Haloarculáceas
| Haloarculáceas | |
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| Familia: | Haloarculáceas Gupta y otros, 2016 |
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Haloarculaceae es una familia de arqueas halófilas y mayoritariamente quimioorganotróficas dentro del orden Halobacteriales . [1] [2] [3] El género tipo de esta familia es Haloarcula . [4] Sus características bioquímicas son las mismas que las del orden Halobacteriales .
El nombre Haloarculaceae se deriva del término latino Haloarcula, que hace referencia al género tipo de la familia, y del sufijo "-ceae", una terminación que se utiliza para designar a una familia. En conjunto, Haloarculaceae hace referencia a una familia cuyo tipo nomenclatural es el género Haloarcula .
Taxonomía actual y firmas moleculares
A partir de 2021, Haloarculaceae contiene 10 géneros publicados válidamente. [4] Esta familia se puede distinguir molecularmente de otras Halobacteria por la presencia de 19 proteínas de firma conservadas (CSP) y siete indeles de firma conservados (CSI) presentes en las siguientes proteínas: acetilglutamato quinasa , ribonucleasa R, metalo-beta-lactamasa , enzima modificadora de ARNt, subunidad grande de la carbamoil fosfato sintasa y proteínas hipotéticas. [1]
Filogenia
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con relevancia en la nomenclatura (LPSN) [4] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [5]
| LTP basado en ARNr 16S _06_2022 [6] [7] [8] | 53 proteínas marcadoras basadas en GTDB 08-RS214 [9] [10] [11] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Nota: * Halobacteriaceae parafilética
Véase también
Referencias
- ^ ab Gupta, Radhey S.; Naushad, Sohail; Fabros, Reena; Adeolu, Mobolaji (2 de febrero de 2016). "Una reevaluación filogenómica de las divisiones a nivel familiar dentro de la clase Halobacteria: propuesta para dividir el orden Halobacteriales en las familias Halobacteriaceae, Haloarculaceae fam. nov. y Halococcaceae fam. nov., y el orden Haloferacales en las familias Haloferacaceae y Halorubraceae fam. nov". Antonie van Leeuwenhoek . 109 (4): 565–587. doi :10.1007/s10482-016-0660-2. ISSN 0003-6072. PMID 26837779. S2CID 254231068.
- ^ Conceder, William D.; Kamekura, Masahiro; McGenity, Terry J.; Ventosa, Antonio (14 de septiembre de 2015). "Clase de halobacterias. noviembre". Manual de sistemática de arqueas y bacterias de Bergey : 1. doi :10.1002/9781118960608.cbm00026. ISBN 9781118960608.
- ^ Oren, Aharon (1 de febrero de 2012). "Taxonomía de la familia Halobacteriaceae: un paradigma para cambiar conceptos en la sistemática de procariotas". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 62 (2): 263–271. doi : 10.1099/ijs.0.038653-0 . ISSN 1466-5026. PMID 22155757.
- ^ abc JP Euzéby. "Haloarculaceae". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 15 de agosto de 2023 .
- ^ Sayers; et al. "Haloarculaceae". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 15 de agosto de 2023 .
- ^ "El LTP" . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
- ^ "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
- ^ "Notas de la versión LTP_06_2022" (PDF) . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
- ^ "GTDB release 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
- ^ "ar53_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
- ^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
