Craig Venter
Científico estadounidense

John Craig Venter
Venter en 2007
Nacido( 14 de octubre de 1946 )14 de octubre de 1946 (77 años)
Salt Lake City , Utah, Estados Unidos
Alma máterUniversidad de California, San Diego
OcupaciónBiólogo
PremiosPremio Gairdner (2002)
Premio Nierenberg (2007)
Premio Kistler (2008)
Premio ENI (2008)
Medalla de la Ciencia (2008)
Premio Dickson (2011)
Medalla Leeuwenhoek
Premio Edogawa NICHE (2020)
Carrera científica
Campos
Instituciones
Sitio webwww.jcvi.org

John Craig Venter (nacido el 14 de octubre de 1946) es un científico estadounidense. Es conocido por liderar uno de los primeros borradores de secuencias del genoma humano [1] [2] y dirigió el primer equipo en transfectar una célula con un cromosoma sintético. [3] [4] Venter fundó Celera Genomics , el Institute for Genomic Research (TIGR) y el J. Craig Venter Institute (JCVI). Fue cofundador de Human Longevity Inc. y Synthetic Genomics . Fue incluido en la lista Time 100 de 2007 y 2008 de las personas más influyentes del mundo de la revista Time . En 2010, la revista británica New Statesman incluyó a Craig Venter en el puesto 14 de la lista de "Las 50 figuras más influyentes del mundo de 2010". [5] En 2012, Venter fue honrado con el Premio Dan David por su contribución a la investigación del genoma. [6] Fue elegido miembro de la Sociedad Filosófica Americana en 2013. [7] Es miembro del consejo asesor del Festival de Ciencia e Ingeniería de EE. UU . [8]

Vida temprana y educación

Venter nació en Salt Lake City , Utah, hijo de Elisabeth y John Venter. [9] [10] : 14  En su juventud, no tomó en serio su educación, prefiriendo pasar su tiempo en el agua en botes o surfeando. [10] : 1–20  Según su biografía, A Life Decoded , se decía que nunca fue un estudiante terriblemente comprometido, teniendo Cs y D en sus boletines de calificaciones de octavo grado. [10] : 1–20  Venter consideró que su comportamiento en su adolescencia era indicativo del trastorno por déficit de atención con hiperactividad (TDAH), y más tarde encontró variantes genéticas vinculadas al TDAH en su propio ADN. [11] Se graduó de Mills High School en Millbrae, California . Su padre murió repentinamente a los 59 años de un paro cardíaco, lo que le dio una conciencia de por vida de su propia mortalidad. Cita un dicho: "Si quieres la inmortalidad, haz algo significativo con tu vida". [12]

Aunque se opuso a la guerra de Vietnam , [13] Venter fue reclutado y alistó en la Marina de los Estados Unidos , donde trabajó como médico en la sala de cuidados intensivos de un hospital de campaña. [14] Sirvió de 1967 a 1968 en la Actividad de Apoyo Naval Danang en Vietnam. Mientras estaba en Vietnam, intentó suicidarse nadando mar adentro, pero cambió de opinión a más de una milla de la costa. [15] El hecho de enfrentarse a marines gravemente heridos y moribundos a diario le inculcó el deseo de estudiar medicina, [16] aunque más tarde se pasó a la investigación biomédica .

Venter comenzó su educación universitaria en 1969 en un colegio comunitario , el College of San Mateo en California, y luego se trasladó a la Universidad de California, San Diego , donde estudió con el bioquímico Nathan O. Kaplan . Recibió una Licenciatura en Ciencias en bioquímica en 1972 y un Doctorado en Filosofía en fisiología y farmacología en 1975 de la UCSD. [17] [18]

Carrera

Después de trabajar como profesor asociado , y más tarde como profesor titular, en la Universidad Estatal de Nueva York en Buffalo , se unió a los Institutos Nacionales de Salud en 1984.

Controversia sobre la EST

Mientras trabajaba para el NIH , Venter aprendió a identificar el ARNm y comenzó a aprender más sobre los que se expresan en el cerebro humano. Los fragmentos cortos de secuencia de ADNc que Venter descubrió mediante secuenciación automatizada de ADN los denominó etiquetas de secuencia expresada o EST. La Oficina de Transferencia de Tecnología del NIH decidió presentar una patente sobre las EST descubiertas por Venter. Patentar los genes identificados basándose en estudios de expresión de ARNm en el cerebro humano. Cuando Venter reveló la estrategia del NIH durante una audiencia en el Congreso, estalló una tormenta de controversia. [19] El NIH luego detuvo el esfuerzo y abandonó las solicitudes de patente que había presentado, tras la protesta pública. [20]

Proyecto Genoma Humano

Venter era un apasionado del poder de la genómica para transformar radicalmente la atención sanitaria. Venter creía que la secuenciación shotgun era la forma más rápida y eficaz de obtener datos útiles sobre el genoma humano. [21] Sin embargo, el Proyecto Genoma Humano rechazó el método porque algunos genetistas pensaban que no sería lo suficientemente preciso para un genoma tan complicado como el de los humanos, que sería logísticamente más difícil y que costaría significativamente más. [22] [23]

Venter consideró que el lento ritmo de progreso del proyecto Genoma Humano era una oportunidad para continuar con su interés en probar su método de secuenciación shotgun para acelerar la secuenciación del genoma humano, por lo que cuando una empresa de secuenciación de ADN le ofreció financiación para iniciar Celera Genomics . [24] La empresa planeaba sacar provecho de su trabajo creando datos genómicos a los que los usuarios pudieran suscribirse pagando una tarifa. En consecuencia, el objetivo ejerció presión sobre el programa público del genoma y animó a varios grupos a redoblar sus esfuerzos para producir la secuencia completa. El esfuerzo de Venter le valió renombre, ya que él y su equipo de Celera Corporation compartieron el crédito por la secuenciación del primer borrador del genoma humano con el Proyecto Genoma Humano financiado con fondos públicos . [25]

En 2000, Venter y Francis Collins de los Institutos Nacionales de Salud y el Proyecto Genoma Público de EE. UU. anunciaron conjuntamente el mapeo del genoma humano, tres años antes del final esperado del Programa Genoma Público. El anuncio se realizó junto con el presidente estadounidense Bill Clinton y el primer ministro del Reino Unido Tony Blair . [26] Venter y Collins compartieron así un premio a la "Biografía del año" de A&E Network . [27] El 15 de febrero de 2001, el consorcio del Proyecto Genoma Humano publicó el primer Genoma Humano en la revista Nature , seguido un día después por una publicación de Celera en Science . [28] [29] A pesar de algunas afirmaciones de que la secuenciación shotgun era en algunos aspectos menos precisa que el método clon por clon elegido por el Proyecto Genoma Humano, [30] la técnica fue ampliamente aceptada por la comunidad científica.

Venter fue despedido de Celera a principios de 2002. [31] Según su biografía, Venter fue despedido debido a un conflicto con el principal inversor, Tony White, que específicamente le prohibió asistir a la ceremonia de la Casa Blanca que celebraba el logro de la secuenciación del genoma humano.

Expedición mundial de muestreo de los océanos

La Expedición Global de Muestreo de los Océanos (Global Ocean Sampling Expedition , GOS) es un proyecto de exploración genómica oceánica cuyo objetivo es evaluar la diversidad genética de las comunidades microbianas marinas y comprender su papel en los procesos fundamentales de la naturaleza. Comenzó como un proyecto piloto de muestreo en el mar de los Sargazos en agosto de 2003 y Venter anunció la expedición completa el 4 de marzo de 2004. El proyecto, que utilizó el yate personal de Venter, el Sorcerer II , comenzó en Halifax, Canadá, circunnavegó el globo y regresó a los EE. UU. en enero de 2006. [32]

Genómica sintética

Instituto J. Craig Venter, Rockville, Maryland, ubicación

En junio de 2005, Venter cofundó Synthetic Genomics , una empresa dedicada a utilizar microorganismos modificados para producir combustibles y productos bioquímicos limpios. En julio de 2009, ExxonMobil anunció una colaboración de 600 millones de dólares con Synthetic Genomics para investigar y desarrollar biocombustibles de próxima generación . [33] Venter sigue trabajando en la creación de microalgas diatómicas diseñadas para la producción de biocombustibles. [34] [35] [36]

Venter busca patentar la primera especie parcialmente sintética que posiblemente se llamará Mycoplasma laboratorium . [37] Existe la especulación de que esta línea de investigación podría llevar a la producción de bacterias que han sido diseñadas para realizar reacciones específicas, por ejemplo, producir combustibles , fabricar medicamentos, combatir el calentamiento global , etc. [38]

En mayo de 2010, un equipo de científicos dirigido por Venter se convirtió en el primero en crear con éxito lo que se describió como " vida sintética ". [39] [40] Esto se hizo sintetizando una molécula de ADN muy larga que contenía un genoma de bacteria completo , e introduciéndolo en otra célula , análogo al logro del grupo de Eckard Wimmer , que sintetizó y ligó un genoma de virus de ARN y lo "arrancó" en lisado celular. [41] El organismo unicelular contiene cuatro "marcas de agua" [42] escritas en su ADN para identificarlo como sintético y ayudar a rastrear a sus descendientes. Las marcas de agua incluyen

  1. Tabla de códigos para todo el alfabeto con signos de puntuación
  2. Nombres de los 46 científicos que colaboraron
  3. Tres citas
  4. La dirección de correo electrónico secreta del móvil. [43]

El 25 de marzo de 2016, Venter informó sobre la creación de Syn 3.0, un genoma sintético que tiene la menor cantidad de genes de cualquier organismo que viva libremente (473 genes). Su objetivo era eliminar todos los genes no esenciales, dejando solo el conjunto mínimo necesario para sustentar la vida. Se espera que esta célula simplificada y de reproducción rápida sea una herramienta valiosa para los investigadores en este campo. [44]

En agosto de 2018, Venter se retiró como presidente de la junta directiva, diciendo que quería centrarse en su trabajo en el Instituto J. Craig Venter. Seguirá siendo asesor científico de la junta. [45]

Instituto J. Craig Venter

En 2006, Venter fundó el Instituto J. Craig Venter (JCVI), una organización sin fines de lucro que realiza investigaciones en biología sintética . Tiene instalaciones en La Jolla y en Rockville, Maryland , y emplea a más de 200 personas.

En abril de 2022, Venter vendió las instalaciones del JCVI de La Jolla a la Universidad de California en San Diego por 25 millones de dólares. Venter seguirá al frente de un grupo de investigación independiente sin ánimo de lucro, también conocido como el Instituto J. Craig Venter, y destacó que no se jubilará. El Instituto Venter ha superado la capacidad de su edificio actual con varias nuevas contrataciones para las instalaciones y se trasladará a un nuevo espacio en 2025. [12]

Genoma humano individual

El 4 de septiembre de 2007, un equipo dirigido por Sam Levy publicó uno de los primeros genomas de un ser humano individual: la secuencia de ADN del propio Venter. [46] Algunas de las secuencias del genoma de Venter están asociadas con la cera húmeda de los oídos, [47] un mayor riesgo de comportamiento antisocial, Alzheimer y enfermedades cardiovasculares . [10] Esta publicación fue especialmente interesante porque intentó separar los dos haplotipos logrados por primera vez mediante la secuenciación de células espermáticas individuales (que tienen solo un haplotipo). [ investigación original? ] Pasaron otros 10 años antes de que comenzaran a aparecer genomas humanos resueltos por haplotipos adicionales.

El Navegador Genómico de Referencia Humana es una aplicación web para la navegación y el análisis del genoma publicado recientemente por Venter. La base de datos HuRef consta de aproximadamente 32 millones de lecturas de ADN secuenciadas mediante secuenciación microfluídica de Sanger , ensambladas en 4.528 estructuras y 4,1 millones de variaciones de ADN identificadas mediante análisis del genoma. Estas variantes incluyen polimorfismos de un solo nucleótido (SNP), sustituciones en bloque , indeles cortos y grandes , y variaciones estructurales como inserciones , deleciones , inversiones y cambios en el número de copias .

El navegador permite a los científicos navegar por el ensamblaje del genoma de HuRef y las variaciones de secuencias, y compararlo con el ensamblaje NCBI human build 36 en el contexto de las anotaciones NCBI y Ensembl . El navegador proporciona una vista comparativa entre las secuencias de consenso de NCBI y HuRef, la alineación múltiple de secuencias del ensamblaje de HuRef, las anotaciones Ensembl y dbSNP, las variantes de HuRef y la evidencia de variantes subyacentes y el análisis funcional. La interfaz también representa los bloques de haplotipos a partir de los cuales se puede inferir la secuencia del genoma diploide y la relación de las variantes con las anotaciones genéticas. La visualización de variantes y anotaciones genéticas está vinculada a recursos públicos externos, incluidos dbSNP , Ensembl, Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) y Gene Ontology (GO).

Los usuarios pueden buscar en el genoma de HuRef utilizando los nombres de los genes HUGO, los identificadores Ensembl y dbSNP, las ubicaciones de los contigs o andamios de HuRef o las ubicaciones de los cromosomas NCBI. Los usuarios pueden explorar de forma fácil y rápida cualquier región genómica a través de los controles de zoom y desplazamiento simples e intuitivos; además, los datos relevantes para loci específicos se pueden exportar para su posterior análisis.

Longevidad Humana, Inc.

El 4 de marzo de 2014, Venter y los cofundadores Peter Diamandis y Robert Hariri anunciaron la formación de Human Longevity , Inc., una empresa centrada en extender la vida humana saludable y de "alto rendimiento". [48] [49] En el momento del anuncio, la empresa ya había recaudado 70 millones de dólares en financiación de riesgo , que se esperaba que durara 18 meses. [48] [49] Venter se desempeñó como presidente y director ejecutivo (CEO) hasta mayo de 2018, cuando se jubiló. La empresa dijo que planea secuenciar 40.000 genomas por año, con un enfoque inicial en los genomas del cáncer y los genomas de los pacientes con cáncer. [48]

En 2018, Human Longevity presentó una demanda contra Venter, acusándolo de robar secretos comerciales. Se alegaba que Venter se había ido con el ordenador de su empresa que contenía información valiosa que podría utilizarse para iniciar un negocio de la competencia. [50] La demanda fue finalmente desestimada por un juez de California sobre la base de que Human Longevity no pudo presentar un caso que cumpliera con el umbral legal requerido para que una empresa o un individuo presente una demanda cuando sus secretos comerciales han sido robados. [51]

La misión de Human Longevity es extender la vida humana saludable mediante el uso de diagnósticos de big data de alta resolución de genómica , metabolómica , microbiómica y proteómica , y el uso de terapia con células madre . [52]

Libros publicados

Venter es autor de tres libros, el primero de los cuales es una autobiografía titulada A Life Decoded . [10] En el segundo libro de Venter, Life at the Speed ​​of Light , anunció su teoría de que esta es la generación en la que parece haber una unión de los dos campos de la ciencia previamente diversos representados por la programación informática y la programación genética de la vida mediante la secuenciación del ADN. [53] Fue aplaudido por su posición al respecto por el futurista Ray Kurzweil . El libro más reciente de Venter, coescrito por David Ewing Duncan , The Voyage of Sorcerer II: The Expedition that Unlocked the Secrets of the Ocean's Microbiome , [54] detalla la Expedición Global de Muestreo Oceánico , que abarcó un período de 15 años durante el cual se recolectaron microbios de los océanos del mundo y se secuenció su ADN.

Vida personal

Después de un matrimonio de 12 años con Barbara Rae-Venter , [55] [56] con quien tuvo un hijo, Christopher, se casó con Claire M. Fraser [57] [18] permaneciendo casado con ella hasta 2005. [58] A finales de 2008 se casó con Heather Kowalski. [59] Viven en el barrio de La Jolla en San Diego, CA. [59] Venter es ateo. [60]

Venter tenía 75 años cuando vendió su edificio principal de investigación a la UCSD en 2022. El instituto había superado el espacio disponible y se mudará a una nueva instalación en 2025. El campus del Venter Institute en Rockville, Maryland, también continúa expandiéndose. Dijo que no tiene intención de jubilarse. [12] Tiene una casa en La Jolla y un rancho en Borrego Springs, California , así como casas en dos pequeños pueblos de Maine. Se entrega a dos pasiones: navegar y volar un avión Cirrus 22T, al que llama "la máxima libertad". [12]

Venter ha sido objeto de artículos en varias revistas, entre ellas Wired , [61] The Economist , [62] la revista científica australiana Cosmos , [63] [64] y The Atlantic . [65]

Venter aparece en el especial de dos horas de NOVA de 2001 , "Descifrando el código de la vida". [66] [67]

El 16 de mayo de 2004, Venter pronunció el discurso de graduación en la Universidad de Boston . [68]

El 4 de diciembre de 2007, Venter dio la conferencia Dimbleby para la BBC en Londres. [69]

Venter pronunció la conferencia pública destacada durante el semestre de Michaelmas de 2007 en la James Martin 21st Century School de la Universidad de Oxford. Su título fue "Genómica: de los humanos al medio ambiente". [70] [71]

Venter pronunció el discurso de convocatoria de 2008 para los estudiantes de honores y especialización de la Facultad de Ciencias de la Universidad de Alberta . [72]

En febrero de 2008, dio un discurso sobre su trabajo actual en la conferencia TED . [73]

Venter apareció en el artículo "Los 10 descubrimientos científicos más importantes de 2008" de la revista Time . El número tres de los 10 descubrimientos científicos más importantes de 2008 fue un artículo que describe su trabajo para unir los 582.000 pares de bases necesarios para inventar la información genética de una bacteria completamente nueva. [74]

El 20 de mayo de 2010, Venter anunció la creación de la primera célula bacteriana semisintética autorreplicante. [75]

En la edición de junio de 2011 de Men's Journal , Venter fue presentado como la celebridad del mes en cuanto a "habilidades de supervivencia". Compartió varias anécdotas y consejos, incluidas historias de su tiempo en Vietnam , además de mencionar un episodio de melanoma en la espalda, que posteriormente resultó en que "cediera un kilo de carne " a la cirugía. [76]

En mayo de 2011, Venter fue el orador de la ceremonia de graduación en la 157.ª ceremonia de graduación de la Universidad de Syracuse . [77] [78]

En mayo de 2017, Venter fue el invitado de honor y orador principal en la ceremonia de inauguración del Centro de Biología de Sistemas de Dresde. [79]

Premios y nominaciones

El Dr. Craig Venter recibe el premio NICHE de Edogawa 2020 en Toronto

Obras

Venter es autor de más de 200 publicaciones en revistas científicas . [96]

  • Fleischmann, Robert D.; Adams, Mark D.; White, Owen; Clayton, Rebecca; ... Venter, J. Craig (28 de julio de 1995). "Secuenciación aleatoria de todo el genoma y ensamblaje de Haemophilus influenzae Rd". Science . 269 (5223): 496–512. Bibcode :1995Sci...269..496F. doi :10.1126/science.7542800. PMID  7542800. S2CID  10423613.
  • Tomb, Jean-F.; White, Owen; Kerlavage, Anthony R.; Clayton, Rebecca A.; Sutton, Granger G.; Fleischmann, Robert D.; ... Venter, J. Craig (7 de agosto de 1997). "La secuencia completa del genoma del patógeno gástrico Helicobacter pylori". Nature . 388 (6642): 539–47. Bibcode :1997Natur.388..539T. doi : 10.1038/41483 . PMID  9252185.
  • Adams, Mark D.; Celniker, Susan E.; Holt, Robert A.; Evans, Cheryl A.; Goccayne, Jeannine A.; Amanatides, Peter G.; ... Venter, J. Craig (24 de marzo de 2000). "La secuencia del genoma de Drosophila melanogaster" (PDF) . Science . 287 (5461): 2185–95. Bibcode :2000Sci...287.2185.. CiteSeerX  10.1.1.549.8639 . doi :10.1126/science.287.5461.2185. PMID  10731132. Archivado desde el original (PDF) el 22 de julio de 2018 . Consultado el 24 de octubre de 2017 .
  • Venter, JC; Adams, M.; Myers, E.; Li, P.; Mural, R.; Sutton, G.; Smith, H.; Yandell, M.; Evans, C.; Holt, RA; Gocayne, JD; Amanátides, P.; Ballew, RM; Huson, DH; Wortman, JR; Zhang, Q.; Kodira, CD; Zheng, XH; Chen, L.; Skupski, M.; Subramanian, G.; Thomas, PD; Zhang, J.; Gabor Miklos, GL; Nelson, C.; Broder, S.; Clark, AG; Nadeau, J.; McKusick, Virginia; et al. (2001). "La secuencia del genoma humano". Ciencia . 291 (5507): 1304-1351. Código Bib : 2001 Ciencia... 291.1304V. doi : 10.1126/science.1058040 . PMID  11181995.
  • Venter, JC; Remington, K.; Heidelberg, J.; Halpern, A.; Rusch, D.; Eisen, J.; Wu, D.; Paulsen, I.; Nelson, K.; Nelson, W.; Fouts, DE; Levy, S.; Knap, AH; Lomas, MW; Nealson, K.; White, O.; Peterson, J.; Hoffman, J.; Parsons, R.; Baden-Tillson, H.; Pfannkoch, C.; Rogers, YH; Smith, HO (2004). "Secuenciación de escopeta del genoma ambiental del mar de los Sargazos". Science . 304 (5667): 66–74. Bibcode :2004Sci...304...66V. CiteSeerX  10.1.1.124.1840 . : 10.1126 /science.1093857. PMID  15001713. S2CID  1454587.
  • Rusch, Donald B.; Halpern, Aaron L.; Sutton, Granger; Heidelberg, Karla B.; Williamson, Shannon; Yooseph, Shibu; Wu, Dongying; ... Venter, J. Craig (13 de marzo de 2007). "La expedición de muestreo global de océanos Sorcerer II: del Atlántico noroccidental al Pacífico tropical oriental". PLOS Biology . 5 (3): 398–431. doi : 10.1371/journal.pbio.0050077 . PMC  1821060 . PMID  17355176.
  • Yooseph, Shibu; Sutton, Granger; Rusch, Donald B.; Halpern, Aaron L.; Williamson, Shannon; Remington, Karin; Eisen, Jonathan A.; ... Venter, J. Craig (13 de marzo de 2007). "La expedición de muestreo global de océanos Sorcerer II: expandiendo el universo de familias de proteínas". PLOS Biology . 5 (3): 432–466. doi : 10.1371/journal.pbio.0050016 . PMC  1821046 . PMID  17355171.
  • Venter, J. Craig (2007). Una vida descifrada: Mi genoma: mi vida. Nueva York: Viking Adult . ISBN 978-0-670-06358-1.OCLC 165048736  .Editor Roger Highfield
  • Venter, J. Craig (2013). La vida a la velocidad de la luz: de la doble hélice al amanecer de la vida digital . Nueva York: Viking Adult . ISBN. 978-0-670-02540-4.OCLC 834432832  .Editor Roger Highfield

Véase también

Referencias

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Lectura adicional

Wikiquote tiene citas relacionadas con Craig Venter .
Wikimedia Commons alberga una categoría multimedia sobre Craig Venter .
  • Longevidad Humana, Inc.
  • Navegador de genomas HuRef
  • Instituto J. Craig Venter
  • Expedición del Hechicero II
  • Genómica sintética Archivado el 21 de diciembre de 2008 en Wayback Machine .
  • El Instituto de Investigación Genómica (TIGR)
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