Motivo de interacción con ubiquitina
| Universidad de Michigan | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Estructura de la solución del complejo s5a uim-1/ubiquitina | |||||||||
| Identificadores | |||||||||
| Símbolo | Universidad de Michigan | ||||||||
| Pfam | PF02809 | ||||||||
| Interprofesional | IPR003903 | ||||||||
| SCOP2 | 1p9d / ALCANCE / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
En biología molecular, el motivo de interacción con ubiquitina ( UIM ), o " motivo LALAL ", es un motivo de secuencia de unos 20 residuos de aminoácidos , que se describió por primera vez en la subunidad 26S del proteasoma PSD4/RPN-10, que se sabe que reconoce la ubiquitina. [1] [2] Además, el UIM se encuentra, a menudo en matrices en tándem o triplete, en una variedad de proteínas implicadas en la ubiquitinación y el metabolismo de la ubiquitina, o que se sabe que interactúan con modificadores similares a la ubiquitina . Entre las proteínas UIM hay dos subgrupos diferentes de la familia UBP (hidrolasa carboxiterminal de ubiquitina) de enzimas desubiquitinantes, una proteína F-box, una familia de ubiquitina-ligasas (E3) que contienen HECT de plantas y varias proteínas que contienen dominios UBA y/o UBX asociados a la ubiquitina . [3] En la mayoría de estas proteínas, el UIM se presenta en múltiples copias y en asociación con otros dominios como UBA (INTERPRO), UBX (INTERPRO), dominio ENTH , EH (INTERPRO), VHS (INTERPRO), dominio SH3 , HECT , VWFA (INTERPRO), EF-hand de unión a calcio, WD-40 , F-box (INTERPRO), LIM , proteína quinasa , anquirina , PX , fosfatidilinositol 3 y 4-quinasa (INTERPRO), dominio C2 , OTU (INTERPRO), dominio DnaJ (INTERPRO), RING-finger (INTERPRO) o FYVE-finger (INTERPRO). Se ha demostrado que los UIM se unen a la ubiquitina y sirven como una señal de orientación específica importante para la monoubiquitinación. Por lo tanto, los UIM pueden tener varias funciones en el metabolismo de la ubiquitina , cada una de las cuales puede requerir diferentes cantidades de UIM. [4] [5] [6]
Es poco probable que el UIM forme un dominio proteico independiente . En cambio, en función del espaciamiento de los residuos conservados , el motivo probablemente forme una hélice alfa corta que se puede incrustar en diferentes pliegues proteicos . [2] A continuación, se enumeran algunas proteínas que se sabe que contienen un UIM:
- PSD4/RPN-10/S5 eucariota , una subunidad de unión a múltiples ubiquitinas del proteasoma 26S.
- Proteína 1 de la enfermedad de Machado-Joseph de vertebrados (ataxina-3), que actúa como una proteína de unión a histonas que regula la transcripción; los defectos en la ataxina-3 causan el trastorno neurodegenerativo enfermedad de Machado-Joseph (MJD).
- Epsina y epsina2 de vertebrados.
- Sustrato de la tirosina quinasa regulada por el factor de crecimiento de hepatocitos de vertebrados (HRS).
- Sustrato 15 del receptor del factor de crecimiento epidérmico de mamíferos (EPS15), que participa en la regulación del crecimiento celular .
- Sustrato del receptor del factor de crecimiento epidérmico de mamíferos EPS15R.
- Facetas líquidas (lqf) de Drosophila melanogaster (mosca de la fruta), una epsina.
- Proteína de clasificación vacuolar VPS27 de levadura , necesaria para el tráfico de membrana hacia la vacuola.
Referencias
- ^ Young P, Deveraux Q, Beal RE, Pickart CM, Rechsteiner M (marzo de 1998). "Caracterización de dos sitios de unión de poliubiquitina en la subunidad 5a de la proteasa 26 S". J. Biol. Chem . 273 (10): 5461–7. doi : 10.1074/jbc.273.10.5461 . PMID: 9488668.
- ^ ab Hofmann K, Falquet L (junio de 2001). "Un motivo de interacción con la ubiquitina conservado en componentes de los sistemas de degradación proteica proteosomal y lisosomal". Trends Biochem. Sci . 26 (6): 347–50. doi :10.1016/s0968-0004(01)01835-7. PMID 11406394.
- ^ Buchberger A (mayo de 2002). "De UBA a UBX: nuevas palabras en el vocabulario de la ubiquitina". Trends Cell Biol . 12 (5): 216–21. doi :10.1016/S0962-8924(02)02269-9. PMID 12062168.
- ^ Oldham CE, Mohney RP, Miller SL, Hanes RN, O'Bryan JP (julio de 2002). "Los motivos que interactúan con la ubiquitina se dirigen a la proteína adaptadora endocítica epsina para la ubiquitinación". Curr. Biol . 12 (13): 1112–6. doi : 10.1016/S0960-9822(02)00900-4 . PMID 12121618.
- ^ Riezman H (marzo de 2002). "Biología celular: la conexión con la ubiquitina". Nature . 416 (6879): 381–3. doi : 10.1038/416381a . PMID 11919614.
- ^ Reece DE, Barnett MJ, Connors JM, Fairey RN, Fay JW, Greer JP, Herzig GP, Herzig RH, Klingemann HG, LeMaistre CF (octubre de 1991). "Quimioterapia intensiva con ciclofosfamida, carmustina y etopósido seguida de trasplante autólogo de médula ósea para la enfermedad de Hodgkin recidivante". J. Clin. Oncol . 9 (10): 1871–9. doi :10.1200/JCO.1991.9.10.1871. PMID 1919637.
