TCF3

TCF3
Estructuras disponibles
AP	Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación del PDB
	2MH0, 2YPA, 2YPB, 3U5V
Identificadores
Alias	TCF3 , E2A, E47, ITF1, TCF-3, VDIR, bHLHb21, AGM8, factor de transcripción 3, p75
Identificaciones externas	OMIM : 147141; MGI : 98510; HomoloGene : 2408; Tarjetas genéticas : TCF3; OMA :TCF3 - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 19 (humano)
Fin	1.652.605 pb
Ubicación del gen ( ratón )
Cristo.	Cromosoma 10 (ratón)
Fin	80.269.481 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	eminencia ganglionar; ; zona ventricular; ; testículo derecho; ; testículo izquierdo; ; célula ductal pancreática; ; ganglio linfático; ; células de la médula ósea; ; gónada; ; apéndice; ; célula estromal del endometrio;
	Top expresado en
	zona ventricular; ; tubérculo genital; ; cola del embrión; ; prominencia mandibular; ; prominencia maxilar; ; labio; ; epiblast; ; segmento; ; pared abdominal; ; saco vitelino;
	Más datos de expresión de referencia
	; ; ; ;
	Más datos de expresión de referencia
Ontología genética
Función molecular	Unión del ADN; unión de ADN específica de secuencia; actividad de dimerización de proteínas; actividad de homodimerización de proteínas; Actividad del factor de transcripción que se une al ADN; proteína quinasa activada por mitógeno quinasa unión a quinasa; Elemento de respuesta a la vitamina D; Actividad coactivadora de la transcripción; unión del factor de transcripción; Unión específica de ADN a la secuencia de la región cis-reguladora de la ARN polimerasa II; Actividad represora de la transcripción de unión al ADN, específica de la ARN polimerasa II; Unión del factor de transcripción bHLH; Encuadernación de caja electrónica; unión a proteínas; actividad de heterodimerización de proteínas; Actividad del factor de transcripción de unión al ADN, específico de la ARN polimerasa II;
Componente celular	citoplasma; complejo regulador de la transcripción; Complejo regulador de la transcripción de la ARN polimerasa II; núcleo; mota nuclear; nucleoplasm; complejo que contiene proteínas;
Proceso biológico	diferenciación celular; regulación de la transcripción, plantilla de ADN; Regulación positiva de la diferenciación de las células musculares.; Regulación positiva de la actividad del factor de transcripción que se une al ADN.; Regulación negativa de la transcripción por la ARN polimerasa II; transcripción, con plantilla de ADN; desarrollo del sistema nervioso; Regulación positiva de la transcripción, con plantilla de ADN.; Regulación de la transición G1/S del ciclo celular mitótico; Compromiso del linaje de células B; regulación positiva del ciclo celular; Regulación positiva de la proliferación de células B.; Regulación positiva de la diferenciación neuronal.; Diferenciación de células B; recombinación de inmunoglobulina V(D)J; Regulación positiva de la transcripción por la ARN polimerasa II.; Regulación de la diferenciación de células madre hematopoyéticas;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	6929
	21423
	ENSG00000071564
	ENSMUSG00000020167
	P15923
	P15806
	NM_001136139 ; NM_003200 ; NM_001351778 ; NM_001351779
NM_001164147 ; NM_001164148 ; NM_001164149 ; NM_001164150 ; NM_001164151;
	NM_001164152 ; NM_001164153 ; NM_011548 ; NM_001378903 ; NM_001378904 ; NM_001378905 ; NM_001378908 ; NM_001378910 ; NM_001378912 ; NM_001378913 ; 378914
	NP_001129611 ; NP_003191 ; NP_001338707 ; NP_001338708
NP_001157619 ; NP_001157620 ; NP_001157621 ; NP_001157622 ; NP_001157623;
	NP_001157624 ; NP_001157625 ; NP_035678 ; NP_001365832 ; NP_001365833 ; NP_001365834 ; NP_001365837 ; NP_001365839 ; NP_001365841 ; NP_001365842 ; 365843
	Wikidatos
Ver/Editar humano	Ver/Editar ratón

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

El factor de transcripción 3 ( factores de unión al potenciador de inmunoglobulina E2A E12/E47 ), también conocido como TCF3 , es una proteína que en los humanos está codificada por el gen TCF3 . ^[5]^[6]^[7] Se ha demostrado que TCF3 mejora directamente la expresión de Hes1 (un objetivo bien conocido de la señalización Notch ). ^[8]

Función

Este gen codifica un miembro de la familia de factores de transcripción hélice-bucle-hélice de la proteína E (clase I) . Los dominios de transactivación 9aaTAD de las proteínas E y MLL son muy similares y ambos se unen al dominio KIX del mediador transcripcional general CBP. ^[9]^[10] Las proteínas E activan la transcripción uniéndose a secuencias reguladoras E-box en genes diana como heterodímeros u homodímeros, y son inhibidas por heterodimerización con proteínas inhibidoras de la unión al ADN (clase IV) hélice-bucle-hélice. Las proteínas E desempeñan un papel crítico en la linfopoyesis, y la proteína codificada es necesaria para el desarrollo de los linfocitos B y T. ^[5]

Este gen regula muchos procesos de desarrollo, como el desarrollo de los linfocitos y del sistema nervioso central (SNC). Las proteínas E participan en el desarrollo de los linfocitos. ^[11] Inician la transcripción uniéndose a las secuencias reguladoras E-box en los genes diana.

Importancia clínica

La eliminación de este gen o la disminución de la actividad de la proteína codificada pueden desempeñar un papel en las neoplasias malignas linfoides . Este gen también está involucrado en varias translocaciones cromosómicas que están asociadas con neoplasias malignas linfoides, incluidas la leucemia linfoblástica aguda de células pre-B (t(1;19), con PBX1 y t(17;19), con HLF), ^[12] leucemia infantil (t(19;19), con TFPT) y leucemia aguda (t(12;19), con ZNF384). ^[5]

Interacciones

Se ha demostrado que TCF3 interactúa con:

CBFA2T3 , ^[13]
CREBBP , ^[14]
ELK3 , ^[15]
EP300 , ^[14]
ID3 , ^[16]^[17]
LDB1 , ^[13]
LMX1A , ^[18]
LYL1 , ^[19]
MAPKAPK3 , ^[20]
MioD , ^[17]^[21]
Miogenina , ^[17]^[22]
PCAF , ^[14]
TAL1 ^[13]^[23]
TWIST1 , ^[24] y
UBE2I . ^[25]

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000071564 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000020167 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
^ abc "Entrez Gen: TCF3".
^ Henthorn P, McCarrick-Walmsley R, Kadesch T (febrero de 1990). "Secuencia del ADNc que codifica ITF-1, un factor de transcripción de acción positiva". Nucleic Acids Research . 18 (3): 677. doi :10.1093/nar/18.3.677. PMC 333499 . PMID 2308859.
^ Kamps MP, Murre C, Sun XH, Baltimore D (febrero de 1990). "Un nuevo gen homeobox contribuye al dominio de unión al ADN de la proteína de translocación t(1;19) en la leucemia linfoblástica aguda pre-B". Cell . 60 (4): 547–555. doi :10.1016/0092-8674(90)90658-2. PMID 1967983. S2CID 39661371.
^ Las proteínas E y la señalización Notch cooperan para promover la especificación y el compromiso del linaje de células T
^ Piskacek S, Gregor M, Nemethova M, Grabner M, Kovarik P, Piskacek M (junio de 2007). "Dominio de transactivación de nueve aminoácidos: utilidades de establecimiento y predicción". Genomics . 89 (6): 756–768. doi :10.1016/j.ygeno.2007.02.003. PMID 17467953.
^ Piskacek M, Vasku A, Hajek R, Knight A (marzo de 2015). "Características estructurales compartidas de la familia 9aaTAD en complejo con CBP". Molecular BioSystems . 11 (3): 844–851. doi : 10.1039/c4mb00672k . PMID 25564305.
^ Quong MW, Romanow WJ, Murre C (2002). "Función de la proteína E en el desarrollo de los linfocitos". Revisión anual de inmunología . 20 : 301–322. doi :10.1146/annurev.immunol.20.092501.162048. PMID 11861605.
^ Herblot S, Aplan PD, Hoang T (febrero de 2002). "Gradiente de actividad de E2A en el desarrollo de células B". Biología molecular y celular . 22 (3): 886–900. doi :10.1128/MCB.22.3.886-900.2002. PMC 133542 . PMID 11784864.
^ abc Goardon N, Lambert JA, Rodriguez P, Nissaire P, Herblot S, Thibault P, et al. (enero de 2006). "ETO2 coordina la proliferación y diferenciación celular durante la eritropoyesis". The EMBO Journal . 25 (2): 357–366. doi :10.1038/sj.emboj.7600934. PMC 1383517 . PMID 16407974.
^ abc Bradney C, Hjelmeland M, Komatsu Y, Yoshida M, Yao TP, Zhuang Y (enero de 2003). "Regulación de las actividades de E2A por las acetiltransferasas de histonas en el desarrollo de los linfocitos B". The Journal of Biological Chemistry . 278 (4): 2370–2376. doi : 10.1074/jbc.M211464200 . PMID 12435739.
^ Maira SM, Wurtz JM, Wasylyk B (noviembre de 1996). "Net (ERP/SAP2), uno de los TCF inducibles por Ras, tiene un nuevo dominio inhibidor con semejanza con el motivo hélice-bucle-hélice". The EMBO Journal . 15 (21): 5849–5865. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00972.x. PMC 452333 . PMID 8918463.
^ Deed RW, Jasiok M, Norton JD (abril de 1998). "Expresión linfoide específica del gen Id3 en células hematopoyéticas. Antagonismo selectivo de la proteína básica hélice-bucle-hélice E2A asociada con la diferenciación inducida por Id3 de células eritroleucémicas". The Journal of Biological Chemistry . 273 (14): 8278–8286. doi : 10.1074/jbc.273.14.8278 . PMID 9525934.
^ abc Langlands K, Yin X, Anand G, Prochownik EV (agosto de 1997). "Interacciones diferenciales de proteínas Id con factores de transcripción de hélice básica-bucle-hélice". The Journal of Biological Chemistry . 272 (32): 19785–19793. doi : 10.1074/jbc.272.32.19785 . PMID 9242638.
^ Johnson JD, Zhang W, Rudnick A, Rutter WJ, German MS (julio de 1997). "Sinergia transcripcional entre proteínas con homeodominio LIM y proteínas básicas hélice-bucle-hélice: el dominio LIM2 determina la especificidad". Biología molecular y celular . 17 (7): 3488–3496. doi :10.1128/mcb.17.7.3488. PMC 232202 . PMID 9199284.
^ Miyamoto A, Cui X, Naumovski L, Cleary ML (mayo de 1996). "Las proteínas hélice-bucle-hélice LYL1 y E2a forman complejos heterodiméricos con propiedades distintivas de unión al ADN en células hematolinfoides". Biología molecular y celular . 16 (5): 2394–2401. doi :10.1128/mcb.16.5.2394. PMC 231228 . PMID 8628307.
^ Neufeld B, Grosse-Wilde A, Hoffmeyer A, Jordan BW, Chen P, Dinev D, et al. (julio de 2000). "Las quinasas de serina/treonina 3pK y la proteína quinasa 2 activada por MAPK interactúan con el factor de transcripción básico hélice-bucle-hélice E47 y reprimen su actividad transcripcional". The Journal of Biological Chemistry . 275 (27): 20239–20242. doi : 10.1074/jbc.C901040199 . PMID 10781029.
^ Maleki SJ, Royer CA, Hurlburt BK (junio de 1997). "Los heterodímeros MyoD-E12 y los homodímeros MyoD-MyoD son igualmente estables". Bioquímica . 36 (22): 6762–6767. doi :10.1021/bi970262m. PMID 9184158.
^ Chakraborty T, Martin JF, Olson EN (septiembre de 1992). "Análisis de la oligomerización de productos de miogenina y E2A in vivo utilizando un sistema de ensayo de dos híbridos". The Journal of Biological Chemistry . 267 (25): 17498–17501. doi : 10.1016/S0021-9258(19)37069-3 . PMID 1325437.
^ Hsu HL, Wadman I, Baer R (abril de 1994). "Formación de complejos in vivo entre los polipéptidos TAL1 y E2A de las células T leucémicas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 91 (8): 3181–3185. Bibcode :1994PNAS...91.3181H. doi : 10.1073/pnas.91.8.3181 . PMC 43539 . PMID 8159721.
^ El Ghouzzi V, Legeai-Mallet L, Aresta S, Benoist C, Munnich A, de Gunzburg J, et al. (marzo de 2000). "Las mutaciones de Saethre-Chotzen causan degradación de la proteína TWIST o localización nuclear alterada". Human Molecular Genetics . 9 (5): 813–819. doi : 10.1093/hmg/9.5.813 . PMID 10749989.
^ Huggins GS, Chin MT, Sibinga NE, Lee SL, Haber E, Lee ME (octubre de 1999). "Caracterización de los sitios de unión de mUBC9 necesarios para la degradación de la proteína E2A". The Journal of Biological Chemistry . 274 (40): 28690–28696. doi : 10.1074/jbc.274.40.28690 . PMID 10497239.

Lectura adicional

LeBrun DP (mayo de 2003). "Factores de transcripción hélice-bucle-hélice básicos E2A en la leucemia humana". Frontiers in Bioscience . 8 (1–3): s206–s222. doi : 10.2741/1030 . PMID 12700034.

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que se encuentra en el dominio público .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000071564 – Ensembl , mayo de 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000020167 – Ensembl , mayo de 2017

[3] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[4] "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .

[entrez_6929-5] "Entrez Gen: TCF3".

[pmid2308859-6] Henthorn P, McCarrick-Walmsley R, Kadesch T (febrero de 1990). "Secuencia del ADNc que codifica ITF-1, un factor de transcripción de acción positiva". Nucleic Acids Research . 18 (3): 677. doi :10.1093/nar/18.3.677. PMC 333499 . PMID 2308859.

[pmid1967983-7] Kamps MP, Murre C, Sun XH, Baltimore D (febrero de 1990). "Un nuevo gen homeobox contribuye al dominio de unión al ADN de la proteína de translocación t(1;19) en la leucemia linfoblástica aguda pre-B". Cell . 60 (4): 547–555. doi :10.1016/0092-8674(90)90658-2. PMID 1967983. S2CID 39661371.

[8] Las proteínas E y la señalización Notch cooperan para promover la especificación y el compromiso del linaje de células T

[9] Piskacek S, Gregor M, Nemethova M, Grabner M, Kovarik P, Piskacek M (junio de 2007). "Dominio de transactivación de nueve aminoácidos: utilidades de establecimiento y predicción". Genomics . 89 (6): 756–768. doi :10.1016/j.ygeno.2007.02.003. PMID 17467953.

[10] Piskacek M, Vasku A, Hajek R, Knight A (marzo de 2015). "Características estructurales compartidas de la familia 9aaTAD en complejo con CBP". Molecular BioSystems . 11 (3): 844–851. doi : 10.1039/c4mb00672k . PMID 25564305.

[11] Quong MW, Romanow WJ, Murre C (2002). "Función de la proteína E en el desarrollo de los linfocitos". Revisión anual de inmunología . 20 : 301–322. doi :10.1146/annurev.immunol.20.092501.162048. PMID 11861605.

[12] Herblot S, Aplan PD, Hoang T (febrero de 2002). "Gradiente de actividad de E2A en el desarrollo de células B". Biología molecular y celular . 22 (3): 886–900. doi :10.1128/MCB.22.3.886-900.2002. PMC 133542 . PMID 11784864.

[pmid16407974-13] Goardon N, Lambert JA, Rodriguez P, Nissaire P, Herblot S, Thibault P, et al. (enero de 2006). "ETO2 coordina la proliferación y diferenciación celular durante la eritropoyesis". The EMBO Journal . 25 (2): 357–366. doi :10.1038/sj.emboj.7600934. PMC 1383517 . PMID 16407974.

[pmid12435739-14] Bradney C, Hjelmeland M, Komatsu Y, Yoshida M, Yao TP, Zhuang Y (enero de 2003). "Regulación de las actividades de E2A por las acetiltransferasas de histonas en el desarrollo de los linfocitos B". The Journal of Biological Chemistry . 278 (4): 2370–2376. doi : 10.1074/jbc.M211464200 . PMID 12435739.

[pmid8918463-15] Maira SM, Wurtz JM, Wasylyk B (noviembre de 1996). "Net (ERP/SAP2), uno de los TCF inducibles por Ras, tiene un nuevo dominio inhibidor con semejanza con el motivo hélice-bucle-hélice". The EMBO Journal . 15 (21): 5849–5865. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00972.x. PMC 452333 . PMID 8918463.

[pmid9525934-16] Deed RW, Jasiok M, Norton JD (abril de 1998). "Expresión linfoide específica del gen Id3 en células hematopoyéticas. Antagonismo selectivo de la proteína básica hélice-bucle-hélice E2A asociada con la diferenciación inducida por Id3 de células eritroleucémicas". The Journal of Biological Chemistry . 273 (14): 8278–8286. doi : 10.1074/jbc.273.14.8278 . PMID 9525934.

[pmid9242638-17] Langlands K, Yin X, Anand G, Prochownik EV (agosto de 1997). "Interacciones diferenciales de proteínas Id con factores de transcripción de hélice básica-bucle-hélice". The Journal of Biological Chemistry . 272 (32): 19785–19793. doi : 10.1074/jbc.272.32.19785 . PMID 9242638.

[pmid9199284-18] Johnson JD, Zhang W, Rudnick A, Rutter WJ, German MS (julio de 1997). "Sinergia transcripcional entre proteínas con homeodominio LIM y proteínas básicas hélice-bucle-hélice: el dominio LIM2 determina la especificidad". Biología molecular y celular . 17 (7): 3488–3496. doi :10.1128/mcb.17.7.3488. PMC 232202 . PMID 9199284.

[pmid8628307-19] Miyamoto A, Cui X, Naumovski L, Cleary ML (mayo de 1996). "Las proteínas hélice-bucle-hélice LYL1 y E2a forman complejos heterodiméricos con propiedades distintivas de unión al ADN en células hematolinfoides". Biología molecular y celular . 16 (5): 2394–2401. doi :10.1128/mcb.16.5.2394. PMC 231228 . PMID 8628307.

[pmid10781029-20] Neufeld B, Grosse-Wilde A, Hoffmeyer A, Jordan BW, Chen P, Dinev D, et al. (julio de 2000). "Las quinasas de serina/treonina 3pK y la proteína quinasa 2 activada por MAPK interactúan con el factor de transcripción básico hélice-bucle-hélice E47 y reprimen su actividad transcripcional". The Journal of Biological Chemistry . 275 (27): 20239–20242. doi : 10.1074/jbc.C901040199 . PMID 10781029.

[pmid9184158-21] Maleki SJ, Royer CA, Hurlburt BK (junio de 1997). "Los heterodímeros MyoD-E12 y los homodímeros MyoD-MyoD son igualmente estables". Bioquímica . 36 (22): 6762–6767. doi :10.1021/bi970262m. PMID 9184158.

[pmid1325437-22] Chakraborty T, Martin JF, Olson EN (septiembre de 1992). "Análisis de la oligomerización de productos de miogenina y E2A in vivo utilizando un sistema de ensayo de dos híbridos". The Journal of Biological Chemistry . 267 (25): 17498–17501. doi : 10.1016/S0021-9258(19)37069-3 . PMID 1325437.

[pmid8159721-23] Hsu HL, Wadman I, Baer R (abril de 1994). "Formación de complejos in vivo entre los polipéptidos TAL1 y E2A de las células T leucémicas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 91 (8): 3181–3185. Bibcode :1994PNAS...91.3181H. doi : 10.1073/pnas.91.8.3181 . PMC 43539 . PMID 8159721.

[pmid10749989-24] El Ghouzzi V, Legeai-Mallet L, Aresta S, Benoist C, Munnich A, de Gunzburg J, et al. (marzo de 2000). "Las mutaciones de Saethre-Chotzen causan degradación de la proteína TWIST o localización nuclear alterada". Human Molecular Genetics . 9 (5): 813–819. doi : 10.1093/hmg/9.5.813 . PMID 10749989.

[pmid10497239-25] Huggins GS, Chin MT, Sibinga NE, Lee SL, Haber E, Lee ME (octubre de 1999). "Caracterización de los sitios de unión de mUBC9 necesarios para la degradación de la proteína E2A". The Journal of Biological Chemistry . 274 (40): 28690–28696. doi : 10.1074/jbc.274.40.28690 . PMID 10497239.