Virus Escherichia T5
| Virus Escherichia T5 | |
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| Estructura del bacteriófago T5 con resolución atómica [1] | |
Clasificación de virus  | |
| (sin clasificar): | Virus |
| Reino : | Duplodnaviria |
| Reino: | Virus de Heunggong |
| Filo: | Uroviricóta |
| Clase: | Caudoviricetes |
| Orden: | Caudovirus |
| Familia: | Demerecviridae |
| Género: | virus tequinta |
| Especies: | Virus Escherichia T5 |
| Sinónimos [2] | |
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El virus Escherichia T5 , a veces llamado bacteriófago T5, es un virus caudal de la familia Demerecviridae . Este bacteriófago infecta específicamente las células bacterianas de E. coli y sigue un ciclo de vida lítico .
Estructura y genoma
El virión T5 incluye una cápside icosaédrica (cabeza) de 90 nanómetros y una cola flexible y no contráctil de 250 nanómetros de largo . [3]
La cápside contiene el genoma de ADN bicatenario de 121.750 pares de bases del fago, que codifica alrededor de 168 proteínas (ahora reducidas a 162). [4] El genoma tiene una secuencia única de 111.613 pb con dos grandes repeticiones terminales directas idénticas de 10.139 pb. Cuando se publicó la secuencia del genoma en 2005, solo 61 (36,3%) de las 168 proteínas codificadas tenían asignadas funciones basadas en la homología con secuencias conocidas. Más de la mitad de todos los genes (92 o 54,7%) eran ORFs predichos que carecían de similitud con ninguna proteína conocida. [5] El número de proteínas no caracterizadas sigue siendo alto, aproximadamente el 50% del genoma (según la última anotación del proteoma de referencia en Uniprot, 2021 ). [4]
Infección
Se ha demostrado que el bacteriófago T5 infecta a E. coli después de que su proteína de unión al receptor, pb5, se une al transportador de ferricromo de la membrana externa de la célula huésped , FhuA. La unión desencadena cambios estructurales en pb5 y, finalmente, conduce a la liberación de ADN de la cápside del fago. [6] [7]
Referencias
- ^ Victor Padilla-Sanchez. (2024). Modelo estructural del bacteriófago T5 a resolución atómica. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.14174057
- ^ Krupovic, Mart; et al. (mayo de 2015). "Renombrar todos los (522) virus bacterianos y 2 especies de virus arqueales existentes" (PDF) . Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Consultado el 27 de febrero de 2020 .
- ^ Effantin G. et al.: La estructura del bacteriófago T5 revela similitudes con HK97 y T4, lo que sugiere relaciones evolutivas. J Mol Biol. (2006) 361, 993–1002, doi:10.1016/j.jmb.2006.06.081
- ^ ab "Fago T5 de Escherichia (Fago T5 de Enterobacteria)". www.uniprot.org . Consultado el 2 de abril de 2021 .
- ^ Wang, Jianbin; Jiang, Yan; Vicente, Myriam; Sol, Yongqiao; Yu, Hong; Wang, Jing; Bao, Qiyu; Kong, Huimin; Hu, Songnian (5 de febrero de 2005). "Secuencia completa del genoma del bacteriófago T5". Virología . 332 (1): 45–65. doi : 10.1016/j.virol.2004.10.049 . ISSN 0042-6822. PMID 15661140.
- ^ Flayhan, A; Wien, F; Paternostre, M; Boulanger, P; Breyton, C (septiembre de 2012). "Nuevos conocimientos sobre pb5, la proteína de unión al receptor del bacteriófago T5, y su interacción con su receptor FhuA de Escherichia coli". Biochimie . 94 (9): 1982–9. doi :10.1016/j.biochi.2012.05.021. PMID 22659573. S2CID 20354844.
- ^ Basit, H; Shivaji Sharma, K; Van der Heyden, A; Gondran, C; Breyton, C; Dumy, P; Winnik, FM; Labbé, P (11 de mayo de 2012). "Inmovilización superficial mediada por anfipol de FhuA: una plataforma para la detección sin etiqueta de la proteína del bacteriófago pb5". Chemical Communications . 48 (48): 6037–9. doi :10.1039/c2cc31107k. PMID 22576748. S2CID 19703515.
Enlaces externos
- UniProt: Fago T5 de enterobacterias
- Taxonomía del NCBI: fago T5 de enterobacterias
