Halococcus

Halococcus
Clasificación científica
Dominio:	Arqueas
Reino:	Euryarchaeota
Filo:	Euryarchaeota
Clase:	Halobacteria
Orden:	Halobacterias
Familia:	Halococcáceas
Género:	Halococcus; Escuela 1935
Especie tipo
	Halococcus litoralis; (Poulsen 1879) Schoop 1935
Especies
	H. agarilyticus; H. dombrowskii; H. hamelinensis; H. morrhuae; H. qingdaonensis; H. saccharolyticus; H. salifodinae; H. salsus; H. sedimentiminicola; H. thailandensis;

Género de arqueas

Halococcus (abreviatura común: Hcc. ) es un género de la familia Halococcaceae .

Ecología

Halococcus es un género de arqueas extremadamente halófilas, lo que significa que requieren altos niveles de sal, a veces hasta 32% de NaCl, para un crecimiento óptimo. Los halófilos se encuentran principalmente en cuerpos de agua continentales con alta salinidad, donde sus pigmentos (de una proteína llamada rodopsina) tiñen el sedimento de colores brillantes. La rodopsina y otras proteínas sirven para proteger a Halococcus de las salinidades extremas de sus entornos. Debido a que pueden funcionar en condiciones de salinidad tan altas, Halococcus y organismos halófilos similares se han utilizado en la industria alimentaria e incluso en productos para el cuidado de la piel.

Halococcus se encuentra en ambientes con altos niveles de sal, principalmente cuerpos de agua salada continentales, pero algunos pueden estar ubicados en suelos o alimentos altamente salados. Las proteínas pigmentadas en algunas especies causan el tinte rojizo que se encuentra en algunas áreas del Mar Muerto y el Gran Lago Salado, especialmente al final de la temporada de crecimiento. Cuando se cultivaban, los organismos crecían mejor en condiciones de alta salinidad. ^[2]

Estructura del genoma

Se ha secuenciado el genoma de varias especies de Halococcus. ^[3] El 16s rDNA de una especie ^{[ ¿cuál? ]} ha demostrado su ubicación en el árbol filogenético . Debido a la longevidad potencial de los organismos, Halococcus puede ser un buen candidato para explorar similitudes taxonómicas con la vida que se encuentra en el espacio exterior.

Estructura celular y metabolismo

Las especies de Halococcus pueden sobrevivir en hábitats de alta salinidad gracias a las bombas de cloro que mantienen el equilibrio osmótico con la salinidad de su hábitat y así evitan la deshidratación del citoplasma.

Las células son cocos de 0,6 a 1,5 micrómetros de largo con paredes de polisacáridos sulfatados. Las células son organótrofas, utilizan aminoácidos, ácidos orgánicos o carbohidratos para obtener energía. En algunos casos, también son capaces de realizar la fotosíntesis.

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con relevancia en la nomenclatura (LPSN) ^[1] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). ^[2]

LTP basado en ARNr 16S _06_2022 ^[4]^[5]^[6]

53 proteínas marcadoras basadas en GTDB 08-RS214 ^[7]^[8]^[9]

H. salifodinae Denner et al. 1994

	H. agarilyticus Minegishi et al. 2015

	H. saccharolyticus Montero et al. 1990

	H. hamelinensis Goh y otros, 2006

	H. salsus Chen y otros, 2018

H. sediminicola Yim et al. 2014

H. thailandensis Namwong et al. 2007

H. qingdaonensis Wang et al. 2007

	H. dombrowskii Stan-Lotter et al. 2002

	H. morrhuae (Farlow 1880) Kocur y Hodgkiss 1973

H. agarilyticus

	H. saccharolyticus

	H. salifodinae

	H. hamelinensis

	H. salsus

H. sedimentiminicola

H. morrhuae [incluido Halococcus dombrowskii ]

	H. qingdaonensis

	H. thailandensis

Véase también

Lista de géneros de Archaea

Referencias

^ de JP Euzéby. "Halococcus". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 17 de noviembre de 2021 .
^ ab Sayers; et al. "Halococcus". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 5 de junio de 2022 .
^ "Genomas completos: Halococcus".
^ "El LTP" . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
^ "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
^ "Notas de la versión LTP_06_2022" (PDF) . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
^ "GTDB release 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
^ "ar53_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .

Lectura adicional

Revistas científicas

Oren A, Ventosa A (2000). "Subcomité sobre taxonomía de Halobacteriaceae del Comité Internacional de Bacteriología Sistemática. Actas de las reuniones, 16 de agosto de 1999, Sydney, Australia". Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 50 (3): 1405–1407. doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID 10843089.
Schoop, G (1935). "Halococcus litoralis, un halófilo obligado Farbstofflbildner". Deutsche Tierärztliche Wochenschrift . 43 : 817–820.

Libros científicos

Gibbons, NE (1974). "Familia V. Halobacteriaceae fam. nov." En RE Buchanan; NE Gibbons (eds.). Manual de bacteriología determinante de Bergey (8.ª ed.). Baltimore: The Williams & Wilkins Co. ISBN 0-683-01117-0.

Este artículo relacionado con las arqueas es un esbozo . Puedes ayudar a Wikipedia expandiéndolo.

[LPSN-1] JP Euzéby. "Halococcus". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 17 de noviembre de 2021 .

[NCBI-2] Sayers; et al. "Halococcus". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 5 de junio de 2022 .

[3] "Genomas completos: Halococcus".

[4] "El LTP" . Consultado el 10 de mayo de 2023 .

[5] "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 10 de mayo de 2023 .

[6] "Notas de la versión LTP_06_2022" (PDF) . Consultado el 10 de mayo de 2023 .

[about-7] "GTDB release 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .

[tree-8] "ar53_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .

[taxon_history-9] "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .