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Un zoo blot o garden blot es un tipo de Southern blot que demuestra la similitud entre secuencias de ADN específicas, generalmente codificantes de proteínas, de diferentes especies. Un zoo blot compara especies animales mientras que un garden blot compara especies vegetales. El propósito del zoo blot es detectar la conservación del gen o genes de interés a lo largo de la evolución de diferentes especies. [1]
Para comprender el grado de similitud de un gen en particular entre especies, se aíslan extractos de ADN de un conjunto de especies y se extienden sobre una superficie. Luego, se marca una sonda genética específica de una de las especies y se deja que se hibride con el ADN preparado. Por lo general, la sonda se marca con un isótopo radiactivo de fósforo . Después de la hibridación, se utilizan autorradiografías u otras técnicas de imagen para identificar las sondas hibridadas con éxito, prueba de la similitud entre los genomas de las especies. [2]
La hibridación entre una sonda y un segmento de ADN se produce incluso cuando las cadenas son similares pero no idénticas. Por ello, el zoo blotting se utiliza para detectar relaciones similares o exactas entre el ADN en cuestión y otros organismos. También puede ayudar a establecer las ubicaciones de los intrones y exones, ya que estos últimos estarán mucho más conservados que los primeros. [3]