Para dar inicio a la nueva temporada, Letran y las otras escuelas miembros de la NCAA realizaron las ceremonias de apertura en el Araneta Coliseum , seguidas de cuatro partidos de baloncesto el 25 de junio de 2005. Otras disciplinas comenzaron sus propios torneos en los meses siguientes, siendo el voleibol de playa el último torneo a mediados de marzo.
Fuente: ABS-CBN Reglas deportivas para la clasificación: 1) porcentaje de victorias ; 2) si hay empate entre los 4 primeros, desempate de un juego ; 3) récord cara a cara; 4) diferencial de puntos cara a cara ; 5) diferencial de puntos general (H) Notas de los anfitriones :
^ ab Playoff del tercer puesto: PCU 96–90 JRU
^ Todas las victorias de Letran se perdieron cuando se descubrió que un jugador había participado en un juego de ligang labas .
¹ Como San Sebastián tenía más campeonatos (4) que LSGH (3), San Sebastián ganó el Campeonato General, a pesar de estar empatado en el primer puesto. ² Mapua no envió representantes en la división Juniors