Superfamilia del factor de necrosis tumoral

Superfamilia de proteínas
Superfamilia del factor de necrosis tumoral
Estructura trimérica del TNF alfa, producido por Mus musculus , basada en la estructura PDB 2TNF (resolución de 1,4 Å). Los diferentes colores representan diferentes monómeros. Baeyens, KJ et al. (1999). [1] Figura generada con FirstGlance Jmol.
Identificadores
SímboloFactor de necrosis tumoral
PfamPF00229
InterprofesionalIPR006052
PROSITIOPDOC00224
SCOP21tnf / ALCANCE / SUPFAM
Superfamilia OPM292
Proteína OPM2hew
Membranoma80
Estructuras de proteínas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
APPDB RCSB; PDBj
PDBsumaResumen de la estructura
Factor de necrosis tumoral
Estructura cristalina de trail-sdr5
Identificadores
SímboloFactor de necrosis tumoral
PfamPF00229
Clan PfamCL0100
ECOD10.3.1
InterprofesionalIPR006052
PROSITIOPDOC00561
SCOP21tnr / ALCANCE / SUPFAM
Estructuras de proteínas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
APPDB RCSB; PDBj
PDBsumaResumen de la estructura

La superfamilia del factor de necrosis tumoral ( TNF ) es una superfamilia de proteínas transmembrana de tipo II que contiene un dominio de homología del TNF y forma trímeros . Los miembros de esta superfamilia pueden liberarse de la membrana celular por escisión proteolítica extracelular y funcionan como una citocina . Estas proteínas se expresan predominantemente en células inmunes y regulan diversas funciones celulares, incluida la respuesta inmune y la inflamación, pero también la proliferación, la diferenciación, la apoptosis y la embriogénesis . [2] [3]

La superfamilia contiene 19 miembros que se unen a 29 miembros de la superfamilia del receptor TNF . [4] La aparición de ortólogos en invertebrados sugiere un origen antiguo de esta superfamilia en la evolución. [2]

El patrón PROSITE de esta superfamilia se encuentra en una lámina beta en la sección central de la proteína que se conserva en todos los miembros.

Miembros

Hay 19 miembros de la familia, clasificados numéricamente como TNFSF#, donde # indica el número de miembro, a veces seguido de una letra. [4] [2]

#TNFSFNombreSinónimosGeneFunción
1Linfotoxina alfaTNFβ, TNFSF1BLTAInducción de inflamación y respuesta antiviral, desarrollo de órganos linfoides secundarios , papel en la tumorigénesis.
2Factor de necrosis tumoralTNFα, Dif, Necrosina, TNFSF1A, ...Factor de necrosis tumoralRegulación de células inmunes, inducción de fiebre , caquexia , inflamación y apoptosis , inhibición de la tumorigénesis y replicación viral y respuesta a la sepsis.
3Linfotoxina betaTNFγLTBInducción de inflamación y respuesta antiviral, desarrollo de órganos linfoides secundarios , papel en la tumorigénesis.
4Ligando OX40CD252, Gp34, CD134LTNFSF4Activación de la respuesta inmune de las células T mediante coestimulación de células T
5Ligando CD40CD154, TRAMPA, Gp39, T-BAMCD40LGRegulación de la respuesta inmune adaptativa mediante la activación de las células presentadoras de antígenos
6Ligando FasCD178, APTL, CD95LFASLGRegulación de la homeostasis de las células T mediante la inducción de la apoptosis
7Ligando CD27CD70CD70Regulación de la activación de las células B y la homeostasis de las células T
8Ligando CD30CD153TNFSF8Inducción de apoptosis de células T y células B , prevención de autoinmunidad.
9Ligando CD1374 barriles por barrilTNFSF9
10Ligando inductor de apoptosis relacionado con TNFCD253, APO-2LTNFSF10Inhibición de la tumorigénesis , inducción de la apoptosis.
11Ligando activador del receptor del factor nuclear kappa-ΒCD254, OPGL, TRANCE, ODFTNFSF11Crecimiento tisular (en particular, regeneración y remodelación ósea), maduración de células dendríticas
12Inductor débil de apoptosis relacionado con el TNFAPO-3L, DR3LTNFSF12Regulación de la angiogénesis , inducción de la apoptosis.
13Un ligando que induce la proliferaciónCD256, ALTO-2, TRDL1TNFSF13Regulación del desarrollo de células B y supervivencia de células plasmáticas
13BFactor activador de células BCD257, BLyS, TALL-1, TNFSF20, ...TNFSF13BEstimulación de la proliferación y diferenciación de células B
14LUZCD258, HVEMLTNFSF14Estimulación de la proliferación de células T , regulación de la apoptosis
15Inhibidor del crecimiento endotelial vascularTL1, TL-1ATNFSF15Inhibición de la angiogénesis
18Miembro 18 de la superfamilia TNFGITRL, AITRL, TL-6TNFSF18Regulación de la supervivencia de las células T
19Ectodisplasina AED1-A1, ED1-A2AEDDesarrollo de los tejidos ectodérmicos

Referencias

  1. ^ Baeyens KJ, De Bondt HL, Raeymaekers A, Fiers W, De Ranter CJ (abril de 1999). "La estructura del factor de necrosis tumoral del ratón a una resolución de 1,4 A: hacia la modulación de su selectividad y trimerización". Acta Crystallographica Sección D . 55 (Pt 4): 772–8. Bibcode :1999AcCrD..55..772B. doi :10.1107/s0907444998018435. PMID  10089307.
  2. ^ abc La evolución del sistema inmunológico: conservación y diversificación . Ámsterdam: Elsevier. 2016. ISBN 978-0-12-801975-7. OCLC  950694824.
  3. ^ Abbas AK, Lichtman AH, Pillai S (mayo de 2017). Inmunología celular y molecular (Novena ed.). Filadelfia, Pensilvania. ISBN 978-0-323-47978-3.OCLC 973917896  .{{cite book}}: Mantenimiento de CS1: falta la ubicación del editor ( enlace )
  4. ^ ab Aggarwal BB, Gupta SC, Kim JH (enero de 2012). "Perspectivas históricas sobre el factor de necrosis tumoral y su superfamilia: 25 años después, un viaje dorado". Blood . 119 (3): 651–65. doi :10.1182/blood-2011-04-325225. PMC 3265196 . PMID  22053109. 
Este artículo incorpora texto de dominio público de Pfam e InterPro : IPR006052
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