VCPIP1

VCPIP1
Identificadores
Alias	VCPIP1 , DUBA3, VCIP135, proteína 1 que interactúa con el complejo de proteína que contiene valosina (p97)/p47, proteína 1 que interactúa con la proteína que contiene valosina
Identificaciones externas	OMIM : 611745; MGI : 1917925; HomoloGene : 11814; Tarjetas genéticas : VCPIP1; OMA : VCPIP1 - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 8 (humano)
Fin	66.667.231 pb
Ubicación del gen ( ratón )
Cristo.	Cromosoma 1 (ratón)
Fin	9.818.607 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	tendón del bíceps braquial; ; célula endotelial; ; tendón de Aquiles; ; ovocito secundario; ; testículo; ; monocito; ; giro temporal medio; ; globo pálido interno; ; Área de Brodmann 23; ; célula estromal del endometrio;
	Top expresado en
	sustancia negra; ; ovocito primario; ; ganglio cervical superior; ; núcleo septal lateral; ; mano; ; órgano otolítico; ; núcleo geniculado lateral; ; utrículo; ; célula cúmulo; ; ganglio trigémino;
	Más datos de expresión de referencia
	Más datos de expresión de referencia
Ontología genética
Función molecular	desubiquitinasa dependiente de tiol; actividad de peptidasa; actividad de la peptidasa de tipo cisteína; actividad hidrolasa;
Componente celular	citoplasma; Pila de Golgi; Aparato de Golgi; retículo endoplasmático; luz del retículo endoplasmático;
Proceso biológico	fusión de membranas del retículo endoplasmático; Desubiquitinación ligada a la proteína K48; Organización del Golgi; ubiquitinación de proteínas; Desubiquitinación ligada a la proteína K11; proteólisis; Reensamblaje del aparato de Golgi; ciclo celular mitótico;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	80124
	70675
	ENSG00000175073
	ENSMUSG00000045210
	Q96JH7
	Q8CDG3
	Número nuevo_025054
	Número nuevo_173443
	NP_079330
	NP_775619
	Wikidatos
Ver/Editar humano	Ver/Editar ratón

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La proteína desubiquitinante VCIP135 es una proteína que en los humanos está codificada por el gen VCPIP1 . ^[5]^[6]^[7]

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000175073 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000045210 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ Nagase T, Nakayama M, Nakajima D, Kikuno R, Ohara O (abril de 2001). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XX. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro". DNA Research . 8 (2): 85–95. doi : 10.1093/dnares/8.2.85 . PMID 11347906.
^ Ficarro S, Chertihin O, Westbrook VA, White F, Jayes F, Kalab P, Marto JA, Shabanowitz J, Herr JC, Hunt DF, Visconti PE (marzo de 2003). "Análisis del fosfoproteoma de espermatozoides humanos capacitados. Evidencia de fosforilación de tirosina de una proteína de anclaje de quinasa 3 y proteína/p97 que contiene valosina durante la capacitación". The Journal of Biological Chemistry . 278 (13): 11579–89. doi : 10.1074/jbc.M202325200 . PMID 12509440.
^ "Entrez Gene: proteína que contiene valosina VCPIP1 (p97)/complejo p47 que interactúa con la proteína 1".

Lectura adicional

Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (septiembre de 1996). "Normalización y sustracción: dos enfoques para facilitar el descubrimiento de genes". Genome Research . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (octubre de 1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5'". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (noviembre de 2000). "Clonación de ADN mediante recombinación específica de sitio in vitro". Genome Research . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948 . PMID 11076863.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (septiembre de 2000). "Localización subcelular sistemática de nuevas proteínas identificadas mediante secuenciación de ADNc a gran escala". EMBO Reports . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732 . PMID 11256614.
Uchiyama K, Jokitalo E, Kano F, Murata M, Zhang X, Canas B, Newman R, Rabouille C, Pappin D, Freemont P, Kondo H (diciembre de 2002). "VCIP135, un nuevo factor esencial para la fusión de membranas mediada por p97/p47, es necesario para el ensamblaje del aparato de Golgi y el RE in vivo". The Journal of Cell Biology . 159 (5): 855–66. doi :10.1083/jcb.200208112. PMC 2173386 . PMID 12473691.
Wang Y, Satoh A, Warren G, Meyer HH, Wang Y (marzo de 2004). "VCIP135 actúa como una enzima desubiquitinante durante el reensamblaje mediado por p97-p47 de fragmentos mitóticos del aparato de Golgi". The Journal of Cell Biology . 164 (7): 973–8. doi :10.1083/jcb.200401010. PMC 2172062 . PMID 15037600.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (agosto de 2004). "Caracterización a gran escala de las fosfoproteínas nucleares de células HeLa". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (33): 12130–5. Bibcode :2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (octubre de 2004). "De ORFeome a la biología: un canal de genómica funcional". Investigación del genoma . 14 (10B): 2136–44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930 . PMID 15489336.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (enero de 2006). "La base de datos LIFEdb en 2006". Investigación de ácidos nucleicos . 34 (Problema de base de datos): D415-8. doi : 10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501 . PMID 16381901.

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000175073 – Ensembl , mayo de 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000045210 – Ensembl , mayo de 2017

[3] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[4] "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[pmid11347906-5] Nagase T, Nakayama M, Nakajima D, Kikuno R, Ohara O (abril de 2001). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XX. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro". DNA Research . 8 (2): 85–95. doi : 10.1093/dnares/8.2.85 . PMID 11347906.

[pmid12509440-6] Ficarro S, Chertihin O, Westbrook VA, White F, Jayes F, Kalab P, Marto JA, Shabanowitz J, Herr JC, Hunt DF, Visconti PE (marzo de 2003). "Análisis del fosfoproteoma de espermatozoides humanos capacitados. Evidencia de fosforilación de tirosina de una proteína de anclaje de quinasa 3 y proteína/p97 que contiene valosina durante la capacitación". The Journal of Biological Chemistry . 278 (13): 11579–89. doi : 10.1074/jbc.M202325200 . PMID 12509440.

[entrez-7] "Entrez Gene: proteína que contiene valosina VCPIP1 (p97)/complejo p47 que interactúa con la proteína 1".