URM1
| Urm1 (modificador relacionado con la ubiquitina) | |||||||||||
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 Modificador relacionado con la ubiquitina-1 (2qjl) . En el centro del pliegue de agarre β de la proteína se encuentra. Además, la glicina carboxiterminal dentro de un motivo de di-glicina está marcada en azul y los iones Mg están representados por esferas negras. | |||||||||||
| Identificadores | |||||||||||
| Símbolo | URM1 | ||||||||||
| Pfam | PF09138 | ||||||||||
| Interprofesional | IPR015221 | ||||||||||
| SCOP2 | d.15.3.3 / ÁMBITO DE APLICACIÓN / SUPFAM | ||||||||||
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El modificador relacionado con la ubiquitina-1 (URM1) es una proteína similar a la ubiquitina que modifica las proteínas en la vía de urmilación similar a la ubiquitina de la levadura. [1] Las comparaciones estructurales y el análisis filogenético de la superfamilia de la ubiquitina han indicado que Urm1 tiene las características estructurales y de secuencia más conservadas del ancestro común de toda la superfamilia. [2] [3]
Urm1 se caracteriza por un pliegue de agarre β central y una glicina carboxiterminal esencial dentro de un motivo de di-glicina. Se sabe que Urm1 está conjugado con la peroxirredoxina Ahp1, ATPBD3 y CTU2 y MOCS3 humano , a través de un mecanismo que involucra a la proteína similar a E1 Uba4 a través de residuos de lisina. [4] De manera similar a la ubiquitinación, la urmilación requiere un intermediario tioéster y forma enlaces isopeptídicos entre Urm1 y sus sustratos. Además, el proceso de urmilación puede mejorarse significativamente por el estrés oxidativo. [5] Funciona como una etiqueta proteica con roles en la detección de nutrientes y la respuesta al estrés oxidativo.
Recientemente se ha demostrado que Urm1 puede actuar como transportador de azufre en la tiolación de ARNt eucariotas a través de un mecanismo que requiere la formación de un Urm1 tiocarboxilado. [6] URM1 está involucrado en la tiolación de ARNt citoplasmáticos; recibe azufre de la enzima similar a E1 Uba4 y lo transfiere al ARNt. Los estudios de homología estructural y de secuencia sugieren que Urm1 puede estar más estrechamente vinculado a las proteínas de transferencia de azufre procariotas, ThiS y MoaD, que pueden considerarse como contrapartes procariotas de las UBls eucariotas. [7]
Véase también
Referencias
- ^ Goehring AS, Rivers DM, Sprague GF (noviembre de 2003). "Urmilación: una vía similar a la ubiquitina que funciona durante el crecimiento invasivo y la gemación en levaduras". Biología molecular de la célula . 14 (11): 4329–41. doi :10.1091/mbc.E03-02-0079. PMC 266754 . PMID 14551258.
- ^ Xu J, Zhang J, Wang L, Zhou J, Huang H, Wu J, Zhong Y, Shi Y (agosto de 2006). "Estructura de la solución de Urm1 y sus implicaciones para el origen de los modificadores de proteínas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 103 (31): 11625–30. Bibcode :2006PNAS..10311625X. doi : 10.1073/pnas.0604876103 . PMC 1518799 . PMID 16864801.
- ^ Goehring AS, Rivers DM, Sprague GF (noviembre de 2003). "Urmilación: una vía similar a la ubiquitina que funciona durante el crecimiento invasivo y la gemación en levaduras". Biología molecular de la célula . 14 (11): 4329–41. doi :10.1091/mbc.E03-02-0079. PMC 266754 . PMID 14551258.
- ^ Van der Veen AG, Schorpp K, Schlieker C, Buti L, Damon JR, Spooner E, Ploegh HL, Jentsch S (febrero de 2011). "Función de la proteína similar a la ubiquitina Urm1 como modificador proteico no canónico dirigido por lisina". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 108 (5): 1763–70. doi : 10.1073/pnas.1014402108 . PMC 3033243 . PMID 21209336.
- ^ Wang F, Liu M, Qiu R, Ji C (agosto de 2011). "El papel dual de la proteína similar a la ubiquitina Urm1 como modificador de proteínas y transportador de azufre". Protein & Cell . 2 (8): 612–9. doi :10.1007/s13238-011-1074-6. PMC 4875326 . PMID 21904977.
- ^ Petroski MD, Salvesen GS, Wolf DA (febrero de 2011). "Urm1 acopla la transferencia de azufre a la función de la proteína similar a la ubiquitina en el estrés oxidativo". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 108 (5): 1749–50. Bibcode :2011PNAS..108.1749P. doi : 10.1073/pnas.1019043108 . PMC 3033263 . PMID 21245332.
- ^ Pedrioli PG, Leidel S, Hofmann K (diciembre de 2008). "Urm1 en la encrucijada de las modificaciones. Serie de revisiones 'Modificaciones de proteínas: más allá de los sospechosos habituales'". EMBO Reports . 9 (12): 1196–202. doi :10.1038/embor.2008.209. PMC 2603462 . PMID 19047990.
