Ligasa de formato-tetrahidrofolato
| Formato-tetrahidrofolato ligasa | |||||||||
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| Identificadores | |||||||||
| N.º CE | 6.3.4.3 | ||||||||
| N.º CAS | 9023-66-9 | ||||||||
| Bases de datos | |||||||||
| IntEnz | Vista de IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Entrada de BRENDA | ||||||||
| Expasí | Vista de NiceZyme | ||||||||
| BARRIL | Entrada de KEGG | ||||||||
| MetaCiclo | vía metabólica | ||||||||
| PRIAMO | perfil | ||||||||
| Estructuras del PDB | RCSB AP APBE APSUMA | ||||||||
| Ontología genética | AmiGO / QuickGO | ||||||||
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| Formato-tetrahidrofolato ligasa | |||||||||
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 La estructura cristalina de la formiltetrahidrofolato sintetasa de Moorella thermoacetica | |||||||||
| Identificadores | |||||||||
| Símbolo | Hermanos míos | ||||||||
| Pfam | PF01268 | ||||||||
| Clan Pfam | CL0023 | ||||||||
| Interprofesional | IPR000559 | ||||||||
| PROSITIO | PDOC00595 | ||||||||
| SCOP2 | 1fpm / ALCANCE / SUPFAM | ||||||||
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En enzimología , una ligasa de formato-tetrahidrofolato ( EC 6.3.4.3) es una enzima que cataliza la reacción química
- ATP + formato + tetrahidrofolato ADP + fosfato + 10-formiltetrahidrofolato
Los 3 sustratos de esta enzima son ATP , formato y tetrahidrofolato , mientras que sus 3 productos son ADP , fosfato y 10-formiltetrahidrofolato .
Esta enzima pertenece a la familia de las ligasas , específicamente a las que forman enlaces genéricos carbono-nitrógeno. Esta enzima participa en el metabolismo del glioxilato y del dicarboxilato y en la formación de un depósito de carbono por parte del folato .
En eucariotas la actividad FTHFS es expresada por una enzima multifuncional, la C-1-tetrahidrofolato sintasa (C1-THF sintasa), que también cataliza las actividades deshidrogenasa y ciclohidrolasa. Se conocen dos formas de síntesis de C1-THF, una se localiza en la matriz mitocondrial , mientras que la segunda es citoplasmática . [1] En ambas formas el dominio FTHFS consta de unos 600 residuos de aminoácidos y se localiza en la sección C-terminal de la C1-THF sintasa. En procariotas la actividad FTHFS es expresada por una enzima homotetramérica monofuncional de unos 560 residuos de aminoácidos. [2]
Nomenclatura
El nombre sistemático de esta clase de enzimas es formiato:tetrahidrofolato ligasa (formadora de ADP) . Otros nombres de uso común son:
- formiltetrahidrofolato sintetasa,
- 10-formiltetrahidrofolato sintetasa,
- formilasa tetrahidrofólica, y
- tetrahidrofolato formilasa.
Ejemplos
Los genes humanos que codifican las ligasas de formato-tetrahidrofolato incluyen:
Estudios estructurales
A finales de 2007, se han resuelto tres estructuras para esta clase de enzimas, con códigos de acceso PDB 1EG7, 1FP7 y 1FPM.
La estructura cristalina de la N(10)-formiltetrahidrofolato sintetasa de Moorella thermoacetica muestra que la subunidad está compuesta por tres dominios organizados alrededor de tres láminas beta mixtas . Hay dos cavidades entre dominios adyacentes . Una de ellas fue identificada como el sitio de unión del nucleótido mediante modelado de homología. El dominio grande contiene una lámina beta de siete cadenas rodeada de hélices en ambos lados. El segundo dominio contiene una lámina beta de cinco cadenas con dos hélices alfa empaquetadas en un lado mientras que las otras dos son una pared de la cavidad del sitio activo . El tercer dominio contiene una lámina beta de cuatro cadenas que forma un medio barril. El lado cóncavo está cubierto por dos hélices mientras que el lado convexo es otra pared de la cavidad grande. Es probable que Arg 97 esté involucrado en la unión del fosfato de formilo. La molécula tetramérica es relativamente plana con la forma de la letra X, y los sitios activos están ubicados al final de las subunidades lejos de la interfaz de la subunidad. [3]
Enzimas relacionadas
La reacción inversa que convierte el 10-formiltetrahidrofolato en tetrahidrofolato la realiza la formiltetrahidrofolato deshidrogenasa .
Referencias
- ^ Shannon KW, Rabinowitz JC (junio de 1988). "Aislamiento y caracterización del gen MIS1 de Saccharomyces cerevisiae que codifica la C1-tetrahidrofolato sintasa mitocondrial". J. Biol. Chem . 263 (16): 7717–25. doi : 10.1016/S0021-9258(18)68558-8 . PMID 2836393.
- ^ Lovell CR, Przybyla A, Ljungdahl LG (junio de 1990). "Estructura primaria de la sintetasa de formiltetrahidrofolato termoestable de Clostridium thermoaceticum". Bioquímica . 29 (24): 5687–94. doi :10.1021/bi00476a007. PMID 2200509.
- ^ Radfar R, Shin R, Sheldrick GM, Minor W, Lovell CR, Odom JD, Dunlap RB, Lebioda L (abril de 2000). "La estructura cristalina de la N(10)-formiltetrahidrofolato sintetasa de Moorella thermoacetica". Bioquímica . 39 (14): 3920–6. doi :10.1021/bi992790z. PMID 10747779.
Lectura adicional
- JAENICKE L, BRODE E (1961). "Investigación sobre compuestos monocarbonados. I. La tetrahidrofolato formilasa del hígado de paloma. Purificación y mecanismo". Biochem. Z. 334 : 108–32. PMID 13789141.
- Long CW; Levitzki A; Houston LL; Koshland DE, Jr (1969). "Estructuras de subunidades e interacciones de la CTP sintetasa". Fed. Proc . 28 : 342.
- RABINOWITZ JC, PRICER WE (1962). "Formiltetrahidrofolato sintetasa. I. Aislamiento y cristalización de la enzima". J. Biol. Chem . 237 (9): 2898–902. doi : 10.1016/S0021-9258(18)60248-0 . PMID: 14489619.
- Whiteley HR, Osborn MJ, Huennekens FM (1959). "Purificación y propiedades de la enzima activadora de formato de Micrococcus aerogenes". J. Biol. Chem . 234 (6): 1538–1543. doi : 10.1016/S0021-9258(18)70046-X . PMID 13654413.
