Superfamilia Ras

Superfamilia de proteínas de GTPasas pequeñas
Estructura H-Ras PDB 121p, superficie coloreada por conservación en alineación de semillas Pfam : dorado, más conservado; cian oscuro, menos conservado.
Identificadores
SímboloRas
PfamPF00071
InterprofesionalIPR013753
PROSITIOPDOC00017
SCOP25p21 / ALCANCE / SUPFAM
Diligenciamiento de conflictoscd00882
Membranoma206
Estructuras de proteínas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
APPDB RCSB; PDBj
PDBsumaResumen de la estructura

La superfamilia Ras , derivada del "virus del sarcoma de rata", es una superfamilia de proteínas de pequeñas GTPasas . [1] Los miembros de la superfamilia se dividen en familias y subfamilias según su estructura, secuencia y función. Las cinco familias principales son las GTPasas Ras, Rho , Ran , Rab y Arf . [2] La propia familia Ras se divide a su vez en 6 subfamilias: Ras , Ral , Rap , Rheb , Rad y Rit. Miro es un reciente colaborador de la superfamilia. Cada subfamilia comparte el dominio G central común, que proporciona la actividad esencial de GTPasa e intercambio de nucleótidos.

La secuencia circundante ayuda a determinar la especificidad funcional de la pequeña GTPasa, por ejemplo, el 'Insert Loop', común a la subfamilia Rho, contribuye específicamente a la unión a proteínas efectoras como WASP .

En general, la familia Ras es responsable de la proliferación celular: Rho de la morfología celular , Ran del transporte nuclear y Rab y Arf del transporte de vesículas . [3]

Subfamilias y miembros

La siguiente es una lista de proteínas humanas que pertenecen a la superfamilia Ras: [1]

Descripción general
SubfamiliaFunciónMiembros
Rasproliferación celular [3]DIRAS1 ; DIRAS2; DIRAS3 ; ERA; GEMA ; HRAS ; KRAS ; MRAS ; NKIRAS1; NKIRAS2 ; NRAS ; RALA ; RALB ; RAP1A ; RAP1B ; RAP2A ; RAP2B ; RAP2C; RASD1 ; RASD2 ; RASL10A; RASL10B; RASL11A; RASL11B ; RASL12; REM1; REM2; RERG ; REGL; RRAD ; RRAS ; RRAS2
RhoDinámica/morfología del citoesqueleto [3]ROA ; ROB ; RHOBTB1 ; RHOBTB2 ; RHOBTB3 ; RHOC ; RODÓ ; RHOF; ROG ; RHOH ; RHOJ ; RHOQ ; RHOU; RHOV ; RND1 ; RND2 ; RND3 ; RAC1 ; RAC2 ; RAC3 ; CDC42
Rabtráfico de membranaRAB1A ; RAB1B ; RAB2; RAB3A ; RAB3B ; RAB3C ; RAB3D ; RAB4A ; RAB4B ; RAB5A ; RAB5B ; RAB5C ; RAB6A ; RAB6B ; RAB6C ; RAB7A ; RAB7B ; RAB7L1 ; RAB8A ; RAB8B ; RAB9; RAB9B; RABL2A; RABL2B; RABL4; RAB10 ; RAB11A ; RAB11B ; RAB12; RAB13 ; RAB14 ; RAB15 ; RAB17 ; RAB18 ; RAB19; RAB20; RAB21 ; RAB22A ; RAB23 ; RAB24; RAB25 ; RAB26 ; RAB27A ; RAB27B; RAB28; RAB2B ; RAB30 ; RAB31 ; RAB32; RAB33A ; RAB33B ; RAB34 ; RAB35 ; RAB36 ; RAB37 ; RAB38 ; RAB39; RAB39B ; RAB40A ; RAB40AL; RAB40B; RAB40C; RAB41; RAB42; RAB43
Rapadhesión celularRAP1A ; RAP1B ; RAP2A ; RAP2B ; RAP2C
Arftransporte vesicular [3]ARL1 ; ARL2 ; ARL3 ; ARL4 ; ARL5 ; ARL5C ; ARL6; ARL7 ; ARL8; ARL9; ARL10A; ARL10B; ARL10C; ARL11; ARL13A ; ARL13B ; ARL14 ; ARL15 ; ARL16 ; ARL17 ; TRIM23 , ARL4D ; ARFRP1 ; ARL13B
Corriótransporte nuclearCORRIÓ
RhebVía mTORRHEBL1 ;
RGKRRAD ; GEMA ; REM; REM2
RitRIT1 ; RIT2
Mirótransporte mitocondrialRHOT1 ; RHOT2

Sin clasificar:

Véase también

Referencias

  1. ^ ab Wennerberg K, Rossman KL, Der CJ (marzo de 2005). "La superfamilia Ras de un vistazo". J. Cell Sci . 118 (parte 5): 843–6. doi : 10.1242/jcs.01660 . PMID  15731001.
  2. ^ Goitre, L; Trapani, E; Trabalzini, L; Retta, SF (26 de diciembre de 2013). La superfamilia Ras de pequeñas GTPasas: los secretos revelados . Métodos en biología molecular. Vol. 1120. págs. 1–18. doi :10.1007/978-1-62703-791-4_1. ISBN 978-1-62703-790-7. Número de identificación personal  24470015.
  3. ^ abcd Munemitsu S, Innis M, Clark R, McCormick F, Ullrich A, Polakis P (1990). "Clonación molecular y expresión de un ADNc de G25K, el homólogo humano del gen del ciclo celular de la levadura CDC42". Mol Cell Biol . 10 (11): 5977–82. doi :10.1128/MCB.10.11.5977. ISSN  0270-7306. PMC 361395 . PMID  2122236. 
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