El oligosacárido central (o Core-OS ) es una cadena corta de residuos de azúcar dentro de un lipopolisacárido (LPS) de bacterias Gram-negativas . Los Core-OS son muy diversos entre especies bacterianas e incluso dentro de cepas de especies [1]
El dominio central siempre contiene un componente de oligosacárido que se une directamente al lípido A y comúnmente contiene azúcares como heptosa y ácido 3-desoxi- D -manooctulosónico (también conocido como KDO o ceto-desoxioctulosonato). [2] Los núcleos de LPS de muchas bacterias también contienen componentes que no son carbohidratos, como fosfato , aminoácidos y sustituyentes de etanolamina .
En la literatura se han descrito muchas estructuras centrales; esta descripción se basa en la estructura general tradicional (tal como se encuentra en las bacterias entéricas y en Pseudomonas ). Consulte la figura anterior para obtener una descripción general de la estructura que se encuentra en E. coli R1.
La "base" del núcleo interno está formada por 1-3 residuos de KDO. El último KDO suele estar modificado con un grupo fosfato o etanolamina . A partir de los KDO, se unen 2-3 heptosas (es decir, L-glicero-D -mano heptulosa) que suelen estar fosforiladas. Estos KDO y heptosas constituyen el "núcleo interno". El enlace cetosídico entre el KDO y el lípido A (α2→6) es especialmente susceptible a la escisión ácida. Los investigadores de LPS utilizan un tratamiento con ácido débil para separar las porciones lipídica y polisacárida del LPS.
Una molécula de LPS que incluye solo un lípido A y un núcleo interno (o menos. Ver ejemplo ) se denomina "LPS rugoso profundo".
El núcleo externo está formado por residuos de hexosas que están unidos al último residuo de heptosa en el núcleo interno. Las hexosas que se encuentran a menudo en el núcleo externo incluyen: D - glucosa , D - manosa , D - galactosa , etc. Suele haber al menos tres hexosas unidas a β1→3, estando el antígeno O ligado a la tercera hexosa. A menudo se encuentran otras hexosas unidas al núcleo externo, ramificándose desde el oligómero principal.
Los LPS que incluyen el lípido A y un oligosacárido central completo (interno y externo) se denominan "LPS rugoso".
Las enzimas implicadas en la síntesis de oligosacáridos básicos se conservan en Escherichia coli y Salmonella . Pseudomonas aeruginosa tiene algunas enzimas únicas. [3] : 273
No se comprende bien el mecanismo por el cual el oligosacárido central del lipopolisacárido afecta el comportamiento de la membrana.