Laberintomicetos

Clase de protistos que producen una red filamentosa

Laberintomicetos
Célula con red de filamentos ectoplasmáticos ( Aplanochytrium sp.)
Clasificación científica Editar esta clasificación
Dominio:Eucariota
Clado :Diaforéticos
Clado :RAE
Clado :Estramenopiles
Filo:Bigira
Subfilo:Sagenista
Clase:Labyrinthulomycetes
Arx, 1970, Dick, 2001
Pedidos [1]
Sinónimos
  • Labyrinthulomycota Whittaker, 1969
  • Página de Labyrinthomorpha en Levine et al., 1980
  • Oliva Labyrinthulea , 1975 ex Cavalier-Smith, 1989

Labyrinthulomycetes ( ICBN ) o Labyrinthulea [2] ( ICZN ) es una clase de protistos que producen una red de filamentos o tubos, [3] que sirven como pistas para que las células se deslicen y absorban nutrientes para ellas. Los dos grupos principales son los labyrinthulids (o redes de limo) y los thraustochytrids . Son en su mayoría marinos , comúnmente encontrados como parásitos en algas y pastos marinos o como descomponedores en material vegetal muerto. También incluyen algunos parásitos de invertebrados marinos y especies mixotróficas que viven en una relación simbiótica con zoochlorella . [4] [5] [6]

Características

Aunque se encuentran fuera de las células, los filamentos de los labyrinthulomycetes están rodeados por una membrana . Están formados y conectados con el citoplasma por un orgánulo único llamado sagenógeno o botrosoma. Las células no tienen núcleo y son típicamente ovoides, y se mueven de un lado a otro a lo largo de la red amorfa a velocidades que varían de 5 a 150 μm por minuto. Entre los labyrinthulids, las células están encerradas dentro de los tubos, y entre los thraustochytrids, están adheridas a sus lados.

Evolución

Origen evolutivo

Los labyrinthulomycetes no son hongos , sino un grupo monofilético de eucariotas dentro de Stramenopiles . Pertenecen al filo Bigyra , que contiene otros microorganismos heterótrofos como los bicosécidos . Considerando que los plástidos de Stramenopiles son posiblemente el resultado de un evento de endosimbiosis en su último ancestro común , los bicosécidos y los labyrinthulomycetes podrían haberse originado a partir de un ancestro común de algas mixotróficas que perdieron secundariamente sus plástidos. [3]

Algunas características de los labyrinthulomycetes pueden explicarse por su origen a partir de plástidos ancestrales. Producen ácidos grasos poliinsaturados omega-3 utilizando una desaturasa que suele estar presente en los cloroplastos . Las zoosporas de los labyrinthulids tienen una mancha ocular compuesta de gránulos unidos a membranas que se asemeja a las manchas oculares de los estramenopilos fotosintéticos, que se encuentran dentro de un plástido o se cree que derivan de un plástido. [3]

Dentro de Bigyra , los labyrinthulomycetes son el grupo hermano de Eogyrea , una clase que contiene la especie Pseudophyllomitus vesiculosus y el clado ambiental llamado MAST-4. Juntos componen el subfilo Sagenista . [7] [8]

Clasificación

Los labyrinthulomycetes o labyrinthulea solían formar parte del filo fúngico extinto Labyrinthulomycota. [9] Originalmente se los consideraba mohos mucilaginosos inusuales , aunque no son muy similares a los otros tipos. La estructura de sus zoosporas y los estudios genéticos muestran que son un grupo primitivo de heterocontos , pero su clasificación y tratamiento siguen siendo algo inciertos.

Esta clase generalmente contenía dos órdenes, Labyrinthulales y Thraustochytriales (ICBN), o Labyrinthulida y Thraustochytrida (ICZN), pero recientemente se ha propuesto una clasificación diferente. [6] [10] [11] [1] [9]

  • Orden Labyrinthulales/ Labyrinthulida E. A. Bessey 1950/Doffein 1901
    • Familia Aplanochytriaceae/Aplanochytriidae Leander ex Cavalier-Smith 2012
      • Aplanochytrium Bahnweg & Sparrow 1972 [= Labyrinthuloides Perkins 1973 ]
    • Familia Labyrinthulaceae/Labyrinthulidae Haeckel 1868/Cinekowksa 1867
      • Labyrinthomyxa Duboscq 1921
      • Pseudoplasmodium molisch 1925
      • Laberinto de Cienkowski 1864 [= Laberintodictio de Valkanov 1969 ; Laberintohorhiza de Chadefaud 1956 ]
    • Clado de nivel familiar "Stellarchytriaceae/Stellarchytriidae": este grupo se ubica provisionalmente en Labyrinthulida [9] [1] pero, según los análisis filogenéticos, diverge antes que el resto de clados labyrinthuleanos. [11]
      • Stellarchytrium FioRito y Leander 2016
  • Orden Oblongichytriales/Oblongichytrida
    • Familia Oblongichytriaceae/Oblongichytriidae Cavalier-Smith 2012
      • Oblongichytrium Yokoyama y Honda 2007
  • Orden Thraustochytriales / Thraustochytrida Gorrión 1973
    • Pirrhosorus Juel 1901
    • Franco y Arvy de Thanatostrea 1969
    • Familia Althornidiaceae/Althorniidae Jones y Alderman 1972
      • Althornia Jones y Alderman 1972
    • Familia Thraustochytriacae/ Thraustochytriidae Gorrión ex Cejp 1959
      • Japanochytrium Kobayasi y Ôkubo 1953
      • Monorhizochytrium Doi & Honda 2017
      • Sicyoidochytrium Yokoy., Salleh y Honda 2007
      • Aurantiochytrium Yokoy. y honda 2007
      • Ulkenia Gaertn. 1977
      • Parietichytrium Yokoy., Salleh y Honda 2007
      • Botryochytrium Yokoy., Salleh y Honda 2007
      • Schizochytrium Goldst. y Belsky enmienda. Booth y Mill.
      • Gorrión de Thraustochytrium 1936
      • Honda Amato y Cagnac 2018
      • Labyrinthulochytrium Hassett y Gradinger 2018 [12]
  • Orden "Amphitremidales"/ Amphitremida Gomaa et al. 2013
    • Familia "Amphitremidiaceae"/Amphitremidae Poch 1913
    • Familia "Diplophrydaceae"/Diplophryidae Cavalier-Smith 2012
      • Diplophrys Barker 1868
  • Orden "Amphifilales"/Amphifilida Cavalier Smith 2012
    • Familia Sorodiplophryidae Cavalier-Smith 2012
      • Sorodiplophrys Oliva y Dykstra 1975
      • Fibrophrys Takahashi y otros, 2016
    • Familia Amphifilidae Cavalier-Smith 2012
      • Género Amphifila Cavalier-Smith 2012

Código genético

El labyrinthulomycete Thraustochytrium aureum se destaca por el código genético alternativo de sus mitocondrias que utilizan TTA como codón de terminación en lugar de codificar leucina . [13] Este código está representado por la tabla de traducción 23 de NCBI , Código mitocondrial de Thraustochytrium . [14]

Código genético
Tabla de traducción
Codón de ADNCodón de ARNTraducción
con este código
Código estándar
(Tabla de traducción 1)
Mitocondria de Thraustochytrium23TTAUUAPARADA = Ter (*)Leu (izq.)

Referencias

  1. ^ abc Adl SM, Bass D, Lane CE, Lukeš J, Schoch CL, Smirnov A, Agatha S, Berney C, Brown MW, Burki F, Cárdenas P, Čepička I, Chistyakova L, del Campo J, Dunthorn M, Edvardsen B , Eglit Y, Guillou L, Hampl V, Heiss AA, Hoppenrath M, James TY, Karnkowska A, Karpov S, Kim E, Kolisko M, Kudryavtsev A, Lahr DJG, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Mann DG, Massana R, Mitchell EAD, Morrow C, Park JS, Pawlowski JW, Powell MJ, Richter DJ, Rueckert S, Shadwick L , Shimano S, Spiegel FW, Torruella G, Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q (2019). "Revisiones a la clasificación, nomenclatura y diversidad de eucariotas". Revista de microbiología eucariota . 66 (1): 4–119. doi :10.1111/jeu.12691. PMC  6492006 . PMID  30257078.
  2. ^ Cavalier-Smith, T. (1997). "Sagenista y bigyra, dos filos de cromistas heterokont heterótrofos". Archiv für Protistenkunde . 148 (3): 253–267. doi :10.1016/S0003-9365(97)80006-1.
  3. ^ abc Tsui, Clement KM; Marshall, Wyth; Yokoyama, Rinka; Honda, Daiske; Lippmeier, J Casey; Craven, Kelly D; Peterson, Paul D; Berbee, Mary L (enero de 2009). "Filogenia de Labyrinthulomycetes y sus implicaciones para la pérdida evolutiva de cloroplastos y la ganancia de deslizamiento ectoplasmático". Filogenética molecular y evolución . 50 (1): 129–40. doi :10.1016/j.ympev.2008.09.027. PMID  18977305.
  4. ^ Schärer, L.; Knoflach, D.; Vizoso, DB; Rieger, G.; Peintner, U. (2007). "Traustoquítridos como nuevos protistas parásitos de platelmintos marinos de vida libre: Thraustochytrium caudivorum sp. nov. Parasita a Macrostomum lignano" (PDF) . Biología Marina . 152 (5): 1095. doi :10.1007/s00227-007-0755-4. S2CID  4836350.
  5. ^ Pan, Jingwen (2016). Metaanálisis de la diversidad de Labyrinthulomycetes (MSc). Universidad de Columbia Británica. doi :10.14288/1.0223199.
  6. ^ ab Gomaa, Fatma; Mitchell, Edward AD; Lara, Enrique (2013). "Amphitremida (poche, 1913) es un nuevo clado importante y ubicuo de laberintomicetos". PLoS One . 8 (1): e53046. Bibcode :2013PLoSO...853046G. doi : 10.1371/journal.pone.0053046 . PMC 3544814 . PMID  23341921. 
  7. ^ Cavalier-Smith, Thomas (2017). "El reino Chromista y sus ocho filos: una nueva síntesis que enfatiza la orientación de las proteínas periplastídicas, la evolución del citoesqueleto y de los periplastídicos y las divergencias antiguas". Protoplasma . 255 (1): 297–357. doi :10.1007/s00709-017-1147-3. PMC 5756292 . PMID  28875267. 
  8. ^ Thakur, Rabindra; Shiratori, Takashi; Ishida, Ken-ichiro (2019). "Análisis filogenéticos multigénicos ricos en taxones resuelven la relación filogenética entre stramenopiles de ramificación profunda". Protist . 170 (5): 125682. doi :10.1016/j.protis.2019.125682. ISSN  1434-4610. PMID  31568885. S2CID  202865459.
  9. ^ abc Bennett, Reuel M.; Honda, D.; Beakes, Gordon W.; Thines, Marco (2017). "Capítulo 14. Labyrinthulomycota". En Archibald, John M.; Simpson, Alastair GB; Slamovits, Claudio H. (eds.). Manual de los protistas . Springer. págs. 507–542. doi :10.1007/978-3-319-28149-0_25. ISBN 978-3-319-28147-6.
  10. ^ Anderson, O. Roger; Cavalier-Smith, Thomas (2012). "Ultraestructura de Diplophrys parva, una nueva especie pequeña de agua dulce, y un análisis revisado de Labyrinthulea (Heterokonta)". Acta Protozoologica . 8 (1): 291–304. doi :10.4467/16890027AP.12.023.0783.
  11. ^ ab FioRito, Rebecca; Leander, Celeste; Leander, Brian (2016). "Caracterización de tres nuevas especies de Labyrinthulomycota aisladas de estrellas de mar ocre (Pisaster ochraceus)". Biología marina . 163 (8): 170. doi :10.1007/s00227-016-2944-5. S2CID  43399688.
  12. ^ Hassett, Brandon T.; Gradinger, Rolf (2018). "Nuevas especies de Labyrinthulea sapróbica (=Labyrinthulomycota) y la erección de un gen. nov. para resolver la polifilia molecular dentro de los aplanoquítridos". Journal of Eukaryotic Microbiology . 65 (4): 475–483. doi :10.1111/jeu.12494. hdl : 10037/13570 . ISSN  1550-7408. PMID  29265676. S2CID  46820836.
  13. ^ Wideman, Jeremy G.; Monier, Adam; Rodríguez-Martínez, Raquel; Leonard, Guy; Cook, Emily; Poirier, Camille; Maguire, Finlay; Milner, David S.; Irwin, Nicholas AT; Moore, Karen; Santoro, Alyson E. (25 de noviembre de 2019). "Diversidad inesperada del genoma mitocondrial revelada por genómica unicelular dirigida de protistos flagelados heterotróficos". Nature Microbiology . 5 (1): 154–165. doi :10.1038/s41564-019-0605-4. hdl : 10871/39819 . ISSN  2058-5276. PMID  31768028. S2CID  208279678.
  14. ^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. "Los códigos genéticos". Navegador de taxonomía . Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI), Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . . Consultado el 11 de agosto de 2016 .
  15. ^ Cienkowski, L. (1867). Ueber den Bau und die Entwicklung der Labyrinthuleen. Arco. micrófono. anat. , 3:274, [1].
  • Laberintomicota
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