiples variantes de transcripción que codifican diferentes isoformas. [7]

Estructura

Comparación estructural de Vps26 con arrestinas

Vps26 es una subunidad de 38 kDa que tiene una estructura de dos lóbulos con un núcleo polar que se asemeja a la familia arrestina de adaptadores de tráfico. [8] [9] Este pliegue consta de dos subdominios β-sándwich relacionados con una topología de dominio de fibronectina tipo III . Los dos dominios están unidos entre sí por un enlazador flexible y están estrechamente asociados por un núcleo polar inusual. Las arrestinas son proteínas reguladoras conocidas por conectar receptores acoplados a proteína G (GPCR) a clatrina durante la endocitosis. Desempeñan muchos papeles críticos en la señalización celular y el tráfico de membrana. [10] Tanto Vps26 como las arrestinas están compuestas por dos dominios de lámina β estructuralmente relacionados que forman extensas interfaces entre sí, utilizando contactos polares y electrostáticos para crear interacciones entre dominios para la unión del ligando. Sin embargo, existen diferencias estructurales significativas entre Vps26 y las arrestinas. La proteína Vps26 tiene colas C-terminales extendidas que no contienen secuencias de unión a clatrina o AP2 identificables y, por lo tanto, no puede formar contactos intramoleculares estables con clatrina y AP2, lo que se ha observado para las arrestinas. Además, Vps26 no tiene secuencias similares a las arrestinas para interacciones de GPCR y fosfolípidos . [11]

Parálogo Vps26B

Diferencias estructurales entre Vps26A y Vps26B

En la levadura, solo hay una especie de Vps26, mientras que hay dos parálogos de Vps26 (Vps26A y Vps26B) en los mamíferos. [12]

La cristalografía de rayos X reveló que las estructuras de Vps26A y Vps26B comparten una estructura de sándwich β bilobal similar y poseen una homología de secuencia del 70%. [8] Sin embargo, estos dos parálogos difieren claramente en el parche de superficie dentro del dominio N-terminal , la región del ápice donde se encuentran los dominios N-terminal y C-terminal y la cola C-terminal desordenada. Vps26B contiene varios residuos putativos de fosforilación de serina dentro de esta cola desordenada, que puede representar un mecanismo potencial para modular la diferencia entre Vps26A y Vps26B. Un estudio reciente realizado por Bugarcic et al. señaló que esta cola desordenada en la región C-terminal de Vps26B es uno de los factores subyacentes que contribuyen a la falla del retrómero que contiene Vps26B para asociarse con CI- M6PR , lo que en última instancia conduce a la degradación de CI-M6PR, acompañada de una mayor secreción de catepsina D. [13]

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000122958 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000020078 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
  5. ^ Lee JJ, Radice G, Perkins CP, Costantini F (agosto de 1992). "Identificación y caracterización de un gen nuevo, conservado evolutivamente, alterado por la inserción letal del transgén embrionario H beta 58 murino". Desarrollo . 115 (1): 277–88. doi :10.1242/dev.115.1.277. PMID  1638986.
  6. ^ Mao M, Fu G, Wu JS, Zhang QH, Zhou J, Kan LX, Huang QH, He KL, Gu BW, Han ZG, Shen Y, Gu J, Yu YP, Xu SH, Wang YX, Chen SJ, Chen Z (agosto de 1998). "Identificación de genes expresados ​​en células madre/progenitoras hematopoyéticas CD34+ humanas mediante etiquetas de secuencia expresadas y clonación eficiente de ADNc de longitud completa". Proc Natl Acad Sci USA . 95 (14): 8175–80. Bibcode :1998PNAS...95.8175M. doi : 10.1073/pnas.95.14.8175 . PMC 20949 . PMID  9653160. 
  7. ^ ab "Gen Entrez: Homólogo A de la proteína vacuolar VPS26A (S. pombe)".
  8. ^ ab Collins BM, Norwood SJ, Kerr MC, Mahony D, Seaman MN, Teasdale RD, Owen DJ (marzo de 2008). "Estructura de Vps26B y mapeo de su interacción con el complejo proteico del retrómero". Traffic . 9 (3): 366–79. doi :10.1111/j.1600-0854.2007.00688.x. PMID  18088321. S2CID  37113942.
  9. ^ Shi H, Rojas R, Bonifacino JS, Hurley JH (junio de 2006). "La subunidad del retrómero Vps26 tiene un pliegue de arrestina y se une a Vps35 a través de su dominio C-terminal". Nat. Struct. Mol. Biol . 13 (6): 540–8. doi :10.1038/nsmb1103. PMC 1584284. PMID  16732284 . 
  10. ^ Gurevich VV, Gurevich EV (junio de 2006). "La base estructural de la regulación mediada por arrestina de los receptores acoplados a proteína G". Pharmacol. Ther . 110 (3): 465–502. doi :10.1016/j.pharmthera.2005.09.008. PMC 2562282. PMID  16460808 . 
  11. ^ Collins BM (noviembre de 2008). "La estructura y función del complejo proteico retromérico". Traffic . 9 (11): 1811–22. doi :10.1111/j.1600-0854.2008.00777.x. PMID  18541005. S2CID  28028098.
  12. ^ Kerr MC, Bennetts JS, Simpson F, Thomas EC, Flegg C, Gleeson PA, Wicking C, Teasdale RD (noviembre de 2005). "Un nuevo componente retromérico en mamíferos, Vps26B". Traffic . 6 (11): 991–1001. doi :10.1111/j.1600-0854.2005.00328.x. PMID  16190980. S2CID  31954489.
  13. ^ Bugarcic A, Zhe Y, Kerr MC, Griffin J, Collins BM, Teasdale RD (diciembre de 2011). "Las subunidades Vps26A y Vps26B definen complejos retroméricos distintos". Traffic . 12 (12): 1759–73. doi : 10.1111/j.1600-0854.2011.01284.x . PMID  21920005. S2CID  24548200.

Lectura adicional

  • Zhang QH, Ye M, Wu XY, et al. (2001). "Clonación y análisis funcional de ADNc con marcos de lectura abiertos para 300 genes previamente indefinidos expresados ​​en células madre/progenitoras hematopoyéticas CD34+". Genome Res . 10 (10): 1546–60. doi :10.1101/gr.140200. PMC  310934 . PMID  11042152.
  • Haft CR, de la Luz Sierra M, Bafford R, et al. (2001). "Ortólogos humanos de las proteínas de clasificación de proteínas vacuolares de levadura Vps26, 29 y 35: ensamblaje en complejos multiméricos". Mol. Biol. Cell . 11 ( 12): 4105–16. doi :10.1091/mbc.11.12.4105. PMC  15060. PMID  11102511.
  • Reddy JV, Seaman MN (2002). "Vps26p, un componente del retromero, dirige las interacciones de Vps35p en la recuperación del endosoma al aparato de Golgi". Mol. Biol. Cell . 12 (10): 3242–56. doi :10.1091/mbc.12.10.3242. PMC  60170 . PMID  11598206.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932.
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa". Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID:  14702039.
  • Deloukas P, Earthrowl ME, Grafham DV, et al. (2004). "La secuencia de ADN y análisis comparativo del cromosoma humano 10". Nature . 429 (6990): 375–81. Bibcode :2004Natur.429..375D. doi : 10.1038/nature02462 . PMID  15164054.
  • Vergés M, Luton F, Gruber C, et al. (2004). "El retrómero mamífero regula la transcitosis del receptor de inmunoglobulina polimérica". Nat. Cell Biol . 6 (8): 763–9. doi :10.1038/ncb1153. PMID  15247922. S2CID  22296469.
  • Mingot JM, Bohnsack MT, Jäkle U, Görlich D (2005). "Exportin 7 define una nueva vía general de exportación nuclear". EMBO J . 23 (16): 3227–36. doi :10.1038/sj.emboj.7600338. PMC  514512 . PMID  15282546.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa del NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)". Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928 . PMID  15489334.
  • Kerr MC, Bennetts JS, Simpson F, et al. (2006). "Un nuevo componente retromérico en mamíferos, Vps26B". Traffic . 6 (11): 991–1001. doi :10.1111/j.1600-0854.2005.00328.x. PMID  16190980. S2CID  31954489.
  • Small SA, Kent K, Pierce A, et al. (2006). "La micromatriz guiada por modelos implica al complejo retromérico en la enfermedad de Alzheimer". Ann. Neurol . 58 (6): 909–19. doi :10.1002/ana.20667. PMID  16315276. S2CID  34144181.
  • Gullapalli A, Wolfe BL, Griffin CT, et al. (2006). "Un papel esencial para SNX1 en la clasificación lisosomal del receptor 1 activado por proteasa: evidencia de funciones independientes de retrómero, Hrs y Tsg101 de las nexinas clasificadoras". Mol. Biol. Cell . 17 (3): 1228–38. doi :10.1091/mbc.E05-09-0899. PMC  1382312. PMID  16407403 .
  • Shi H, Rojas R, Bonifacino JS, Hurley JH (2006). "La subunidad del retrómero Vps26 tiene un pliegue de arrestina y se une a Vps35 a través de su dominio C-terminal". Nat. Struct. Mol. Biol . 13 (6): 540–8. doi :10.1038/nsmb1103. PMC  1584284. PMID  16732284 .
  • Riemenschneider M, Schoepfer-Wendels A, Friedrich P, et al. (2007). "No hay asociación entre los polimorfismos de la proteína vacuolar sorting 26 y la enfermedad de Alzheimer". Neurobiol. Aging . 28 (6): 883–4. doi :10.1016/j.neurobiolaging.2006.05.009. PMID  16784798. S2CID  20057417.
  • Rojas R, Kametaka S, Haft CR, Bonifacino JS (2007). "Funciones intercambiables pero esenciales de SNX1 y SNX2 en la asociación del retrómero con endosomas y el tráfico de receptores de manosa 6-fosfato". Mol. Cell. Biol . 27 (3): 1112–24. doi :10.1128/MCB.00156-06. PMC  1800681. PMID  17101778 .
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