La ADN-liasa (sitio apurínico o apirimidínico) es una enzima que en los humanos está codificada por el gen APEX1 .
Los sitios apurínicos/apirimidínicos (AP) (también llamados "sitios abásicos") aparecen con frecuencia en las moléculas de ADN por hidrólisis espontánea, por agentes que dañan el ADN o por ADN glicosilasas que eliminan bases anormales específicas. Los sitios AP son lesiones premutagénicas que pueden impedir la replicación normal del ADN. Todas las células, desde los procariotas simples hasta los humanos, han desarrollado sistemas para identificar y reparar dichos sitios. Las endonucleasas AP de clase II escinden la cadena principal de fosfodiéster en el sentido 5' del sitio AP, iniciando así un proceso conocido como reparación por escisión de bases (BER). El gen APEX (también llamado APE1, HAP1, APEN) codifica la principal endonucleasa AP en las células humanas. Se han encontrado variantes de empalme para este gen; todas codifican la misma proteína. [5]
^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000100823 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000035960 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Entrez Gene: APEX1 nucleasa APEX (enzima multifuncional de reparación del ADN) 1".
^ Parker A, Gu Y, Mahoney W, Lee SH, Singh KK, Lu AL (febrero de 2001). "El homólogo humano de la proteína reparadora MutY (hMYH) interactúa físicamente con las proteínas implicadas en la reparación por escisión de bases de ADN de parches largos". The Journal of Biological Chemistry . 276 (8): 5547–55. doi : 10.1074/jbc.M008463200 . PMID 11092888.
^ Dianova II, Bohr VA, Dianov GL (octubre de 2001). "Interacción de la endonucleasa AP 1 humana con la endonucleasa 1 del colgajo y el antígeno nuclear de células proliferantes implicado en la reparación por escisión de la base con parche largo". Bioquímica . 40 (42): 12639–44. doi :10.1021/bi011117i. PMID 11601988.
^ Vidal AE, Boiteux S, Hickson ID, Radicella JP (noviembre de 2001). "XRCC1 coordina las etapas iniciales y tardías de la reparación del sitio abásico del ADN a través de interacciones proteína-proteína". The EMBO Journal . 20 (22): 6530–9. doi :10.1093/emboj/20.22.6530. PMC 125722 . PMID 11707423.
^ Li M, Yang X, Lu X, Dai N, Zhang S, Cheng Y, et al. (junio de 2018). "La deficiencia de APE1 promueve la senescencia celular y las características del envejecimiento prematuro". Nucleic Acids Research . 46 (11): 5664–5677. doi :10.1093/nar/gky326. PMC 6009672 . PMID 29750271.
^ Gensler HL, Bernstein H (septiembre de 1981). "Daños en el ADN como causa principal del envejecimiento". The Quarterly Review of Biology . 56 (3): 279–303. doi :10.1086/412317. PMID 7031747. S2CID 20822805.
Lectura adicional
Mol CD, Hosfield DJ, Tainer JA (agosto de 2000). "Reconocimiento de sitios abásicos por dos familias de endonucleasas apurínicas/apirimidínicas en la reparación por escisión de bases del ADN: los extremos 3' justifican los medios". Mutation Research . 460 (3–4): 211–29. doi : 10.1016/s0921-8777(00)00028-8 . PMID 10946230.
Fritz G (septiembre de 2000). "Proteína APE/Ref-1 humana". Revista internacional de bioquímica y biología celular . 32 (9): 925–9. doi :10.1016/S1357-2725(00)00045-5. PMID 11084372.
Fritz G, Grösch S, Tomicic M, Kaina B (noviembre de 2003). "APE/Ref-1 y la respuesta de los mamíferos al estrés genotóxico". Toxicología . 193 (1–2): 67–78. doi :10.1016/S0300-483X(03)00290-7. PMID 14599768.
Tell G, Damante G, Caldwell D, Kelley MR (2005). "La localización intracelular de APE1/Ref-1: ¿más que un fenómeno pasivo?". Antioxidantes y señalización redox . 7 (3–4): 367–84. doi :10.1089/ars.2005.7.367. hdl : 1805/4802 . PMID: 15706084.
Hung RJ, Hall J, Brennan P, Boffetta P (noviembre de 2005). "Polimorfismos genéticos en la vía de reparación por escisión de la base y riesgo de cáncer: una revisión enorme". American Journal of Epidemiology . 162 (10): 925–42. doi : 10.1093/aje/kwi318 . PMID 16221808.
Dyrkheeva NS, Khodyreva SN, Lavrik OI (2007). "[Endonucleasa apurínica/apirimidínica humana multifuncional 1: el papel de funciones adicionales]". Molekuliarnaia Biologiia . 41 (3): 450–66. PMID 17685223.
Harrison L, Ascione G, Menninger JC, Ward DC, Demple B (diciembre de 1992). "Gen de la endonucleasa apurínica humana (APE): estructura y mapeo genómico (cromosoma 14q11.2-12)". Human Molecular Genetics . 1 (9): 677–80. doi :10.1093/hmg/1.9.677. PMID 1284593.
Cheng XB, Bunville J, Patterson TA (enero de 1992). "Secuencia de nucleótidos de un ADNc para una endonucleasa apurínica/apirimidínica de células HeLa". Nucleic Acids Research . 20 (2): 370. doi :10.1093/nar/20.2.370. PMC 310384 . PMID 1371347.
Xanthoudakis S, Miao G, Wang F, Pan YC, Curran T (septiembre de 1992). "La activación redox de la actividad de unión al ADN de Fos-Jun está mediada por una enzima reparadora del ADN". The EMBO Journal . 11 (9): 3323–35. doi :10.1002/j.1460-2075.1992.tb05411.x. PMC 556867 . PMID 1380454.
Zhao B, Grandy DK, Hagerup JM, Magenis RE, Smith L, Chauhan BC, Henner WD (agosto de 1992). "El gen humano de la endonucleasa apurínica/apirimidínica (HAP1): secuencia y localización en la banda q12 del cromosoma 14". Nucleic Acids Research . 20 (15): 4097–8. doi :10.1093/nar/20.15.4097. PMC 334100 . PMID 1380694.
Robson CN, Hochhauser D, Craig R, Rack K, Buckle VJ, Hickson ID (septiembre de 1992). "Estructura del gen de reparación del ADN humano HAP1 y su localización en el cromosoma 14q 11.2-12". Nucleic Acids Research . 20 (17): 4417–21. doi :10.1093/nar/20.17.4417. PMC 334166 . PMID 1383925.
Seki S, Hatsushika M, Watanabe S, Akiyama K, Nagao K, Tsutsui K (julio de 1992). "Clonación, secuenciación, expresión y posible estructura de dominio de la nucleasa APEX humana homóloga a la exonucleasa III de Escherichia coli". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Estructura y expresión de genes . 1131 (3): 287–99. doi :10.1016/0167-4781(92)90027-w. PMID 1627644.
Robson CN, Hickson ID (octubre de 1991). "Aislamiento de clones de ADNc que codifican una endonucleasa apurínica/apirimidínica humana que corrige los defectos de reparación y mutagénesis del ADN en mutantes de E. coli xth (exonucleasa III)". Nucleic Acids Research . 19 (20): 5519–23. doi :10.1093/nar/19.20.5519. PMC 328951 . PMID 1719477.
Demple B, Herman T, Chen DS (diciembre de 1991). "Clonación y expresión de APE, el ADNc que codifica la principal endonucleasa apurínica humana: definición de una familia de enzimas reparadoras del ADN". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 88 (24): 11450–4. Bibcode :1991PNAS...8811450D. doi : 10.1073/pnas.88.24.11450 . PMC 53153 . PMID 1722334.
Okazaki T, Chung U, Nishishita T, Ebisu S, Usuda S, Mishiro S, Xanthoudakis S, Igarashi T, Ogata E (noviembre de 1994). "Una proteína del factor redox, ref1, participa en la regulación genética negativa del calcio extracelular". La Revista de Química Biológica . 269 (45): 27855–62. doi : 10.1016/S0021-9258(18)46865-2 . PMID 7961715.
Akiyama K, Seki S, Oshida T, Yoshida MC (septiembre de 1994). "Estructura, análisis del promotor y asignación cromosómica del gen APEX humano". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Estructura y expresión génica . 1219 (1): 15–25. doi :10.1016/0167-4781(94)90241-0. PMID 8086453.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (abril de 1996). "Un método de "doble adaptador" para mejorar la construcción de bibliotecas de escopetas". Analytical Biochemistry . 236 (1): 107–13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
Chung U, Igarashi T, Nishishita T, Iwanari H, Iwamatsu A, Suwa A, Mimori T, Hata K, Ebisu S, Ogata E, Fujita T, Okazaki T (abril de 1996). "La interacción entre el antígeno Ku y la proteína REF1 media la regulación genética negativa por el calcio extracelular". La Revista de Química Biológica . 271 (15): 8593–8. doi : 10.1074/jbc.271.15.8593 . PMID 8621488.
Rothwell DG, Hickson ID (noviembre de 1996). "La asparagina 212 es esencial para el reconocimiento de sitios abásicos por la endonucleasa de reparación del ADN humano HAP1". Nucleic Acids Research . 24 (21): 4217–21. doi :10.1093/nar/24.21.4217. PMC 146231 . PMID 8932375.
Izumi T, Henner WD, Mitra S (noviembre de 1996). "Regulación negativa de la principal AP-endonucleasa humana, una proteína multifuncional". Bioquímica . 35 (47): 14679–83. doi :10.1021/bi961995u. PMID 8942627.