UBE2B

UBE2B
Estructuras disponibles
AP	Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación del PDB
	1JAS, 2Y4W, 2YB6, 2YBF
Identificadores
Alias	UBE2B , E2-17kDa, HHR6B, HR6B, RAD6B, UBC2, enzima conjugadora de ubiquitina E2 B
Identificaciones externas	OMIM : 179095; MGI : 102944; HomoloGene : 101298; Tarjetas genéticas : UBE2B; OMA :UBE2B - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 5 (humano)
Fin	134.392.108 pb
Ubicación del gen ( ratón )
Cristo.	Cromosoma 11 (ratón)
Fin	51.891.589 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	músculo del muslo; ; músculo gastrocnemio; ; Tejido muscular esquelético del recto abdominal; ; Pulmón derecho; ; aurícula derecha; ; bíceps braquial; ; cuerpo del páncreas; ; Aorta torácica descendente; ; pituitaria anterior; ; eminencia ganglionar;
	Top expresado en
	músculo intercostal; ; cabeza medial del músculo gastrocnemio; ; músculo del muslo; ; músculo cuádriceps femoral; ; músculo tríceps braquial; ; músculo vasto lateral; ; músculo esternocleidomastoideo; ; músculo temporal; ; válvula auriculoventricular; ; núcleo arqueado;
	Más datos de expresión de referencia
	; ; ; ;
	Más datos de expresión de referencia
Ontología genética
Función molecular	actividad transferasa; unión de nucleótidos; Actividad de la ligasa de la proteína ubiquitina; Actividad de la ubiquitina-proteína transferasa; unión de proteínas; Unión de ATP; Actividad enzimática conjugadora de ubiquitina; unión de la proteína ligasa ubiquitina;
Componente celular	citoplasma; membrana; membrana plasmática; horquilla de replicación; Complejo HULC; nucleoplasm; Cuerpo XY; cromatina; núcleo;
Proceso biológico	conjunto de quiasma; ubiquitinación de la histona H2A; Regulación negativa de la señalización mediada por AMPc; reparación posreplicación; Proceso catabólico de proteínas dependiente de ubiquitina; ubiquitinación ligada a la proteína K63; agrupamiento de telómeros meióticos; Regulación positiva de la recombinación meiótica recíproca.; estabilización de proteínas; poliubiquitinación de proteínas; regulación negativa del proceso apoptótico; desarrollo embrionario en el útero; monoubiquitinación de proteínas; ensamblaje del axonema del espermatozoide; Respuesta celular al estímulo de daño del ADN; ubiquitinación ligada a la proteína K11; desmetilación de lisina de histona; ubiquitinación ligada a la proteína K48; Regulación de la modificación de histonas.; espermatogénesis; vía de señalización Wnt canónica; organización del complejo sinaptonémico; respuesta a los rayos UV; Proceso catabólico de proteínas dependiente de ubiquitina mediado por proteasoma; autoubiquitinación de proteínas; Reparación del ADN; ubiquitinación de proteínas; Regulación positiva de la vía de señalización Wnt canónica;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	7320
	22210
	ENSG00000119048
	ENSMUSG00000020390
	P63146
	P63147
	Número nuevo_003337
	NM_009458 ; NM_001362685 ; NM_001362686
	NP_003328
	NP_033484 ; NP_001349614 ; NP_001349615
	Wikidatos
Ver/Editar humano	Ver/Editar ratón

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La enzima conjugadora de ubiquitina E2 B es una proteína que en los humanos está codificada por el gen UBE2B . ^[5]^[6]

La modificación de proteínas con ubiquitina es un mecanismo celular importante para la degradación de proteínas anormales o de vida corta. La ubiquitinación involucra al menos tres clases de enzimas: enzimas activadoras de ubiquitina, o E1, enzimas conjugadoras de ubiquitina, o E2, y ligasas de ubiquitina-proteína, o E3. Este gen codifica un miembro de la familia de enzimas conjugadoras de ubiquitina E2. Esta enzima es necesaria para la reparación del daño del ADN post-replicativo. Su secuencia proteica es 100% idéntica a las homólogas de ratón, rata y conejo, lo que indica que esta enzima está altamente conservada en la evolución eucariota. ^[6]

Interacciones

Se ha demostrado que UBE2B interactúa con RAD18 . ^[7]^[8]

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000119048 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000020390 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ Koken MH, Smit EM, Jaspers-Dekker I, Oostra BA, Hagemeijer A, Bootsma D, Hoeijmakers JH (mayo de 1992). "Localización de dos homólogos humanos, HHR6A y HHR6B, del gen de reparación del ADN de levadura RAD6 en los cromosomas Xq24-q25 y 5q23-q31". Genómica . 12 (3): 447–53. doi :10.1016/0888-7543(92)90433-S. hdl : 1765/3036 . PMID 1559696.
^ ab "Gen Entrez: enzima conjugadora de ubiquitina UBE2B E2B (homólogo de RAD6)".
^ Xin H, Lin W, Sumanasekera W, Zhang Y, Wu X, Wang Z (julio de 2000). "El producto del gen humano RAD18 interactúa con HHR6A y HHR6B". Nucleic Acids Res . 28 (14). INGLATERRA: 2847–54. doi :10.1093/nar/28.14.2847. PMC 102657. PMID 10908344 .
^ Tateishi S, Sakuraba Y, Masuyama S, Inoue H, Yamaizumi M (julio de 2000). "La disfunción de Rad18 humana da como resultado una reparación post-replicación defectuosa e hipersensibilidad a múltiples mutágenos". Proc. Natl. Sci. USA 97 (14). ESTADOS UNIDOS: 7927–32. Bibcode :2000PNAS...97.7927T. doi : 10.1073/pnas.97.14.7927 . ISSN 0027-8424. PMC 16647 . PMID 10884424.

Lectura adicional

Koken MH, Reynolds P, Jaspers-Dekker I, et al. (1991). "Conservación estructural y funcional de dos homólogos humanos del gen de reparación del ADN de levadura RAD6". Proc. Natl. Sci. USA . 88 (20): 8865–9. Bibcode :1991PNAS...88.8865K. doi : 10.1073/pnas.88.20.8865 . PMC 52611 . PMID 1717990.
Woffendin C, Chen ZY, Staskus K, et al. (1991). "ARNm de mamíferos que codifican proteínas estrechamente relacionadas con la enzima conjugadora de ubiquitina codificada por el gen de reparación del ADN de levadura RAD6". Biochim. Biophys. Acta . 1090 (1): 81–5. doi :10.1016/0167-4781(91)90039-o. PMID 1883845.
Schneider R, Eckerskorn C, Lottspeich F, Schweiger M (1990). "La proteína transportadora de ubiquitina humana E2 (Mr = 17.000) es homóloga al gen de reparación del ADN de la levadura RAD6". EMBO J . 9 (5): 1431–5. doi :10.1002/j.1460-2075.1990.tb08259.x. PMC 551831 . PMID 2158443.
Koken MH, Hoogerbrugge JW, Jasper-Dekker I, et al. (1996). "La expresión de las enzimas de reparación del ADN que se conjugan con ubiquitina HHR6A y B sugiere un papel en la espermatogénesis y la modificación de la cromatina". Dev. Biol . 173 (1): 119–32. doi : 10.1006/dbio.1996.0011 . hdl : 1765/3093 . PMID: 8575614.
Tateishi S, Sakuraba Y, Masuyama S, et al. (2000). "La disfunción de Rad18 humana da como resultado una reparación post-replicación defectuosa e hipersensibilidad a múltiples mutágenos". Proc. Natl. Sci. USA . 97 (14): 7927–32. Bibcode :2000PNAS...97.7927T. doi : 10.1073/pnas.97.14.7927 . PMC 16647 . PMID 10884424.
Xin H, Lin W, Sumanasekera W, et al. (2000). "El producto del gen humano RAD18 interactúa con HHR6A y HHR6B". Nucleic Acids Res . 28 (14): 2847–54. doi :10.1093/nar/28.14.2847. PMC 102657 . PMID 10908344.
Miura T, Klaus W, Ross A, et al. (2003). "La estructura de RMN de la enzima conjugadora de ubiquitina humana de clase I 2b". J. Biomol. RMN . 22 (1): 89–92. doi :10.1023/A:1013807519703. PMID 11885984. S2CID 27799378.
Shekhar MP, Lyakhovich A, Visscher DW, et al. (2002). "La sobreexpresión de Rad6 induce multinucleación, amplificación del centrosoma, mitosis anormal, aneuploidía y transformación". Cancer Res . 62 (7): 2115–24. PMID 11929833.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
Kwon YT, Xia Z, An JY, et al. (2003). "Letalidad femenina y apoptosis de espermatocitos en ratones que carecen de la vía de la regla del extremo N de la ubiquitina ligasa UBR2". Mol . Cell. Biol . 23 (22): 8255–71. doi :10.1128/MCB.23.22.8255-8271.2003. PMC 262401. PMID 14585983.
Lyakhovich A, Shekhar MP (2004). "La sobreexpresión de RAD6B confiere quimiorresistencia: expresión de RAD6 durante el ciclo celular y su redistribución a la cromatina durante la respuesta inducida por daño del ADN". Oncogene . 23 (17): 3097–106. doi :10.1038/sj.onc.1207449. PMID 14981545. S2CID 6180818.
Watanabe K, Tateishi S, Kawasuji M, et al. (2005). "Rad18 guía a poleta a sitios de bloqueo de replicación a través de interacción física y monoubiquitinación de PCNA". EMBO J . 23 (19): 3886–96. doi :10.1038/sj.emboj.7600383. PMC 522788 . PMID 15359278.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa del NIH: la Colección de Genes de Mamíferos (MGC)". Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928 . PMID 15489334.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). "Una red de interacción proteína-proteína humana: un recurso para anotar el proteoma". Cell . 122 (6): 957–68. doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070. S2CID 8235923.
Shekhar MP, Tait L, Gerard B (2007). "Función esencial del factor de células T/beta-catenina en la regulación de Rad6B: un mecanismo potencial para la sobreexpresión de Rad6B en células de cáncer de mama". Mol. Cancer Res . 4 (10): 729–45. doi : 10.1158/1541-7786.MCR-06-0136 . PMID 17050667.

Este artículo sobre un gen del cromosoma 5 humano es un esbozo . Puedes ayudar a Wikipedia expandiéndolo.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000119048 – Ensembl , mayo de 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000020390 – Ensembl , mayo de 2017

[3] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[4] "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[pmid1559696-5] Koken MH, Smit EM, Jaspers-Dekker I, Oostra BA, Hagemeijer A, Bootsma D, Hoeijmakers JH (mayo de 1992). "Localización de dos homólogos humanos, HHR6A y HHR6B, del gen de reparación del ADN de levadura RAD6 en los cromosomas Xq24-q25 y 5q23-q31". Genómica . 12 (3): 447–53. doi :10.1016/0888-7543(92)90433-S. hdl : 1765/3036 . PMID 1559696.

[entrez-6] "Gen Entrez: enzima conjugadora de ubiquitina UBE2B E2B (homólogo de RAD6)".

[pmid10908344-7] Xin H, Lin W, Sumanasekera W, Zhang Y, Wu X, Wang Z (julio de 2000). "El producto del gen humano RAD18 interactúa con HHR6A y HHR6B". Nucleic Acids Res . 28 (14). INGLATERRA: 2847–54. doi :10.1093/nar/28.14.2847. PMC 102657. PMID 10908344 .

[pmid10884424-8] Tateishi S, Sakuraba Y, Masuyama S, Inoue H, Yamaizumi M (julio de 2000). "La disfunción de Rad18 humana da como resultado una reparación post-replicación defectuosa e hipersensibilidad a múltiples mutágenos". Proc. Natl. Sci. USA 97 (14). ESTADOS UNIDOS: 7927–32. Bibcode :2000PNAS...97.7927T. doi : 10.1073/pnas.97.14.7927 . ISSN 0027-8424. PMC 16647 . PMID 10884424.