Virus del enanismo amarillo de la cebada 5'UTR
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| Virus del enanismo amarillo de la cebada 5' UTR | |
|---|---|
 Estructura secundaria conservada de BYDV 5' UTR. | |
| Identificadores | |
| Símbolo | BYDV 5'UTR |
| RFAM | RF01508 |
| Otros datos | |
| Tipo de ARN | elemento cis-regulador |
| Dominio(s) | Cebada amarilla enana |
| Estructuras del PDB | PDBe |
El UTR 5' del virus del enanismo amarillo de la cebada es un elemento de ARN no codificante que contiene elementos estructurales necesarios para la traducción del genoma del virus del enanismo amarillo de la cebada, patógeno de la enfermedad de las plantas .
A diferencia del ARNm eucariota , este virus carece de una tapa 5' y una cola poli(A) , pero aún así circulariza su ARNm a través del apareamiento de bases entre dos bucles de tallo , uno ubicado en la región no traducida (UTR) 5' y el otro dentro de la UTR 3' . La estructura dentro de la UTR 3' se ha caracterizado previamente como el elemento de traducción independiente de la tapa 3' (elemento TE 3') y se ha predicho que la UTR 5' del virus del enanismo amarillo de la cebada contiene 4 estructuras de bucle de tallo. [1] La mutagénesis mostró que el bucle de tallo 4 es esencial para el apareamiento de bases con 3'TE y solo se necesitan 5 bases para el apareamiento de bases para que ocurra la circularización del ARNm . [2]
Referencias
- ^ Wang S, Browning KS, Miller WA (julio de 1997). "Una secuencia viral en la región 3' no traducida imita una tapa 5' para facilitar la traducción de ARNm sin tapa". The EMBO Journal (texto completo gratuito). 16 (13): 4107–4116. doi :10.1093/emboj/16.13.4107. PMC 1170033 . PMID 9233819.
- ^ Guo L, Allen EM, Miller WA (mayo de 2001). "El apareamiento de bases entre regiones no traducidas facilita la traducción de ARN viral no poliadenilado y sin capuchón". Molecular Cell . 7 (5): 1103–1109. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00252-0 . PMID 11389856.
Lectura adicional
Malys N, McCarthy JE (marzo de 2011). "Inicio de la traducción: se pueden anticipar variaciones en el mecanismo". Ciencias de la vida celular y molecular . 68 (6): 991–1003. doi :10.1007/s00018-010-0588-z. PMC 11115079 . PMID 21076851. S2CID 31720000.
Enlaces externos
- Página del virus del enanismo amarillo de la cebada 5'UTR en Rfam
