PABPC1
Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

PABPC1
Estructuras disponibles
APBúsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Identificadores
AliasPABPC1 , PAB1, PABP, PABP1, PABPC2, PABPL1, proteína de unión a poli(A) citoplasmática 1
Identificaciones externasOMIM : 604679; MGI : 1349722; HomoloGene : 37638; Tarjetas genéticas : PABPC1; OMA :PABPC1 - ortólogos
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entre

26986

18458

Conjunto

ENSG00000070756

ENSMUSG00000022283

Protección unificada

P11940

P29341

RefSeq (ARNm)

Número de modelo NM_002568

Número nuevo_008774

RefSeq (proteína)

NP_002559

NP_032800

Ubicación (UCSC)Crónica 8: 100,69 – 100,72 MbCrónicas 15: 36.6 – 36.61 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
Wikidatos
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La proteína 1 de unión a poliadenilato es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen PABPC1 . [5] La proteína PABP1 se une al ARNm y facilita una variedad de funciones, como el transporte hacia dentro y hacia fuera del núcleo, la degradación, la traducción y la estabilidad. Hay dos proteínas PABP1 independientes, una que se encuentra en el núcleo (PABPN1) y la otra que se encuentra en el citoplasma (PABPC1). La ubicación de PABP1 afecta el papel de esa proteína y su función con el ARN. [6]

Función

La proteína de unión a poli(A) (PAB o PABP), que se encuentra unida a la cola poli(A) 3' del ARNm eucariota, es necesaria para el alargamiento de la poli(A) y la terminación de la traducción. En los seres humanos, las PABP comprenden una pequeña isoforma nuclear y una familia de genes conservados de otras proteínas de unión a poli(A) . [suministrada por OMIM] [7]

PABPC1 suele difundirse dentro del citoplasma y concentrarse en sitios de alta concentración de ARNm, como gránulos de estrés, cuerpos de procesamiento y lugares de alta actividad traduccional. PABPC1 también está asociado con la degradación del ARNm mediada por sinsentidos (NMD). PABPC1 se une a la cola de poli(A) e interactúa con eIF4G, que estabiliza la circularización de los ARNm. Esta estructura es necesaria para la prevención de la degradación del ARNm a través de NMD. [8]

En el núcleo, la PABP1 se une a las colas de poli(A) de los pre-ARNm para facilitar la estabilidad, la exportación, el transporte y la degradación. La unión de la PABP1 también es necesaria para la degradación mediada por el núcleo. La PABPC1 contiene cuatro motivos de reconocimiento de ARN (RRM). Los dos primeros, RRM1 y RRM2, se unen tanto a la α-importina como a la cola de poli(A) del ARNm procesado. Esta característica evita que el ARNm regrese al núcleo. [6]

Interacciones

Se ha demostrado que PABPC1 interactúa con:

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000070756 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000022283 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ Grange T, de Sa CM, Oddos J, Pictet R (junio de 1987). "Proteína de unión a poliadenilato de ARNm humano: conservación evolutiva de un motivo de unión a ácidos nucleicos". Nucleic Acids Research . 15 (12): 4771–87. doi :10.1093/nar/15.12.4771. PMC 305917 . PMID  2885805. 
  6. ^ ab Gray NK, Hrabálková L, Scanlon JP, Smith RW (diciembre de 2015). "Proteínas de unión a poli(A) y localización del ARNm: ¿quién manda?". Biochemical Society Transactions . 43 (6): 1277–84. doi : 10.1042/BST20150171 . PMID  26614673.
  7. ^ "Gen Entrez: proteína de unión a poli(A) PABPC1, citoplasmática 1".
  8. ^ Fatscher T, Boehm V, Weiche B, Gehring NH (octubre de 2014). "La interacción de la proteína de unión a poli(A) citoplasmática con el factor de iniciación eucariota 4G suprime la degradación del ARNm mediada por sinsentidos". ARN . 20 (10): 1579–92. doi :10.1261/rna.044933.114. PMC 4174440 . PMID  25147240. 
  9. ^ Koloteva-Levine N, Pinchasi D, Pereman I, Zur A, Brandeis M, Elroy-Stein O (mayo de 2004). "La subunidad Apc5 del complejo promotor de anafase/ciclosoma interactúa con la proteína de unión a poli(A) y reprime la traducción mediada por el sitio de entrada interno del ribosoma". Biología molecular y celular . 24 (9): 3577–87. doi :10.1128/mcb.24.9.3577-3587.2004. PMC 387753 . PMID  15082755. 
  10. ^ Funakoshi Y, Doi Y, Hosoda N, Uchida N, Osawa M, Shimada I, Tsujimoto M, Suzuki T, Katada T, Hoshino S (diciembre de 2007). "Mecanismo de deadenilación del ARNm: evidencia de una interacción molecular entre el factor de terminación de la traducción eRF3 y las deadenilasas del ARNm". Genes & Development . 21 (23): 3135–48. doi :10.1101/gad.1597707. PMC 2081979 . PMID  18056425. 
  11. ^ ab Imataka H, ​​Gradi A, Sonenberg N (diciembre de 1998). "Una secuencia de aminoácidos N-terminal recientemente identificada de eIF4G humana se une a la proteína de unión a poli(A) y funciona en la traducción dependiente de poli(A)". The EMBO Journal . 17 (24): 7480–9. doi :10.1093/emboj/17.24.7480. PMC 1171091 . PMID  9857202. 
  12. ^ Hoshino S, Imai M, Kobayashi T, Uchida N, Katada T (junio de 1999). "El factor liberador de la cadena polipeptídica eucariota (eRF3/GSPT) que lleva la señal de terminación de la traducción a la cola 3'-Poli(A) del ARNm. Asociación directa de erf3/GSPT con la proteína de unión al poliadenilato". The Journal of Biological Chemistry . 274 (24): 16677–80. doi : 10.1074/jbc.274.24.16677 . PMID  10358005.
  13. ^ Roy G, De Crescenzo G, Khaleghpour K, Kahvejian A, O'Connor-McCourt M, Sonenberg N (junio de 2002). "Paip1 interactúa con la proteína de unión a poli(A) a través de dos motivos de unión independientes". Biología molecular y celular . 22 (11): 3769–82. doi :10.1128/mcb.22.11.3769-3782.2002. PMC 133836 . PMID  11997512. 
  14. ^ Craig AW, Haghighat A, Yu AT, Sonenberg N (abril de 1998). "La interacción de la proteína de unión al poliadenilato con el homólogo de eIF4G PAIP mejora la traducción". Nature . 392 (6675): 520–3. Bibcode :1998Natur.392..520C. doi :10.1038/33198. PMID  9548260. S2CID  10891925.
  15. ^ Khaleghpour K, Kahvejian A, De Crescenzo G, Roy G, Svitkin YV, Imataka H, ​​O'Connor-McCourt M, Sonenberg N (agosto de 2001). "Interacciones duales del represor traduccional Paip2 con la proteína de unión a poli(A)". Biología molecular y celular . 21 (15): 5200–13. doi :10.1128/MCB.21.15.5200-5213.2001. PMC 87244 . PMID  11438674. 

Lectura adicional

  • Görlach M, Burd CG, Dreyfuss G (abril de 1994). "La proteína de unión a poli(A) del ARNm: localización, abundancia y especificidad de unión al ARN". Experimental Cell Research . 211 (2): 400–7. doi : 10.1006/excr.1994.1104 . PMID  7908267.
  • Campbell LH, Borg KT, Haines JK, Moon RT, Schoenberg DR, Arrigo SJ (septiembre de 1994). "El virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 Rev es necesario in vivo para la unión de la proteína de unión a poli(A) a los ARN dependientes de Rev". Journal of Virology . 68 (9): 5433–8. doi :10.1128/jvi.68.9.5433-5438.1994. PMC  236943 . PMID  8057425.
  • Huang Y, Carmichael GG (abril de 1996). "El papel de la poliadenilación en el transporte nucleocitoplasmático del ARNm". Biología molecular y celular . 16 (4): 1534–42. doi :10.1128/mcb.16.4.1534. PMC  231138 . PMID  8657127.
  • Craig AW, Haghighat A, Yu AT, Sonenberg N (abril de 1998). "La interacción de la proteína de unión al poliadenilato con el homólogo de eIF4G PAIP mejora la traducción". Nature . 392 (6675): 520–3. Bibcode :1998Natur.392..520C. doi :10.1038/33198. PMID  9548260. S2CID  10891925.
  • Afonina E, Stauber R, Pavlakis GN (mayo de 1998). "La proteína 1 de unión a poli(A) humana se desplaza entre el núcleo y el citoplasma". The Journal of Biological Chemistry . 273 (21): 13015–21. doi : 10.1074/jbc.273.21.13015 . PMID  9582337.
  • Imataka H, ​​Gradi A, Sonenberg N (diciembre de 1998). "Una secuencia de aminoácidos N-terminal recientemente identificada de eIF4G humana se une a la proteína de unión a poli(A) y funciona en la traducción dependiente de poli(A)". The EMBO Journal . 17 (24): 7480–9. doi :10.1093/emboj/17.24.7480. PMC  1171091 . PMID  9857202.
  • Hornstein E, Git A, Braunstein I, Avni D, Meyuhas O (enero de 1999). "La expresión del gen de la proteína de unión a poli(A) se regula de forma traduccional de manera dependiente del crecimiento a través de un motivo de tracto de oligopirimidina 5'-terminal". The Journal of Biological Chemistry . 274 (3): 1708–14. doi : 10.1074/jbc.274.3.1708 . PMID  9880551.
  • Laroia G, Cuesta R, Brewer G, Schneider RJ (abril de 1999). "Control de la degradación del ARNm mediante la vía de choque térmico-ubiquitina-proteasoma". Science . 284 (5413): 499–502. Bibcode :1999Sci...284..499L. doi :10.1126/science.284.5413.499. PMID  10205060.
  • Hoshino S, Imai M, Kobayashi T, Uchida N, Katada T (junio de 1999). "El factor liberador de la cadena polipeptídica eucariota (eRF3/GSPT) que lleva la señal de terminación de la traducción a la cola 3'-Poli(A) del ARNm. Asociación directa de erf3/GSPT con la proteína de unión al poliadenilato". The Journal of Biological Chemistry . 274 (24): 16677–80. doi : 10.1074/jbc.274.24.16677 . PMID  10358005.
  • Deo RC, Bonanno JB, Sonenberg N, Burley SK (septiembre de 1999). "Reconocimiento de ARN poliadenilato por la proteína de unión a poli(A)". Cell . 98 (6): 835–45. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81517-2 . PMID  10499800. S2CID  16247357.
  • Féral C, Mattéi MG, Pawlak A, Guellaën G (octubre de 1999). "Localización cromosómica de tres genes de la proteína de unión a poli(A) humana y cuatro pseudogenes relacionados". Genética humana . 105 (4): 347–53. doi :10.1007/s004399900148. PMC  1865476 . PMID  10543404.
  • Grosset C, Chen CY, Xu N, Sonenberg N, Jacquemin-Sablon H, Shyu AB (septiembre de 2000). "Un mecanismo para el recambio de ARNm acoplado a la traducción: interacción entre la cola poli(A) y un determinante de codificación de ARN c-fos a través de un complejo proteico". Cell . 103 (1): 29–40. doi : 10.1016/S0092-8674(00)00102-1 . PMID  11051545. S2CID  18135412.
  • Khaleghpour K, Svitkin YV, Craig AW, DeMaria CT, Deo RC, Burley SK, Sonenberg N (enero de 2001). "Represión traduccional por un nuevo socio de la proteína de unión a poli(A) humana, Paip2". Molecular Cell . 7 (1): 205–16. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00168-X . PMID  11172725.
  • Bushell M, Wood W, Carpenter G, Pain VM, Morley SJ, Clemens MJ (junio de 2001). "Interrupción de la interacción del factor de iniciación eucariota de la síntesis proteica de mamíferos 4B con la proteína de unión a poli(A) por escisiones mediadas por caspasa y proteasa viral". The Journal of Biological Chemistry . 276 (26): 23922–8. doi : 10.1074/jbc.M100384200 . PMID  11274152.
  • Féral C, Guellaën G, Pawlak A (mayo de 2001). "El testículo humano expresa una proteína específica de unión a poli(A)". Nucleic Acids Research . 29 (9): 1872–83. doi :10.1093/nar/29.9.1872. PMC  37253 . PMID  11328870.
  • Khaleghpour K, Kahvejian A, De Crescenzo G, Roy G, Svitkin YV, Imataka H, ​​O'Connor-McCourt M, Sonenberg N (agosto de 2001). "Interacciones duales del represor traduccional Paip2 con la proteína de unión a poli(A)". Biología molecular y celular . 21 (15): 5200–13. doi :10.1128/MCB.21.15.5200-5213.2001. PMC  87244 . PMID  11438674.
  • Woods AJ, Roberts MS, Choudhary J, Barry ST, Mazaki Y, Sabe H, Morley SJ, Critchley DR, Norman JC (febrero de 2002). "La paxilina se asocia con la proteína de unión a poli(A) 1 en el retículo endoplasmático denso y el borde delantero de las células migratorias". The Journal of Biological Chemistry . 277 (8): 6428–37. doi : 10.1074/jbc.M109446200 . PMID  11704675.
  • Lee J, Bedford MT (marzo de 2002). "PABP1 identificado como sustrato de la arginina metiltransferasa mediante matrices de proteínas de alta densidad". EMBO Reports . 3 (3): 268–73. doi :10.1093/embo-reports/kvf052. PMC  1084016 . PMID  11850402.
  • Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (abril de 2002). "Purificación y caracterización de espliceosomas nativos adecuados para el análisis estructural tridimensional". ARN . 8 (4): 426–39. doi :10.1017/S1355838202021088. PMC  1370266 . PMID  11991638.
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