Orden de ramificación de los filos bacterianos (Woese, 1987)
Existen varios modelos del orden de ramificación de los filos bacterianos , uno de ellos fue propuesto en un artículo de 1987 por Carl Woese . [1]
El orden de ramificación propuesto por Carl Woese se basó en la filogenia molecular , que se consideró revolucionaria ya que todos los modelos anteriores se basaban en discusiones sobre la morfología. ( v. Monera ). [2] Se han propuesto varios modelos desde entonces y no se ha llegado a un consenso en la actualidad en cuanto al orden de ramificación de los principales linajes bacterianos. [3]
El gen utilizado fue el ADN ribosomal 16S .
Árbol
Se han cambiado los nombres para reflejar la nomenclatura más actual utilizada por los filogenistas moleculares.
Arqueas + eucariotas | |
| Bacteria | |
Nota sobre los nombres
A pesar del impacto que tuvo el artículo en la clasificación bacteriana, no se trató de una propuesta de cambio de taxonomía. En consecuencia, a muchos clados se les dieron nombres oficiales. Esto ocurrió solo posteriormente: por ejemplo, las "bacterias púrpuras y sus parientes" fueron renombradas Proteobacteria . [4]
Discusión
En 1987, Carl Woese , considerado el precursor de la revolución de la filogenia molecular, dividió Eubacteria en 11 divisiones basadas en secuencias de ARN ribosómico 16S (SSU), que se enumeran a continuación. [1] [6] Desde entonces se han propuesto muchos nuevos filos.
- Bacterias púrpuras y sus parientes (posteriormente rebautizadas como Proteobacterias [7] )
- subdivisión alfa ( bacterias púrpuras no azufradas , rizobacterias , Agrobacterium , Rickettsiae , Nitrobacter )
- subdivisión beta ( Rhodocyclus , (algunos) Thiobacillus , Alcaligenes , Spirillum , Nitrosovibrio )
- subdivisión gamma (entéricos, pseudomonas fluorescentes , bacterias de azufre púrpura , Legionella , (algunas) Beggiatoa )
- Subdivisión delta (reductores de azufre y sulfato ( Desulfovibrio ), Myxobacteria , Bdellovibrio )
- Eubacterias grampositivas [Nota 1]
- Especies con alto contenido de G+C (posteriormente rebautizadas como Actinobacteria [11] ) ( Actinomyces , Streptomyces , Arthrobacter , Micrococcus , Bifidobacterium )
- Especies de bajo contenido de G+C (posteriormente rebautizadas como Firmicutes [11] ) ( Clostridium , Peptococcus , Bacillus , Mycoplasma )
- Especies fotosintéticas ( Heliobacteria )
- Especies con paredes Gram-negativas ( Megasphaera , Sporomusa )
- Cianobacterias y cloroplastos ( Aphanocapsa , Oscillatoria , Nostoc , Synechococcus , Gloeobacter , Prochloron )
- Espiroquetas y parientes
- Espiroquetas ( Spirochaeta , Treponema , Borrelia )
- Leptospiras ( Leptospira , Leptonema )
- Bacterias verdes del azufre ( Chlorobium , Chloroherpeton )
- Bacteroides , Flavobacteria y parientes (posteriormente rebautizados como Bacteroidetes)
- Bacteroides ( Bacteroides , Fusobacterium )
- Grupo de flavobacterias ( Flavobacterium , Cytophaga , Saprospira , Flexibacter )
- Planctomyces y parientes (posteriormente rebautizados como Planctomycetes )
- Grupo Planctomyces ( Planctomyces , Pasteuria [ sic ] [Nota 2] )
- Termófilos ( Isocystis pallida )
- Clamidias ( Chlamydia psittaci , Chlamydia trachomatis )
- Micrococos radioresistentes y parientes (ahora comúnmente denominados Deinococcus–Thermus [12] o Thermi ) [Nota 3]
- Grupo Deinococcus ( Deinococcus radiodurans )
- Termófilos ( Thermus aquaticus )
- Bacterias verdes no azufradas y sus parientes (posteriormente rebautizadas como Chloroflexi [16] )
- Grupo cloroflexo ( Chloroflexus , Herpetosiphon )
- Grupo Thermomicrobium ( Thermomicrobium roseum )
- Termotoga maritima ( Thermotoga maritima )
Último antepasado común universal
La raíz del árbol, es decir , el nodo del último ancestro común universal , se sitúa entre el dominio Bacteria (o reino Eubacteria como se conocía entonces) y el clado formado por los dominios Archaea (antiguamente reino Archaebacteria ) y Eukaryotes . Esto es coherente con todos los estudios posteriores, salvo el estudio de Thomas Cavalier-Smith en 2002 y 2004, que no se basó en la filogenia molecular. [17]
Los eucariotas son un mosaico de diferentes linajes:
- El genoma en el núcleo desciende del primer eucariota sin orgánulos, el "urcariota", una especie hermana del arqueón ancestral.
- Las mitocondrias son orgánulos que descienden de la proto-mitocondria , una especie de Rickettsiales ( Alphaproteobacteria ) ( v. Reclinomonas y retortamonads ).
- Los cloroplastos son orgánulos de origen cianobacteriano.
Por ello, en Woese (1987) el grupo se denomina urcariota.
El clado compuesto por Archaea y el genoma nuclear de eucariotas es llamado Neomura por T. Cavalier-Smith [17]
Véase también
- Orden de ramificación de los filos bacterianos (Woese, 1987)
- Orden de ramificación de los filos bacterianos (Rappe y Giovanoni, 2003)
- Orden de ramificación de los filos bacterianos según ARB Silva Living Tree
- Orden de ramificación de los filos bacterianos (Ciccarelli et al., 2006)
- Orden de ramificación de los filos bacterianos (Battistuzzi et al., 2004)
- Orden de ramificación de los filos bacterianos (Gupta, 2001)
- Orden de ramificación de los filos bacterianos (Cavalier-Smith, 2002)
- Revolución woeseiana
Notas al pie
- ^ Hasta hace poco, se creía que solo Firmicutes y Actinobacteria eran Gram-positivas. Sin embargo, el filo candidato TM7 también puede ser Gram-positivo. [8] Sin embargo, Chloroflexi posee una sola bicapa, pero se tiñe de forma negativa (con algunas excepciones [9] ). [10]
- ^ Pasteuria ahora se asigna al filo Bacilli , no al filo Planctomycetes .
- ^ Se ha propuesto llamar al clado Xenobacteria [13] o Hadobacteria [14] (este último se considera un nombre ilegítimo [15] ).
Referencias
- ^ ab Woese, CR (1987). "Evolución bacteriana". Microbiological Reviews . 51 (2): 221–71. doi :10.1128/MMBR.51.2.221-271.1987. PMC 373105 . PMID 2439888.
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