APEX1

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens
APEX1
Estructuras disponibles
APBúsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Identificadores
AliasAPEX1 , APE, APE1, APEN, APEX, APX, HAP1, REF1, endodesoxirribonucleasa 1 apurínica/apirimidínica
Identificaciones externasOMIM : 107748; MGI : 88042; HomoloGene : 1241; Tarjetas genéticas : APEX1; OMA :APEX1 - ortólogos
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entre
Conjunto
Protección unificada
RefSeq (ARNm)

NM_001244249
NM_001641
NM_080648
NM_080649

Número de modelo_009687

RefSeq (proteína)

NP_001231178
NP_001632
NP_542379
NP_542380

NP_033817

Ubicación (UCSC)Crónicas 14:20.46 – 20.46 MbCrónicas 14:51.16 – 51.16 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
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La ADN-liasa (sitio apurínico o apirimidínico) es una enzima que en los humanos está codificada por el gen APEX1 .

Los sitios apurínicos/apirimidínicos (AP) (también llamados "sitios abásicos") aparecen con frecuencia en las moléculas de ADN por hidrólisis espontánea, por agentes que dañan el ADN o por ADN glicosilasas que eliminan bases anormales específicas. Los sitios AP son lesiones premutagénicas que pueden impedir la replicación normal del ADN. Todas las células, desde los procariotas simples hasta los humanos, han desarrollado sistemas para identificar y reparar dichos sitios. Las endonucleasas AP de clase II escinden la cadena principal de fosfodiéster en el sentido 5' del sitio AP, iniciando así un proceso conocido como reparación por escisión de bases (BER). El gen APEX (también llamado APE1, HAP1, APEN) codifica la principal endonucleasa AP en las células humanas. Se han encontrado variantes de empalme para este gen; todas codifican la misma proteína. [5]

Interacciones

Se ha demostrado que APEX1 interactúa con MUTYH , [6] la endonucleasa 1 específica de la estructura del colgajo [7] y XRCC1 . [8]

Envejecimiento

La deficiencia de APEX1 provoca la acumulación de daño en el ADN, lo que conduce tanto a la senescencia celular como a características de envejecimiento prematuro . [9] Este hallazgo es consistente con la teoría de que el daño en el ADN es una causa primaria del envejecimiento. [10]

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000100823 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000035960 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ "Entrez Gene: APEX1 nucleasa APEX (enzima multifuncional de reparación del ADN) 1".
  6. ^ Parker A, Gu Y, Mahoney W, Lee SH, Singh KK, Lu AL (febrero de 2001). "El homólogo humano de la proteína reparadora MutY (hMYH) interactúa físicamente con las proteínas implicadas en la reparación por escisión de bases de ADN de parches largos". The Journal of Biological Chemistry . 276 (8): 5547–55. doi : 10.1074/jbc.M008463200 . PMID  11092888.
  7. ^ Dianova II, Bohr VA, Dianov GL (octubre de 2001). "Interacción de la endonucleasa AP 1 humana con la endonucleasa 1 del colgajo y el antígeno nuclear de células proliferantes implicado en la reparación por escisión de la base con parche largo". Bioquímica . 40 (42): 12639–44. doi :10.1021/bi011117i. PMID  11601988.
  8. ^ Vidal AE, Boiteux S, Hickson ID, Radicella JP (noviembre de 2001). "XRCC1 coordina las etapas iniciales y tardías de la reparación del sitio abásico del ADN a través de interacciones proteína-proteína". The EMBO Journal . 20 (22): 6530–9. doi :10.1093/emboj/20.22.6530. PMC 125722 . PMID  11707423. 
  9. ^ Li M, Yang X, Lu X, Dai N, Zhang S, Cheng Y, et al. (junio de 2018). "La deficiencia de APE1 promueve la senescencia celular y las características del envejecimiento prematuro". Nucleic Acids Research . 46 (11): 5664–5677. doi :10.1093/nar/gky326. PMC 6009672 . PMID  29750271. 
  10. ^ Gensler HL, Bernstein H (septiembre de 1981). "Daños en el ADN como causa principal del envejecimiento". The Quarterly Review of Biology . 56 (3): 279–303. doi :10.1086/412317. PMID  7031747. S2CID  20822805.

Lectura adicional

  • Mol CD, Hosfield DJ, Tainer JA (agosto de 2000). "Reconocimiento de sitios abásicos por dos familias de endonucleasas apurínicas/apirimidínicas en la reparación por escisión de bases del ADN: los extremos 3' justifican los medios". Mutation Research . 460 (3–4): 211–29. doi : 10.1016/s0921-8777(00)00028-8 . PMID  10946230.
  • Fritz G (septiembre de 2000). "Proteína APE/Ref-1 humana". Revista internacional de bioquímica y biología celular . 32 (9): 925–9. doi :10.1016/S1357-2725(00)00045-5. PMID  11084372.
  • Fritz G, Grösch S, Tomicic M, Kaina B (noviembre de 2003). "APE/Ref-1 y la respuesta de los mamíferos al estrés genotóxico". Toxicología . 193 (1–2): 67–78. doi :10.1016/S0300-483X(03)00290-7. PMID  14599768.
  • Tell G, Damante G, Caldwell D, Kelley MR (2005). "La localización intracelular de APE1/Ref-1: ¿más que un fenómeno pasivo?". Antioxidantes y señalización redox . 7 (3–4): 367–84. doi :10.1089/ars.2005.7.367. hdl : 1805/4802 . PMID:  15706084.
  • Hung RJ, Hall J, Brennan P, Boffetta P (noviembre de 2005). "Polimorfismos genéticos en la vía de reparación por escisión de la base y riesgo de cáncer: una revisión enorme". American Journal of Epidemiology . 162 (10): 925–42. doi : 10.1093/aje/kwi318 . PMID  16221808.
  • Dyrkheeva NS, Khodyreva SN, Lavrik OI (2007). "[Endonucleasa apurínica/apirimidínica humana multifuncional 1: el papel de funciones adicionales]". Molekuliarnaia Biologiia . 41 (3): 450–66. PMID  17685223.
  • Harrison L, Ascione G, Menninger JC, Ward DC, Demple B (diciembre de 1992). "Gen de la endonucleasa apurínica humana (APE): estructura y mapeo genómico (cromosoma 14q11.2-12)". Human Molecular Genetics . 1 (9): 677–80. doi :10.1093/hmg/1.9.677. PMID  1284593.
  • Cheng XB, Bunville J, Patterson TA (enero de 1992). "Secuencia de nucleótidos de un ADNc para una endonucleasa apurínica/apirimidínica de células HeLa". Nucleic Acids Research . 20 (2): 370. doi :10.1093/nar/20.2.370. PMC  310384 . PMID  1371347.
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  • Demple B, Herman T, Chen DS (diciembre de 1991). "Clonación y expresión de APE, el ADNc que codifica la principal endonucleasa apurínica humana: definición de una familia de enzimas reparadoras del ADN". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 88 (24): 11450–4. Bibcode :1991PNAS...8811450D. doi : 10.1073/pnas.88.24.11450 . PMC  53153 . PMID  1722334.
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  • Chung U, Igarashi T, Nishishita T, Iwanari H, Iwamatsu A, Suwa A, Mimori T, Hata K, Ebisu S, Ogata E, Fujita T, Okazaki T (abril de 1996). "La interacción entre el antígeno Ku y la proteína REF1 media la regulación genética negativa por el calcio extracelular". La Revista de Química Biológica . 271 (15): 8593–8. doi : 10.1074/jbc.271.15.8593 . PMID  8621488.
  • Rothwell DG, Hickson ID (noviembre de 1996). "La asparagina 212 es esencial para el reconocimiento de sitios abásicos por la endonucleasa de reparación del ADN humano HAP1". Nucleic Acids Research . 24 (21): 4217–21. doi :10.1093/nar/24.21.4217. PMC  146231 . PMID  8932375.
  • Izumi T, Henner WD, Mitra S (noviembre de 1996). "Regulación negativa de la principal AP-endonucleasa humana, una proteína multifuncional". Bioquímica . 35 (47): 14679–83. doi :10.1021/bi961995u. PMID  8942627.
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