Existen varios modelos del orden de ramificación de los filos bacterianos , uno de ellos fue propuesto en 2006 por Ciccarelli et al. para su proyecto iTOL. [1]
Este árbol se basa en un conjunto concatenado de proteínas conservadas y no de ARNr 16S (cf. Orden de ramificación de los filos bacterianos (Woese, 1987) ).
"Neomura" | |
Dominio Bacterias | |
La disposición de los diversos filos difiere de la de 16S, pero puede deberse a la atracción de ramificaciones largas y al muestreo limitado (muchos filos tienen un único representante secuenciado, mientras que Firmicutes y Proteobacteria están sobrerrepresentados). Proteobacteria no es monofilética en este filograma, pero esto puede ser erróneo dada la gran cantidad de literatura a favor de Acidobacteria basal. Al contrario de los árboles 16S, el clado con ramificación más profunda es Firmicutes . Sin embargo, el último ancestro común fue entre Bacteria y Archaea+Eukarya.