Complejo citocromo b6f

Enzima
Complejo citocromo b6f
Estructura cristalina del complejo citocromo b6f de C. reinhardtii ( 1q90 ). Los límites hidrocarbonados de la bicapa lipídica se muestran mediante líneas rojas y azules (lado del espacio tilacoide y lado del estroma, respectivamente).
Identificadores
SímboloB6F
Base de datos de datos termodinámica3.D.3
Superfamilia OPM92
Proteína OPM4pv1
Membranoma258
Complejo citocromo b 6 f
Identificadores
N.º CE7.1.1.6
N.º CAS79079-13-3
Nombres alternativosPlastoquinol/plastocianina reductasa
Bases de datos
IntEnzVista de IntEnz
BRENDAEntrada de BRENDA
ExpasíVista de NiceZyme
BARRILEntrada de KEGG
MetaCiclovía metabólica
PRIAMOperfil
Estructuras del PDBRCSB AP APBE APSUMA
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Compañía Médica Protegidaartículos
PubMedartículos
Instituto Nacional de BiologíaProteínas

El complejo citocromo b 6 f (plastoquinol/plastocianina reductasa o plastoquinol/plastocianina oxidorreductasa; EC 7.1.1.6) es una enzima que se encuentra en la membrana tilacoide de los cloroplastos de plantas, cianobacterias y algas verdes , que cataliza la transferencia de electrones del plastoquinol a la plastocianina :

plastoquinol + 2 plastocianinas oxidadas + 2 H + [lado 1] plastoquinona + 2 plastocianinas reducidas + 4 H + [lado 2]. [1] {\displaystyle \arponesderechoizquierdo}

La reacción es análoga a la reacción catalizada por el citocromo bc 1 (complejo III) de la cadena de transporte de electrones mitocondrial . Durante la fotosíntesis , el complejo citocromo b 6 f es un paso a lo largo de la cadena que transfiere electrones del fotosistema II al fotosistema I y, al mismo tiempo, bombea protones al espacio tilacoide, lo que contribuye a la generación de un gradiente electroquímico (energético) [2] que luego se utiliza para sintetizar ATP a partir de ADP .

Estructura de la enzima

El complejo citocromo b 6 f es un dímero, y cada monómero está compuesto por ocho subunidades. [3] Estas consisten en cuatro subunidades grandes: un citocromo f de 32 kDa con un citocromo de tipo c, un citocromo b 6 de 25 kDa con un grupo hemo de potencial bajo y alto, una proteína de hierro-azufre de Rieske de 19 kDa que contiene un grupo [2Fe-2S] y una subunidad IV de 17 kDa; junto con cuatro subunidades pequeñas (3-4 kDa): PetG, PetL, PetM y PetN. [3] [4] El peso molecular total es de 217 kDa.

Se han determinado las estructuras cristalinas de los complejos de citocromo b 6 f de Chlamydomonas reinhardtii , Mastigocladus laminosus y Nostoc sp. PCC 7120. [2] [5] [6] [7] [8] [9]

El núcleo del complejo es estructuralmente similar al núcleo del citocromo bc 1. El citocromo b 6 y la subunidad IV son homólogos del citocromo b , [10] y las proteínas de hierro-azufre de Rieske de los dos complejos son homólogas. [11] Sin embargo, el citocromo f y el citocromo c 1 no son homólogos. [12]

El citocromo b 6 f contiene siete grupos prostéticos . [13] [14] Cuatro de ellos se encuentran tanto en el citocromo b 6 f como en el bc 1 : el hemo de tipo c del citocromo c 1 y f, los dos hemo de tipo b (b p y b n ) en bc 1 y b 6 f, y el grupo [2Fe-2S] de la proteína Rieske. Se encuentran tres grupos prostéticos únicos en el citocromo b 6 f: clorofila a , β-caroteno y hemo c n (también conocido como hemo x). [5]

El espacio intermonómero dentro del núcleo del dímero del complejo citocromo b6f está ocupado por lípidos, [9] lo que proporciona direccionalidad a la transferencia de electrones hemo-hemo a través de la modulación del entorno dieléctrico intraproteico. [15]

Subunidad 6 del complejo citocromo b6-f (PetL)
Identificadores
Símbolo?
PfamPF05115
InterprofesionalIPR007802
Estructuras de proteínas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
APPDB RCSB; PDBj
PDBsumaResumen de la estructura

Función biológica

Mutante del citocromo b 6 f del tabaco ( Nicotiana tabacum ) (derecha) junto a una planta normal. Las plantas se utilizan en la investigación de la fotosíntesis para investigar la fotofosforilación cíclica.

En la fotosíntesis , el complejo citocromo b 6 f funciona para mediar la transferencia de electrones y de energía entre los dos complejos del centro de reacción fotosintético, el fotosistema II y el fotosistema I , mientras transfiere protones desde el estroma del cloroplasto a través de la membrana tilacoide hasta el lumen . [2] El transporte de electrones a través del citocromo b 6 f es responsable de crear el gradiente de protones que impulsa la síntesis de ATP en los cloroplastos. [4]

En una reacción separada, el complejo citocromo b 6 f juega un papel central en la fotofosforilación cíclica , cuando el NADP + no está disponible para aceptar electrones de la ferredoxina reducida . [16] Este ciclo, impulsado por la energía de P700 + , contribuye a la creación de un gradiente de protones que se puede utilizar para impulsar la síntesis de ATP. Se ha demostrado que este ciclo es esencial para la fotosíntesis, [17] ayudando a mantener la proporción adecuada de producción de ATP/NADPH para la fijación de carbono . [18] [19]

Las reacciones de desprotonación-oxidación de quinol del lado p dentro del complejo citocromo b6f se han implicado en la generación de especies reactivas de oxígeno. [20] Se ha sugerido que una molécula de clorofila integral ubicada dentro del sitio de oxidación de quinol realiza una función estructural, no fotoquímica, en la mejora de la tasa de formación de especies reactivas de oxígeno, posiblemente para proporcionar una vía redox para la comunicación intracelular. [21]

Mecanismo de reacción

El complejo citocromo b 6 f es responsable de la transferencia de electrones " no cíclica " (1) y " cíclica " (2) entre dos transportadores redox móviles, plastoquinol (QH 2 ) y plastocianina (Pc):

H2Ofotosistema IIQH 2Cita b 6 fOrdenador personalfotosistema INadph(1)
QH 2Cita b 6 fOrdenador personalfotosistema IQ(2)

El citocromo b 6 f cataliza la transferencia de electrones del plastoquinol a la plastocianina, mientras bombea dos protones desde el estroma hacia el lumen del tilacoide:

QH 2 + 2Pc(Cu 2+ ) + 2H + (estroma) → Q + 2Pc(Cu + ) + 4H + (lumen) [16]

Esta reacción ocurre a través del ciclo Q como en el Complejo III. [22] El plastoquinol actúa como transportador de electrones, transfiriendo sus dos electrones a cadenas de transporte de electrones (CTE) de alto y bajo potencial a través de un mecanismo llamado bifurcación de electrones . [23] El complejo contiene hasta tres moléculas de plastoquinona que forman una red de transferencia de electrones que son responsables del funcionamiento del ciclo Q y sus funciones de detección redox y catalíticas en la fotosíntesis. [24]

Ciclo Q

Ciclo Q del citocromo b 6 f

Primera mitad del ciclo Q

  1. El QH 2 se une al lado "p" positivo (lado del lumen) del complejo. Se oxida a una semiquinona (SQ) por el centro de hierro-azufre (cadena de transporte de electrones de alto potencial) y libera dos protones al lumen del tilacoide [ cita requerida ] .
  2. El centro de hierro-azufre reducido transfiere su electrón a través del citocromo f a Pc.
  3. En la cadena de transporte de electrones de bajo potencial, SQ transfiere su electrón al hemo b p del citocromo b6.
  4. El hemo b p luego transfiere el electrón al hemo b n .
  5. El hemo b n reduce Q con un electrón para formar SQ.

Segunda mitad del ciclo Q

  1. Un segundo QH 2 se une al complejo.
  2. En la cadena de transporte de electrones de alto potencial, un electrón reduce otro Pc oxidado.
  3. En la cadena de transporte de electrones de bajo potencial, el electrón del hemo b n se transfiere a SQ, y el Q 2− completamente reducido toma dos protones del estroma para formar QH 2 .
  4. El Q oxidado y el QH 2 reducido que se ha regenerado se difunden en la membrana.

Transferencia cíclica de electrones

A diferencia del complejo III, el citocromo b 6 f cataliza otra reacción de transferencia de electrones que es fundamental para la fotofosforilación cíclica . El electrón de la ferredoxina (Fd) se transfiere a la plastoquinona y luego al complejo citocromo b 6 f para reducir la plastocianina, que es reoxidada por P700 en el fotosistema I. [25] El mecanismo exacto de la reducción de la plastoquinona por la ferredoxina aún está bajo investigación. Una propuesta es que existe una ferredoxina:plastoquinona-reductasa o una NADP deshidrogenasa. [25] Dado que el hemo x no parece ser necesario para el ciclo Q y no se encuentra en el complejo III, se ha propuesto que se utiliza para la fotofosforilación cíclica mediante el siguiente mecanismo: [23] [26]

  1. Fd (rojo) + hemo x (buey) → Fd (buey) + hemo x (rojo)
  2. hemo x (rojo) + Fd (rojo) + Q + 2H + → hemo x (buey) + Fd (buey) + QH 2

Referencias

  1. ^ ExplorEnz: CE 7.1.1.6
  2. ^ abc Hasan SS, Yamashita E, Baniulis D, Cramer WA (marzo de 2013). "Vías de transferencia de protones dependientes de quinona en el complejo fotosintético del citocromo b6f". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 110 (11): 4297–302. doi : 10.1073/pnas.1222248110 . PMC  3600468 . PMID  23440205.
  3. ^ ab Whitelegge JP, Zhang H, Aguilera R, Taylor RM, Cramer WA (octubre de 2002). "Cromatografía líquida con espectrometría de masas de ionización por electrospray (LCMS+) de cobertura total de subunidades de un complejo de proteína de membrana oligomérica: citocromo b(6)f de espinaca y la cianobacteria Mastigocladus laminosus". Molecular & Cellular Proteomics . 1 (10): 816–27. doi : 10.1074/mcp.m200045-mcp200 . PMID  12438564.
  4. ^ ab Voet DJ, Voet JG (2011). Bioquímica . Nueva York, Nueva York: Wiley, J. ISBN 978-0-470-57095-1.
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  6. ^ Yamashita E, Zhang H, Cramer WA (junio de 2007). "Estructura del complejo citocromo b6f: inhibidores de análogos de quinona como ligandos del grupo hemo". Journal of Molecular Biology . 370 (1): 39–52. doi :10.1016/j.jmb.2007.04.011. PMC 1993820 . PMID  17498743. 
  7. ^ Baniulis D, Yamashita E, Whitelegge JP, Zatsman AI, Hendrich MP, Hasan SS, Ryan CM, Cramer WA (abril de 2009). "Estructura-función, estabilidad y modificación química del complejo cianobacteriano citocromo b6f de Nostoc sp. PCC 7120". Revista de química biológica . 284 (15): 9861–9. doi : 10.1074/jbc.M809196200 . PMC 2665108 . PMID  19189962. 
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Lectura adicional

  • Sarewicz, M; Pintscher, S; Pietras, R; Borek, A; Bujnowicz, Ł; Hanke, G; Cramer, WA; Finazzi, G; Osyczka, A (24 de febrero de 2021). "Reacciones catalíticas y conservación de energía en los complejos de citocromo bc(1) y b(6)f de membranas transductoras de energía". Chemical Reviews . 121 (4): 2020–2108. doi : 10.1021/acs.chemrev.0c00712 . PMC  7908018 . PMID  33464892.
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