Variante delta del SARS-CoV-2

Variante del SARS-CoV-2 detectada a finales de 2020

SARS-CoV-2Variante
Modelo atómico científicamente preciso de la estructura externa del SARS-CoV-2. Cada "bola" es un átomo.
Modelo atómico científicamente preciso de la estructura externa del SARS-CoV-2. Cada "bola" es un átomo.
Detalles generales
Síntomas
Variantes principales

La variante Delta (B.1.617.2) fue [3] [4] una variante del SARS-CoV-2 , el virus que causa la COVID-19 . Se detectó por primera vez en la India el 5 de octubre de 2020. La variante Delta recibió su nombre el 31 de mayo de 2021 y se había extendido a más de 179 países hasta el 22 de noviembre de 2021. La Organización Mundial de la Salud (OMS) indicó en junio de 2021 que la variante Delta se estaba convirtiendo en la cepa dominante a nivel mundial. [5]

Tiene mutaciones en el gen que codifica la proteína de pico del SARS-CoV-2 [6] que causan las sustituciones T478K, P681R y L452R , [7] [8] que se sabe que afectan la transmisibilidad del virus, así como si puede ser neutralizado por anticuerpos para variantes previamente circulantes del virus COVID-19. [9] En agosto de 2021, Public Health England (PHE) informó que la tasa de ataque secundario en contactos domésticos de casos no viajeros o desconocidos para Delta era del 10,8% frente al 10,2% para la variante Alpha ; [10] la tasa de letalidad para esas 386.835 personas con Delta es del 0,3%, donde el 46% de los casos y el 6% de las muertes son personas no vacunadas y menores de 50 años. [11] La inmunidad derivada de una recuperación previa [12] [13] o las vacunas contra la COVID-19 son eficaces para prevenir la enfermedad grave o la hospitalización por infección con la variante. [14]

El 7 de mayo de 2021, PHE cambió su clasificación del linaje B.1.617.2 de una variante bajo investigación (VUI) a una variante preocupante (VOC) basándose en una evaluación de la transmisibilidad que es al menos equivalente a B.1.1.7 ( variante Alpha ); [15] el SAGE del Reino Unido, utilizando datos de mayo, estimó una posibilidad "realista" de ser un 50% más transmisible. [16] El 11 de mayo de 2021, la OMS también clasificó este linaje como VOC y dijo que mostraba evidencia de mayor transmisibilidad y neutralización reducida. El 15 de junio de 2021, los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) declararon a Delta como una variante preocupante. [17]

Se cree que la variante es en parte responsable de la segunda ola mortal de la pandemia en la India que comenzó en febrero de 2021. [18] [19] [20] Posteriormente contribuyó a una tercera ola en Fiji , el Reino Unido [21] [22] [23] y Sudáfrica , [24] y la OMS advirtió en julio de 2021 que podría tener un efecto similar en otras partes de Europa y África . [25] [24] A fines de julio, también había impulsado un aumento en las infecciones diarias en partes de Asia , [26] Estados Unidos , [27] Australia y Nueva Zelanda . [28]

Clasificación

La variante Delta tiene mutaciones en el gen que codifica la proteína de pico del SARS-CoV-2 [6] que causan las sustituciones D614G , T478K, P681R y L452R . [29] [8] Se identifica como los clados 21A, 21I y 21J bajo el sistema de clasificación filogenética Nextstrain . [30]

Nombres

El virus también ha sido denominado con el término "variante india" [31] , ya que se detectó originalmente en la India. Sin embargo, la variante Delta es solo una de las tres variantes del linaje B.1.617 , todas las cuales se detectaron por primera vez en la India. [32] A fines de mayo de 2021, la OMS asignó la etiqueta Delta al linaje B.1.617.2 después de introducir una nueva política de uso de letras griegas para las variantes preocupantes y las variantes de interés. [33]

Otros sublinajes de B.1.617

Hay tres sublinajes del linaje B.1.617 categorizados hasta el momento.

B.1.617.1 ( variante kappa ) fue designada como variante bajo investigación en abril de 2021 por Public Health England . Más tarde, en abril de 2021, otras dos variantes, B.1.617.2 y B.1.617.3, fueron designadas como variantes bajo investigación. Si bien B.1.617.3 comparte las mutaciones L452R y E484Q encontradas en B.1.617.1, B.1.617.2 carece de la mutación E484Q. B.1.617.2 tiene la mutación T478K, que no se encuentra en B.1.617.1 y B.1.617.3. [34] [35] Simultáneamente, el ECDC publicó un informe en el que mantiene los tres sublinajes de B.1.617 como VOI, estimando que "es necesaria una mayor comprensión de los riesgos relacionados con estos linajes de B.1.617 antes de que se pueda considerar cualquier modificación de las medidas actuales". [36]

Mutaciones

Definición de mutaciones en la
variante Delta del SARS-CoV-2
GeneNucleótidoAminoácido
ORF1bP314L
P1000L
EspigaG142D
T19R
R158G
L452R
T478K
D614G
P681R
D950N
E156del
F157del
METROI82T
norteD63G
R203M
D377Y
ORF3aS26L
ORF7aV82A
T120I
Fuentes: CDC [38] Covariants.org [39]

El genoma de Delta/B.1.617.2 tiene 13 mutaciones (15 o 17 según algunas fuentes, [¿ cuáles? ] dependiendo de si se incluyen mutaciones más comunes) que producen alteraciones en las secuencias de aminoácidos de las proteínas que codifica. [40]

La lista de mutaciones de la proteína de pico es: 19R, (G142D), Δ156-157, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N según GVN, [41] o T19R, G142D, del 156–157, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R según Genscript [42]. Cuatro de ellas, todas las cuales están en el código de la proteína de pico del virus , son de particular preocupación:

  • D614G. La sustitución en la posición 614, una sustitución de ácido aspártico a glicina , se comparte con otras variantes altamente transmisibles como Alpha , Beta y Gamma . [9]
  • T478K. [9] [29] El intercambio en la posición 478 es una sustitución de treonina a lisina . [43]
  • L452R. La sustitución en la posición 452, una sustitución de leucina por arginina , confiere una mayor afinidad de la proteína de la espícula por el receptor ACE2 [44] y una menor capacidad de reconocimiento del sistema inmunológico. [8] [45]
  • P681R. La sustitución en la posición 681, una sustitución de prolina por arginina , que, según William A. Haseltine , puede aumentar la infectividad a nivel celular de la variante "al facilitar la escisión de la proteína precursora S a la configuración activa S1/S2". [46]

La mutación E484Q no está presente en el genoma B.1.617.2. [46] [47]

Linajes

A partir de agosto de 2021, las variantes Delta se han subdividido en el sistema de designación de linaje Pango en variantes de AY.1 a AY.28. Sin embargo, no hay información sobre si dicha clasificación se correlaciona con cambios característicos biológicos del virus. [48] Se dice que, a partir de agosto de 2021, AY.4 a AY.11 son predominantes en el Reino Unido, AY.12 en Israel, AY.2, AY.3, AY.13, AY.14, AY.25 en los EE. UU., AY.20 en los EE. UU. y México, AY.15 en Canadá, AY.16 en Kenia, AY.17 en Irlanda e Irlanda del Norte, AY.19 en Sudáfrica, AY.21 en Italia y Suiza, AY.22 en Portugal, AY.24 en Indonesia y AY.23 en Indonesia, Singapur, Japón y Corea del Sur. [49]

Variante "Delta plus"

Delta con K417N correspondió originalmente a los linajes AY.1 y AY.2, [50] posteriormente también al linaje AY.3, [51] y ha sido apodado "Delta plus" o "variante de Nepal". [52] Tiene la mutación K417N, [53] que también está presente en la variante Beta . [54] El intercambio en la posición 417 es una sustitución de lisina a asparagina . [55]

A mediados de octubre de 2021, la variante AY.3 representaba una prevalencia acumulada de aproximadamente el 5 % en los Estados Unidos y el 2 % en todo el mundo. [56] A mediados de octubre, el sublinaje AY.4.2 Delta se estaba expandiendo en Inglaterra y se estaba monitoreando y evaluando. Contiene las mutaciones A222V e Y145H en su proteína de pico, [57] no consideradas de particular preocupación. Se ha sugerido que AY.4.2 podría ser entre un 10 y un 15 % más transmisible que la variante Delta original. A mediados de octubre de 2021, AY.4.2 representaba aproximadamente el 10 % de los casos y ha dado lugar a una tasa de crecimiento adicional que aumenta a aproximadamente el 1 % (10 % del 10 %) por tiempo generacional de cinco días aproximadamente. Esta tasa de crecimiento adicional aumentaría con el aumento de la prevalencia. Sin AY.4.2 y sin otros cambios, el número de casos en el Reino Unido habría sido aproximadamente un 10 % menor. [58] La AY.4.2 crece aproximadamente un 15 % más rápido por semana. [59] En el Reino Unido se reclasificó como una "variante en investigación" (pero no "preocupante") a fines de octubre de 2021. [60] En Dinamarca, después de una caída en los casos de AY.4.2, se detectó y monitoreó un nuevo aumento rápido, pero aún no se consideró motivo de preocupación. [61] [62]

Síntomas

Es posible que los síntomas más comunes hayan cambiado con respecto a los síntomas más comunes que se asociaban anteriormente con el COVID-19 estándar. Las personas infectadas pueden confundir los síntomas con un resfriado fuerte y no darse cuenta de que necesitan aislarse. Los síntomas comunes informados han sido dolores de cabeza, dolor de garganta, secreción nasal o fiebre. [1] [ cita médica necesaria ] [2]

Prevención

Resumen de la protección de la vacuna contra la variante Delta
( actualización de la OMS , 24 de agosto de 2021 [63] )
Enfermedad o infecciónGrave : se mantiene la protección.
Sintomático : posiblemente se reduzca la protección.
Enfermedad graveEstable: AstraZeneca-Vaxzevria (1), Moderna (1), Pfizer-BioNTech (2)
Enfermedad sintomáticaEstablea Disminución neutra: Pfizer-BioNTech(3)
Disminución neutra: Covaxin (1) : AstraZeneca-Vaxzevria(2)
Disminución neutraDisminución neutra
InfecciónDisminución neutra: AstraZeneca-Vaxzevria(1), Pfizer-BioNTech(1)
Los símbolos indican la magnitud de la reducción de la efectividad de la vacuna (EV). Tenga en cuenta que la reducción de la EV no significa pérdida de protección, porque la alta tasa de protección original (como el 95 %) con cierta reducción (como el 10 %) aún conservaría la protección (como el 85 %). Entre paréntesis se incluye el número de estudios que respaldan la indicación. Los estudios varían en cuanto a población, definiciones de resultados, diseño del estudio, etc., lo que puede explicar las diferencias en las estimaciones de EV para un producto en diferentes estudios. Además, las reducciones representan estimaciones de EV y no representan incertidumbres en torno a las estimaciones que pueden variar sustancialmente entre estudios. Las reducciones de EV deben interpretarse con estas limitaciones.

Estable: VE se reduce <10%, o VE >90% sin comparador
Disminución neutra: VE se reduce entre 10 y <20%

Disminución neutraDisminución neutra:VE se reduce entre un 20 y <30%
Efectos sobre la neutralización (completamente vacunados) [64]
Establea Disminución neutra: Anhui-ZIFIVAX (2), Covaxin (3)
Disminución neutra: Janssen (3), Moderna (3), Covishield (2)
Disminución neutraa : AstraZeneca-Vaxzevria (4), Pfizer-BioNTech (8) :Moderna y Pfizer-BioNTech(1) * a : Coronavac (2)Disminución neutraDisminución neutra
Disminución neutraDisminución neutra
Disminución neutraDisminución neutraDisminución neutraDisminución neutra
Los símbolos indican la magnitud de la reducción de la neutralización con la vacunación completa. Entre paréntesis se encuentra el número de estudios que respaldan la indicación.

Estable: La neutralización reduce <2 veces
Disminución neutra: La neutralización reduce de 2 a <5 veces : La neutralización reduce de 5 a <10 veces : La neutralización reduce ≥ 10 veces * Moderna y Pfizer-BioNTech se evaluaron juntos.
Disminución neutraDisminución neutra
Disminución neutraDisminución neutraDisminución neutra

La OMS no ha emitido medidas preventivas contra la variante Delta en particular; las medidas no farmacéuticas recomendadas para prevenir la COVID-19 de tipo salvaje deberían seguir siendo eficaces. Estas medidas incluirían lavarse las manos, usar mascarilla, mantener la distancia con los demás, evitar tocarse la boca, la nariz o los ojos, evitar espacios cerrados abarrotados con poca ventilación, especialmente donde la gente está hablando, hacerse la prueba si se desarrollan síntomas y aislarse si se enferma. [65] Las autoridades de salud pública deberían seguir encontrando a las personas infectadas mediante pruebas, rastrear sus contactos y aislar a quienes hayan dado positivo o hayan estado expuestos. [66] Los organizadores de eventos deberían evaluar los riesgos potenciales de cualquier reunión masiva y desarrollar un plan para mitigar estos riesgos. [67] Véase también Intervención no farmacéutica (epidemiología) .

El Consejo Indio de Investigación Médica (ICMR) descubrió que los sueros convalecientes de los casos de COVID-19 y los receptores de BBV152 (Covaxin) de Bharat Biotech pudieron neutralizar VUI B.1.617, aunque con una eficacia menor. [68]

Anurag Agrawal , director del Instituto de Genómica y Biología Integrativa (IGIB), dijo que el estudio sobre la eficacia de las vacunas disponibles en el linaje B.1.617 sugiere que después de la vacunación, las infecciones son más leves. [69]

Anthony Fauci , el asesor médico jefe del presidente de Estados Unidos , también ha expresado su confianza en los resultados preliminares. En una entrevista del 28 de abril, dijo:

Se trata de un tema sobre el que seguimos obteniendo datos a diario, pero los datos más recientes se obtuvieron de sueros convalecientes de casos de COVID-19 y de personas que recibieron la vacuna utilizada en la India, la Covaxin, que neutraliza las 617 variantes. [70]

Otro estudio del Centro de Biología Celular y Molecular (CCMB) en Hyderabad encontró que los sueros vacunados con Covishield (Oxford–AstraZeneca) ofrecen protección contra el linaje B.1.617. [71]

Un estudio realizado por Public Health England (PHE) encontró que, en comparación con los no vacunados, los vacunados con Pfizer-BioNTech o AstraZeneca-Oxford tuvieron un 33% menos de casos de enfermedad sintomática causada por la variante después de la primera dosis. Entre los que estaban dos semanas después de recibir su segunda dosis de la vacuna Pfizer-BioNTech, el 88% menos de sujetos tuvieron enfermedad sintomática por la variante Delta en comparación con los que no estaban vacunados. Entre los que estaban dos semanas después de recibir su segunda dosis de la vacuna AstraZeneca-Oxford, el 60% menos de sujetos tuvieron enfermedad sintomática por la variante Delta en comparación con los que no estaban vacunados. [72] [73]

Un estudio realizado por un grupo de investigadores del Instituto Francis Crick , publicado en The Lancet , muestra que los humanos completamente vacunados con la vacuna Pfizer-BioNTech probablemente tengan niveles más de cinco veces más bajos de anticuerpos neutralizantes contra la variante Delta en comparación con la cepa original de COVID-19. [74] [75]

En junio de 2021, PHE anunció que había realizado un estudio que concluyó que, después de dos dosis, la vacuna Pfizer-BioNTech y la vacuna AstraZeneca tienen una eficacia del 96 % y el 92 % respectivamente para prevenir la hospitalización por la variante Delta. [76] [77]

El 3 de julio, investigadores de las universidades de Toronto y Ottawa en Ontario, Canadá, publicaron un estudio preimpreso que sugiere que la vacuna Moderna puede ser efectiva contra la muerte o la hospitalización por la variante Delta. [78] [ ¿ Fuente médica poco confiable? ]

En un estudio de la Universidad de Sri Jayewardenepura en julio de 2021 se descubrió que la vacuna BIBP de Sinopharm provocó seroconversión en el 95 % de las personas estudiadas que habían recibido ambas dosis de la vacuna. La tasa fue mayor en el grupo de edad de 20 a 39 años (98,9 %), pero ligeramente menor en el grupo de mayores de 60 años (93,3 %). Se detectaron anticuerpos neutralizantes en el 81,25 % de las personas vacunadas estudiadas. [79] [80]

El 29 de junio de 2021, el director del Instituto Gamaleya, Denis Logunov, dijo que la Sputnik V tiene una eficacia de aproximadamente el 90% contra la variante Delta. [81]

El 21 de julio, investigadores de PHE publicaron un estudio que concluyó que la vacuna Pfizer tenía una eficacia del 93,7% contra la enfermedad sintomática causada por Delta después de dos dosis, mientras que la vacuna Astrazeneca tenía una eficacia del 67%. [82]

El 2 de agosto, varios expertos expresaron su preocupación por la posibilidad de que no sea posible alcanzar la inmunidad colectiva en la actualidad porque la variante Delta se transmite entre las personas inmunizadas con las vacunas actuales. [83]

El 10 de agosto, un estudio mostró que la tasa de cobertura de vacunación completa está inversamente correlacionada con la frecuencia de mutación de la variante delta del SARS-CoV-2 en 16 países (R cuadrado = 0,878). Los datos indican firmemente que la vacunación completa contra la COVID-19 puede ralentizar la evolución del virus. [84]

Tratamiento

Los experimentos in vitro sugieren que el bamlanivimab puede no ser eficaz contra la variante Delta por sí solo. [85] En concentraciones suficientemente altas, casirivimab , etesevimab e imdevimab parecen seguir siendo eficaces. Un estudio previo a la publicación sugiere que el sotrovimab también puede ser eficaz contra la variante Delta. [86] Los médicos de Singapur han estado utilizando oxígeno suplementario, remdesivir y corticosteroides en más pacientes con variante Delta que en variantes anteriores. [87]

Epidemiología

Resumen de los impactos de Delta *
( actualización de la OMS , 24 de agosto de 2021 [63] )
TransmisibilidadAumento de la transmisibilidad y tasa de ataque secundario, transmisibilidad similar entre individuos vacunados y no vacunados.
VirulenciaMayor riesgo de hospitalización
ReinfecciónDisminución de la actividad neutralizante
DiagnósticoAún no se han reportado impactos
* Hallazgo generalizado en comparación con otras cepas, basado en evidencia que incluye publicaciones no revisadas por pares.

Transmisibilidad

Los científicos del Reino Unido han dicho que la variante Delta es entre un 40% y un 60% más transmisible que la variante Alpha , previamente dominante , que se identificó por primera vez en el Reino Unido (como la variante Kent). [88] Dado que Alpha ya es un 150% tan transmisible como la cepa original del SARS-CoV-2 que surgió a fines de 2019 en Wuhan , [88] y si Delta es un 150% tan transmisible como Alpha, entonces Delta puede ser un 225% tan transmisible como la cepa original. [89] La BBC informó que  el número básico de reproducción , o el número esperado de casos generados directamente por un caso en una población donde todos los individuos son susceptibles a la infección, para el primer virus SARS-CoV-2 detectado es de 2,4 a 2,6, mientras que el número de reproducción de Alpha es de 4 a 5 y el de Delta es de 5 a 9. [90] [91] Estas cifras básicas de reproducción pueden compararse con las del MERS (0,29-0,80 [92] ), la gripe estacional (1,2-1,4 [93] ), el ébola (1,4-1,8 [94] ), el resfriado común (2-3 [95] ), el SARS (2-4 [96] ), la viruela (3,5-6 [97] ) y la varicela (10-12 [98] ). Debido a la alta transmisibilidad de la variante Delta, incluso las personas vacunadas son vulnerables, [99] aunque en menor medida. [73] R 0 {\displaystyle R_{0}}

Un estudio [100] publicado en línea (no revisado por pares) por el Centro Provincial de Control y Prevención de Enfermedades de Guangdong puede explicar en parte la mayor transmisibilidad: las personas con infección causada por Delta tenían 1.000 veces más copias del virus en las vías respiratorias que aquellas con infección causada por variantes identificadas por primera vez al comienzo de la pandemia; y las personas infectadas con Delta tardaron en promedio 4 días en detectar el virus, en comparación con los 6 días con las variantes identificadas inicialmente. [101] [102]

Los datos de vigilancia de los EE. UU., Alemania y los Países Bajos indican que la variante Delta está creciendo aproximadamente a un ritmo de un factor de 4 cada dos semanas con respecto a la variante Alfa. [103] [104] [105]

En la India, el Reino Unido, [106] Portugal, [107] Rusia, [108] México, Australia, Indonesia, [109] Sudáfrica, Alemania, [110] Luxemburgo, [111] los Estados Unidos, [112] los Países Bajos, [113] Dinamarca, [114] Francia [115] y probablemente muchos otros países, la variante Delta se había convertido en la cepa dominante en julio de 2021. Según el país, suele haber un retraso de unos pocos días a varias semanas entre los casos y la notificación de la variante. Al 20 de julio, esta variante se había extendido a 124 países [64] y la OMS había indicado que se estaba convirtiendo en la cepa dominante, si no en una ya. [116]

En los Países Bajos, el virus todavía pudo propagarse significativamente en la población, y más del 93,4 % de los donantes de sangre dieron positivo en la prueba de anticuerpos contra el SARS-CoV-2 después de la semana 28 de 2021. Muchas personas allí no están completamente vacunadas, por lo que esos anticuerpos se habrían desarrollado a partir de la exposición al virus salvaje o de una vacuna. [117] [118] En el Reino Unido se dan niveles elevados similares de seroinmunidad en los donantes de sangre y en la vigilancia general. [119] [120] [121]

Un estudio preliminar reveló que la carga viral en la primera prueba positiva de infecciones con la variante era en promedio ~1000 veces mayor que en las infecciones comparadas durante 2020. [122] [123] Los datos preliminares de un estudio con 100.000 voluntarios en el Reino Unido de mayo a julio de 2021, cuando Delta se estaba propagando rápidamente, indican que las personas vacunadas que dan positivo en la prueba de COVID-19, incluidos los casos asintomáticos, tienen una carga viral más baja en promedio. Los datos de los EE. UU., el Reino Unido y Singapur indican que las personas vacunadas infectadas por Delta pueden tener cargas virales tan altas como las personas infectadas no vacunadas, pero podrían seguir siendo infecciosas durante un período más corto. [124]

Grupos de edad de infección

Los datos de vigilancia del Programa Integrado de Vigilancia de Enfermedades (IDSP) del gobierno indio muestran que alrededor del 32% de los pacientes, tanto hospitalizados como fuera de los hospitales, tenían menos de 30 años en la segunda ola, en comparación con el 31% durante la primera ola; entre las personas de 30 a 40 años, la tasa de infección se mantuvo en el 21%. La hospitalización en el grupo de 20 a 39 años aumentó del 23,7% al 25,5%, mientras que el grupo de 0 a 19 años aumentó del 4,2% al 5,8%. Los datos también mostraron que durante la segunda ola se admitió una mayor proporción de pacientes asintomáticos, con más quejas de disnea. [125]

Virulencia

Algunos estudios preliminares sugieren que la variante Delta causa una enfermedad más grave que otras cepas. [126] El 7 de junio de 2021, investigadores del Centro Nacional de Enfermedades Infecciosas de Singapur publicaron un artículo que sugería que los pacientes que dan positivo en la prueba de Delta tienen más probabilidades de desarrollar neumonía y/o requerir oxígeno que los pacientes con el tipo salvaje o Alpha. [127] El 11 de junio, Public Health England publicó un informe que concluyó que había un "riesgo significativamente mayor de hospitalización" por Delta en comparación con Alpha; [128] el riesgo era aproximadamente el doble para los infectados con la variante Delta. [129] El 14 de junio, investigadores de Public Health Scotland descubrieron que el riesgo de hospitalización por Delta era aproximadamente el doble que el de Alpha. [130] El 7 de julio, un estudio preimpreso de epidemiólogos de la Universidad de Toronto encontró que Delta tenía un riesgo 120% mayor -o más del doble- de hospitalización, un riesgo 287% mayor de ingreso en UCI y un riesgo 137% mayor de muerte en comparación con cepas no variantes de preocupación del SARS-COV-2. [131] Sin embargo, el 9 de julio, Public Health England informó que la variante Delta en Inglaterra tenía una tasa de letalidad (CFR) del 0,2%, mientras que la tasa de letalidad de la variante Alpha era del 1,9%, aunque el informe advierte que "las tasas de letalidad no son comparables entre variantes, ya que han alcanzado su punto máximo en diferentes puntos de la pandemia y, por lo tanto, varían en la presión hospitalaria de fondo, la disponibilidad y las tasas de vacunación y los perfiles de casos, las opciones de tratamiento y el impacto del retraso en la notificación, entre otros factores". [132] James McCreadie, portavoz de Public Health England, aclaró que "es demasiado pronto para evaluar la tasa de letalidad en comparación con otras variantes". [133]

Un estudio canadiense publicado el 5 de octubre de 2021 reveló que la variante Delta provocó un aumento del 108 por ciento en las hospitalizaciones, del 235 por ciento en los ingresos a la UCI y del 133 por ciento en las muertes en comparación con otras variantes. es más grave y resultó en un mayor riesgo de muerte en comparación con las variantes anteriores, probabilidades que disminuyen significativamente con la inmunización. [134] [135]

Estadística

La probabilidad de detectar un caso de Delta varía significativamente, especialmente dependiendo de la tasa de secuenciación de un país (menos del 0,05 % de todos los casos de COVID-19 han sido secuenciados en los países con la secuenciación más baja, y alrededor del 50 % en los países con la más alta). [136] [137]

Hasta el 22 de junio de 2021, [ necesita actualización ] se habían detectado más de 4.500 secuencias de la variante en unos 78 países. [138] [139] [140] Los números notificados de secuencias en países con detecciones son:

Casos por país
País/ÁreaCasos confirmados ( PANGOLIN ) [141]
al 19 de diciembre
Casos confirmados ( GISAID ) [138]
al 23 de noviembre
Casos (otras fuentes)
al 19 de enero de 2022
Primera detecciónÚltima detección
 Reino Unido985.491826.4651.625.557 [142]22 de febrero de 2021
 Estados Unidos1.099.811947.47299,4% de los casos [143]23 de febrero de 2021
 Canadá78.41262.008196.866 [144]15 de marzo de 2021
 Alemania150.416117.5131 de marzo de 2021
 Dinamarca138.33689.7068 de marzo de 2021
 Japón86.38370,97386.037 [145] [146]28 de marzo de 2021
 Francia75,22470.82221 de febrero de 2021
 Pavo54.13450,5785 [147]28 de abril de 2021
 Fiyi49550747.639 [148] [149] [150]19 de abril de 2021
 India45.63845.0555 de octubre de 2020
  Suiza48.30438.00329 de marzo de 2021
 Suecia46.01837.77326 de marzo de 2021
 Bélgica37.33431.61125 de marzo de 2021
 Italia33.64229,2822 de abril de 2021
 España30.61828.25722 de abril de 2021
 Países Bajos33.12827.8706 de abril de 2021
 Australia23.69622.71525.750 [151]16 de marzo de 2021
 Irlanda22,42521.06126 de febrero de 2021
 Brasil27.73317.9871051 [152] [153]20 de mayo de 2021 [154] [155] [156] [157] [158]
 México20.23017.7105 de abril de 2021
 Eslovenia16.33413.43920 de abril de 2021
 Israel15.78712.25941 [159] [160] [161]16 de abril de 2021
 Noruega15.71612.1301 [162]15 de abril de 2021
 Portugal12,98411,9835 de abril de 2021
 Sudáfrica2,58210,6194 [163]30 de abril de 2021
 Polonia16.48410,32016 [164]26 de abril de 2021
 Lituania8999.0701 [165]17 de junio de 2021
 Finlandia1.5708.7332.876 [166] [167] [168] [169]18 de marzo de 2021
 República Checa11,2258,48724 de abril de 2021
 Singapur2.7277,51026 de febrero de 2021
 Eslovaquia3537,14615 de junio de 2021
 Filipinas8703.2208.612 [170] [171]11 de mayo de 2021
 Corea del Sur7066,49726 de marzo de 2021
 Croacia4796.16511 de junio de 2021
 Chile645.85813 de junio de 2021
 Luxemburgo1,1535,51515 de abril de 2021
 Indonesia1.6234.9803 de abril de 2021
 Rumania2944.65526 de abril de 2021
 Bulgaria2314.6145 de abril de 2021
 Rusia1.4684.29516 [172]21 de abril de 2021
 Tailandia2364.2932 [173]24 de abril de 2021
 Islandia-3.76730 de agosto de 2021
 Malasia1463.62410 de abril de 2021
 Austria1,5783.62217 de abril de 2021
 Nueva Zelanda922.844107 [174] [175]9 de marzo de 2021
 Estonia-2.74021 de julio de 2021
 Grecia172.64223 de marzo de 2021
 Perú62.58010 de junio de 2021
 Bahréin1172.0135 de abril de 2021
 Nigeria361.7951 [176]7 de agosto de 2021
 Kenia2561.7005 [176] [177]17 de julio de 2021
 Aruba901,59216 de abril de 2021
 Vietnam541.41412 [178] [179]18 de abril de 2021
 Puerto Rico1.3551.3609 de septiembre de 2021
 Katar1211.34319 de abril de 2021
 Bangladés2831.2739 [180] [181]28 de abril de 2021
 San Martín1.2251.23119 de marzo de 2021
 Ecuador9551.02320 de julio de 2021
 Sri Lanka1179841 [182]30 de abril de 2021
 Colombia-9743 de julio de 2021
 Botsuana1969122 [183]28 de abril de 2021
 Gibraltar8358485 de septiembre de 2021
 Kosovo8298342 de mayo de 2021
 Reunión547544 de mayo de 2021
 Camboya1717335 de abril de 2021
 Papúa Nueva Guinea71071710 de agosto de 2021
 Costa Rica356897 de julio de 2021
 Pakistán4967616 de mayo de 2021
 Porcelana52053624 de abril de 2021
 Maldivas652531 de julio de 2021
 Ghana10152220 de abril de 2021
 Curazao-46723 de abril de 2021
 Bonaire-45813 de julio de 2021
 Bosnia y Herzegovina3143026 de julio de 2021
 Etiopía-42416 de agosto de 2021
 Seychelles-40730 de septiembre de 2021
 Argentina43852 [184]24 de abril de 2021
 Martinica836510 de agosto de 2021
 Guadalupe-36210 de marzo de 2021
 Jordán536021 de abril de 2021
 Uganda1343401 [185]26 de marzo de 2021
 Zambia8232629 de mayo de 2021
 Gambia4231612 de julio de 2021
 Mozambique-31416 de julio de 2021
 Guatemala430229 de julio de 2021
 Ruanda912839 de julio de 2021
 Camerún-28228 de septiembre de 2021
 Georgia (país)1927215 de mayo de 2021
 Guayana Francesa5326422 de julio de 2021
 Islas Vírgenes de los Estados Unidos-24718 de agosto de 2021
   Nepal1002389 [186]28 de abril de 2021
 República Democrática del Congo192285 [176]3 de mayo de 2021
 Malaui521330 de abril de 2021
 Kuwait1081915 de junio de 2021
 Montenegro-1788 de agosto de 2021
 Ucrania1317024 de junio de 2021
 Kazajstán-16719 de agosto de 2021
 Omán815917 de mayo de 2021
 Angola615914 de enero de 2021
 Hong Kong15314522 de abril de 2021
 Surinam-1503 de agosto de 2021
 Marruecos31382 [187]3 de mayo de 2021
 Ir-13031 de julio de 2021
 Trinidad y Tobago-1143 de agosto de 2021
 Namibia-110Junio ​​2021
 Paraguay41008 de julio de 2021
 Belice-9830 de junio de 2021
 Egipto-9815 de julio de 2021
 Zimbabue-9626 de julio de 2021
 Liechtenstein-9515 de julio de 2021
 Senegal13936 de mayo de 2021
 República del Congo-8715 de julio de 2021
 Västra Götaland-8619 de julio de 2021
 Eswatini-8126 de julio de 2021
 Líbano-803 de julio de 2021
 Letonia227327 de mayo de 2021
 Mónaco347015 de mayo de 2021
 Mauricio15678 de mayo de 2021
 Malta426323 de junio de 2021
 Guinea-Bissau-623 de noviembre de 2021
 Burundi35731 de mayo de 2021
 Antigua y Barbuda-576 de agosto de 2021
 Liberia-5610 de julio de 2021
 Armenia-505 de agosto de 2021
 Uzbekistán3047(número no informado) [188]25 de junio de 2021
 Benín-4723 de julio de 2021
 Macedonia del Norte63811 de julio de 2021
 Las Bahamas-388 de agosto de 2021
 Islas Caimán-3730 de julio de 2021
 Birmania12331 de junio de 2021
 Serbia5336 de julio de 2021
 Timor Oriental-3312 [189]8 de agosto de 2021
 Sudán del Sur-297 de junio de 2021
 Emiratos Árabes Unidos-2823 de junio de 2021
 Brunéi-2817 de agosto de 2021
 Gabón-272 de agosto de 2021
 Mayotte-2721 de octubre de 2021
 Argelia17256 [190]28 de julio de 2021
 Andorra-2517 de julio de 2021
 Barbados32324 de mayo de 2021
 Sierra Leona-228 de septiembre de 2021
 Irán11213 [191]11 de mayo de 2021
 Burkina Faso-2121 de abril de 2021
 Crimea-211 de julio de 2021
 Afganistán-2024 de mayo de 2021
 Islas Marianas del Norte2197 de julio de 2021
 República Centroafricana-1714 de agosto de 2021
 Taiwán101514 de junio de 2021
 Guam-1426 de abril de 2021
 República Dominicana-143 de mayo de 2021
 Hungría--14 [192]22 de julio de 2021
 Guinea Ecuatorial-1430 de agosto de 2021
 Irak21327 de abril de 2021
 Moldavia11116 de julio de 2021
 Albania111113 de julio de 2021
 Comoras111126 de octubre de 2021
 Jamaica101023 de julio de 2021
 Anguila8820 de abril de 2021
 Santa Lucía7726 de julio de 2021
 Montserrat771 de agosto de 2021
 San Bartolomé7717 de agosto de 2021
 Islas Vírgenes Británicas5527 de julio de 2021
 Chipre114 [193]19 de mayo de 2021
 Islas Turcas y Caicos4412 de julio de 2021
 Azerbaiyán2214 de julio de 2021
 Honduras2231 de julio de 2021
 El Salvador222 de agosto de 2021
 San Vicente y las Granadinas228 de agosto de 2021
 Malí2211 de agosto de 2021
 Arabia Saudita229 de septiembre de 2021
 Haití11(número no informado) [188]27 de julio de 2021
 Panamá111 [194]29 de abril de 2021
 Túnez1121 de mayo de 2021
 Södermanland117 de julio de 2021
 Venezuela117 de julio de 2021
 Mongolia1123 de septiembre de 2021
 Kirguistán11(número no informado) [188]16 de mayo de 2021 [188]
 Mundo (178 países)Total: 3.119.592
(sólo B.1.617.2)
Total: 2.768.050
(B.1.617,2+AY.1+AY.2+AY.3)
Total: 1.862.122


Historia

Los primeros casos de la variante fuera de la India se detectaron a fines de febrero de 2021, incluido el Reino Unido el 22 de febrero, los Estados Unidos el 23 de febrero y Singapur el 26 de febrero. [195] [40] [138]

El 7 de mayo de 2021, los científicos británicos de Public Health England redesignaron la variante B.1.617.2 como "variante preocupante" (VOC-21APR-02), [196] después de que señalaran evidencia en mayo de 2021 de que se propaga más rápidamente que la versión original del virus. [21] Otra razón fue que identificaron 48 grupos de B.1.617.2, algunos de los cuales revelaron un grado de transmisión comunitaria. [197] [198] Dado que los casos de la variante Delta aumentaron rápidamente, los científicos británicos consideraron que la variante Delta había superado a la variante Alpha como la variante dominante del SARS-CoV-2 en el Reino Unido a principios de junio de 2021. [199] Los investigadores de Public Health England descubrieron más tarde que más del 90% de los casos nuevos en el Reino Unido a principios de junio de 2021 eran de la variante Delta; también citaron evidencia de que la variante Delta estaba asociada con un riesgo aproximadamente 60% mayor de transmisión en el hogar en comparación con la variante Alpha. [200]

El primer caso confirmado de la variante en Canadá se identificó en Quebec el 21 de abril de 2021, y más tarde ese mismo día se identificaron 39 casos de la variante en Columbia Británica . [201] Alberta notificó un solo caso de la variante el 22 de abril de 2021. [202] Nueva Escocia notificó dos casos de la variante Delta en junio de 2021. [203]

Fiji también confirmó su primer caso de la variante el 19 de abril de 2021 en Lautoka , y desde entonces ha aumentado hasta 47.000 casos y sigue contando. [204] La variante ha sido identificada como una superpropagadora y ha provocado el cierre de cinco ciudades ( Lautoka , Nadi , Suva , Lami y Nausori ), un área que representa casi dos tercios de la población del país.

El 29 de abril de 2021, los funcionarios de salud del Ministerio de Asuntos Sociales y Salud de Finlandia (STM) y del Instituto Finlandés de Salud y Bienestar (THL) informaron que se había detectado la variante en tres muestras que databan de marzo de 2021. [166]

Filipinas confirmó sus dos primeros casos de la variante el 11 de mayo de 2021, a pesar de la prohibición de viajes impuesta al país desde las naciones del subcontinente indio (excepto Bután y Maldivas ). Ninguno de los pacientes tenía antecedentes de viajes desde la India durante los últimos 14 días, pero sí desde Omán y los Emiratos Árabes Unidos. [205]

Macedonia del Norte confirmó su primer caso de la variante el 7 de junio de 2021, después de que una persona que se estaba recuperando del virus en Irak fuera trasladada a Macedonia del Norte. En una prueba de laboratorio, se detectó la variante en la persona. El 22 de junio de 2021, el país notificó su segundo caso de la variante Delta en un colega del primer caso que también había estado en Irak y que posteriormente desarrolló síntomas. [206]

La detección de la variante B.1.617 se vio obstaculizada en algunos países por la falta de kits especializados para la variante y de laboratorios que puedan realizar la prueba genética . [207] [208] Por ejemplo, hasta el 18 de mayo, Pakistán no había notificado ningún caso, pero las autoridades señalaron que el 15% de las muestras de COVID-19 en el país eran de una "variante desconocida"; no pudieron decir si se trataba de la variante B.1.617 porque no pudieron realizar la prueba. Otros países habían informado de viajeros que llegaban de Pakistán que estaban infectados con la variante B.1.617. [207]

En junio de 2021, el científico Vinod Scaria, del Instituto de Genómica y Biología Integrativa de la India , destacó la existencia de la variante B.1.617.2.1, también conocida como AY.1 o Delta plus, que tiene una mutación K417N adicional en comparación con la variante Delta. [53] La variante B.1.617.2.1 se detectó en Europa en marzo de 2021 y desde entonces se ha detectado en Asia y América. [53]

El 23 de junio de 2021, el Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades (ECDC) advirtió que la variante representaría el 90% de todos los casos nuevos en la Unión Europea a finales de agosto. [209]

El 3 de julio de 2021, Delta se convirtió en la variante dominante en Estados Unidos. [210]

El 9 de julio de 2021, Public Health England publicó el Informe técnico n.º 18 sobre las variantes del SARS-CoV-2, en el que se documentaron 112 muertes entre 45 136 casos de la variante Delta del SARS-CoV-2 en el Reino Unido con un seguimiento de 28 días y una tasa de mortalidad del 0,2 %. [211] El Informe n.º 16 señala que "la mortalidad es un indicador rezagado, lo que significa que el número de casos que han completado 28 días de seguimiento es muy bajo; por lo tanto, es demasiado pronto para proporcionar una evaluación formal de la letalidad de la variante Delta, estratificada por edad, en comparación con otras variantes". [212] El Informe n.º 18 advierte de que "la letalidad no es comparable entre variantes, ya que han alcanzado su punto máximo en diferentes puntos de la pandemia y, por lo tanto, varían en función de la presión hospitalaria de fondo, la disponibilidad y las tasas de vacunación y los perfiles de los casos, las opciones de tratamiento y el impacto del retraso en la notificación, entre otros factores". [211] La cuestión más preocupante es la tasa de crecimiento logístico de 0,93/semana en relación con Alpha. Esto significa que por semana, el número de muestras/casos de Delta crece en un factor de exp (0,93)=2,5 con respecto a la variante Alpha. Esto da como resultado, bajo las mismas medidas de prevención de infecciones, una carga de casos mucho mayor a lo largo del tiempo hasta que una gran fracción de personas han sido infectadas por ella. [213] [214]

Respuestas del gobierno

Tras el aumento de casos a raíz de la segunda ola, al menos 20 países impusieron prohibiciones y restricciones de viaje a los pasajeros procedentes de la India en abril y mayo. El primer ministro del Reino Unido, Boris Johnson, canceló su visita a la India dos veces, mientras que el primer ministro japonés, Yoshihide Suga, pospuso su viaje de abril. [215] [216] [217]

En mayo de 2021, los residentes de dos bloques de pisos en Velbert , Alemania , fueron puestos en cuarentena después de que una mujer en el edificio dio positivo a la variante Delta. [218]

En mayo, el ministro principal de Delhi, Arvind Kejriwal, dijo que una nueva variante del coronavirus procedente de Singapur era extremadamente peligrosa para los niños y podría provocar una tercera ola en la India.

Del 16 de mayo al 13 de junio de 2021, así como del 22 de julio de 2021 al 10 de agosto de 2021, Singapur entró en cuarentena , conocida como "Fase 2 de alerta intensificada", similar a la de 2020.

El 14 de junio, el primer ministro británico, Boris Johnson, anunció que el fin propuesto de todas las restricciones el 21 de junio en el Reino Unido se retrasaría hasta cuatro semanas y que se aceleraría el despliegue de la vacunación tras las preocupaciones por la variante Delta, que representó la gran mayoría (90%) de las nuevas infecciones. [219] Los científicos del Reino Unido han dicho que la variante Delta es entre un 40% y un 60% más transmisible que la variante Alpha , previamente dominante, que se identificó por primera vez en el Reino Unido (como la variante Kent). [220]

El 23 de junio, la provincia de Ontario en Canadá aceleró las citas para la segunda dosis de la vacuna para las personas que viven en puntos críticos del Delta, como Toronto, Peel y Hamilton. [221]

El 25 de junio, Israel restableció el uso obligatorio de mascarillas, citando la amenaza de la variante Delta. [222]

El 28 de junio, Sydney y Darwin volvieron a estar en cuarentena debido a brotes de la variante Delta. [223] Sudáfrica prohibió las reuniones en espacios interiores y exteriores, salvo los funerales, impuso un toque de queda y prohibió la venta de alcohol. [224]

El 3 de julio, las islas de Bali y Java en Indonesia entraron en cuarentena de emergencia . [225]

El 8 de julio, el primer ministro japonés, Yoshihide Suga, anunció que Tokio volvería a entrar en estado de emergencia y que a la mayoría de los espectadores se les prohibiría asistir a los Juegos Olímpicos que comenzarían allí el 23 de julio. [226]

El 9 de julio, Seúl, Corea del Sur , intensificó las restricciones instando a las personas a usar mascarillas al aire libre y limitando el tamaño de las reuniones. [227]

El 12 de julio, el presidente francés, Emmanuel Macron, anunció que todos los trabajadores de la salud deberán vacunarse antes del 15 de septiembre y que Francia comenzará a utilizar pasaportes sanitarios para ingresar a bares, cafés, restaurantes y centros comerciales a partir de agosto. [228]

Los Ángeles anunció que exigirá el uso de mascarillas en espacios cerrados a partir del 17 de julio de 2021. [229]

El Reino Unido levantó la mayoría de las restricciones por COVID-19 el 19 de julio, a pesar de un aumento de casos a medida que la variante Delta se volvió dominante. El gobierno mencionó la protección y la amplia cobertura del programa de vacunación contra COVID-19 , aunque los expertos en salud expresaron preocupación por la medida. [230] [231]

El 23 de julio, Vietnam extendió el confinamiento de la ciudad de Ho Chi Minh hasta el 1 de agosto y anunció que se establecerían restricciones de confinamiento en Hanoi , que afectarían a un tercio de la población del país. La variante Delta había provocado el brote más grande del país hasta la fecha , después de medidas de contención mayormente exitosas a lo largo de 2020. [232] [233]

El 17 de agosto, Nueva Zelanda entró en un nivel de alerta 4 tras la notificación de un caso positivo en Auckland . Poco después se produjeron más casos en la península de Coromandel . [234] Este fue el primer caso de transmisión comunitaria notificado en el país en 170 días (desde febrero de 2021). [235]

Extinción

En octubre de 2021, la Dra. Jenny Harries, directora ejecutiva de la Agencia de Salud y Seguridad del Reino Unido, afirmó que las variantes que circulaban anteriormente, como la Alfa , habían "desaparecido" y habían sido reemplazadas por la variante Delta. [236] En marzo de 2022, la Organización Mundial de la Salud incluyó las variantes Alfa, Beta y Gamma como variantes que circulaban anteriormente, citando la falta de casos detectados en las semanas y meses anteriores, en parte debido al predominio de la variante Delta y la posterior variante Ómicron . [237] Sin embargo, en pocos meses, la variante Delta fue incluida como variante que circulaba anteriormente y países como Australia pasaron 12 semanas sin detectar ninguna variante Delta. [4]

Véase también

Notas

Referencias

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  2. ^ abc Roberts, Michelle (14 de junio de 2021). «Dolor de cabeza y secreción nasal vinculados a la variante Delta». BBC News . Londres. Archivado desde el original el 14 de junio de 2021 . Consultado el 2 de julio de 2021 .
  3. ^ "Seguimiento de las variantes del SARS-CoV-2". www.who.int . Archivado desde el original el 9 de junio de 2021 . Consultado el 17 de agosto de 2022 .
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