SIMPK

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens
SIMPK
Estructuras disponibles
APBúsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Identificadores
AliasSYMPK , SPK, SYM, symplekin, Pta1, proteína de andamiaje de symplekin
Identificaciones externasOMIM : 602388; MGI : 1915438; HomoloGene : 37969; Tarjetas genéticas : SYMPK; OMA : SYMPK - ortólogos
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entre
Conjunto
Protección unificada
RefSeq (ARNm)

Número de modelo_004819

Número de serie 026605 Número de
serie 001360713

RefSeq (proteína)

NP_004810

NP_001347642
NP_080881

Ubicación (UCSC)Crónicas 19: 45.82 – 45.86 MbCrónicas 7: 18.76 – 18.79 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
Wikidatos
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La symplekina es una proteína que en los humanos está codificada por el gen SYMPK . [5] [6]

Función

Este gen codifica una proteína nuclear que funciona en la regulación de la poliadenilación y promueve la expresión génica. La proteína forma un complejo de alto peso molecular con componentes de la maquinaria de poliadenilación. Se cree que sirve como andamio para reclutar factores reguladores para el complejo de poliadenilación. También participa en la maduración del extremo 3' de los ARNm de las histonas, que no experimentan poliadenilación. La proteína también se localiza en las placas citoplasmáticas de las uniones estrechas en algunos tipos de células. [6]

Interacciones

Se ha demostrado que SYMPK interactúa con CSTF2 , [7] HSF1 [8] y Oct4 [9].

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000125755 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000023118 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
  5. ^ Ueki K, Ramaswamy S, Billings SJ, Mohrenweiser HW, Louis DN (mayo de 1997). "Localización cromosómica en 19q13.3, estructura genómica parcial y secuencia de ADNc 5' del gen symplekin humano". Genética molecular y de células somáticas . 23 (3): 229–31. doi :10.1007/BF02721375. PMID  9330635. S2CID  24956684.
  6. ^ ab "Entrez Gene: SYMPK symplekin".
  7. ^ Takagaki Y, Manley JL (marzo de 2000). "Las interacciones proteicas complejas dentro de la maquinaria de poliadenilación humana identifican un nuevo componente". Biología molecular y celular . 20 (5): 1515–25. doi :10.1128/MCB.20.5.1515-1525.2000. PMC 85326 . PMID  10669729. 
  8. ^ Xing H, Mayhew CN, Cullen KE, Park-Sarge OK, Sarge KD (marzo de 2004). "Modulación de HSF1 de la poliadenilación del ARNm de Hsp70 a través de la interacción con symplekin". The Journal of Biological Chemistry . 279 (11): 10551–5. doi : 10.1074/jbc.M311719200 . PMID  14707147.
  9. ^ Yu J, Lu W, Ge T, et al., (2019). "La interacción entre Sympk y Oct4 promueve la proliferación de células madre embrionarias de ratón". CÉLULAS MADRE; 37 (6): 743-753 https://doi.org/10.1002/stem.2992

Lectura adicional

  • Keon BH, Schäfer S, Kuhn C, Grund C, Franke WW (agosto de 1996). "Symplekin, un nuevo tipo de proteína de placa de unión estrecha". The Journal of Cell Biology . 134 (4): 1003–18. doi :10.1083/jcb.134.4.1003. PMC  2120966 . PMID  8769423.
  • Alwazzan M, Hamshere MG, Lennon GG, Brook JD (junio de 1998). "Seis transcripciones se mapean dentro de 200 kilobases de la repetición expandida de la distrofia miotónica". Genoma de mamíferos . 9 (6): 485–7. doi :10.1007/s003359900804. PMID  9585442. S2CID  319161.
  • Faber PW, Barnes GT, Srinidhi J, Chen J, Gusella JF, MacDonald ME (septiembre de 1998). "Huntingtin interactúa con una familia de proteínas del dominio WW". Human Molecular Genetics . 7 (9): 1463–74. doi : 10.1093/hmg/7.9.1463 . PMID  9700202.
  • Paffenholz R, Kuhn C, Grund C, Stehr S, Franke WW (agosto de 1999). "La proteína de repetición de brazo NPRAP (neurojungina) es un componente de las placas de la zona limitante externa de la retina, que define un nuevo tipo de unión adherente". Experimental Cell Research . 250 (2): 452–64. doi :10.1006/excr.1999.4534. PMID  10413599.
  • Takagaki Y, Manley JL (marzo de 2000). "Las interacciones proteicas complejas dentro de la maquinaria de poliadenilación humana identifican un nuevo componente". Biología molecular y celular . 20 (5): 1515–25. doi :10.1128/MCB.20.5.1515-1525.2000. PMC  85326 . PMID  10669729.
  • Langbein L, Pape UF, Grund C, Kuhn C, Praetzel S, Moll I, Moll R, Franke WW (agosto de 2003). "Estructuras relacionadas con las uniones estrechas en ausencia de un lumen: ocludina, claudinas y proteínas de placa de unión estrecha en formaciones celulares densamente empaquetadas de epitelios estratificados y carcinomas de células escamosas". Revista Europea de Biología Celular . 82 (8): 385–400. doi :10.1078/0171-9335-00330. PMID  14533737.
  • Xing H, Mayhew CN, Cullen KE, Park-Sarge OK, Sarge KD (marzo de 2004). "Modulación de la poliadenilación del ARNm de Hsp70 por HSF1 a través de la interacción con symplekin". The Journal of Biological Chemistry . 279 (11): 10551–5. doi : 10.1074/jbc.M311719200 . PMID  14707147.
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (agosto de 2004). "Caracterización a gran escala de las fosfoproteínas nucleares de células HeLa". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (33): 12130–5. Bibcode :2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446 . PMID  15302935.
  • Barnard DC, Ryan K, Manley JL, Richter JD (noviembre de 2004). "Symplekin y xGLD-2 son necesarios para la poliadenilación citoplasmática mediada por CPEB". Cell . 119 (5): 641–51. doi : 10.1016/j.cell.2004.10.029 . PMID  15550246. S2CID  8289230.
  • Kolev NG, Steitz JA (noviembre de 2005). "Symplekin y otros factores de poliadenilación participan en la maduración del extremo 3' de los ARNm de las histonas". Genes & Development . 19 (21): 2583–92. doi :10.1101/gad.1371105. PMC  1276732 . PMID  16230528.
  • Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (enero de 2006) ). "Diversificación de la modulación transcripcional: identificación y caracterización a gran escala de supuestos promotores alternativos de genes humanos". Investigación del genoma . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. Número de modelo  : PMID 16344560  .
  • Kavanagh E, Buchert M, Tsapara A, Choquet A, Balda MS, Hollande F, Matter K (diciembre de 2006). "Interacción funcional entre el factor de transcripción ZONAB/DbpA que interactúa con ZO-1 y el factor de procesamiento de ARN symplekin" (PDF) . Journal of Cell Science . 119 (Pt 24): 5098–105. doi : 10.1242/jcs.03297 . PMID  17158914. S2CID  8702837.
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